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An interdisciplinary evaluation of the best management practices in aquaculture in Tocantins State, Brazil: preliminary results and trends. Repositório Alice
PRYSTHON, A.; BERGAMIN, G. T.; VARELA, E. S.; PEDROZA FILHO, M. X.; TORATI, L. S.; LUCHIARI JUNIOR, A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tocantins; Aquicultura; Peixe; Produção pesqueira.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905860
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Broodstock management: cryopreservation parameters to select native tropical fish. Repositório Alice
MATAVELI, M.; ALVES, A. L.; KIRSCHNIK, L. N. G.; MORO, G. V.; VARELA, E. S..
Genetic management of broodstock aims to produce fingerlings of superior quality from the adoption of practices and technological processes that assist in the control of the breeders. For this effective control, the fish farmer must avoid matings that would yield inbreeding and select the best breeders by the sperm quality.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Peixe; Criopreservação; Esperma; Breeding stock.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1039649
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Caracterização do sistema pesqueiro de produção do camarão-da-amazônia no estuário amazônico. Infoteca-e
LIMA, J. de F.; CINTRA, I. H. A.; BASTOS, A. M.; DAMASCENO, L. F.; MONTAGNER, D.; VARELA, E. S..
2016
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Crustáceo; Pesca artesanal; Cadeia produtiva; Comercialização.
Ano: 2016 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1064543
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Changing the production chain of Amazonian pirarucu. Repositório Alice
LIMA, A. F.; RODRIGUES, A. P. O.; VARELA, E. S.; LIMA, L. K. F. de; TORATI, L. S.; MACIEL, P. O..
This article summarizes these recent findings and envisions how these are impacting the production sector in the short and medium terms. Recent studies in Brazil have addressed the main challenges faced by commercial producers of pirarucu, including breeding, larval rearing, grow-out, feeding, health management, processing and more.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pesca; Peixe; Pirarucu; Produção Pesqueira; Desenvolvimento Sustentável; Fish; Arapaima gigas; Fish production; Food chain.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100360
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Characterization of aquaculture production in Tocantins State, Brazil. Repositório Alice
LIMA, A. F.; VARELA, E. S.; GANECO, L. N.; CHICRALA, P. C. M. S.; LIMA, L. K. F.; PRYSTHON, A.; LUCHIARI JUNIOR, A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Peixe; Produção pesqueira; Aquicultura.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905835
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Complete mitochondrial genome from South American catfish Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmann & Eigenmann) and its impact in Siluriformes phylogenetic tree. Repositório Alice
VILLELA, L. C. V.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PONZETTO, J. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
The cachara (Pseudoplatystoma reticulatum) is a Neotropical freshwater catfish from family Pimelodidae (Siluriformes) native to Brazil. The species is of relative economic importance for local aquaculture production and basic biological information is under development to help boost efforts to domesticate and raise the species in commercial systems. The complete cachara mitochondrial genome was obtained by assembling Illumina RNA-seq data from pooled samples. The full mitogenome was found to be 16,576 bp in length, showing the same basic structure, order, and genetic organization observed in other Pimelodidae, with 13 protein-coding genes, 2 rNA genes, 22 trNAs, and a control region. Observed base composition was 24.63% T, 28.47% C, 31.45% A, and 15.44% G....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cachara; Peixe-gato; Mitogenome; Aquicultura; Filogenia; Melhoramento genético animal; Peixe de água doce; RNA; Pseudoplatystoma reticulatum; Mitochondrial genome; Siluriformes; Phylogeny; Catfish; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074198
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Composição da ictiofauna em canal de irrigação no Rio Caiapó, tributário do Rio Araguaia (Tocantins). Repositório Alice
BARROSO, A. da S.; OLIVEIRA, A. da S.; ALVES, M. S. S.; VARELA, E. S.; HASHIMOTO, D. T.; ALVES, A. L..
O Rio Caiapó pertence à bacia Araguaia-Tocantins, sendo um dos afluentes da margem direita do Rio Araguaia, que embora não esteja diretamente ligada ao rio Amazonas, tem uma contribuição muito significativa com a maior ictiofauna de peixes de água doce do mundo. Esforços urgentes ainda necessitam ser direcionados para conhecer toda a biodiversidade contida neste ambiente, pois muitas espécies ainda são desconhecidas, mas já estão sendo extintas devido às impactantes ações antrópicas, como por exemplo, a construção de usinas hidrelétricas. Além disso, a identificação e prospecção dos peixes de água doce são necessárias para conhecer possíveis espécies que tenham potencial para produção. Este estudo teve como principal objetivo inventariar a ictiofauna dos...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Rio Araguaia; Peixe; Ictiologia; Biodiversidade; Conservação.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/971737
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Current scenario of fish hatchery in Tocantins State, Brazil. Repositório Alice
GANECO, L. N.; VARELA, E. S.; LIMA, A. F.; TORATI, L. S.; BERGAMIN, G. T.; LUCHIARI JUNIOR, A..
2011
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tocantins; Incubador de peixe; Peixe; Aquicultura.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905827
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de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). Repositório Alice
LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
The Tambaqui (Colossoma macropomum) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin which has historically been widely exploited by community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last ten years. Current production is above 120,000 metric tons per year with a strong growth trend, making it the most important native aquaculture species in Brazil. Data for generating the draft assembly were produced from shotgun libraries with two different insert sizes and mate-paired libraries with four different sizes sequenced (2x150bps) with Illumina HiSeq2000 technology. A total of 124.8Gbp quality-filtered...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sequência genômica; Tambaqui; Genome assembly; Sequence analysis; Colossoma macropomum.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1013201
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Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. Repositório Alice
CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise genômica; Marcadores SNP; Peixes nativos; Aquicultura; Aquaculture; Fish; Genomics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1003702
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Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. Repositório Alice
CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Análise genômica; Marcadores SNP; Peixes nativos; Aquicultura.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1000716
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Desenvolvimento embrionário do híbrido "Pintado-da-amazônia" (fêmea Pseudoplatystoma punctifer x macho Leiarius marmoratus). Repositório Alice
GANECO, L. N.; LIMA, A. F.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; TORATI, L. S.; LUNDSTEDT, L. M..
Com o intuito de fornecer maiores informações sobre o desenvolvimento inicial dos híbridos, o objetivo do presente estudo foi descrever o período embrionário do híbrido "pintado-da-amazônia" (fêmea Pseudoplatystoma punctifer x macho Leiarius marmoratus).
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Peixe híbrido; Desenvolvimento inicial; Pseudoplatystoma punctifer; Pintado-da-amazônia; Peixe; Ovo.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/905808
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Diversidade e parentesco genético em piracurus (Arapaima gigas) de cativeiro do baixo Amazônas: bases para implantação de um núcleo de conservação in situ. Repositório Alice
SOUSA, A. R. B. de; MARTINS JUNIOR, H.; ALVES, A. R.; ARARIPE, J.; OLIVEIRA, N. F. A.; VARELA, E. S..
2016
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pirarucu; Arapaima gigas; Microssatélites; Heterozigosidade; Coancestria.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1060409
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Estrogen receptors are sex-differentially expressed in tambaqui (Colossoma macropomum) during sex differentiation. Repositório Alice
PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F.; LOBO, I.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R.; VARELA, E. S.; ALMEIDA, F. L..
Here we report, for the first time, the identification and initial characterization of ERs and ERRs transcriptional levels in tambaqui (Colossoma macropomum) during sexual differentiation.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Tambaqui; Peixe; Colossoma Macropomum; Estrógeno; Estrogens; Colossoma; Fish; Sex differentiation disorders.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092861
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Genetic diversity and structure in Arapaima gigas populations from Amazon and Araguaia-Tocantins river basins. Repositório Alice
TORATI, L. S.; TAGGART, J. B.; VARELA, E. S.; ARARIPE, J.; WEHNER, S.; MIGAUD, H..
Background: Arapaima gigas (Schinz, 1822) is the largest freshwater scaled fish in the world, and an emerging species for tropical aquaculture development. Conservation of the species, and the expansion of aquaculture requires the development of genetic tools to study polymorphism, differentiation, and stock structure. This study aimed to investigate genomic polymorphism through ddRAD sequencing, in order to identify a panel of single nucleotide polymorphisms (SNPs) and to simultaneously assess genetic diversity and structure in wild (from rivers Amazon, Solimões, Tocantins and Araguaia) and captive populations. Results: Compared to many other teleosts, the degree of polymorphism in A. gigas was low with only 2.3% of identified RAD-tags (135 bases long)...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Araguaia; Tocantins; Conservação; Genética Animal; Pirarucu; Arapauma Gigas; Arapaima gigas; Fisheries; Aquaculture; Species diversity; Amazonia; Rivers.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105220
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Genética na piscicultura: marcação e coleta de amostras para análise de DNA. Infoteca-e
HASHIMOTO, D. T.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; MORO, G. V..
Análise de variabilidade genética. Identificação individual dos animais por tags. Coleta de nadadeira do peixe e transferência para o tubo. Envio de material.
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Piscicultura; Peixe; Melhoramento genético animal; Variação genética.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/946444
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Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). Repositório Alice
CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B..
The South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum) is the most important native aquaculture species in Brazil. Current production levels are above 150,000 mt per year. Recent efforts to domesticate, breed and raise the species in aquaculture systems has led to significant increases in production (>10-fold) over the last decade, and development of new technologies based on genomic tools and information could help further increase productivity and production growth rates.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Colossoma Macropomum; Tambaqui; Genome assembly; Bioinformatics; Fish.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118807
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Genome Sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). Repositório Alice
LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
The South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer) is a freshwater fish species naturally found in the Amazon river basin with an important role in local community and commercial fishing. Recent efforts to domesticate and raise the species in aquaculture systems has led to >10-fold production increases in the last decade. Current production levels are >15,000mt/year. Recently stablished initiatives to structure genetic improvement programs for increasing productivity-associated traits could greatly benefit from using genomic tools for broodstock management and assisted genetic evaluations and breeding. Multiple shotgun libraries with two different insert sizes and multiple Nextera mate pair libraries with three different sizes were...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Genômica; Sequenciamento de genoma; Bioinformatics; Genomics; Genome assembly; Sequence analysis.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1038884
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Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. Repositório Alice
ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R..
bitstream/item/206503/1/genome-sequencing-and-de-novo-assembly-of-the-southe-american.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pseudoplatystoma Punctifer; Aquaculture.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116379
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Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. Repositório Alice
ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R..
bitstream/item/208152/1/Genome-Sequencing-PAG.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pseudoplatystoma Punctifer; Aquacultura; Bioinformática; Aquaculture; Genome assembly; Bioinformatics.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118157
Registros recuperados: 42
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