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A begomovirus is a putative causal agent of internerval chlorosis and curling in soybean leaves. Repositório Alice
TAVARES, M. L.; NAKASU, E. Y. T.; MICHEREFF FILHO, M..
2015
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Inseto; Praga; Mosca branca; Virus; DNA; Bean golden mosaic virus; Tomato spotted wilt virus.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031025
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A comparison of silver staining protocols for detecting DNA in polyester-backed polyacrylamide gel BJM
Qiu,Shanlian; Chen,Jichen; Lin,Si; Lin,Xinjian.
Eight silver-staining protocols were applied to detect DNA in polyester-backed gels to select the optimal. Results showed important differences in staining quality and that four methods were well-suited for TGGE gels due to high sensitivity and low background, including the Bassam et al. methods, the manufacturer method and our improved method.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Backed gel; DNA; Silver staining.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822012000200029
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A genômica na bovinocultura de corte. Repositório Alice
COUTINHO, L. L.; JORGE, E. C.; ROSÁRIO, M. F. do; REGITANO, L. C. de A..
Genômica: definição e conceito; Aplicações da genômica; Perspectivas das aplicações da genômica.
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Genômica; Melhoramento genético; DNA.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/862890
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A procedure to evaluate the efficiency of surface sterilization methods in culture-independent fungal endophyte studies BJM
Burgdorf,R.J.; Laing,M.D.; Morris,C.D.; Jamal-Ally,S.F..
Extraneous DNA interferes with PCR studies of endophytic fungi. A procedure was developed with which to evaluate the removal of extraneous DNA. Wheat (Triticum aestivum) leaves were sprayed with Saccharomyces cerevisiae and then subjected to physical and chemical surface treatments. The fungal ITS1 products were amplified from whole tissue DNA extractions. ANOVA was performed on the DNA bands representing S. cerevisiae on the agarose gel. Band profile comparisons using permutational multivariate ANOVA (PERMANOVA) and non-metric multidimensional scaling (NMDS) were performed on DGGE gel data, and band numbers were compared between treatments. Leaf surfaces were viewed under variable pressure scanning electron microscopy (VPSEM). Yeast band analysis of the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Endophyte; Fungi; DNA; Surface sterilization.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822014000300030
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A rare and unusual new bittiine genus with two new species from the South Pacific (Cerithiidae, Gastropoda) ArchiMer
Strong, Ellen E.; Bouchet, Philippe.
A new genus, Limatium gen, n., and two new species, L. pagodula sp, n, and L. aureum sp, n. are described, found on outer slopes of barrier reefs and fringing reefs in the South Pacific. They are rare for cerithiids, which typically occur in large populations. The two new species arc represented by 108 specimens sampled over a period of 30 years, only 16 of which were collected alive. Three subadults from the Philippines and Vanuatu likely represent a third species. In addition to their rarity, Limatium species arc atypical for cerithiids in their smooth, polished, honey to golden brown shells with distinctive white fascioles extending suture to suture. The radula presents a unique morphology that does not readily suggest an affinity to any of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Bittiinae; New genus; New species; Marine; DNA.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00494/60615/64101.pdf
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A review of methods for discrimination of honey bee populations as applied to European beekeeping Inra
Bouga, M.; ALAUX, C.; Bienkowska, M.; Büchler, R.; Carreck, N.L.; Cauia, E.; Chlebo, R.; Dahle, B.; Dall'Olio, R.; De la Rúa, P.; Gregorc, A.; Ivanova, E.; Kence, A.; Kence, M.; Kezic, N.; Kiprijanovska, H.; Kozmus, P.; Kryge, P.; Le Conte, Y.; Lodesani, M.; Murilhas, A.M.; Siceanu, A.; Soland, G.; Uzunov, A.; Wilde, J..
Here, scientists from 19 European countries, most of them collaborating in Working Group 4: “Diversity and Vitality” of COST Action FA 0803“Prevention of honey bee COlony LOSSes” (COLOSS), review the methodology applied in each country for discriminating between honey beepopulations. Morphometric analyses (classical and geometric) and different molecular markers have been applied. Even if the approach hasbeen similar, however, different methodologies regarding measurements, landmarks or molecular markers may have been used, as well asdifferent statistical procedures. There is therefore the necessity to establish common methods in all countries in order to have results that canbe directly compared. This is one of the goals of WG4 of the COLOSS project
Tipo: Journal Article Palavras-chave: ABEILLE DOMESTIQUE; INSECTE SOCIAL; APICULTURE; SOUS-ESPECE; MORPHOMETRIE; ADN; ISOENZYME; MARQUEUR MOLECULAIRE; METHODOLOGIE; SYSTEMATIQUE; DIAGNOSE MOLECULAR MARKER; METHODOLOGY; SYSTEMATICS; DIAGNOSIS; HONEYBEE; BEEKEEPING; SUB-SPECIES; MORPHOMETRICS; DNA; ISOENZYMES.
Ano: 2011 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2011a0114f97&uri=/notices/prodinra1/2011/04/
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A simple method for DNA isolation from Xanthomonas spp. Scientia Agricola
Gomes,Luiz Humberto; Duarte,Keila Maria Roncato; Andrino,Felipe Gabriel; Tavares,Flavio Cesar Almeida.
A simple DNA isolation method was developed with routine chemicals that yields high quality and integrity preparations when compared to some of the most well known protocols. The method described does not require the use of lysing enzymes, water bath and the DNA was obtained within 40 minutes The amount of nucleic acid extracted (measured in terms of absorbancy at 260 nm) from strains of Xanthomonas spp., Pseudomonas spp. and Erwinia spp. was two to five times higher than that of the most commonly used method.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: DNA; Xanthomonas; RAPD.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162000000300028
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A simple protocol for the extraction and sequence analysis of DNA from study skin of museum collections Genet. Mol. Biol.
Moraes-Barros,Nadia de; Morgante,João Stenghel.
Museum collections have been widely used as sources of biological samples for molecular biology studies and there are several methodologies and techniques to obtain and analyze DNA from tissues archived in museums, but most of these protocols have been developed for a specific tissue or are commercial kits. We present a simple protocol for extracting and amplifying DNA segments from sloth museum specimens. With this simple protocol we analyzed DNA fragments from 64% of 64 skin samples from three-toed sloths (Bradypus variegatus and Bradypus tridactylus) archived in three different museums: 43 samples from the University of São Paulo Museum of Zoology (Museu de Zoologia da Universidade de São Paulo, MUZUSP) São Paulo, São Paulo, Brazil; 18 samples from the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bradypus; DNA; Dried skins; Museum specimens.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000600024
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A simplified DNA extraction method for PCR analysis of Camarotella spp. BABT
Vitória,Nadja Santos; Bezerra,José Luiz; Gramacho,Karina Peres.
This work aimed to optimize an efficient and simple protocol for DNA extraction of Camarotella species, an obligate plant pathogen that cause verrucosis or "lixa" on coconut tree and other palms, facilitating the molecular studies of these biotrophic microorganisms. The method proposed enabled a fast, reproducible and reliable DNA extraction from Camarotella species.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Camarotella torrendiella; C. acrocomiae; Verrucosis on coconut; DNA; PCR.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132010000200001
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Advantages of the metagenomic approach for soil exploration: reply from Vogel et al. Inra
Vogel, T.M.; Hirsch, P.R.; Simonet, P.; Janson, J.K.; Tiedje, J.M.; van Elsas, J.D.; Nalin, R.; Philippot, L.; Bailey, M.J..
Tipo: Journal Article Palavras-chave: MICROBIOLOGY; SOIL; ADVANTAGE; METAGENOMIC; DNA; ENVIRONMENT.
Ano: 2009 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD20109aa7b47b&uri=/notices/prodinra1/2011/06/
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AFLP markers and DNA barcodes indicate diverse cryptic species lineages withn Urobenus brasiliensis (Clitellata: Rhinodrilidae). Repositório Alice
LOCATELLI, M.; JAMES, S. W.; BROWN, G. G.; BARETTA, D.; BARTZ, M. L. C.; FORBES, A..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Minhoca; Espécie; Urobenus brasiliensis; AFLP; DNA.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/960846
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Ajustes no protocolo de DNA CTAB 2x para extração de DNA em diversas espécies vegetais. Repositório Alice
LIMA, R. S. N.; SANTOS, C. A. F.; RODRIGUES, M. A.; BATISTA, P. P..
Diversas técnicas de biologia molecular estão disponíveis para a detecção da variabilidade genética ao nível de seqüência de DNA. O objetivo do presente trabalho foi ajustar a técnica de extração de DNA a partir de diferentes concentrações de -mercaptoetanol, utilizando o protocolo CTAB 2X. DNA genômico total foi isolado de folhas verdes e sadias em espécies distintas como umbuzeiro, mangueira, cebola e goiabeira, segundo protocolo do CTAB 2X com algumas adaptações (500 mM Tris pH 8,0; 1,4 M NaCl; CTAB 0,2% (p/v); 2% -mercaptoetanol; 20 mM de EDTA). A concentração do mercaptoetanol utilizado foi de 2%, um aumento de 10X em relação ao protocolo padrão. A concentração e a integridade do DNA genômico foram observadas em géis 0.8% de agarose comum, comparado a...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Extração; DNA; Espécie vegetal; Protocolo.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/160442
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Ajustes para purificação pré-seqüenciamento de produtos de amplificação de insertos de DNA de Paullinia cupana var. sorbilis utilizando exonuclease e fosfatase alcalina. Repositório Alice
OLIVEIRA, C. L.; ANGELO, P. C. da S..
Neste trabalho estão descritos resultados da evidenciação do DNA clonado em plasmídio via PCR e da preparação para o seqüenciamento automático, via tratamento dos insertos amplificados com as enzimas exonuclease I (EXO) e fosfatase alcalina de camarão (SAP).
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Paullinia cupana; Guaraná; Exonuclease; DNA.
Ano: 2004 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/678202
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Alterações de cromatina em espermatozóides de ovinos e caprinos avaliadas por azul de toluidina e alaranjado de acridina Ciência e Agrotecnologia
Kamimura,Cristina de Figueiredo; Jacomini,José Octávio; Beletti,Marcelo Emílio.
Reprodutores com espermograma normal podem se comportar como subférteis ou passarem por períodos de subfertilidade. As alterações na cromatina dos espermatozóides são possíveis explicações encontradas para tais comportamentos. Conduziu-se este trabalho, com o objetivo de testar a eficiência de azul de toluidina (AT) e do alaranjado de acridina (AA) na identificação de alterações na compactação de cromatina em espermatozóides de ovinos e caprinos, além de avaliar a correlação entre essas alterações e as de morfologia espermática. Para tal, foram avaliadas amostras de sêmen de 15 ovinos e de 15 caprinos, com dez repetições para cada método por animal. Calcularam-se a média, o desvio padrão (DP) e o coeficiente de variação (CV) para cada técnica e animal....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Azul de toluidina; Alaranjado de acridina; Espermatozóide; Cromatina; DNA.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000100027
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Alterations in Biomarkers Associated with Sterility in Pectinophora gossypiella (Saunders) Induced by Gamma Irradiation BABT
Ali,Hanaa Mahmoud; Moustafa,Hemat Zakaria; Sayed,Rehab Mahmoud.
ABSTRACT Nowadays, radiation technology is widely used to produce changes in Biosystems. The goal of this work is to determine the variation induced male Pectinophora gossypiella in gamma-irradiated as pupae using 50Gy and 150Gy. Comparing elements composition and DNA (using RAPD-PCR) between substerile 50Gy and the sterile dose 150Gy in P. gossypiella showed variation between them. Potassium (K) was the most abundant elements in unirradiated and irradiated males followed by magnesium (Mg). The percentage of heavy metals as copper, zinc, and cadmium concurrent with K was directly proportional to the radiation dose. While the percentage of Mg, Phosphorous and calcium decreased as the radiation dose increased. The results also revealed that some extra bands...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pectinophora gossypiella; Gamma rays; RAPD-PCR; Elements; DNA.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132017000100436
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Alterations in Biomarkers Associated with Sterility in Pectinophora gossypiella (Saunders) Induced by Gamma Irradiation BABT
Ali,Hanaa Mahmoud; Moustafa,Hemat Zakaria; Sayed,Rehab Mahmoud.
ABSTRACT Nowadays, radiation technology is widely used to produce changes in Biosystems. The goal of this work is to determine the variation induced male Pectinophora gossypiella in gamma-irradiated as pupae using 50Gy and 150Gy. Comparing elements composition and DNA (using RAPD-PCR) between substerile 50Gy and the sterile dose 150Gy in P. gossypiella showed variation between them. Potassium (K) was the most abundant elements in unirradiated and irradiated males followed by magnesium (Mg). The percentage of heavy metals as copper, zinc, and cadmium concurrent with K was directly proportional to the radiation dose. While the percentage of Mg, Phosphorous and calcium decreased as the radiation dose increased. The results also revealed that some extra bands...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pectinophora gossypiella; Gamma rays; RAPD-PCR; Elements; DNA.
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89132018000100401
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Alternative cytoplasmic male sterility systems in sorghum and their utilization Open Agri
A.A. ( A. Ashok Kumar ).
Palavras-chave: Cytoplasm; Genes; Sorghum; Hybrids; Heterosis; Transcription; DNA; Genetic structures; Segregation; Genomes.
Ano: 2008 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3149
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An effective method for cloning of partial MADS-box genes related to flower development in groundnut Open Agri
Yuan, M..
Palavras-chave: Genes; PCR; DNA; Cloning; Transcription factors; Genomes; Transcription; Genetic structures; Nucleotides; Molecular cloning.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3213
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An improved method for genomic DNA extraction from strawberry leaves. Repositório Alice
NUNES, C. F.; FERREIRA, J. L.; FERNANDES, M. C. N.; BREVES, S. de S.; GENEROSO, A. L.; SOARES, B. D. F.; DIAS, M. S. C.; PASQUAL, M.; BOREM, A.; CANÇADO, G. M. de A..
2011
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Fragaria ananassa; DNA; Liofilização; Morango; PCR.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/955705
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Análise de dois métodos de quantificação de DNA em amostras de diferentes populações de açaizeiro. Repositório Alice
OLIVEIRA, E. M. de; OLIVEIRA, M. do S. P. de; FERREIRA, S. F..
2008
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Açaí; DNA; População vegetal; Euterpe; Genética vegetal.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/408902
Registros recuperados: 350
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