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A fast PCR assay to identify Meloidogyne hapla, M. chitwoodi, and M. fallax, and to sensitively differentiate them from each other and from M. incognita in mixtures IRD
Zijlstra, C..
Des fragments préalablement amplifiés de rDNA-ITS de #Meloidogyne chitwoodi$, #M. fallax$, #M. hapla$ et #M. incognita$ ont été clonés et séquencés. L'alignement des séquences montre une variabilité faible dans les parties codantes et quelque variabilité dans la région ITS1. La plus importante variabilité est observée dans la région ITS2. Les séquences ont été utilisées pour établir les amorces "sens" H-18S, I-ITS et CF-ITS, lesquelles en combinaison avec l'amorce "anti-sens" HCFI28S ont été utilisées pour l'amplification spécifique de #M. hapla$, #M. incognita$, #M. chitwoodi$ et #M. fallax$, respectivement. Il en résulte un polymorphisme de taille des fragments distinguant les quatre espèces. Lorsque les quatre amorces sont utilisées pour une unique...
Tipo: Text Palavras-chave: NEMATODE PHYTOPARASITE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; DIAGNOSTIC; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE.
Ano: 1997 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010012351
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A molecular diagnostic for endosulfan insecticide resistance in the coffee berry borer Hypothenemus hampei (Coleoptera : Scolytidae) IRD
Ffrench-Constant, R.H.; Steichen, J.C.; Brun, Luc-Olivier.
Tipo: Text Palavras-chave: INSECTE NUISIBLE; INSECTICIDE CHIMIQUE; RESISTANCE; GENE; TEST; BIOLOGIE MOLECULAIRE; DIAGNOSTIC; CAFEIER; ENDOSULFAN; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE; RECOMMANDATION.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39830
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A rapid method for sequencing of rRNA gene(s) amplified by polymerase chain reaction using an automated DNA sequencer IRD
Dwivedi, P.P.; Patel, B.K.C.; Rees, G.N.; Ollivier, Bernard.
A method for DNA sequencing of ribosomal RNA (rRNA) genes, amplified by polymerase chain reaction (PCR), using internal primers, designed on the basis of conserved regions of rRNA genes for determining a near complete sequence (99%) of the gene using an automated DNA sequencer (Applied Biosystem Incorporation, USA) is described. The procedure is extremely rapid as cloning of the gene is not required for sequence determination. In addition time consuming steps such as ethanol precipitation and hazardous steps such as phenol/chloroform extractions are excluded from the protocol for the purification of extension products after Taq cycle sequencing using the ABI dye terminator chemistry. The method has been successfully used for sequencing of the 16S and 18S...
Tipo: Text Palavras-chave: BIOLOGIE MOLECULAIRE; GENE; ARN; METHODE D'ANALYSE; PCR.REACTION DE POLYMERISATION EN CHAINE.
Ano: 1996 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010009566
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Acquérir une connaissance par abstraction et explication IRD
Mephu Nguifo, E..
Le but de ce papier est de montrer l'importance de l'explication dans une stratégie de recherche d'abstraction, et de façon duale de l'abstraction pour la construction d'explications. La production d'abstraction s'appuie sur la structure de treillis de Galois et sur des mécanismes de raisonnement empirique et analogique. Nous nous basons sur la notion d'objection pour bâtir les explications compréhensibles par l'usager et qui de plus vont lui permettre d'interagir avec le système de manière très précise pour éventuellement valider ou refuter l'explication produite, et par conséquent l'abstraction construite. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: INTELLIGENCE ARTIFICIELLE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; ABSTRACTION; CONNAISSANCE; EXPLICATION; APPRENTISSAGE AUTOMATIQUE.
Ano: 1994 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:40901
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Adipose tissue transcriptomic signature highlights the pathological relevance of extracellular matrix in human obesity IRD
Henegar, C.; Tordjman, J.; Achard, V.; Lacasa, D.; Cremer, I.; Guerre-Millo, M.; Poitou, C.; Basdevant, A.; Stich, V.; Viguerie, N.; Langin, D.; Bedossa, P.; Zucker, Jean-Daniel; Clement, K..
Tipo: Text Palavras-chave: MALADIE NUTRITIONNELLE; OBESITE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; METABOLISME; PHENOTYPE; ARN; CYTOLOGIE; EXPRESSION DES GENES; MICROESSAI; TECHNIQUE PCR; FIBROSE; TRANSCRIPTION; TISSU ADIPEUX.
Ano: 2008 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010049779
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ANAIS: Analysis of nimbleGen array interface Inra
Simon, A.; Biot, E..
ANAIS is a user-friendly web-based tool for the processing of NimbleGen expression data. The interface reads single-channel microarray files generated by NimbleGen platforms and produces easily interpretable graphical and numerical results. It provides biologists six turnkey analysis modules—normalization, probe to gene, quality controls, differential expression, detection, queries and clustering—to explore quickly, freely and without the need for computer programming, NimbleGen transcriptome data.
Tipo: Journal Article Palavras-chave: BIOLOGIE MOLECULAIRE; ANALYSE; BASE DE DONNES; EXPRESSION DES GENES; QUALITE DES GENES; PUCE A ADN; PUCE A GENES TRANSCRIPTOME; ANALYSIS; MICROARRAY; NIMBLEGEN.
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20107e986ff&uri=/notices/prodinra1/2010/11/
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Analyse moléculaire du génome du caféier Arabica : relations avec la valorisation des ressources génétiques IRD
Lashermes, Philippe; Combes, Marie-Christine; Herrera, J.C.; Noir, S.; Prakash, N.S.; Topart, P.; Anthony, F..
Tipo: Text Palavras-chave: AMELIORATION DES PLANTES; AMELIORATION GENETIQUE; CAFE; RESSOURCES GENETIQUES; ANALYSE GENETIQUE; GENOME; PHYLOGENIE; HEREDITE; RESISTANCE; MALADIE DES PLANTES; HYBRIDATION INTERSPECIFIQUE; BIOLOGIE MOLECULAIRE.
Ano: 2001 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010028489
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Applications of molecular genetics in apomixis research IRD
Grimanelli, Daniel; Tohme, J.; Gonzalez-de-Leon, D..
Tipo: Text Palavras-chave: APOMIXIE; REPRODUCTION ASEXUEE; ANALYSE GENETIQUE; BIOLOGIE MOLECULAIRE.
Ano: 2001 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010026312
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Apport de la biologie moléculaire en acarologie appliquée à l'agronomie IRD
Navajas, M.; Perrot-Minnot, M.J.; Gutierrez, Jean.
La contribution des techniques de la biologie moléculaire en Acarologie est présentée sur la base de résultats obtenus chez les acariens phytophages et prédateurs de phytophages. Différentes situations biologiques sont abordées : identification précise des espèces, élaboration de phylogénies, estimation de la variabilité génétique d'une espèce de prédateur utilisé en lutte biologique. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: ACARIEN PHYTOPHAGE; ACARIEN PREDATEUR; AGRONOMIE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; PHYLOGENIE; VARIABILITE GENETIQUE; LUTTE BIOLOGIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41755
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Apport de la génétique des populations au problème du typage des souches de parasites IRD
Tibayrenc, Michel; Ben Abderrazak, Souha.
Tipo: Text Palavras-chave: GENETIQUE DE POPULATION; AGENT PATHOGENE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; SPECIATION; TYPOLOGIE; THEORIE; TAXONOMIE BIOCHIMIQUE; MODELE CLONAL; MODELE PANMICTIQUE; DISCUSSION.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:39075
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Approche histopathologique de la résistance du riz (Oryza sativa) au virus de la panachure jaune (RYMV) IRD
Lett, Jean-Michel.
Tipo: Text Palavras-chave: PATHOLOGIE VEGETALE; VIROSE; BIOLOGIE DU PARASITE; RELATION HOTE PARASITE; RESISTANCE DE L'HOTE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; CYTOLOGIE; TEST ELISA; MICROSCOPIE ELECTRONIQUE; FLUORESCENCE; VIRUS DE LA PANACHURE JAUNE.
Ano: 1997 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010014938
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Biodiversité intraspécifique : étude de quatre populations de l'acarien vert du manioc, Mononychellus progresivus (Acari : Tetranychidae) par la biologie moléculaire et par croisements IRD
Navajas, M.; Gutierrez, Jean; Bonato, Olivier; Bolland, H.R.; Mapangou-Divassa, S..
La biodiversité de quatre populations de l'acarien vert du manioc #Mononychellus progresivus$ Doreste, récoltées au Bénin et au Congo d'une part, en Colombie et au Brésil d'autre part, a été étudiée en se basant sur l'analyse de séquences d'ADN mitochondrial et ribosomique, ainsi que sur les résultats de plusieurs croisements. Les deux populations africaines paraissent identiques. Elles semblent proches de celle de Colombie, alors que celle du Brésil est plus éloignée. (Résumé d'auteur)
Tipo: Text Palavras-chave: INSECTE NUISIBLE; ACARIEN PHYTOPHAGE; MANIOC; BIOLOGIE MOLECULAIRE; COMPARAISON INTRASPECIFIQUE; CROISEMENT; BIODIVERSITE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:41757
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Biologie moléculaire du pouvoir pathogène des champignons IRD
Lebrun, M.H..
Tipo: Text Palavras-chave: MALADIE DES PLANTES; CHAMPIGNON PARASITE; POUVOIR PATHOGENE; GENETIQUE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; RELATION HOTE PARASITE; INFESTATION.
Ano: 1995 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:43226
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Cartographie génétique du mil IRD
Peigne, M.T.; Enjalbert, J.; Robert, T.; Ricroch, A.; Lespinasse, R.; Sandmeier, M.; Sarr, A..
Tipo: Text Palavras-chave: MIL; DOMESTICATION DES PLANTES; PLANTE CULTIVEE; PLANTE SAUVAGE; MORPHOLOGIE; POLYMORPHISME; DISTANCE GENETIQUE; METHODOLOGIE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; RFLP.RESTRICTION FRAGMENT LENGHT POLYMORPHISM; MARQUEUR ENZYMATIQUE; CARTOGRAPHIE GENETIQUE; MARQUEUR GENETIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:38956
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Characterization of an antennal carboxylesterase from the pest moth Spodoptera littoralis degrading a host plant odorant Inra
Durand, N.; Carot-Sans, G.; Chertemps, T.; Bozzolan, F.; Party, V.; Renou, M.; Debernard, S.; Rosell, G.; Maïbèche-Coisne, M..
Background: Carboxyl/cholinesterases (CCEs) are highly diversified in insects. These enzymes have a broad range of proposed functions, in neuro/developmental processes, dietary detoxification, insecticide resistance or hormone/ pheromone degradation. As few functional data are available on purified or recombinant CCEs, the physiological role of most of these enzymes is unknown. Concerning their role in olfaction, only two CCEs able to metabolize sex pheromones have been functionally characterized in insects. These enzymes are only expressed in the male antennae, and secreted into the lumen of the pheromone-sensitive sensilla. CCEs able to hydrolyze other odorants than sex pheromones, such as plant volatiles, have not been identified. Methodology: In...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: LEPIDOPTERA; NOCTUIDAE; HEXAPODA; PCR; ADNC; SDS PAGE; EXPRESSION DES GENES; ELECTROPHORESE; CARBOXYLESTERASE; SPODOPTERA LITTORALIS; OLFACTION; ODEEUR; PLANTE HOTE; INSECTE; ENZYME; BIOLOGIE MOLECULAIRE; BIOCHIMIE; ELECTROPHYSIOLOGIE; PHEROMONE; PHEROMONE SEXUELLE; RECOMBINAISON; PROTEINE.
Ano: 2010 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2010229c7cd1&uri=/notices/prodinra1/2011/05/
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Chloroplast DNA isolation from higher plants : an improved non-aqueous method IRD
Dally, A.M.; Second, Gérard.
Tipo: Text Palavras-chave: BIOLOGIE MOLECULAIRE; PLASTE; ADN; ISOLEMENT.
Ano: 1989 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010008071
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Comparaison de l’efficacité et de la spécificité de trois couples d’amorces à PCR pour l’étude des Planctomycetes en milieu lacustre Inra
Pollet, T.; Tadonléké, R.; Humbert, J.F..
Tipo: Meeting Paper Palavras-chave: PLANCTOMYCETES; LAC D'ANNECY; LAC DU BOURGET; ARN 16S; BIOLOGIE MOLECULAIRE.
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2009b5b3b053&uri=/notices/prodinra1/2009/11/
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Comparison of molecular patterns and virulence behaviour of potato cyst nematodes IRD
Fullaondo, A.; Salazar, A.; Barrena, E.; Ritter, E..
Sept populations de nématodes à kyste de la pomme de terre (#Globodera rostochiensis$ et #G. pallida$) ont été analysées au moyen de marqueurs provenant de fragments d'ADN amplifiés au hasard (RAPD), d'amorces de microsatellites amplifiés en chaîne par réaction de polymérase (PCR) et d'électrophorèse de protéines totales en deux dimensions sur gel. Un degré élevé de polymorphisme a été détecté chez tous les types de marqueurs. De plus, des réactions de virulence des populations et de l'hôte, de même qu'une interaction hautement significative entre ces deux variables, ont été observés. Les distances génétiques entre populations de nématodes, fondées sur les données moléculaires et les réactions de virulence ont été estimées. Des analyses en grappes ont été...
Tipo: Text Palavras-chave: NEMATODE PHYTOPARASITE; POMME DE TERRE; BIOLOGIE MOLECULAIRE; DISTANCE GENETIQUE; VIRULENCE.
Ano: 1997 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010012333
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Discrimination entre Heterodera carotae et H. cruciferae par l'électrophorèse (SDS PAGE) de protéines solubles extraites à partir de kystes individualisés IRD
Bossis, M..
Tipo: Text Palavras-chave: NEMATODE PHYTOPARASITE; IDENTIFICATION; BIOLOGIE MOLECULAIRE; PROTEINE; ELECTROPHORESE.
Ano: 1991 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:34702
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Diversité des gènes de résistance au sein du génome des caféiers (Coffea L.) : analyse génétique de la résistance au nématode à galles, Meloidogyne exigua chez C. arabica IRD
Noir, Sandra.
Tipo: Text Palavras-chave: CAFE; AMELIORATION GENETIQUE; RESISTANCE DE L'HOTE; NEMATODE PHYTOPARASITE; MECANISME DE RESISTANCE; GENE; GENOME; EVOLUTION; ANALYSE GENETIQUE; DIVERSITE GENETIQUE; TECHNIQUE PCR; BIOLOGIE MOLECULAIRE; TECHNIQUE AFLP.
Ano: 2002 URL: http://www.documentation.ird.fr/hor/fdi:010031148
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