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16S rRNA gene-based identification of microbiota associated with the parthenogenetic troglobiont sand fly Deanemyia maruaga (Diptera, Psychodidae) from central Amazon, Brazil BJM
Sousa,Katianne Barbosa Alves de; Silva,Túllio Romão Ribeiro da; Alencar,Ronildo Baiatone; Baton,Luke Anthony; Naveca,Felipe Gomes; Shimabukuro,Paloma Helena Fernandes.
Bacteria associated with the parthenogenetic troglobiont sand fly Deanemyia maruaga were characterized by sequencing cloned 16S rDNA PCR products. Eleven novel partial 16S rDNA sequences, with varying degrees of similarity to Actinobacteria, were identified. None of the sequences identified had homology to those known from parthenogenesis-inducing bacteria.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Bat guano; Parthenogensis; Sand flies; Troglobiont.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822013000100047
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Ação de actinobactérias da Caatinga no controle de Aspergillus niger produtor de enzimas, ácido cítrico e micotoxinas. Repositório Alice
DIOGO, M. S.; DIOGO, M. S.; GOULART, A. P.; FONTANA, J.; LEME, M. M. P.; MELO, I. S. de.
Resumo: Aspergillus niger é um fungo de grande importância devido à sua patogenicidade, rodução de micotoxinas, exploração biotecnológica e por ser um organismo eucarioto. Ele é considerado um patógeno oportunista que se propaga de forma eficaz em diferentes ambientes, causando danos a diversas culturas agrícolas. Assim, o objetivo desse trabalho foi avaliar a capacidade de actinobactérias provenientes de solos secos do bioma Caatinga em inibir o crescimento de A. niger. O experimento foi realizado na Embrapa Meio Ambiente, em duas etapas. A primeira etapa consistiu no isolamento e purificação de 117 actinobactérias selecionadas de amostras de solo seco e rizosférico do bioma Caatinga. Na segunda etapa foi realizado o teste de inibição do desenvolvimento...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Actinomiceto; Bactéria; Aspergillus Niger; Controle Biológico; Caatinga; Aflatoxina; Actinobacteria; Fungal diseases of plants; Biological control; Aflatoxins.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126342
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Actinobacteria from Antarctica as a source for anticancer discovery. Repositório Alice
SILVA, L. J. da; CREVELIN, E. J.; SOUZA, D. T.; LACERDA JÚNIOR, G. V.; OLIVEIRA, V. M.; RUIZ, A. L. T. G.; ROSA, L. H.; MORAES, L. A. B.; MELO, I. S. de.
Abstract: Although many advances have been achieved to treat aggressive tumours, cancer remains a leading cause of death and a public health problem worldwide. Among the main approaches for the discovery of new bioactive agents, the prospect of microbial secondary metabolites represents an effective source for the development of drug leads. In this study, we investigated the actinobacterial diversity associated with an endemic Antarctic species, Deschampsia antarctica, by integrated culture-dependent and culture-independent methods and acknowledged this niche as a reservoir of bioactive strains for the production of antitumour compounds. The 16S rRNA-based analysis showed the predominance of the Actinomycetales order, a well-known group of bioactive...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Anticancer activity; Antitumoral activity; Bactéria não Patogênica; Câncer; Actinobacteria; Antarctica.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1128824
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An Actinobacterium strain from soil of Cerrado promotes Phosphorus solubilization and plant growth in soybean plants. Repositório Alice
VARGAS HOYOS, H. A.; CHIARAMONTE, J. B; BARBOSA-CASTELIANI, A G.; , ORAIS, J. F.; PEREZ-JARAMILLO, J. E.; SANTOS, S. N.; QUEIROZ, S. C. do N. de; MELO, I. S. de.
Abstract: The huge biological diversity of the Brazilian Cerrado is an important source of economically interesting microbial agents. The phylum Actinobacteria plays an important role in nutrient cycling, potentially improving their availability to plants. In this study, we isolated an actinobacteria (strain 3AS4) from wheat rhizospheres of crops cultivated in the Cerrado biome. Strain 3AS4 was identified as belonging to the genus Streptomyces and had phosphorus mobilization ability, mineralizing approximately 410 mg ml-1 from phytate, 300 mg ml-1 from calcium phosphate, and 200 mg ml-1 from rock phosphate. The analysis of the actinobacteria crude extract by spectrometric techniques revealed the presence of gluconic and 2-ketogluconic acid, and a...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bactéria; Rizosfera; Estimulante de Crescimento Vegetal; Soja; Soybeans; Actinobacteria; Cerrado soils; Growth promotion; Streptomyces rishiriensis; Gluconic acid; Solubilization; Phosphorus.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1133501
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Biodiversidade de actinobactérias da rizosfera de plantas da Caatinga. Repositório Alice
LINS, M. R. da C. R.; SILVA, J. J. R. da; TENÓRIO, R. R.; SOARES, E. C. de L.; LINS, C. V.; DINIZ, C. C.; MELO, J. G. da S.; SILVA, J. M.; LIMA, G. M. de S.; MELO, I. S. de.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Caatinga; Rizosfera; Actinobacteria.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/917527
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Characterization and phylogenetic affiliation of Actinobacteria from tropical soils with potential uses for agro-industrial processes. Repositório Alice
DORNELAS, J. C. M.; FIGUEIREDO, J. E. F.; ABREU, C. S. de; LANA, U. G. P.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; MARRIEL, I. E..
Secondary metabolites produced by Actinobacteria of tropical soils represent a largely understudied source of novel molecules with relevant application in medicine, pharmaceutical and food industries, agriculture, and environmental bioremediation. The present study aimed to characterize sixty-nine Actinobacteria isolated from compost and tropical soils using morphological, biochemical, and molecular methods. All the isolates showed high variation for morphological traits considering the color of pigments of the aerial and vegetative mycelium and spore chain morphology. The enzymatic activity of amylase, cellulase, and lipase was highly variable. The amylase activity was detected in 53 (76.81%) isolates. Eighteen (Streptomyces curacoi) and ACSL 6 (S....
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Morphological traits; Identificação molecular; Molecular identification.; Actinomiceto; Atividade enzimática; Actinobacteria; Enzyme activity..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076062
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Characterization and phylogenetic affiliation of actinobacteria of biotechnological interest isolated from tropical soils. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. M. D.; ABREU, C. S.; FIGUEIREDO, J. E. F.; LANA, U. G. P.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; GOMES, E. A.; STOIANOFF, M. A. R.; MARRIEL, I. E..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Actinomiceto; Enzima; Actinobacteria; Enzymes.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078785
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Composition of bacterial community in enrichment cultures of shale by-products from Irati Formation, Brazil BJM
Goes,Kelly Campos Guerra Pinheiro de; Lovato,Gisele Milani; Andrade,Diva S..
ABSTRACT We examined microbial communities from enriched fine and retorted shale particles using sequencing of V4 variable region of 16S rRNA. High number of microbial genera was found in both enriched shale by-products that were dominate by Actinobacteria, Firmicutes and Proteobacteria, showing differences due to microbial colonization after the pyrolysis process.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Firmicutes; Fine shale particles; Proteobacteria; Retorted shale.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822018000400742
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Draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1 (Thermomonosporaceae) and in silico evidence of its functional role in filter cake biomass deconstruction Genet. Mol. Biol.
Omori,Wellington P.; Pinheiro,Daniel G.; Kishi,Luciano T.; Fernandes,Camila C.; Fernandes,Gabriela C.; Gomes-Pepe,Elisângela S.; Pavani,Claudio D.; Lemos,Eliana G. de M.; Souza,Jackson A. M. de.
Abstract The filter cake from sugar cane processing is rich in organic matter and nutrients, which favors the proliferation of microorganisms with potential to deconstruct plant biomass. From the metagenomic data of this material, we assembled a draft genome that was phylogenetically related to Thermomonospora curvata DSM 43183, which shows the functional and ecological importance of this bacterium in the filter cake. Thermomonospora is a gram-positive bacterium that produces cellulases in compost, and it can survive temperatures of 60 ºC. We identified a complete set of biomass depolymerizing enzymes in the draft genome of Thermomonospora sp. CIT 1, such as α-amylase, catalase-peroxidases, β-mannanase, and arabinanase, demonstrating the potential of this...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Pectin; Hemicellulose; Crystalline cellulose; Orthologous genes.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572019000100145
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Draft genome sequence of Streptomyces sp. strain F1, a potential source for glycoside hydrolases isolated from Brazilian soil BJM
Melo,Ricardo Rodrigues de; Persinoti,Gabriela Felix; Paixão,Douglas Antonio Alvaredo; Squina,Fábio Márcio; Ruller,Roberto; Sato,Helia Harumi.
ABSTRACT Here, we show the draft genome sequence of Streptomyces sp. F1, a strain isolated from soil with great potential for secretion of hydrolytic enzymes used to deconstruct cellulosic biomass. The draft genome assembly of Streptomyces sp. strain F1 has 69 contigs with a total genome size of 8,142,296 bp and G + C 72.65%. Preliminary genome analysis identified 175 proteins as Carbohydrate-Active Enzymes, being 85 glycoside hydrolases organized in 33 distinct families. This draft genome information provides new insights on the key genes encoding hydrolytic enzymes involved in biomass deconstruction employed by soil bacteria.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Glycoside hydrolases; Streptomyces; Draft genome sequence; Soil bacteria.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822017000400612
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Effect of nickel in the degradation of oil in soils contaminated with petroleum and nickel. Repositório Alice
TAKETANI, N. F.; TAKETANI, R. G.; LEITE, S. G. F.; MELO, I. S. de; LIMA-RIZZO, A. C.; ANDREOTE, F. D.; CUNHA, C. D. da.
Abstract: The pollution originated from the petrochemical industry is currently one of the main environmental concerns. Most of this is due to the high volume of toxic hydrocarbons that are produced and transported around the globe. However, this industry is also associated with toxic metals that are minor components of petroleum and used during refining processes. Here we have evaluated the impact of nickel in the biodegradation of crude oil in natural soils. We have assessed bacterial community profiles in these samples using ion torrent 16S rRNA gene sequencing and Real-Time PCR quantification and shotgun metagenome sequencing. We have found that the contamination with oil and nickel reduced the bacterial abundance compared with only soil. There was...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Metagenome; Metal contamination; Hydrocarbon remediation; Contaminação; Poluição do Solo; Petróleo; Níquel; Bactéria; Metagenomics; Soil pollution; Petroleum; Actinobacteria; Decontamination.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125486
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Effect of sulfonylurea tribenuron methyl herbicide on soil Actinobacteria growth and characterization of resistant strains BJM
Rachedi,Kounouz; Zermane,Ferial; Tir,Radja; Ayache,Fatima; Duran,Robert; Lauga,Béatrice; Karama,Solange; Simon,Maryse; Boulahrouf,Abderrahmane.
ABSTRACT Repeated application of pesticides disturbs microbial communities and cause dysfunctions on soil biological processes. Granstar® 75 DF is one of the most used sulfonylurea herbicides on cereal crops; it contains 75% of tribenuron-methyl. Assessing the changes on soil microbiota, particularly on the most abundant bacterial groups, will be a useful approach to determine the impact of Granstar® herbicide. For this purpose, we analyzed Actinobacteria, which are known for their diversity, abundance, and aptitude to resist to xenobiotic substances. Using a selective medium for Actinobacteria, 42 strains were isolated from both untreated and Granstar® treated soils. The number of isolates recovered from the treated agricultural soil was fewer than that...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bacterial diversity; Actinobacteria; Granstar® herbicide; Resistance; 16S rRNA genes.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822018000100079
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Identificação de actinobacterias patogênicas em queijo por PCR e MALDI-TOF. Repositório Alice
BACANELLI, G. M.; LEGUIZAMON, G. O. de C.; OLARTE, L.; VERBISCK, N. V.; SILVA, M. R.; ARAUJO, F. R..
No Brasil é comum o consumo de queijo do tipo Minas artesanal produzido a partir de leite cru, contudo este fato pode representar risco para a saúde pública, pois muitos microorganismos patogênicos têm sido identificados nestes produtos. O objetivo deste trabalho foi identificar actinobactérias patogênicas em queijo por métodos de PCR e MALDI-TOF. Foram analisadas 54 amostras de queijo tipo Minas oriundos da região do Serro de Minas Gerais, Brasil.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Leite; Saúde Pública; Bactéria Patogênica; Gene; Queijo de Minas; Actinobacteria.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1098794
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Identification and in vitro antagonistic activity of actinobacteria against Pantoea ananatis, the causal agent of maize white spot disease. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. M. D.; LANA, U. G. P.; FIGUEIREDO, J. E. F.; ABREU, C. S.; OLIVEIRA-PAIVA, C. A.; COTA, L. V.; GOMES, E. A.; STOIANOFF, M. A. R.; MARRIEL, I. E..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Doença foliar; Doença de planta; Controle biológico; Actinomiceto; Biological control; Foliar diseases; Actinobacteria.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078781
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In vitro evaluation of novel crude extracts produced by actinobacteria for modulation of ruminal fermentation R. Bras. Zootec.
Alves,Bruna Gomes; Martins,Cristian Marlon de Magalhães Rodrigues; Peti,Ana Paula Ferranti; Moraes,Luiz Alberto Beraldo de; Santos,Marcos Veiga dos.
ABSTRACT We evaluated the inclusion of two crude extracts produced by Streptomyces genus on in vitro dry matter and organic matter digestibility (IVDMD; IVOMD), cumulative gas production, volatile fatty acids (VFA), and methane (CH4) and ammoniacal nitrogen (NH3-N) concentration. The experimental design was randomized blocks with three blocks and four treatments: AMC (1.2 mg/25 mL ruminal inoculum), Caat (1.2 mg/25 mL ruminal inoculum), negative control (no inclusion of extracts), and positive control (sodium monensin, 1.7 mg/25 mL ruminal inoculum). Ruminal fluid samples were collected from three multiparous Holstein dairy cows fitted with ruminal cannula and incubated in a 24-h fermentation assay. There was no effect of crude extract inclusion in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Extracts; In vitro fermentation; Monensin.
Ano: 2019 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982019000100721
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Influência da temperatura e meios de cultura na atividade antimicrobiana produzida por actinobactérias isoladas da rizosfera de Licania rigida Benth da caatinga nordestina - Brasil. Repositório Alice
COSTA, E. P.; SOARES, E. C. de L.; LUCIO, D. F.; GODOY, M. F.; MELO, I. S. de; ARAÚJO, J. M.; PORTO, A. L. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Influência da temperatura; Antimicrobial agents.; Caatinga; Rizosfera; Temperatura; Actinobacteria; Licania..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/917617
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Microrganismos endofíticos de mandioca de áreas comerciais e etnovariedades em três estados brasileiros PAB
Teixeira,Manoel Araújo; Melo,Itamar Soares de; Vieira,Rosana Faria; Costa,Francisco Eduardo Carvalho; Harakava,Ricardo.
O objetivo deste trabalho foi realizar um levantamento da diversidade de microrganismos endofíticos, em plantas de mandioca (Manihot esculenta Crantz) coletadas de áreas comerciais, no Estado de São Paulo, e de etnovariedades dos estados do Amazonas e Bahia e, também, avaliar seu potencial para fixar N atmosférico e para produzir ácido indolacético. Nos três estados, foram identificadas 47 espécies de microrganismos pertencentes a 27 gêneros. Bacillus spp. foi o mais freqüente em todas as regiões. O maior número de gêneros foi encontrado em plantas provenientes do Estado do Amazonas, que apresenta a maior diversidade de microrganismos endofíticos. Amplificações por PCR do gene nifH foram avaliadas em espécies bacterianas pertencentes às...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Manihot esculenta; Bacillus; Actinobacteria; Fixação de nitrogênio; Ácido indolacético.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2007000100006
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Physiological response to Nickel in bacteria isolated from Cerrado serpentine soil. Repositório Alice
COSTA, F. S.; COSTA, R. A. da; PESSOA-FILHO, M. A. C. de P.; BARRETO, C. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Solos serpentinos; Tolerância à metais pesados; Genetic resistence.; Niquel; Solo; Resistência genética; Cerrado; Nickel; Serpentine soils; Metal tolerance; Actinobacteria; Savannas; Brazil..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1036917
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Potenciais metabólitos secundários em Streptomyces cavourensis SOL153 isolada de sedimentos do Rio Solimões. Repositório Alice
CALDAS, L. F. G. de S.; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A. de; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da.
O gênero Streptomyces, pertencente a classe Actinobacteria, que destaca-se por ser uma fonte de moléculas bioativas com diversas atividades já reportadas como: anticâncer, antioxidante, anti- alzheimer e principalmente antimicrobiana de uso clínico e agrícola (1;2). Vários estudos têm demonstrado o potencial deste gênero no desenvolvimento de produtos voltados ao biocontrole e promoção de crescimento de plantas (2;3). Apesar de Streptomyces spp. ser amplamente estudado do ponto de vista químico, representantes desse gênero continuam sendo fonte de descoberta de novas moléculas, principalmente com o avanço dos estudos guiados por genoma completo e desbloqueio de vias biossintéticas relacionadas ao metabolismo secundário (4;5). Nesse contexto, o presente...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Mineração genômica; Streptomyces; Actinobacteria.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1141105
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Potential for biocontrol of melanized fungi by actinobacteria isolated from intertidal region of Ilha Do Mel, Paraná, Brazil BJM
Dalitz,Camila de Araújo; Porsani,Mariana Vieira; Figel,Izabel Cristina; Pimentel,Ida C.; Dalzoto,Patrícia R..
Abstract Actinobacteria occur in many environments and have the capacity to produce secondary metabolites with antibiotic potential. Identification and taxonomy of actinobacteria that produce antimicrobial substances is essential for the screening of new compounds, and sequencing of the 16S region of ribosomal DNA (rDNA), which is conserved and present in all bacteria, is an important method of identification. Melanized fungi are free-living organisms, which can also be pathogens of clinical importance. This work aimed to evaluate growth inhibition of melanized fungi by actinobacteria and to identify the latter to the species level. In this study, antimicrobial activity of 13 actinobacterial isolates from the genus Streptomyces was evaluated against seven...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Actinobacteria; Melanized fungi; Antimicrobial activity; 16S rDNA.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822017000100032
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