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Análise de sequências de DNA cloroplástico de espécies do gênero Capsicum. Infoteca-e
BUSO, G. S. C.; AMARAL, Z. P. de S.; BIANCHETTI, L. de B.; FERREIRA, M. E..
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Analise de sequencias; DNA cloropastico; Evolucao; CAPS; Filogenia; Pimenta; Capsicum.
Ano: 2002 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/176888
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Análisis filogenético del género sacciolepis: poaceae, panicoideae, paniceae) con caracteres morfológicos Darwiniana
De Gennaro,Diego; Scataglini,M. Amalia.
Sacciolepis (Poaceae, Panicoideae, Paniceae) es un género pantropical constituido por 23 especies, distribuidas mayormente en África, con algunos taxones en América, Asia y Australia. Los objetivos de este trabajo son poner a prueba el origen monofilético de Sacciolepis y explorar las relaciones filogenéticas intragenéricas. Se analizaron 31 taxones y 80 caracteres morfológicos y anatómicos, incluyendo caracteres continuos, bajo el criterio de máxima parsimonia. Se corroboró la monofilia del género y se discutieron sus caracteres diagnósticos. Este trabajo es el primer análisis filogenético de Sacciolepis.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Caracteres continuos; Caracteres morfológicos; Filogenia; Poaceae; Sacciolepis.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0011-67932012000100004
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Anatomía de raíz de la tribu Cranichideae (Orchidaceae), con énfasis en la importancia filogenética del velamen Colegio de Postgraduados
Figueroa Batalla, Coyolxauhqui.
El velamen es una rizodermis especializada formada por células muertas con engrosamientos en la pared secundaria; se encuentra en muchas orquídeas y otras monocotiledóneas. Se considera que esta estructura podría tener valor taxonómico, aunque no se han realizado estudios al respecto en la tribu Cranichideae. En este trabajo se examinó la estructura anatómica de la raíz de 26 especies/19 géneros de cinco linajes (subtribus) de la tribu Cranichideae mediante microscopía de luz y microscopía electrónica de barrido. Se evaluó la importancia taxonómica y filogenética del velamen en el marco de una filogenia generada a partir de secuencias de ADN nuclear y de cloroplasto así como caracteres morfológicos/anatómicos de raíz. Se registró por primera vez...
Tipo: Tesis Palavras-chave: Anatomía de raíz; Cranichideae; Filogenia; NrITS; Orchidaceae; Plastidio trnK-matK; Secuencias de ADN; Tilosomas; Velamen; Maestría; Botánica; DNA sequences; Orchidaceae; Phylogeny; Plastid trnK-matK; Root anatomy; Tilosomes.
Ano: 2007 URL: http://hdl.handle.net/10521/1467
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Caracterização de rizóbios indicados para produção de inoculantes por meio de sequenciamento parcial do 16S rRNA PAB
Toledo,Bethânia Figueiredo Barbosa de; Marcondes,Jackson; Lemos,Eliana Gertrudes de Macedo.
O objetivo deste trabalho foi confrontar as sequências parciais do gene 16S rRNA de estirpes padrão de rizóbios com as de estirpes recomendadas para a produção de inoculantes no Brasil, com vistas à verificação da confiabilidade do sequenciamento parcial desse gene para a identificação rápida de estirpes. Foram realizados sequenciamentos através de reação em cadeia da polimerase (PCR) com iniciadores relativos à região codificadora do gene 16S rRNA entre as bactérias estudadas. Os resultados foram analisados pela consulta de similaridade de nucleotídeos aos do "Basic Local Alignment Search Tool" (Blastn) e por meio da interpretação de árvores filogenéticas geradas usando ferramentas de bioinformática. A classificação taxonômica das estirpes Semia...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bradyrhizobium; Rhizobium; Filogenia.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009000400008
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Caracterização do gene da proteína capsidial do Grapevine virus A em videiras afetadas pela acanaladura do lenho de Kober no Estado de São Paulo Trop. Plant Pathol.
Moreira,Andreia E.; Gaspar,José O.; Camargo,Luis E. A.; Kuniyuki,Hugo.
O presente trabalho caracteriza o gene codificador da proteína capsidial do isolado do Grapevine virus A (GVA) encontrado no Estado de São Paulo (GVA-SP). RNA total foi extraído de folhas e pecíolos de plantas de videira (Vitis spp.) da variedade 'Kober 5BB' e submetido a RT-PCR usando oligonucleotídeos desenhados para amplificar um fragmento entre as posições 6409 e 7175 do RNA do GVA ("GenBank", acesso X75433). Foi obtido um fragmento de tamanho esperado (767 nt) que inclui o gene da proteína capsidial, codificando 198 aminoácidos. A seqüência do GVA-SP apresentou similaridade de nucleotídeos e aminoácidos de, respectivamente, 86-92,3% e 94,5-98% com isolados do GVA da Europa, África e Japão (Acessos X75433, AF441234, AF007415, AB039841) e da região Sul...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: GVA; Vitivirus; Vitis spp.; "Kober stem grooving"; Complexo do lenho rugoso; Seqüenciamento; Filogenia.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000200015
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Descripción morfológica del esqueñeto axial de filotinos (Rodentia: Sigmodontinae): Aspectos morfofuncionales y filogenéticos Mastozool. neotrop.
Carrizo,Luz. V; Díaz,M. Mónica.
Los estudios de taxonomía y filogenia en roedores filotinos en particular, y en sigmodontinos en general, se han enfocado en el análisis de las características externas, craneales y dentarias, otorgándole menor importancia al esqueleto postcraneal. Es por esto que se planteó un estudio descriptivo y comparativo de los elementos óseos del esqueleto axial de los representantes de la tribu Phyllotini sobre la base de 140 ejemplares pertenecientes a 10 géneros y 26 especies. Los objetivos del estudio fueron contribuir al conocimiento de la anatomía postcraneal de los filotinos, determinar los morfotipos de las estructuras vertebrales e identificar patrones morfológicos con un probable significado funcional y filogenético. Nuestros resultados indican que el...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Anatomía; Filogenia; Morfología funcional; Phyllotini; Vértebras.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0327-93832013000100002
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Diagnóstico molecular e análise filogenética de isolados brasileiros de Trypanosoma vivax baseado na reação da polimerase em cadeia - PCR. Infoteca-e
MADRUGA, C. R.; ARAÚJO, F. R. de; SOARES, C. O.; MELO, E. S. de P.; ALMEIDA, D. A.; ALMEIDA JÚNIOR, N. F. de; XAVIER, M. A. S.; OSÓRIO, A. L. A.; GÓES-CAVALCANTE, G.; RAMOS, C. A. do N..
CNPGC.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Reação da polimerase em cadeia; Brasil; Diagnosis; Diagnostico; Filogenia; Trypanosoma Vivax; Brazil; Polymerase chain reaction; Phylogeny.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/325753
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Distribución ecológica del subgénero Neodawsonia Backeb. del género Cephalocereus Pfeiff. (Cactaceae), en el Itsmo de Tehuantepec, México. Colegio de Postgraduados
Bárcenas Argüello, María Luisa.
Cephalocereus es un género monofilético, cuya distribución es alopátrica y está restringida a la Barranca de Metztitlán (C. senilis), al Valle de Tehuacán-Cuicatlán (C. columna-trajani) y a la cuenca del río Tehuantepec (subgénero Neodawsonia, C. apicicephalium, C. nizandensis, C. totolapensis). Se desconoce qué factores condicionan este patrón de distribución endémico. El objetivo de este trabajo fue el proponer una hipótesis que explique el endemismo de sus especies, a partir de relaciones específicas entre la fisiología de los oxalatos de calcio y las propiedades de las rocas y de los suelos en los que habitan. En cada población se tomaron muestras del material parental (roca) del suelo, se removió tejido vegetal y se recolectaron semillas; estas...
Palavras-chave: Endemismo; Material Parental; Oxalato de calcio; Germinación; Filogenia; Endemism; Parent material; Calcium oxalate; Germination; Phylogeny; Doctorado; Botánica.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/458
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Distribución ecológica del subgénero Neodawsonia Backeb. del género Cephalocereus Pfeiff. (Cactaceae), en el Itsmo de Tehuantepec, México. Colegio de Postgraduados
Bárcenas Argüello, María Luisa.
Cephalocereus es un género monofilético, cuya distribución es alopátrica y está restringida a la Barranca de Metztitlán (C. senilis), al Valle de Tehuacán-Cuicatlán (C. columna-trajani) y a la cuenca del río Tehuantepec (subgénero Neodawsonia, C. apicicephalium, C. nizandensis, C. totolapensis). Se desconoce qué factores condicionan este patrón de distribución endémico. El objetivo de este trabajo fue el proponer una hipótesis que explique el endemismo de sus especies, a partir de relaciones específicas entre la fisiología de los oxalatos de calcio y las propiedades de las rocas y de los suelos en los que habitan. En cada población se tomaron muestras del material parental (roca) del suelo, se removió tejido vegetal y se recolectaron semillas; estas...
Palavras-chave: Endemismo; Material Parental; Oxalato de calcio; Germinación; Filogenia; Endemism; Parent material; Calcium oxalate; Germination; Phylogeny; Doctorado; Botánica.
Ano: 2011 URL: http://hdl.handle.net/10521/458
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Diversidad de los recursos genéticos mexicanos del hongo funcional ganoderma (Fungi, Ganodermataceae), conocido como reishi en los mercados internacionales, y su relevancia para el desarrollo regional. Colegio de Postgraduados
Tello Salgado, Isaac.
Actualmente se estudia la capacidad funcional a nivel molecular de los hongos basidiomicetos como modificadores de la respuesta biológica, dada la efectividad de los productos examinados de activar al sistema inmunológico, sin embargo, el origen geográfico de estos recursos, principalmente son asiáticos y europeos. Ganoderma es reconocido por su eficiente actividad en el tratamiento de varias enfermedades, principalmente las anticancerígenas y antitumorales, crece de manera silvestre en el área central de México, una de las más importantes, debido a la convergencia de las regiones Neártica y Neotropical, lo cual da como resultado un amplia diversidad de recursos genéticos. En la presente investigación se aislaron 66 cepas del género Ganoderma producto de...
Palavras-chave: Caracterización; Cultivo; Filogenia; Ganoderma; Recurso Genético; Characterization; Cultivation; Phylogeny; Genetic resource; Doctorado; EDAR; Estrategias para el Desarrollo Agrícola Regional.
Ano: 2010 URL: http://hdl.handle.net/10521/372
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Diversidade de bactérias diazotróficas endofíticas dos gêneros Herbaspirillum e Burkholderia na cultura do arroz inundado PAB
Rodrigues,Luciana da Silva; Baldani,Vera Lucia Divan; Reis,Veronica Massena; Baldani,José Ivo.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a diversidade de bactérias diazotróficas endofíticas, dos gêneros Herbaspirillum e Burkholderia, em duas variedades de arroz, consideradas de alta (IR 42) e baixa (IAC 4440) eficiência de fixação biológica de nitrogênio. Foram realizados dois experimentos em casa de vegetação, em vasos com dois tipos de solos, provenientes dos Estados de Goiás e do Rio de Janeiro. Foi feita a contagem do número de bactérias e o isolamento em diferentes partes e estágios de desenvolvimento das plantas, mediante o uso de meios de cultivo JNFb e JMV. Os isolados bacterianos foram caracterizados a partir de aspectos morfológicos das colônias, com o crescimento em meios de cultivo, e de testes fisiológicos (uso de fontes de carbono e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio; Filogenia; Interação planta-bactéria.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000200012
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Diversidades filogenética e funcional: novas abordagens para a Ecologia de comunidades Biota Neotropica
Cianciaruso,Marcus Vinicius; Silva,Igor Aurélio; Batalha,Marco Antônio.
Embora a diversidade pareça ser o conceito ecológico mais intuitivo, nenhuma definição consensual foi formulada. As medidas tradicionais de diversidade, que levam em conta apenas o número de espécies e suas contribuições relativas, têm se mostrado estimativas pouco preditivas da estrutura e do funcionamento das comunidades. Medidas de diversidade que incorporem informações sobre as relações filogenéticas das espécies ou suas características funcionais podem ser melhores do que as medidas tradicionais para muitas finalidades. Apresentamos uma pequena revisão das propriedades e aplicações de algumas medidas de diversidade. Enfatizamos aqui duas abordagens recentes e promissoras, as diversidades filogenética e funcional, que têm se mostrado mais sensíveis...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Complementaridade; Comunidade; Diversidade; Filogenia; Nicho.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1676-06032009000300008
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Escenarios evolutivos en larvas y adultos de Hydrophiloidea (Coleoptera) analizados en función de diferentes hipótesis filogenéticas Rev. Soc. Entomol. Argent.
Archangelsky,Miguel.
Se comparan cinco hipótesis filogenéticas de las relaciones, a nivel de familia, de la superfamilia Hydrophiloidea (s.str.) en función de la evolución de cuatro caracteres bionómicos y morfológicos: hábitat de adultos (acuático o ripario), hábitat de larvas (terrestre, acuático o ripario), tipo de sistema respiratorio en larvas (holopnéustico o metapnéustico) y número de segmentos abdominales en larvas (décimo segmento no reducido o décimo segmento reducido). Si bien no se favorece una hipótesis sobre la otra, éstas se evalúan por el nivel explicativo de la secuencia de cambios de estado de los caracteres de interés, y se destaca cuáles de ellas explican de forma más parsimoniosa la secuencia de cambios.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Hydrophiloidea; Escenarios evolutivos; Filogenia; Larvas; Adaptaciones.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0373-56802007000200013
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Estudio filogenético de los géneros de Lithinini de Sudamérica Austral (Lepidoptera, Geometridae): una nueva clasificación Rev. Bras. entomol.
Parra,Luis E.; Hernández,Cristián E..
Estudio filogenético de los géneros de Lithinini de Sudamérica Austral (Lepidoptera, Geometridae): una nueva clasificación. Se evalúa la taxonomía de la tribu Lithinini de Sudamérica Austral sobre la base de un análisis filogenético. Para el análisis se utilizó a Catophoenissa como grupo externo. Se usaron dos aproximaciones filogenéticas para evaluar las relaciones de parentesco: 1) criterio de parsimonia; e 2) inferencia bayesiana. El análisis de parsimonia se realizó a través del programa PAUP y el análisis bayesiano con cadenas de Markov y Monte Carlo a través del programa BayesPhylogenies. Los resultados generados a partir de la hipótesis filogenética permiten proponer una nueva taxonomía para los Lithinini de Sudamérica Austral. Los géneros validos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Argentina; Chile; Ennominae; Filogenia; Taxonomía.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0085-56262010000100001
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ESTUDIOS MORFO-ANATÓMICOS, CITOGENÉTICOS Y MOLECULARES EN Talinum (TALINACEAE): UNA NUEVA ENTIDAD PARA EL NOROESTE ARGENTINO Acta biol.Colomb.
ANDRADA,Aldo Rubén; SILENZI-USANDIVARAS,Gabriela Mana; RUIZ,Ana Inés; PÁEZ,Valeria de los Angeles; ALBORNOZ,Patricia Liliana.
RESUMEN Talinum paniculatum es una hierba adventicia ampliamente distribuida en Argentina, que tiene importancia económica como maleza de cultivos resistente a herbicidas. Esta especie se presenta en el campo con dos morfotipos y ellos se distinguen por la forma, tamaño y color de sus flores, frutos y hojas. El objetivo de este trabajo fue determinar las características morfo-anatómicas (de hoja y tallo), citogenéticas y moleculares en dos morfotipos de la provincia de Tucumán (Argentina), y establecer diferencias entre ellos. Se utilizaron técnicas morfo-anatómicas y citogenéticas clásicas y se realizaron análisis moleculares con el marcador ITS2. Los resultados evidencian que las características morfológicas, anatómicas, citogenéticas y moleculares de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Anatomía; Cromosomas; Filogenia; ITS2; Mitosis; Morfotipos.
Ano: 2020 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2020000300310
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Estudos filogenéticos e padrões de restrição em Phaeomoniella chlamydospora e Phaeoacremonium spp. associados a podridões de tronco da videira no Rio Grande do Sul. Infoteca-e
CAVALCANTI, F. R.; BERLATTO, J. T.; ALMANÇA, M. A. K.; LOESER, B. G..
Esta publicação investiga os aspectos moleculares dos fungos fitopatogênicos Phaeomoniella chlamydospora e Phaeoacremonium spp., causadores de “chocolate” e doença de Petri em vinhedos no Rio Grande do Sul, Brasil. Foram desenvolvidos métodos moleculares para analisar a filogenia desses fungos e técnicas de Reação em Cadeia da Polimerase (PCR) foram adaptadas para detectá-los. Os fungos foram isolados de partes sintomáticas do tronco. O DNA total foi extraído da biomassa micelial. O sequenciamento de DNA Sanger das amostras de PCR foi utilizado para estudos filogenéticos. A identidade dos patógenos foi confirmada por BLASTN das sequências obtidas nas regiões ITS1/2, ß-tubulina (BTUB) e fator de elongação (EF-1α), por PCR com iniciadores específicos e...
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Doença de Petri; Vitis Vinifera; Chocolate; Filogenia.
Ano: 2024 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1164506
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Etiología, patrón espacio-temporal y análisis filogenético de Armillaria spp., en árboles de durazno [Prunus persica (L.) Batsch.] en el sur del Estado de México. Colegio de Postgraduados
Elías Román, Rubén Damián.
La pudrición de raíces por Armillaria es responsable de la mortalidad significativa de árboles de duraznos en plantaciones del Estado de México, México. En 15 huertas monitoreadas, el promedio en mortalidad de árboles fue 9.7, 15.3 y 20.3% y el área afectada fue 23.2, 24.7 y 28.3% durante 2009, 2010 y 2011, respectivamente. Los portainjertos empleados (‘Nemaguard’ y ‘Criollo de la Goleta’) en la región fueron susceptibles a la enfermedad. Las especies de Armillaria se identificaron mediante la secuenciación de dos regiones de ADN ribosomal (5.8S partial-ITS2-LSU D-dominios y 3' LSU parcial-IGS1) y el gen del factor de elongación-1α (tef-1), las secuencias de ADN se compararon con las especies de Armillaria en el GenBank y se realizaron análisis...
Palavras-chave: Filogenia; Identificación de especies; Portainjertos; Patogenicidad; Enfermedades de raíz; Phylogeny; Species identification; Rootstocks; Pathogenicity; Armillaria root disease; Doctorado; Fruticultura.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/10521/1856
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Evolución de los filotinos (Rodentia, Muridae) en los Andes del Sur RChHN
SPOTORNO,ANGEL E; WALKER,LAURA I; FLORES,SERGIO V; YEVENES,MARCO; MARÍN,JUAN C; ZULETA,CARLOS.
La tribu Phyllotini es un grupo avanzado de 46 especies endémicas entre los Muridae de América del Sur que, estando adaptado a sus ambientes xéricos, parece haber tenido el Altiplano Sur como área de diferenciación original (<A HREF="#REIG">Reig 1986</A>). Esta hipótesis es puesta a prueba examinando la distribución geográfica y los datos citogenéticos de 35 especies, incluyendo la descripción de bandas G de Andinomys edax y Euneomys chinchilloides y su comparación con Phyllotis, bandas AgNOR y FISH para ADNr en siete especies, así como datos de electroforesis de proteínas (118 electroalelos en 12 especies) y de secuencias del gen para citocromo b en el ADNmt (407 pb en 14 especies). Todos los cariotipos resultaron cromosómicamente distintos,...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Cromosomas; Filogenia; Electroforesis de proteínas; Citocromo b; Altiplano.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-078X2001000000019
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GENERALIDADES DE LOS UREDINALES(Fungi: Basidiomycota) Y DE SUS RELACIONES FILOGENÉTICAS Acta biol.Colomb.
ZULUAGA,CATALINA MARÍA; BURITICÁ CÉSPEDES,PABLO; MARÍN-MONTOYA,MAURICIO.
Los hongos-roya (Uredinales, Basidiomycetes) representan uno de los grupos de microorganismos fitoparásitos más diversos y con mayor importancia económica mundial en la producción agrícola y forestal. Se caracterizan por ser patógenos obligados y por presentar una estrecha coevolución con sus hospedantes vegetales. Su taxonomía se ha basado fundamentalmente en el estudio de caracteres morfológicos, resultando en muchos casos en la formación de taxones polifiléticos. Sin embargo, en los últimos años se han tratado de incorporar herramientas moleculares que conduzcan a la generación de sistemas de clasificación basados en afinidades evolutivas. En esta revisión se ofrece una mirada general a las características de los uredinales, enfatizando en el...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Filogenia; Hongos-roya; Puccinia; Secuenciación; Teliosporas.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2009000100003
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Identificação e caracterização de um potyvírus isolado de Zinnia elegans Trop. Plant Pathol.
Maritan,Ana C; Gaspar,José O; Camargo,Luis E. A.
O presente trabalho teve como objetivo a identificação e caracterização de um potyvírus isolado de Zinnia elegans, na Região Noroeste do Estado de São Paulo. O potyvírus foi transmitido por inoculação mecânica e apresentou uma gama restrita de hospedeiras sendo que as espécies mais afetadas pertencem à família Asteraceae. Em SDS-PAGE, a massa molecular da proteína capsidial (CP) foi estimada em 33 kDa e, em "Western-blot", reagiu com anti-soro para o Bidens mosaic virus (BiMV). Um fragmento de aproximadamente 820 pb foi amplificado por RT/PCR, clonado e seqüenciado. O fragmento, que inclui o gene da proteína capsidial, mostrou similaridade de aminoácidos do "core" da CP variando de 55% (Tobacco vein mottling virus, TVMV) a 95% (Sunflower chlorotic mottle...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Sunflower chlorotic mottle virus; Girassol; Asteraceae; Bidens; Filogenia.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582004000100005
Registros recuperados: 41
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