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A preliminary approach to the phylogeny of the genus Paspalum (Poaceae). Repositório Alice
SOUZA-CHIES, T. T.; ESSI, L.; RUA, G. H.; VALLS, J. F. M.; MIZ, R. B..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Allopolyploids; CpDNA; Evolutionary relationships; Capim; Filogenia; Gramínea; Paspalum; Poaceae; Phylogeny.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/188344
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An updated phylogenetic classification of Corynespora cassiicola isolates and a practical approach to their identification based on the nucleotide polymorphisms at the ga4 and caa5 loci. Repositório Alice
BANGUELA-CASTILHO, A.; RAMOS-GONZALES, P. L.; PENA-MAREY, M.; GODOY, C. V.; HARAKAVA, R..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Corynespora Cassiicola; Filogenia; Polimorfismo; Phylogeny; Polymorphism; Arrestins.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116739
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Análise de sequências de DNA cloroplástico de espécies do gênero Capsicum. Infoteca-e
BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. de S.; BIANCHETTI, L. de B.; FERREIRA, M. E..
bitstream/CENARGEN/23669/1/bp037.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Analise de sequencias; DNA cloropastico; Evolucao; CAPS.; Filogenia; Pimenta.; Capsicum..
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/176888
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Análise e comparação filogenética de expansinas presentes em Urochloa decumbens cv Basilick. Repositório Alice
ONO, R. Y.; CHIARI, L.; PEREIRA, M..
O objetivo deste trabalho foi analisar 4 expansinas de Urochloa decumbens, verificando a similaridade e a homologia delas com as de outras plantas.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Transcriptoma; Bioinformática; Filogenia.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1012029
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Análise filogenética de espécies de potyvirus provenientes de Cucurbitáceas no estado do Pará. Repositório Alice
PONTE, N. H. T. da; BOARI, A. de J..
Organizadoras: Paula Fernanda Viegas Pinheiro e Tatianne Feitosa Soares.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Filogenia; Vírus..
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087292
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Análisis filogenético del género sacciolepis: poaceae, panicoideae, paniceae) con caracteres morfológicos Darwiniana
De Gennaro,Diego; Scataglini,M. Amalia.
Sacciolepis (Poaceae, Panicoideae, Paniceae) es un género pantropical constituido por 23 especies, distribuidas mayormente en África, con algunos taxones en América, Asia y Australia. Los objetivos de este trabajo son poner a prueba el origen monofilético de Sacciolepis y explorar las relaciones filogenéticas intragenéricas. Se analizaron 31 taxones y 80 caracteres morfológicos y anatómicos, incluyendo caracteres continuos, bajo el criterio de máxima parsimonia. Se corroboró la monofilia del género y se discutieron sus caracteres diagnósticos. Este trabajo es el primer análisis filogenético de Sacciolepis.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Caracteres continuos; Caracteres morfológicos; Filogenia; Poaceae; Sacciolepis.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0011-67932012000100004
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Anatomía de raíz de la tribu Cranichideae (Orchidaceae), con énfasis en la importancia filogenética del velamen Colegio de Postgraduados
Figueroa Batalla, Coyolxauhqui.
El velamen es una rizodermis especializada formada por células muertas con engrosamientos en la pared secundaria; se encuentra en muchas orquídeas y otras monocotiledóneas. Se considera que esta estructura podría tener valor taxonómico, aunque no se han realizado estudios al respecto en la tribu Cranichideae. En este trabajo se examinó la estructura anatómica de la raíz de 26 especies/19 géneros de cinco linajes (subtribus) de la tribu Cranichideae mediante microscopía de luz y microscopía electrónica de barrido. Se evaluó la importancia taxonómica y filogenética del velamen en el marco de una filogenia generada a partir de secuencias de ADN nuclear y de cloroplasto así como caracteres morfológicos/anatómicos de raíz. Se registró por primera vez...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Anatomía de raíz; Cranichideae; Filogenia; NrITS; Orchidaceae; Plastidio trnK-matK; Secuencias de ADN; Tilosomas; Velamen; Maestría; Botánica; DNA sequences; Orchidaceae; Phylogeny; Plastid trnK-matK; Root anatomy; Tilosomes.
Ano: 2007 URL: http://hdl.handle.net/10521/1467
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Biogeografia e genética populacional de rizóbios isolados de sabiá (Mimosa caesalpiniifolia Benth.). Repositório Alice
OLIVEIRA, I. S. R. de; SILVA, M. S. R. de A. da; FARIA, S. M. de; JESUS, E. da C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Fixação biológica do nitrogênio; Rizóbio; Filogenia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092609
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Caracterização de novas espécies virais infectando plantas forrageiras no Brasil e reação de genótipos de Panicum maximum à virose. Repositório Alice
SILVA, K. N.; SOUZA, J. M.; MELO, F. L.; NAGATA, T.; SILVA, M. S.; ORILIO, A. F.; FERNANDES, C. D.; JANK, L.; SANTOS, M. F.; VERZIGNASSI, J. R.; FRAGOSO, R. da R.; DESSAUNE, S. N.; RESENDE, R. O..
Em área experimental da Embrapa Gado de Corte, Campo Grande-MS, genótipos de espécies de Panicum, Brachiaria e Stylosanthes têm exibido sintomas típicos de infecção viral, como mosaico nas folhas e redução do crescimento da parte aérea, cuja etiologia ainda não estava esclarecida. Fontes de resistência são as principais formas de controle da doença. Objetivou-se, neste trabalho, identificar o(s) vírus agente(s) da doença, bem como fontes de resistência de P. maximum à mesma. Folhas sintomáticas foram maceradas em tampão PBS e o extrato foliar foi centrifugado e filtrado. O RNA viral foi extraído utilizando-se RNeasy Mini Kit, de acordo com as instruções do fabricante. As amostras de RNA foram concentradas e sequenciadas na Macrogen inc. (Korea) usando-se a...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Diversidade viral.; Graminea; Genoma; Filogenia; Estilosante..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066082
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Caracterização de rizóbios indicados para produção de inoculantes por meio de sequenciamento parcial do 16S rRNA PAB
Toledo,Bethânia Figueiredo Barbosa de; Marcondes,Jackson; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
O objetivo deste trabalho foi confrontar as sequências parciais do gene 16S rRNA de estirpes padrão de rizóbios com as de estirpes recomendadas para a produção de inoculantes no Brasil, com vistas à verificação da confiabilidade do sequenciamento parcial desse gene para a identificação rápida de estirpes. Foram realizados sequenciamentos através de reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rRNA entre as bactérias estudadas. Os resultados foram analisados pela consulta de similaridade de nucleotídeos aos do "Basic Local Alignment Search Tool" (Blastn) e por meio da interpretação de árvores filogenéticas geradas usando ferramentas de bioinformática. A classificação taxonômica das estirpes Semia...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bradyrhizobium; Rhizobium; Filogenia.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000400008
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Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo Trop. Plant Pathol.
Moreira,Andreia E.; Gaspar,José O.; Camargo,Luis E. A.; Kuniyuki,Hugo.
O presente trabalho caracteriza o gene codificador da proteína capsidial do isolado do Grapevine virus A (GVA) encontrado no Estado de São Paulo (GVA-SP). RNA total foi extraído de folhas e pecíolos de plantas de videira (Vitis spp.) da variedade 'Kober 5BB' e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar um fragmento entre as posições 6409 e 7175 do RNA do GVA ("GenBank", acesso X75433). Foi obtido um fragmento de tamanho esperado (767 nt) que inclui o gene da proteína capsidial, codificando 198 aminoácidos. A seqüência do GVA-SP apresentou similaridade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 86-92,3% e 94,5-98% com isolados do GVA da Europa, África e Japão (Acessos X75433, AF441234, AF007415, AB039841) e da região Sul...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: GVA; Vitivirus; Vitis spp.; "Kober stem grooving"; Complexo do lenho rugoso; Seqüenciamento; Filogenia.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000200015
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Caracterização molecular e controle de fungos da família botryosphaeriaceae associados à fruteiras tropicais. Repositório Alice
COUTINHO, I. B. de L..
A família Botryosphaeriaceae (Ascomycota, Botryosphaeriales) é composta por complexos de espécies crípticas endofíticas e patogênicas capazes de provocar sintomas de cancros e morte descendente de ramos a diversos hospedeiros, sobretudo plantas lenhosas, dentre as fruteiras tropicais se destacam. Objetivou-se com o presente estudo realizar a caracterização biológica, molecular e o controle de isolados fúngicos família Botryosphaeriaceae associados a fruteiras tropicais no Nordeste brasileiro. Dentre as técnicas utilizadas estão: o sequenciamento gênico combinado das regiões do espaçador interno transcristo (ITS) do DNA ribossômico, fator de elongação 1-alfa (TEF-1?) e ?-tubulina (?t) para a determinação das relações filogenéticas entre os isolados, dados...
Tipo: Teses Palavras-chave: Anacardiáceas; Taxonomia; Filogenia; Lasiodiplodia Theobromae; Taxonomy; Phylogeny.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101452
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Complete mitochondrial genome from South American catfish Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmann & Eigenmann) and its impact in Siluriformes phylogenetic tree. Repositório Alice
VILLELA, L. C. V.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PONZETTO, J. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R..
The cachara (Pseudoplatystoma reticulatum) is a Neotropical freshwater catfish from family Pimelodidae (Siluriformes) native to Brazil. The species is of relative economic importance for local aquaculture production and basic biological information is under development to help boost efforts to domesticate and raise the species in commercial systems. The complete cachara mitochondrial genome was obtained by assembling Illumina RNA-seq data from pooled samples. The full mitogenome was found to be 16,576 bp in length, showing the same basic structure, order, and genetic organization observed in other Pimelodidae, with 13 protein-coding genes, 2 rNA genes, 22 trNAs, and a control region. Observed base composition was 24.63% T, 28.47% C, 31.45% A, and 15.44% G....
Tipo: Separatas Palavras-chave: Cachara; Peixe-gato; Mitogenome.; Filogenia; Melhoramento genético animal; Peixe de água doce; RNA; Aquicultura.; Pseudoplatystoma reticulatum; Mitochondrial genome; Siluriformes; Phylogeny; Catfish; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074198
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Descripción morfológica del esqueñeto axial de filotinos (Rodentia: Sigmodontinae): Aspectos morfofuncionales y filogenéticos Mastozool. neotrop.
Carrizo,Luz. V; Díaz,M. Mónica.
Los estudios de taxonomía y filogenia en roedores filotinos en particular, y en sigmodontinos en general, se han enfocado en el análisis de las características externas, craneales y dentarias, otorgándole menor importancia al esqueleto postcraneal. Es por esto que se planteó un estudio descriptivo y comparativo de los elementos óseos del esqueleto axial de los representantes de la tribu Phyllotini sobre la base de 140 ejemplares pertenecientes a 10 géneros y 26 especies. Los objetivos del estudio fueron contribuir al conocimiento de la anatomía postcraneal de los filotinos, determinar los morfotipos de las estructuras vertebrales e identificar patrones morfológicos con un probable significado funcional y filogenético. Nuestros resultados indican que el...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Anatomía; Filogenia; Morfología funcional; Phyllotini; Vértebras.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-93832013000100002
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Detecção e caracterização molecular de Leishmania em cães do Nordeste do Brasil. Repositório Alice
EVARISTO, A. M. da C. F.; SILVA, I. W. G. da; OLIVEIRA, G. M. B. de; SILVA, R. E. da; COSTA, J. de O. J.; VESCHI, J. L. A.; MARCILI, A.; HORTA, M. C..
O objetivo do presente estudo foi determinar a soroprevalência atual da Leishmaniose Visceral Canina (LVC) em cães domiciliados, os fatores associados à soropositividade, espécies circulantes de Leishmania e análise espacial em seis municípios das mesorregiões do Sertão e São Francisco, localizados no estado de Pernambuco, Brasil.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Leishmaniose canina; Geoprocessamento; Cachorro; Leishmaniose; Diagnostico; Filogenia; Cão; Doença Animal; Dog diseases.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134489
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Detecção molecular de Colletotrichum siamense em mudas de palma de óleo. Repositório Alice
QUADROS, A. F. F.; BOARI, A. de J.; CARVALHO, T. P.; GOMES JUNIOR, R. A..
A palma de óleo é uma das culturas mais importantes no mundo, encontrando-se em franca expansão no estado do Pará. Muitos fungos têm sido encontrados causando doenças nesta cultura. Durante o monitoramento das plantas do Banco Ativo de Germoplasma de palma de óleo da Embrapa Amazônia Oriental, utilizado no programa de melhoramento, foi observada a presença de mudas com sintomas de necrose foliar onde se observou a presença de conídios característicos do gênero Colletotrichum. Assim, o trabalho teve como objetivo identificar a espécie do fungo por meio de PCR, seguido do sequenciamento multilocus do DNA. Para isso, tecidos de folhas das mudas de palma de óleo que apresentavam sintomas de doenças foram plaqueados em ágar-água. Posteriormente, o fungo foi...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Palma de óleo; Elaeis guineenses.; Antracnose; Filogenia; Muda..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1022662
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Diagnóstico molecular e análise filogenética de isolados brasileiros de Trypanosoma vivax baseado na reação da polimerase em cadeia - PCR. Infoteca-e
MADRUGA, C. R.; ARAÚJO, F. R. de; SOARES, C. O.; MELO, E. S. de P.; ALMEIDA, D. A.; ALMEIDA JÚNIOR, N. F. de; XAVIER, M. A. S.; OSÓRIO, A. L. A.; GÓES-CAVALCANTE, G.; RAMOS, C. A. do N..
bitstream/item/104658/1/Diagnostico-molecular-e-analise.pdf
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Reação da polimerase em cadeia; Brasil; Diagnosis.; Diagnostico; Filogenia; Trypanosoma Vivax.; Brazil; Phylogeny; Polymerase chain reaction..
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/325753
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Distribución ecológica del subgénero Neodawsonia Backeb. del género Cephalocereus Pfeiff. (Cactaceae), en el Itsmo de Tehuantepec, México. Colegio de Postgraduados
Bárcenas Argüello, María Luisa.
Cephalocereus es un género monofilético, cuya distribución es alopátrica y está restringida a la Barranca de Metztitlán (C. senilis), al Valle de Tehuacán-Cuicatlán (C. columna-trajani) y a la cuenca del río Tehuantepec (subgénero Neodawsonia, C. apicicephalium, C. nizandensis, C. totolapensis). Se desconoce qué factores condicionan este patrón de distribución endémico. El objetivo de este trabajo fue el proponer una hipótesis que explique el endemismo de sus especies, a partir de relaciones específicas entre la fisiología de los oxalatos de calcio y las propiedades de las rocas y de los suelos en los que habitan. En cada población se tomaron muestras del material parental (roca) del suelo, se removió tejido vegetal y se recolectaron semillas; estas...
Palavras-chave: Endemismo; Material Parental; Oxalato de calcio; Germinación; Filogenia; Endemism; Parent material; Calcium oxalate; Germination; Phylogeny; Doctorado; Botánica.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/458
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Distribución ecológica del subgénero Neodawsonia Backeb. del género Cephalocereus Pfeiff. (Cactaceae), en el Itsmo de Tehuantepec, México. Colegio de Postgraduados
Bárcenas Argüello, María Luisa.
Cephalocereus es un género monofilético, cuya distribución es alopátrica y está restringida a la Barranca de Metztitlán (C. senilis), al Valle de Tehuacán-Cuicatlán (C. columna-trajani) y a la cuenca del río Tehuantepec (subgénero Neodawsonia, C. apicicephalium, C. nizandensis, C. totolapensis). Se desconoce qué factores condicionan este patrón de distribución endémico. El objetivo de este trabajo fue el proponer una hipótesis que explique el endemismo de sus especies, a partir de relaciones específicas entre la fisiología de los oxalatos de calcio y las propiedades de las rocas y de los suelos en los que habitan. En cada población se tomaron muestras del material parental (roca) del suelo, se removió tejido vegetal y se recolectaron semillas; estas...
Palavras-chave: Endemismo; Material Parental; Oxalato de calcio; Germinación; Filogenia; Endemism; Parent material; Calcium oxalate; Germination; Phylogeny; Doctorado; Botánica.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/458
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Diversidad de los recursos genéticos mexicanos del hongo funcional ganoderma (Fungi, Ganodermataceae), conocido como reishi en los mercados internacionales, y su relevancia para el desarrollo regional. Colegio de Postgraduados
Tello Salgado, Isaac.
Actualmente se estudia la capacidad funcional a nivel molecular de los hongos basidiomicetos como modificadores de la respuesta biológica, dada la efectividad de los productos examinados de activar al sistema inmunológico, sin embargo, el origen geográfico de estos recursos, principalmente son asiáticos y europeos. Ganoderma es reconocido por su eficiente actividad en el tratamiento de varias enfermedades, principalmente las anticancerígenas y antitumorales, crece de manera silvestre en el área central de México, una de las más importantes, debido a la convergencia de las regiones Neártica y Neotropical, lo cual da como resultado un amplia diversidad de recursos genéticos. En la presente investigación se aislaron 66 cepas del género Ganoderma producto de...
Palavras-chave: Caracterización; Cultivo; Filogenia; Ganoderma; Recurso Genético; Characterization; Cultivation; Phylogeny; Genetic resource; Doctorado; EDAR; Estrategias para el Desarrollo Agrícola Regional.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/372
Registros recuperados: 67
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