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Abordagem bayesiana da sensitividade de modelos para o coeficiente de endogamia Ciência Rural
Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de.
Este trabalho tem como objetivo realizar uma análise bayesiana de modelos, por meio do fator de Bayes, para o desequilíbrio de Hardy-Weinberg. Pretende-se também testar a metodologia por meio da simulação de dados e aplicá-la a um conjunto de dados reais. Na definição dos modelos, utilizaram-se as prioris Dirichlet (modelo 1), Beta - função degrau Uniforme (modelo 2), Uniforme - função degrau Uniforme (modelo 3) e as prioris independentes Uniformes (modelo 4) relacionadas aos parâmetros coeficiente de endogamia e proporção alélica. Foi implementado um algoritmo no software livre R para realizar a amostragem pelo Metropolis-Hastings das distribuições condicionais a posteriori dos parâmetros dos modelos. A convergência das cadeias foram monitoradas por meio...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fator de Bayes; Desequilíbrio de Hardy-Weinberg; Simulação de dados.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000600018
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Abordagem bayesiana para avaliação da adaptabilidade e estabilidade de genótipos de alfafa PAB
Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Nascimento,Ana Carolina Campana; Ferreira,Reinaldo de Paula; Cruz,Cosme Damião.
O objetivo deste trabalho foi propor uma abordagem bayesiana do método de Eberhart & Russell para avaliar a adaptabilidade e da estabilidade fenotípica de genótipos de alfafa (Medicago sativa), bem como avaliar a eficiência da utilização de distribuições a priori informativas e pouco informativas. Foram utilizados dados de um experimento em blocos ao acaso, no qual se avaliou a produção de massa de matéria seca de 92 genótipos. A metodologia bayesiana proposta foi implementada no programa livre R por meio da função MCMCregress do pacote MCMCpack. Para representar as distribuições a priori pouco informativas, utilizaram-se distribuições de probabilidade com grande variância; e, para representar distribuições a priori informativas, adotou-se o...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Medicago sativa; Fator de Bayes; Priori informativa; Interação genótipo x ambiente; MCMC.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000100004
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Comparação bayesiana de modelos com uma aplicação para o equilíbrio de Hardy-Weinberg usando o coeficiente de desequilíbrio Ciência Rural
Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de.
O equilíbrio de Hardy-Weinberg é um dos principais assuntos estudados pela Genética de populações. Neste contexto, o presente trabalho aborda a análise e a comparação bayesiana de modelos utilizando o coeficiente de desequilíbrio (D A). Para isso, realizou-se um estudo de simulação no qual as seguintes distribuições a priori foram consideradas: Dirichlet (modelo 1); beta - função degrau uniforme (modelo 2); uniforme - função degrau uniforme (modelo 3); e as prioris independentes uniformes (modelo 4). Exemplos de aplicação a dados reais de grupos raciais também são apresentados e discutidos. As amostras das distribuições marginais a posteriori para os parâmetros de interesse foram obtidas mediante o algoritmo Metropolis-Hastings, o qual foi implementado no...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fator de Bayes; Genética de populações; Simulação de dados.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000500016
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Comparação entre modelos para predição do nitrogênio mineralizado: uma abordagem bayesiana Ciência e Agrotecnologia
Pereira,Janser Moura; Muniz,Joel Augusto; Sáfadi,Thelma; Silva,Carlos Alberto.
Neste trabalho, desenvolveu-se uma abordagem bayesiana para predizer as quantidades de nitrogênio mineralizados por intermédio de modelos não lineares. Os modelos não lineares considerados para avaliar a dinâmica da mineralização do nitrogênio e para ilustrar o procedimento bayesiano foram: modelo de Cabrera, Marion, Stanford e Smith. A comparação dos modelos foi feita por meio do Fator de Bayes (FB) e do Critério de Informação Bayesiano (BIC). A inferência sobre os parâmetros realizou-se por intermédio do Amostrador de Gibbs e do Metropolis Hastings. O modelo de Cabrera (1993) foi o que proporcionou melhor qualidade de ajuste ao conjunto de dados de mineralização de nitrogênio, sendo seguido pelo modelo de Stanford & Smith (1972) e, por último, o...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amostrador de Gibbs; Metropolis Hastings; Fator de Bayes; Critério de Informação Bayesiano.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000700016
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Perspectiva bayesiana na seleção de genótipos de feijão-caupi em ensaios de valor de cultivo e uso. Repositório Alice
TEODORO, P. E.; NASCIMENTO, M.; TORRES, F. E.; BARROSO, L. M. A.; SAGRILO, E..
O objetivo deste trabalho foi selecionar, sob a perspectiva bayesiana, genótipos de feijão-caupi (Vigna unguiculata) que reúnam alta adaptabilidade e estabilidade fenotípicas, no Estado do Mato Grosso do Sul. Foram utilizados dados de quatro experimentos, conduzidos em delineamento de blocos ao acaso, em que a produtividade de grãos de 20 genótipos de feijão-caupi semiprostrado foi avaliada. Para representar as distribuições a priori pouco informativas, utilizaram-se distribuições de probabilidade com grande variância e, para representar distribuições a priori informativas, adotou-se o conceito de metanálise, com uso de informações de trabalhos anteriores. A comparação entre as distribuições a priori foi realizada por meio do fator de Bayes. A abordagem...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Fator de Bayes; Metanálise; Metanalysis.; Bayes factor; Environment interaction; Informative prior; Genótipo; Fenótipo; Aclimatação; Vigna unguiculata; Feijão de corda; Genotype..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030114
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Perspectiva bayesiana na seleção de genótipos de feijão-caupi em ensaios de valor de cultivo e uso PAB
Teodoro,Paulo Eduardo; Nascimento,Moysés; Torres,Francisco Eduardo; Barroso,Laís Mayara Azevedo; Sagrilo,Edvaldo.
Resumo:O objetivo deste trabalho foi selecionar, sob a perspectiva bayesiana, genótipos de feijão-caupi (Vigna unguiculata) que reúnam alta adaptabilidade e estabilidade fenotípicas, no Estado do Mato Grosso do Sul. Foram utilizados dados de quatro experimentos, conduzidos em delineamento de blocos ao acaso, em que a produtividade de grãos de 20 genótipos de feijão-caupi semiprostrado foi avaliada. Para representar as distribuições a priori pouco informativas, utilizaram-se distribuições de probabilidade com grande variância; e, para representar distribuições a priori informativas, adotou-se o conceito de metanálise, com uso de informações de trabalhos anteriores. A comparação entre as distribuições a priori foi realizada por meio do fator de Bayes. A...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Vigna unguiculata; Fator de Bayes; Interação genótipo x ambiente; Metanálise; Priori informativa..
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2015001000878
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