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A genomewide association mapping study using ultrasound-scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle. Repositório Alice
SANTANA, M. H. A.; GOMES, R. da C.; BONIN, M. N..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Candidate genes; Genomewide association studies; Single nucleotide polymorphisms.; Bos Indicus.; Fat thickness; Ultrasonography..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030961
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A SNP in NEUROD1 is associated with production traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; NORONHA, C. T.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Candidate gene; Feed consuption.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/992509
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Análise haplotípica do gene ASAP1 associado com maciez de carne em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; THOLON, P.; MUDADU, M. de A.; BRESSANI, F. A.; REDE BIFEQUALI; REGITANO, L. C. de A..
A maciez da carne tem impacto importante na satisfação dos consumidores, portanto, o conhecimento da variação desta característica, assim como a prospecção de genes ou segmentos genômicos que influenciem a mesma, pode ajudar no desenvolvimento de critérios quantitativos e moleculares para seleção de bovinos de corte. A análise haplotípica com os SNPs do gene ASAP1 representados no Illumina BovineHD BeadChip mostram que estes marcadores estão associados com força de cisalhamento medida após 7 dias de maturação da carne nessa população da raça Nelore. A validação desses resultados em outras populações poderá contribuir para inclusão desses marcadores em programas de melhoramento da raça Nelore.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gene candidato; Força de cisalhamento.; Bos Indicus..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943060
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Assessment of autozygosity in Nellore cows (Bos indicus) through high-density SNP genotypes. Repositório Alice
ZAVAREZ, L. B.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S.; NEVES, H. H.; CARVALHEIRO, R.; FERENCAKOVIC, M.; O'BRIEN, A. M. P.; CURIK, I.; COLE, J. B.; TASSELL, C. P. V.; SILVA, M. V. G. B.; SONSTEGARD, T. S.; SÖLKNER, J.; GARCIA, J. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Fertility; Runs of homozygosity; Selection.; Bos Indicus.; Cattle; Disease resistance..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1036982
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Avaliação de testes estatísticos em dados de Q-PCR. Repositório Alice
CARVALHO, F. M.; BARIONI JUNIOR, W.; NAKATA, L. C.; REGITANO, L. C. de A..
A Q-PCR (Quantitative Polymerase Chain Reaction) é uma técnica que permite quantificar de forma precisa, especifica e indireta a quantidade de RNA mensageiro presente em uma determinada amostra. A Q-PCR apresenta vantagens metodológicas para a quantificação do RNA mensageiro quando comparada às técnicas de Northern Blot e Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, facilitando estudos de expressão gênica diferenciada. No entanto, experimentos de Q-PCR freqüentemente apresentam limitações amostrais (6= N =12) e são analisados por testes estatísticos tradicionais (paramétricos) sem a devida verificação da condição de normalidade da variável resposta e de homogeneidade das variâncias dos grupos experimentais, exigidas nesses testes. O presente trabalho...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Q-PCR; Estatística não paramétrica; Bovinos.; Boophilus Microplus; Bos Indicus.; Rhipicephalus..
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/48710
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Candidate genes for procution traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, R.; MEIRELLES, S. L.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A..
Meat quality is an important trait for the beef industry. Backfat thickness, ribeye area, and shear force are traits measured late in life, and the investigation of molecular markers associated with these traits can help breeding programs. In cattle, some polymorphisms have been related to production traits. Thus, the purpose of this study was to assess the presence of polymorphisms in the candidate genes insulin-like growth factor 1 (IGF1), fatty acid-binding protein 4 (FABP4), and peroxisome proliferative active receptor gamma coactivator 1 A (PPARGC1A) and associate them with production traits in reference families of Nelore cattle. We used 270 steers descendent from 20 sires that were chosen to represent variability in this breed. The investigation of...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polymorphisms; Bovino de Corte.; Melhoramento genético animal; Gado de corte; Bos Indicus.; Insulin-like growth factor I..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/948638
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Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A.; REDE BIFEQUALI.
A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação; Genotipagem; REHH; Snps.; Bos Indicus..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943057
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Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
SOMAVILLA, A. L.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. de A.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Desequilíbrio de ligação; Genotipagem.; Bos Indicus.; Zebu; Genotype; Single nucleotide polymorphism; Linkage disequilibrium.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946719
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Efeito da estimulação ovariana na quantidade e qualidade de ovócitos obtidos por aspiração folicular transvaginal em novilhas Nelore. Repositório Alice
DIESEL, T. O..
O objetivo deste estudo foi avaliar o efeito da estimulação ovariana na quantidade e qualidade de ovócitos obtidos por aspiração folicular transvaginal (OPU) em novilhas Nelore. Foram utilizadas 27 novilhas cíclicas da raça Nelore, sendo que todos os animais passaram pelos três tratamentos em delineamento "cross-over". Os animais foram sincronizados e no D6 após a manifestação do cio foi realizada a ablação dos folículos 2: 5mm de diâmetro, com colocação de implante intravaginal de progesterona e aplicação de prostaglandina F2a,. Nos animais do grupo controle (Te) a OPU foi realizada no D12 após estro; no grupo SOV-LH (TI) no D8 após estro teve início a administração de FSH (162 UI-PLUSET ®) em 6 doses decrescentes de 12 em 12 horas, e a OPU foi realizada...
Tipo: Teses Palavras-chave: Estimulação hormonal; OPU; Quantidade e qualidade ovocitária; Produção in vitro; Fecundação in vitro.; Bos Indicus..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/882859
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Effects of quantitative trait loci on iron content of bovine longissimus dorsi muscle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; TAYLOR, J. F.; DECKER, J. E.; GROMBONI, C. F.; MUDADU, M. de A.; SCHNABEL, R. D.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; NASSU, R. T.; DONATONI, F. A. B.; THOLON, P.; SONSTEGARD, T. S.; ALENCAR, M. M. de; TULLIO, R. R.; REECY, J. M.; NOGUEIRA, A. R. de A.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Fe; GWAS.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/997999
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Estimativas de parâmetros genéticos para altura do posterior, peso e circunferência escrotal em bovinos de raça Nelore. Repositório Alice
YOKOO, M. I.; ALBUQUERQUE, L. G. de; LÔBO, R. B.; SAINZ, R. D.; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; BEZERRA, L. A. F.; ARAÚJO, F. R. da C..
Visando estimar parâmetros genéticos em bovinos, foram utilizados registros de pesos padronizados aos 120, 210, 365, 450 e 550 dias de idade (P120, P210, P365, P450 e P550), altura do posterior mensurada próxima ao sobreano (ALT) e circunferências escrotais (CE) padronizadas aos 365, 450 e 550 dias de idade (CE365, CE450 e CE550). Os dados foram provenientes de animais machos e fêmeas, nascidos entre 1998 e 2003 em dez fazendas de seis estados brasileiros. Os componentes de (co)variância foram estimados pela metodologia REML em análises uni, bi e trivariadas, utilizando-se modelos animal. As estimativas de herdabilidade do efeito direto com os respectivos erros-padrão foram: ALT 0,63 (0,09), P120 0,25 (0,03), P210 0,34 (0,03), P365 0,45 (0,04), P450 0,48...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Metologia REML; Circunferência escrotal; Altura do posterior; Correlação genética; Raza de bovinos Nelore.; Escroto; Cruce de animales; Ganado de carne; Peso (masa); Gado de corte; Gado Nelore; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Peso; Bos Indicus.; Beef cattle; Nellore; Animal breeding; Weight; Scrotum; Genetic correlation..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/505266
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Genes diferencialmente expressos no músculo Longissimus dorsi de novilhos nelore divergentes para eficiência bruta. Repositório Alice
SILVA, J. V. da; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; SOUZA, M. M. de; ROCHA, M. I. P.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: RNA-seq; Eficiência alimentar.; Bos Indicus..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1054252
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Genomic variants revealed by invariably missing genotypes in nelore cattle. Repositório Alice
SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B..
High density genotyping panels have been used in a wide range of applications. From population genetics to genome-wide association studies, this technology still offers the lowest cost and the most consistent solution for generating SNP data. However, in spite of the application, part of the generated data is always discarded from final datasets based on quality control criteria used to remove unreliable markers. Some discarded data consists of markers that failed to generate genotypes, labeled as missing genotypes. A subset of missing genotypes that occur in the whole population under study may be caused by technical issues but can also be explained by the presence of genomic variations that are in the vicinity of the assayed SNP and that prevent...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Sequenciamento de DNA.; Gado de corte; Bos Indicus.; Single nucleotide polymorphism; Sequence analysis; Cattle..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033982
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Global liver gene expression differences in Nelore steers with divergent residual feed intake phenotypes. Repositório Alice
TIZIOTO, P.; COUTINHO, L. L.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; ROSA, C. O.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOUZA, M. M.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; CHAVES, A. S.; LANNA, D. P. D.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. A..
Background: Efficiency of feed utilization is important for animal production because it can reduce greenhouse gas emissions and improve industry profitability. However, the genetic basis of feed utilization in livestock remains poorly understood. Recent developments in molecular genetics, such as platforms for genome-wide genotyping and sequencing, provide an opportunity to identify genes and pathways that influence production traits. It is known that transcriptional networks influence feed efficiency-related traits such as growth and energy balance. This study sought to identify differentially expressed genes in animals genetically divergent for Residual Feed Intake (RFI), using RNA sequencing methodology (RNA-seq) to obtain information from genome-wide...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Transcriptoma; Sequenciamento genético; Bioinformática; RFI; Feed efficiency.; Bos Indicus.; Zebu; Feed conversion; Transcriptomics; Bioinformatics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1034697
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miRNAs related to fatty acids composition in Nellore cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; OLIVEIRA, G. B. de; TIZIOTO, P. C.; POLETI, M. D.; DINIZ, W. J. da S.; LIMA, A. O. de; REECY, J. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gene regulation.; Bos Indicus.; Adipogenesis..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066405
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Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. Repositório Alice
SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. de A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Imprint; Neuronatin.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/997977
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MyoD1 expression levels affect meat tenderness in Nellore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; GASPARIN, G.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M.; MALAGO JUNIOR, W.; DONATONI, F. A. B.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: QPCR; Shear force; Gene expres.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/998063
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O papel do porco monteiro (Sus scrofa), do gado nelore (Bos indicus) e de pequenos mamíferos como hospedeiros para imaturos do carrapato Amblyomma cajennense no Pantanal Sul-Mato-Grossense. Repositório Alice
RAMOS, V. N.; PIOVEZAN, U.; FRANCO, A. H. A.; SZABÓ, M. P. J..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Pequenos mamíferos.; Amblyomma cajennense; Bos Indicus.; Sus scrofa.; Pantanal.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/927743
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Positional candidate genes for residual intake and gain in Nelore beef cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; NASCIMENTO, M. L. do; SOUZA, M. M.; TULLIO, R. R.; LANNA, D. P.; SONSTEGARD, T.; MOURÃO, G. B.; REECY, J. M.; GARRICK, D. J.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A.; COUTINHO, L. L..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Feed efficiency; SNPs.; Bos Indicus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/998065
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Produção de sêmen de touros mestiços Bos Taurus/Bos Indicus 4. Repetibilidade e correlações fenotípicas entre as características seminais Repositório Alice
ABREU, C. P. de; ELER, J. P.; BARBOSA, P. F.; BRUSCHI, J. H.; MADALENA, F. E.; BARBOSA, R. T.; JONDET, R..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Características seminais.; Sêmen; Bos Taurus; Bos Indicus..
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/45982
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