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Aplicação de modelos de regressão aleatória utilizando diferentes estruturas de dados Ciência Rural
Sousa Júnior,Severino Cavalcante de; Faro,Lenira El; Bignardi,Annaiza Braga; Cardoso,Vera Lucia; Machado,Paulo Fernando; Albuquerque,Lucia Galvão de.
Foram utilizadas 3.202 primeiras lactações de vacas da raça Holandesa de quatro fazendas da região Sudeste, para verificar a influência da estrutura de dados de produção de leite sobre os parâmetros genéticos. Foram testados quatro arquivos com diferentes estruturas: controles semanais (CS), arquivo mensal (CM), bimestral (CB) e trimestral (CT), com 122.842, 30.883, 15.837 e 12.702 controles, respectivamente. Um modelo de regressão aleatória foi empregado nas análises, considerando os efeitos genético aditivo e o de ambiente permanente de animal, como aleatórios. Os efeitos fixos, grupos de contemporâneos (GC) foram comuns para todos os arquivos de dados e foram compostos por fazenda, mês e ano do controle, além da co-variável idade da vaca ao parto...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Bovinos de leite; Dados longitudinais.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001102058
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Arranjos para efeitos fixos e estruturas de (co)variâncias residuais para análises de medidas repetidas do peso de bovinos da raça Canchim R. Bras. Zootec.
Toral,Fábio Luiz Buranelo; Alencar,Maurício Mello de; Freitas,Alfredo Ribeiro de.
Este trabalho foi realizado com o objetivo de selecionar o arranjo para efeitos fixos e a estrutura de (co)variância residual que melhor representam a variabilidade dos pesos dentro do rebanho e dentro dos indivíduos, considerando-se dados de pesos de bovinos analisados como medidas repetidas. Foram utilizados dados de peso de 3.690 bovinos Canchim, obtidos ao nascimento, à desmama, aos 12 e aos 18 meses de idade. Analisaram-se diferentes arranjos para os efeitos fixos (grupos de contemporâneos e/ou efeitos principais de ano, mês ou época de nascimento e sexo do bezerro) e diferentes estruturas de (co)variâncias para os resíduos, considerando-se ou não alteração da variância residual ao longo da vida do animal e alteração da correlação entre as medidas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Dados longitudinais; Efeitos principais; Grupos de contemporâneos; Resíduos correlacionados.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000700010
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Arranjos para efeitos fixos e estruturas de (co)variâncias residuais para análises de medidas repetidas do peso de bovinos da raça Canchim. Repositório Alice
TORAL, F. L. B; ALENCAR, M. M. de; FREITAS, A. R. de..
Este trabalho foi realizado com o objetivo de selecionar o arranjo para efeitos fixos e a estrutura de (co)variância residual que melhor representam a variabilidade dos pesos dentro do rebanho e dentro dos indivíduos, considerando-se dados de pesos de bovinos analisados como medidas repetidas. Foram utilizados dados de peso de 3.690 bovinos Canchim, obtidos ao nascimento, à desmama, aos 12 e aos 18 meses de idade. Analisaram-se diferentes arranjos para os efeitos fixos (grupos de contemporâneos e/ou efeitos principais de ano, mês ou época de nascimento e sexo do bezerro) e diferentes estruturas de (co)variâncias para os resíduos, considerando-se ou não alteração da variância residual ao longo da vida do animal e alteração da correlação entre as medidas...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Dados longitudinais; Efeitos principais; Grupos de contemporâneos; Resíduos correlacionados.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/47594
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Avaliação dos efeitos do fungicida sobre perfis de crescimento de ratos durante a amamentação. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. P. de; LIMA, C. G. de; MAIA, A. de H. N.; CASTRO, V. L. S. S. de; DIAS, C. T. S..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Dados longitudinais; Estruturas matriz covariâncias; Modelos mistos.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/982468
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Estimação de funções de covariância para características de crescimento da raça Tabapuã utilizando modelos de regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Sousa Júnior,Severino Cavalcante de; Oliveira,Sônia Maria Pinheiro de; Albuquerque,Lucia Galvão de; Boligon,Arione Augusti; Martins Filho,Raimundo.
Foram utilizados 35.732 registros de peso do nascimento aos 660 dias de idade de 8.458 animais da raça Tabapuã para estimar funções de covariância utilizando modelos de regressão aleatória sobre polinômios de Legendre. Os modelos incluíram: como aleatórios, os efeitos genético aditivo direto, materno, de ambiente permanente de animal e materno; como fixos, os efeitos de grupo de contemporâneo; como covariáveis, a idade do animal à pesagem e a idade da vaca ao parto (linear e quadrática); e sobre a idade à pesagem, polinômio ortogonal de Legendre (regressão cúbica) foi considerado para modelar a curva média da população. O resíduo foi modelado considerando sete classes de variância e os modelos foram comparados pelos critérios de informação Bayesiano de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Correlação genética; Dados longitudinais; Gado de corte; Herdabilidade; Peso.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010000500014
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Estimação de parâmetros genéticos para peso do nascimento aos 550 dias de idade para animais da raça Tabapuã utilizando-se modelos de regressão aleatória R. Bras. Zootec.
Dias,Laila Talarico; Albuquerque,Lucia Galvão de; Tonhati,Humberto; Teixeira,Rodrigo de Almeida.
Foram utilizados 21.762 registros de peso do nascimento aos 550 dias de idade de 4.221 animais para estimativa das funções de covariância empregando modelos de regressão aleatória. Os modelos incluíram, como aleatórios, os efeitos genéticos aditivo direto e materno, de ambiente permanente de animal e de ambiente permanente materno e, como fixos, os efeitos de grupo contemporâneo, a idade da vaca ao parto (linear e quadrático) e o polinômio ortogonal de Legendre da idade do animal (regressão cúbica), como covariáveis. As variâncias residuais foram modeladas por uma função de variâncias com ordens de 2 a 6. Análises com polinômios ortogonais de diversas ordens foram realizadas para os efeitos genético aditivo direto, genético aditivo materno, de ambiente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Curva de crescimento; Dados longitudinais; Funções de covariância; Gado de corte.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982006000700006
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Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória PAB
Pinheiro,Valeria Rosado; Silva,Fabyano Fonseca e; Guimarães,Simone Eliza Facioni; Resende,Marcos Deon Vilela de; Lopes,Paulo Sávio; Cruz,Cosme Damião; Azevedo,Camila Ferreira.
O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância "identical‑by‑descent" associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve efeito de QTL, ou nulo,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sus scrofa; Curvas de crescimento; Dados longitudinais; "identical‑by‑descent"; Locos de características quantitativas; Seleção assistida por marcadores.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013000200009
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Mapeamento de QTL para características de crescimento de suínos por meio de modelos de regressão aleatória. Repositório Alice
PINHEIRO, V. R.; SILVA, F. F. e; GUIMARÃES, S. E. F.; RESENDE, M. D. V. de; LOPES, P. S.; CRUZ, C. D.; AZEVEDO, C. F..
O objetivo deste trabalho foi avaliar eficiência de modelos de regressão aleatória (MRA) para detectar locus de características quantitativas (QTL) para características de crescimento, em suínos. Utilizou-se uma população divergente F2 Piau x Comercial. A eficiência da metodologia proposta na detecção de QTL foi comparada à da metodologia tradicional de regressão por intervalo de mapeamento. Para tanto, utilizaram-se MRA com efeitos aleatórios poligênicos, de ambiente permanente e de QTL, tendo-se utilizado o enfoque de matriz de covariância ?identical‑by‑descent? associada aos efeitos de QTL. Testou-se a significância dos efeitos de QTL mediante a razão de verossimilhanças, tendo-se considerado o modelo como completo quando houve...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Sus scrofa; Curva de crescimento; Dados longitudinais; Identical-by-descent; Locos de característica quantitativas; Seleção assistida por marcadores.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/966562
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Regressão aleatória Bayesiana para avaliação genética da resistência ao mal das folhas em seringueiras Rev. Ciênc. Agron.
Sandoval,Victor Javier Cevallos; Silva,Fabyano Fonseca; Resende,Marcos Deon Vilela de; Macedo,Leandro Roberto de; Cecon,Paulo Roberto.
RESUMO O mal das folhas causado pelo fungo Microcyclus ulei é a doença mais séria dos seringais da América Latina. Com o objetivo de identificar clones de seringueira mais resistentes em diferentes ambientes ao longo do tempo, compararam-se diferentes modelos de regressão aleatória (MRA) ajustados via abordagem Bayesiana. Oito clones foram testados em campos clonais no delineamento em blocos completos casualizados com quatro repetições, utilizando-se 80 árvores por parcela. As duas fileiras centrais foram avaliadas a cada dois meses em relação às variáveis severidade (SEV) e índice de estroma em folha adulta (EFA). Foram incluídas como covariáveis nos modelos a circunferência do tronco e as variáveis climáticas de cada campo clonal. Os MRA foram comparados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Hevea brasiliensis; Microcyclus ulei; Dados longitudinais; Inferência estatística; Simulação estocástica.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902017000100151
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Seleção da matriz de variância-covariância residual na análise de ensaios varietais com medidas repetidas em cana-de-açúcar Ciência Rural
Silva,Emerson Noleto; Duarte,João Batista; Reis,Américo José dos Santos.
Este trabalho objetivou avaliar diferentes estruturas da matriz de variâncias e covariâncias residual (Σ), quanto ao ajustamento de dados longitudinais via modelos mistos, em experimentos varietais de cana-de-açúcar. A seleção adequada desta matriz garante a escolha de um modelo mais representativo dos dados. Em cada modelagem, variou-se ainda a suposição associada aos efeitos de tratamentos (variedades), como fixos e aleatórios. Quatro ensaios varietais, conduzidos entre 2005 e 2009, em três localidades do Estado de Goiás, foram considerados. Cada experimento foi delineado em blocos casualizados com três ou quatro repetições. A variável resposta analisada foi toneladas de colmos por hectare (TCH). Para avaliar a qualidade de ajustamento dos modelos, foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Saccharum spp.; Dados longitudinais; Estruturas de covariância; Modelos mistos; Genótipos aleatórios..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015000600993
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Seleção de genótipos de amendoim forrageiro para cobertura do solo e produção de biomassa aérea no período de estabelecimento utilizando-se metodologia de modelos mistos R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Valentim,Judson Ferreira; Carneiro Júnior,José Marques; Azevedo,José Marlo Araújo de; Ferreira,Aliedson Sampaio.
Objetivou-se estimar parâmetros genéticos e selecionar genótipos de amendoim forrageiro para maior cobertura do solo e produção de biomassa aérea durante o período de estabelecimento nas condições ambientais do Acre. A área experimental foi estabelecida em dezembro de 2005. O experimento foi realizado em delineamento de blocos ao acaso com quatro repetições utilizando-se 21 genótipos de amendoim forrageiro, incluindo três cultivares (Amarillo, Alqueire 1 e Belmonte). A seleção dos genótipos foi realizada considerando a cobertura do solo e a produção de matéria seca. As avaliações de cobertura do solo foram realizadas entre janeiro e outubro de 2006, em intervalos de quatro semanas. A produção de matéria seca foi mensurada 304 dias após o plantio. Os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arachis; BLUP; Dados longitudinais; Leguminosas forrageiras; Parâmetros genéticos; REML.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100001
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Seleção de modelos de regressão aleatória para ajuste de pesos do nascimento ao momento da seleção (378 dias) de machos Nelore. Repositório Alice
CYRILLO, J. N. dos S. G.; ALENCAR, M. M. de; RAZOOK, A. G.; MERCADANTE, M. E. Z.; FIGUEIREDO, L. A. de..
Foram utilizados pesos (17.942 registros ) de 2.582 machos da raça Nelore, nascidos de 1976 a 2001, filhos de 186 touros e 1.035 matrizes, provenientes dos rebanhos selecionados (NeS e NeT) e controle (NeC) do Projeto de Melhoramento Genético das Raças Zebu de Sertãozinho. Os dados foram classificados, em uma escala contínua, em intervalos de sete dias de idade, perfazendo 60 idades, com o mínimo de três e o máximo de sete registros por animal. A grande maioria dos animais (96%) apresenta sete registros. Foram testados 21 modelos de regressão aleatória, compostos por diferentes combinações de ordens (k) dos efeitos aleatórios genético aditivo direto (A), de ambiente permanente do animal (C) e de ambiente permanente materno (Q), além do efeito residual, com...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Gado de corte; Crescimento; Dados longitudinais; Estruturas de variâncias.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/46483
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Seleção genômica ampla para curvas de crescimento Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Silva,F.F.; Rocha,G.S.; Resende,M.D.V.; Guimarães,S.E.F.; Peternelli,L.A.; Duarte,D.A.S.; Azevedo,C..
Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano - BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: SNP; LASSO bayesiano; Dados longitudinais.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352013000500033
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Seleção genômica ampla para curvas de crescimento. Repositório Alice
SILVA, F. F.; ROCHA, G. S.; RESENDE, M. D. V. de; GUIMARÃES, S. E. F.; PETERNELLI, L. A.; DUARTE, D. A. S.; AZEVEDO, C..
Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genético; SNP; Dados longitudinais; LASSO bayesiano; Longitudinal data; Bayesian LASSO.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/974473
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