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Análise de agrupamento de dados de expressão gênica na Rede Genômica Animal. 14
HIGA, R. H.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; IBELLI, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; CARDOSO, F. F..
O objetivo deste trabalho é apresentar a análise de agrupamento de dados de expressão gênica, conforme realizada no escopo da ?Rede Genômica Animal?. Na seção 2, são apresentados conceitos básicos sobre análises de agrupamento. Em particular, os algoritmos de agrupamento utilizados nessas análises compreendem aqueles mais conhecidos, como k-means, SOM e agrupamento hierárquico. A plataforma de análise escolhida para realização das análises de agrupamento na ?Rede Genômica Animal? é o ambiente de análise estatística R (R DEVELOPMENT CORE TEAM, 2010) e o projeto Bioconductor (GENTLEMAN et al., 2004). Assim, na seção 3 é apresentado um exemplo completo de análise de agrupamento e seu respectivo script R.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Agrupamento de dados; Expressão gênica; Rede Genômica Animal; Análise de componentes principais; PCA; Análise Estatística; Gene expression; Algorithms; Statistical analysis; Principal component analysis.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/883623
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Estudo da função Gama e mapa auto-organizável como metodologia para validação e imputação de precipitação diária em séries temporais de estações meteorológicas. 14
MANCINI, A. L.; VICTORIA, D. de C..
Resumo - O uso da função Gama e de mapas auto-organizáveis são métodos descritos na literatura para compreensão do regime pluviométrico de uma região. Este trabalho relata o estudo destas ferramentas para validação e imputação de precipitação diária em séries históricas diárias de 18 estações meteorológicas em localidades diversas do Brasil. A função Gama não se mostrou eficaz para este propósito e o mapa auto-organizável teve resultados muito próximos comparados com o uso da média da precipitação. Mas considerando que é possível alterar o tamanho do mapa e incluir variações no vetor de entrada dos dados, novos estudos são necessários para verificar se é possível melhorar os resultados.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Métodos estatísticos; Agrupamento de dados; Precipitação; Validação de precipitação; Função Gama; Mapas auto-organizáveis; Precipitation validation; Statistical methods; Data clustering; Gamma function; Self-organizing maps.
Ano: 2023 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1163381
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