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Approximate restricted maximum likelihood and approximate prediction error variance of the Mendelian sampling effect Inra
Boichard, D.; Schaeffer, L.R.; Lee, A.J..
Dans certaines procédures de Maximum de Vraisemblance Restreint (REML), l’estimation des composantes de (co)variance génétique implique le calcul de la trace du produit de l’inverse de la matrice des coefficients par l’inverse de la matrice de parentés, calcul qui constitue généralement le facteur limitant de ce type de procédure. Nous présentons dans cet article une méthode visant à obtenir une valeur approchée de cette trace dans le cadre d’un modèle animal, en utilisant un modèle équivalent basé sur l’aléa de méiose, en simplifiant sa matrice des coefficients et en en calculant une inverse approchée. Cette approximation est très précise lorsque l’héritabilité du caractère est faible mais elle tend à sous-estimer la trace vraie lorsque...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MAXIMUM DE VRAISEMBLANCE; HERITABILITE; VARIANCE GENETIQUE; MEIOSE; MODELE ANIMAL; COMPOSANTE DE LA VARIANCE; COMPOSANTE DE LA COVARIANCE.
Ano: 1992 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300032740033962&uri=/notices/prodinra1/2008/01/
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Estimation of genetic parameters of preweaning performance in the French Limousin cattle breed Inra
Shi, M.J.; Laloe, D.; Menissier, F.; Renand, G..
Les paramètres génétiques et environnementaux de la croissance avant sevrage et de la conformation au sevrage ont été estimés pour la race Limousine à partir des données du contrôle de performances en ferme. La méthode d’estimation de ces paramètres était la méthode tilde-chapeau de Van Raden et Jung (1988), avec un modèle père, grand-père maternel et mère intra-grand-père maternel. Les coefficients de parenté ont été inclus dans l’analyse. Les données analysées comprenaient 169 391 veaux avec performances nés entre 1972 et 1989, issus de 43 683 mères, 7 265 pères, 5 644 grand-pères maternels et 1 605 troupeaux. Les caractères considérés étaient : les poids à la naissance, à 120 j et à 210 j, les croissances de la naissance à 120 j, de 120 j à 210...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PERFORMANCE EN FERME; RACE BOVINE LIMOUSINE; CROISSANCE AVANT SEVRAGE; RACE BOVINE A VIANDE; EFFET DIRECT; PARAMETRE GENETIQUE; CONTROLE DE PERFORMANCE; COMPOSANTE DE LA VARIANCE; CONFORMATION; EFFET MATERNEL; VARIANCE PHENOTYPIQUE.
Ano: 1993 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300008807032583&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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Inference about multiplicative heteroskedastic components of variance in a mixed linear Gaussian model with an application to beef cattle breeding Inra
San Cristobal, M.; Foulley, J.L.; Manfredi, E..
Une méthode statistique est présentée, capable d’identifier les sources significatives d’hétérogénéité de variances résiduelles et génétiques dans un modèle linéaire mixte gaussien. La méthode est fondée sur un modèle structurel de décomposition du logarithme des variances. L’inférence concernant les paramètres de dispersion est basée sur la vraisemblance marginale obtenue après intégration des paramètres de position. Un test du rapport des vraisemblances utilisant la vraisemblance marginale est aussi proposé afin de tester des hypothèses sur différentes sources de variation. Une extension bayésienne de la procédure d’estimation des paramètres de dispersion est présentée; elle consiste en la maximisation de leur distribution marginale a posteriori,...
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MODELE LINEAIRE MIXTE; HETEROSCEDASTICITE; TECHNIQUE BAYESIENNE; COMPOSANTE DE LA VARIANCE; SELECTION.
Ano: 1993 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9500032262043068&uri=/notices/prodinra1/2007/11/
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On sire evaluation with uncertain paternity Inra
Foulley, J.L.; Thompson, R.; Gianola, D..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: PATERNITE INCERTAINE; ALGORITHME; REPRODUCTEUR; COMPOSANTE DE LA VARIANCE.
Ano: 1990 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PUB9300032566028477&uri=/notices/prodinra1/2007/12/
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