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A genomewide association mapping study using ultrasound-scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle. Repositório Alice
SANTANA, M. H. A.; GOMES, R. da C.; BONIN, M. N..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Candidate genes; Fat thickness; Genomewide association studies; Single nucleotide polymorphisms; Ultrasonography.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1030961
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A SNP in NEUROD1 is associated with production traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice
OLIVEIRA, P. S. N. de; TIZIOTO, P. C.; NORONHA, C. T.; MALAGO JUNIOR, W.; MUDADU, M. de A.; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Candidate gene; Feed consuption.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/992509
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Accuracy of genomic selection predictions for hip height in Brahman cattle using different relationship matrices PAB
Farah,Michel Marques; Fortes,Marina Rufino Salinas; Kelly,Matthew; Porto-Neto,Laercio Ribeiro; Meira,Camila Tangari; Carreño,Luis Orlando Duitama; Fonseca,Ricardo da; Moore,Stephen Stewart.
Abstract: The objective of this work was to evaluate the effects of genomic information on the genetic evaluation of hip height in Brahman cattle using different matrices built from genomic and pedigree data. Hip height measurements from 1,695 animals, genotyped with high-density SNP chip or imputed from 50 K high-density SNP chip, were used. The numerator relationship matrix (NRM) was compared with the H matrix, which incorporated the NRM and genomic relationship (G) matrix simultaneously. The genotypes were used to estimate three versions of G: observed allele frequency (HGOF), average minor allele frequency (HGMF), and frequency of 0.5 for all markers (HG50). For matrix comparisons, animal data were either used in full or divided into calibration (80%...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Beef cattle; Genomics; Rare alleles.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2018000600717
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Ajuste de modelos não lineares no estudo de associação entre polimorfismos genéticos e o crescimento em bovinos de corte. Repositório Alice
PAZ, C. C. P. de; FREITAS, A. R.; PACKER, I. U.; TAMBASCO TALHARI, D.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de.
Foram utilizados dados de peso ao nascimento, ao desmame e mensais dos 8 aos 19 meses de idade de 11 classes de genótipos formadas pela concatenação dos polimorfismos genéticos da kappa-caseína-HinfI (CSN3): AA e AB, do hormônio do crescimento-AluI (GH): LL e LV e da b-lactoglobulina-HaeIII (LGB): AA, AB e BB. As informações foram obtidas de animais de três grupos genéticos: ½Canchim-Nelore (CN), ½Angus-Nelore (AN) e ½Simental-Nelore (SN), nascidos em 1998 e 1999 e pertencentes à Embrapa Pecuária Sudeste, São Carlos, SP. Dos cinco modelos estudados: Brody, Von Bertalanffy, Richards, Gompertz e Logístico, o último apresentou melhor qualidade do ajuste. As estimativas dos parâmetros A (valor assintótico), k (taxa de maturação) e m (ponto de inflexão) obtidas...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos taurus; Bos indicus; Curva de crescimento; Desenvolvimento ponderal; Modelo logístico; Marcadores genéticos.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46471
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Ajuste de modelos não-lineares em estudos de associação entre polimorfismos genéticos e crescimento em bovino de corte. Repositório Alice
PAZ, C. C. P. de; PACKER, I. U; FREITAS, A. R. de; TAMBASCO-TALHARI, D.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; CRUZ, G. M. da..
2004
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bos taurus; Bos indicus; Curvas de crescimento; Desenvolvimento ponderal; Marcadores genéticos; Modelo logistico.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46994
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Análise de haplótipos em QTL associado ao conteúdo de ferro no músculo de bovinos Nelore. Repositório Alice
DINIZ, W. J. da S.; TIZIOTO, P. C.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; SOUZA, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: ABC; Bos indicus; Blocos de haplótipos; Minerais; QTL; Bovino; Nelore.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002861
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Análise genética de peso em um rebanho de bovinos Nelore. Repositório Alice
PASSAFARO, T. L.; FRAGOMENI, B. de O.; GONÇALVES, D. R.; MORAES, M. M. de; TORAL, F. L. B..
O objetivo deste trabalho foi determinar os parâmetros genéticos para o peso de bovinos Nelore, do nascimento até 1.000 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória. Utilizaram-se 115.096 registros de peso de 19.417 animais. Os parâmetros genéticos foram obtidos por modelos de regressão aleatória via inferência bayesiana. A trajetória média de crescimento foi ajustada com um polinômio de Legendre quártico. O efeito genético aditivo direto foi ajustado com um polinômio quadrático de Legendre. Os efeitos de ambiente permanente direto e materno foram ajustados com polinômios de Legendre quíntico e quadrático, espectivamente. A variância residual foi modelada com três classes de idades. Os valores genéticos dos pesos, do nascimento até 1.000 dias...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Inferência bayesiana; Superfície de resposta; Bayesian inference; Genetic parameter; Bos indicus; Parâmetro genético; Seleção; Zebu.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1042279
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Análise genética do peso em um rebanho de bovinos Nelore PAB
Passafaro,Tiago Luciano; Fragomeni,Breno de Oliveira; Gonçalves,Daniel Resende; Moraes,Mariana Mamedes de; Toral,Fabio Luiz Buranelo.
Resumo: O objetivo deste trabalho foi determinar os parâmetros genéticos para o peso de bovinos Nelore, do nascimento até 1.000 dias de idade, por meio de modelos de regressão aleatória. Utilizaram-se 115.096 registros de peso de 19.417 animais. Os parâmetros genéticos foram obtidos por modelos de regressão aleatória via inferência bayesiana. A trajetória média de crescimento foi ajustada com um polinômio de Legendre quártico. O efeito genético aditivo direto foi ajustado com um polinômio quadrático de Legendre. Os efeitos de ambiente permanente direto e materno foram ajustados com polinômios de Legendre quíntico e quadrático, respectivamente. A variância residual foi modelada com três classes de idades. Os valores genéticos dos pesos, do nascimento até...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Inferência bayesiana; Parâmetro genético; Seleção; Superfície de resposta..
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016000200149
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Análise haplotípica do gene ASAP1 associado com maciez de carne em bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; THOLON, P.; MUDADU, M. de A.; BRESSANI, F. A.; REDE BIFEQUALI; REGITANO, L. C. de A..
A maciez da carne tem impacto importante na satisfação dos consumidores, portanto, o conhecimento da variação desta característica, assim como a prospecção de genes ou segmentos genômicos que influenciem a mesma, pode ajudar no desenvolvimento de critérios quantitativos e moleculares para seleção de bovinos de corte. A análise haplotípica com os SNPs do gene ASAP1 representados no Illumina BovineHD BeadChip mostram que estes marcadores estão associados com força de cisalhamento medida após 7 dias de maturação da carne nessa população da raça Nelore. A validação desses resultados em outras populações poderá contribuir para inclusão desses marcadores em programas de melhoramento da raça Nelore.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gene candidato; Força de cisalhamento; Bos indicus.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943060
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Assessment of autozygosity in Nellore cows (Bos indicus) through high-density SNP genotypes. Repositório Alice
ZAVAREZ, L. B.; UTSUNOMIYA, Y. T.; CARMO, A. S.; NEVES, H. H.; CARVALHEIRO, R.; FERENCAKOVIC, M.; O'BRIEN, A. M. P.; CURIK, I.; COLE, J. B.; TASSELL, C. P. V.; SILVA, M. V. G. B.; SONSTEGARD, T. S.; SÖLKNER, J.; GARCIA, J. F..
2015
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bos indicus; Cattle; Disease resistance; Fertility; Runs of homozygosity; Selection.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1036982
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Associação de polimorfismos de genes candidatos com características de crescimento em cruzamentos Bos taurus X Bos indicus. Repositório Alice
TAMBASCO, D. D.; PAZ, C. C. P.; TAMBASCO, M. D.; POZZI, A.; ALENCAR, M. M. de; FREITAS, A. R. de; COUTINHO, L. L.; PACKER, I. U.; REGITANO, L. C. de A..
2001
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Crescimento; Cruzamento; Polimorfismo; Bos taurus; Bos indicus.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46002
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Associações entre eficiência alimentar e comportamento ingestivo de touros da raça Nelore confinados em baias coletivas equipadas com cochos eletrônicos. Repositório Alice
SILVA, A. M. da; SILVA, L. O. C.; OKAMURA, V.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; FAVERO, R.; MENEZES, G. R. de O.; GOMES, R. da C..
Avaliou-se as associações entre características de desempenho e eficiência alimentar com o comportamento ingestivo de 309 touros da raça Nelore confinados em baias coletivas equipadas com cochos eletrônicos. Os animais receberam dieta contendo 70 % de nutrientes digestíveis totais e 14 % de proteína bruta por 56 dias para obtenção de dados de consumo de matéria seca e ganho de peso para o cálculo das medidas de eficiência alimentar. As variáveis comportamentais avaliadas foram: tempos totais no cocho (TT) e em alimentação (TA), visitas totais (VT), visitas com e sem consumo de alimentos (VA e VsA) e as taxas de alimentação por hora (Taxa/hr) e por visita (Taxa/v). Foram estimadas correlações de Pearson através do PROC CORR (SAS) a 5 % de significância. O...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Consumo alimentar residual; Peso corporal; Taxa de alimentação; Feed rate; Residual feed intake; Bos indicus; Gado zebu; Body weight; Zebu.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077426
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Associations among growth, scrotal circumference, and visual score of beef cattle in performance tests on pasture or in feedlots R. Bras. Zootec.
Raidan,Fernanda Santos Silva; Tineo,Juan Salvador Andrade; Moraes,Mariana Mamedes de; Escarce,Thiago Campos; Araújo,Andresa Eva Melo de; Gomes,Muller Marques de Carvalho; Ventura,Henrique Torres; Toral,Fabio Luiz Buranelo.
ABSTRACT This study aimed to evaluate associations among final weight (FW), average daily gain (ADG), scrotal circumference (SC), and visual score (VS) of beef cattle in performance tests on pasture or in feedlots. Genetic parameters for FW, ADG, SC, and VS of young Nellore bulls performance-tested on pasture or in feedlots were evaluated by mixed model. The performance test and final age were considered as fixed effects and additive genetic and residual effects were considered as random effects. Additive genetic and residual variances for final weight and average daily gain were smaller on pasture than in feedlots. There was no difference between genetic and residual variances and heritability for scrotal circumference on pasture or in feedlots. Genetic...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Genetic correlation; Heritability; Phenotypic selection.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982017000400309
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Avaliação de diferentes osmolaridades de soluções hiposmóticas e tempos de incubação no teste hiposmótico do sêmen de touros Nelore R. Bras. Zootec.
Martins,Leonardo Franco; Pinho,Rogério Oliveira; Paraizo,Renan Moreira; Oliveira,Renan Reis de; Castilho,Erick Fonseca; Guimarães,José Domingos.
O objetivo neste estudo foi avaliar diferentes osmolaridades e tempos de incubação durante o teste hiposmótico e suas correlações com a congelabilidade do sêmen de touros zebuínos. Foram utilizados 30 ejaculados de seis touros adultos da raça Nelore. No sêmen in natura foi feita avaliação física e morfológica, classificação quanto à coloração supravital e o teste hiposmótico. No teste hiposmótico foram utilizadas soluções com osmolaridades de 60, 100, 150 mOsm/kg e água destililada (19 mOsm/kg) om 15, 30 e 60 minutos de período de incubação a 37ºC. Após a criopreservação, as amostras foram descongeladas e avaliadas quanto aos testes hiposmótico, à coloração supravital, ao teste de termorresistência lento e à coloração fluorescente. Não foram detectadas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Criopreservação; Espermatozoide; Testes complementares.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000700017
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Avaliação de testes estatísticos em dados de Q-PCR. Repositório Alice
CARVALHO, F. M.; BARIONI JUNIOR, W.; NAKATA, L. C.; REGITANO, L. C. de A..
A Q-PCR (Quantitative Polymerase Chain Reaction) é uma técnica que permite quantificar de forma precisa, especifica e indireta a quantidade de RNA mensageiro presente em uma determinada amostra. A Q-PCR apresenta vantagens metodológicas para a quantificação do RNA mensageiro quando comparada às técnicas de Northern Blot e Reverse Transcription Polymerase Chain Reaction, facilitando estudos de expressão gênica diferenciada. No entanto, experimentos de Q-PCR freqüentemente apresentam limitações amostrais (6= N =12) e são analisados por testes estatísticos tradicionais (paramétricos) sem a devida verificação da condição de normalidade da variável resposta e de homogeneidade das variâncias dos grupos experimentais, exigidas nesses testes. O presente trabalho...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Q-PCR; Estatística não paramétrica; Bovinos; Bos indicus; Rhipicephalus; Boophilus microplus.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/48710
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Bases genética e evolutivas para a divergência das espécies de bovinos. Repositório Alice
BARBOSA, P. F..
As bases genética e evolutivas para a divergência entre as duas espécies de bovinos , Europeu e Zebu, são discutidas neste trabalho com base nas evidencias experimentais encontradas na literatura.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Base; Genetica; Europeu; Zebu; Bos Taurus; Bos indicus.
Ano: 1988 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/42111
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Bayesian random regression threshold models for genetic evaluation of pregnancy probability in Red Sindhi heifers. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. T. de; BONAFÉ, C. M.; SIVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; OLIVEIRA, H. R. de; MENEZES, G. R. de O.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S..
We proposed a Bayesian random regression threshold model for genetic evaluation of pregnancy probability (PP) in Red Sindhi heifers over different months. Since this breed was recently introduced in Brazil, the age of 14 months usually preconized for Nellore cattle may not reflect the reality of the fertility indicator. In this context, the pregnancy success was evaluated at other ages aiming to understand its genetic variability pattern over time. A total of 4828 phenotyped heifers belong to 657 contemporary groups were used for the analysis. The estimated connectedness was equal to 99.75% considering 6189 individuals in the final pedigree. The random regression threshold models were implemented by combining second, third and fourth order Legendre...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Heifer pregnancy; Legendre polynomials; Prenhez; Novilho; Bos indicus; Gado nelore; Zebu; Pedigree; Genetic heterogeneity.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077375
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Body chemical composition, tissue deposition rates and gain composition of young Nellore cattle selected for postweaning weight R. Bras. Zootec.
Bonilha,Eduardo Figueiredo Martins; Branco,Renata Helena; Bonilha,Sarah Figueiredo Martins; Araújo,Fabiana Lana de; Cyrillo,Joslaine Noely dos Santos Gonçalves; Magnani,Elaine.
Empty body and carcass chemical composition were determined in 67 Nellore bulls from Selection Nellore (NeS) and Control Nellore (NeC) herds of an animal breeding program for growth, slaughtered at 570 days of average age, after 100 days of feedlot. Selection Nellore animals had, respectively, 360 and 430 kg of initial and slaughter body weight, and NeC animals had 318 and 373 kg for the same traits. Animals were slaughtered and empty body composition was determined by chemical analysis of the components blood, hide, head and feet, viscera and carcass. Tissue deposition rates and gain chemical composition were also determined based on gains estimated by comparative slaughter technique. Significant differences were detected between NeS and NeC animals for...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Efficiency; Fat; Protein; Selection; Weight gain.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982014000400175
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Bovine herpesvirus type 1 in cumulus-oocyte complexes collected from naturally infected cows PAB
Oliveira,Andre Penido; Heinemann,Marcos Bryan; Cortez,Adriana; Nascimento,Paula Maria Pires do; Leite,Romulo Cerqueira; Viana,João Henrique Moreira.
Abstract: The objective of this work was to investigate the presence of bovine herpesvirus type 1 (BoHV-1) in follicular fluid and in cumulus-oocyte complexes (COC) recovered from naturally infected cows but with no clinical signs of the disease. Cows that were seropositive (n=38) or seronegative (n=8, control) to infectious bovine rhinotracheitis were selected after a serum neutralization test in microplates. The presence of the virus was investigated by PCR in COC and in follicular fluid. Viral DNA was not found in any of the samples. The obtained results suggest that serologically positive cows with no clinical signs of the disease offer negligible risk of transmitting BoHV-1 by COC or follicular fluid.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bos indicus; Follicular fluid; Infectious bovine rhinotracheitis virus; Transmission risk; Viral DNA..
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2016000500676
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Candidate genes for procution traits in Nelore beef cattle. Repositório Alice
TIZIOTO, R.; MEIRELLES, S. L.; TULLIO, R. R.; ROSA, A. do N.; MEDEIROS, S. R. de; SIQUEIRA, F.; FEIJO, G. L. D.; SILVA, L. O. C. da; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; REGITANO, L. C. de A..
Meat quality is an important trait for the beef industry. Backfat thickness, ribeye area, and shear force are traits measured late in life, and the investigation of molecular markers associated with these traits can help breeding programs. In cattle, some polymorphisms have been related to production traits. Thus, the purpose of this study was to assess the presence of polymorphisms in the candidate genes insulin-like growth factor 1 (IGF1), fatty acid-binding protein 4 (FABP4), and peroxisome proliferative active receptor gamma coactivator 1 A (PPARGC1A) and associate them with production traits in reference families of Nelore cattle. We used 270 steers descendent from 20 sires that were chosen to represent variability in this breed. The investigation of...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Polymorphisms; Bos indicus; Melhoramento genético animal; Bovino de corte; Gado de corte; Insulin-like growth factor I; Bos indicus.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/948638
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