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Deep learning architectures for semantic segmentation and automatic estimation of severity of foliar symptoms caused by diseases or pests. Repositório Alice
GONÇALVES, J. P.; PINTO, F. A. C.; QUEIROZ, D. M.; VILLAR, F. M. M.; BARBEDO, J. G. A.; DEL PONTE, E. M..
Colour-thresholding digital imaging methods are generally accurate for measuring the percentage of foliar area affected by disease or pests (severity), but they perform poorly when scene illumination and background are not uniform. In this study, six convolutional neural network (CNN) architectures were trained for semantic segmentation in images of individual leaves exhibiting necrotic lesions and/or yellowing, caused by the insect pest coffee leaf miner (CLM), and two fungal diseases: soybean rust (SBR) and wheat tan spot (WTS). All images were manually annotated for three classes: leaf background (B), healthy leaf (H) and injured leaf (I). Precision, recall, and Intersection over Union (IoU) metrics in the test image set were the highest for B, followed...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Aprendizado profundo; Fitopatometria; Inteligência artificial; Aprendizado de máquina; Rede neural convolucional; Segmentação de imagem; Phytopathometry; Machine learning; Convolutional neural network; Image segmentation; Doença de Planta; Artificial intelligence; Plant diseases and disorders; Neural networks.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1134326
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Elaboração e validação de escala diagramática para quantificação da mancha de isariopsis da videira Ciência Rural
Lenz,Giuvan; Costa,Ivan Dressler da; Balardin,Ricardo Silveiro; Marques,Leandro Nascimento; Arrué,Adriano; Stefanelo,Maurício Silva; Zemolin,Carla Rejane.
A falta de um método-padrão de quantificação visual para doenças foliares pode levar a estimativas imprecisas da severidade destas, provocando conclusões erradas. O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma escala diagramática para avaliação da mancha de isariopsis em videira causada por Isariopsis clavispora. Uma escala diagramática com seis níveis (1,60; 3,20; 6,60; 13,00; 24,10 e 40,24%) foi desenvolvida e validada para quantificar a severidade da mancha de isariopsis em videira. A validação da escala foi realizada por oito avaliadores, que estimaram a severidade de 30 folhas com diferentes intensidades de doença. Por meio de regressão linear, confrontando valores de severidade reais e estimados, foram analisadas a acurácia e a precisão dos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Isariopsis clavispora; Pseudocercospora vitis; Diagnose; Mancha foliar; Fitopatometria.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000800005
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Elaboração e validação de escalas diagramáticas para avaliação da severidade da mancha-bacteriana do feijão - caupi em cultivares com trifólios morfologicamente distintos Ciência Rural
Lima,Hyanameyka Evangelista de; Nechet,Kátia de Lima; Vieira,Bernardo de Almeida Halfeld; Oliveira,José Rogério de; Duarte,Henrique da Silva Silveira; Queiroz,Ezequiel de Souza; Oliveira,Francidalva de Lima.
Duas escalas diagramáticas foram desenvolvidas para quantificar a severidade da mancha-bacteriana do feijão-caupi, causada pela bactéria Xanthomonas axonopodis pv. vignicola, em cultivares de feijão-caupi de trifólios com folíolos ovais e lanceolados. Trifólios com diferentes níveis de severidade foram coletados para determinação do limite mínimo e máximo de severidade, sendo níveis intermediários determinados de acordo com a "Lei do Estímulo de Weber-Fechner". Os níveis propostos foram: 0,05; 0,25; 1,00; 3,40; 9,70; e 17,70% para trifólios com folíolos ovais e 0,10; 0,35; 1,10; 3,50; 9,30; e 19,10% para trifólios com folíolos lanceolados. As escalas foram validadas por meio do cálculo da sua acurácia e precisão. Para tanto, realizou-se análises de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Epidemiologia; Quantificação; Fitopatometria; Vigna unguiculata; Xanthomonas axonopodis pv. Vignicola.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013001000001
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Escala diagramática para avaliação da severidade da antracnose em bastão do imperador Ciência Rural
Barguil,Beatriz Meireles; Albert,Igor Corrêa Lima; Michereff,Sami Jorge; Oliveira,Sônia Maria Alves de.
A antracnose, causada pelo fungo Colletotrichum gloeosporioides (Penz.) Sacc., é uma importante doença do bastão do imperador [Etlingera elatior (Jack) Smith] no Nordeste brasileiro. Considerando a inexistência de métodos padronizados para quantificação dessa doença, foi elaborada uma escala diagramática com os níveis 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64, 82 e 92% de área da bráctea lesionada, testando-se a acurácia, a precisão e a reprodutibilidade das estimativas de severidade da antracnose com e sem a utilização da escala. A escala diagramática foi validada por 10 avaliadores, usando 45 brácteas com diferentes níveis de severidade da antracnose. Sem a escala, a maioria dos avaliadores superestimou a severidade da doença. Com a escala, os avaliadores obtiveram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Etlingera elatior; Colletotrichum gloeosporioides; Fitopatometria.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000300034
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Escala diagramática para avaliação da severidade da antracnose em pinha Ciência Rural
Correia,Kamila Câmara; Martins,Ricardo Brainer; Câmara,Marcos Paz Saraiva; Michereff,Sami Jorge.
A antracnose, causada por Colletotrichum gloeosporioides, é uma importante doença da pinha (Annona squamosa) no Brasil e em nível mundial. Devido à inexistência de métodos padronizados para quantificação dessa doença, foi desenvolvida uma escala diagramática com níveis de 1, 2, 5, 10, 20 e 40% de área foliar lesionada. A escala diagramática foi validada por 10 avaliadores, baseado em 48 folhas de pinha com diferentes níveis de severidade da antracnose, mensurados previamente com o programa Assess®. A acurácia, a precisão e a reprodutibilidade das estimativas de cada avaliador foi determinada por regressão linear simples entre a severidade real e a estimada, com e sem o auxílio da escala. Com a escala, os avaliadores obtiveram melhores níveis de acurácia e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Annona squamosa; Colletotrichum gloeosporioides; Fitopatometria.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000100001
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Escala diagramática para avaliação da severidade da cercosporiose em caupi Ciência Rural
Albert,Igor Corrêa Lima; Noronha,Marissônia de Araújo; Martins,Ricardo Brainer; Michereff,Sami Jorge.
A cercosporiose, causada por Cercospora cannescens e Pseudocercospora cruenta, é uma importante doença do caupi (Vigna unguiculata) no Brasil. Devido à inexistência de métodos padronizados para quantificação dessa doença, foi desenvolvida uma escala diagramática com níveis de 1, 2, 4, 8, 16, 32, 64 e 82% de área foliar lesionada. A escala diagramática foi validada por 10 avaliadores, usando 50 folíolos de caupi com diferentes níveis de severidade, mensurados previamente com o programa Assess®. A acurácia, a precisão e a reprodutibilidade das estimativas de cada avaliador foi determinada por regressão linear simples entre a severidade real e a estimada, com e sem o auxílio da escala. Com a escala, os avaliadores obtiveram melhores níveis de acurácia e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Vigna unguiculata; Cercospora canescens; Pseudocercospora cruenta; Fitopatometria.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000700036
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Escala diagramática para avaliação de severidade de mancha-de-septoria em girassol Ciência Rural
Lenz,Giuvan; Costa,Ivan Dressler da; Balardin,Ricardo Silveiro; Stefanelo,Maurício Silva; Marques,Leandro Nascimento; Arrué,Adriano.
A falta de um método-padrão de quantificação visual para doenças foliares pode levar a estimativas imprecisas da severidade dessas doenças, induzindo os avaliadores a conclusões erradas. O objetivo deste trabalho foi desenvolver uma escala diagramática para avaliação da mancha-de-septoria em girassol, causada por Septoria helianthi. Uma escala diagramática com cinco níveis (2; 12; 26; 48,0; e 71%) foi desenvolvida e validada para quantificar a severidade da mancha-de-septoria em girassol. A escala considerou o limite de severidade máxima da doença observado no campo, e os níveis intermediários seguiram incrementos logarítmicos, obedecendo-se à "Lei do estímulo de Weber-Fechner". Inicialmente, a estimativa da severidade foi feita sem auxílio da escala em 30...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fitopatometria; Mancha foliar; Septoria helianthi.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000800040
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Escala diagramática para avaliação de severidade de mancha-parda em arroz Ciência Rural
Lenz,Giuvan; Balardin,Ricardo Silveiro; Corte,Gerson Dalla; Marques,Leandro Nascimento; Debona,Daniel.
Uma escala diagramática com seis níveis: 1,6; 3,2; 6,4; 12,6; 23,1 e 38,6% foi desenvolvida e validada para quantificar a severidade da mancha-parda em arroz causada por Bipolaris oryzae. A escala considerou o limite de severidade máxima da doença observado no campo, e os níveis intermediários seguiram incrementos logarítmicos, obedecendo-se à "Lei do estímulo de Weber-Fechner". Inicialmente, a estimativa da severidade foi realizada sem auxílio da escala, em 30 folhas com diferentes níveis de severidade, por oito indivíduos, sem experiência na avaliação de doenças. Em seguida, os mesmos avaliadores utilizaram a escala diagramática proposta. As avaliações com a escala diagramática foram mais precisas e acuradas nas estimativas de todos os avaliadores, não...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bipolaris oryzae; Drechslera oryzae; Diagnose; Mancha foliar; Fitopatometria.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000400002
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Escalas diagramáticas para avaliação da severidade do cancro cítrico Trop. Plant Pathol.
Belasque Júnior,José; Bassanezi,Renato B.; Spósito,Marcel B.; Ribeiro,Luciane M.; Jesus Junior,Waldir C. de; Amorim,Lilian.
Escalas diagramáticas são importantes ferramentas na avaliação da severidade de doenças. Objetivando padronizar a estimativa da severidade do cancro cítrico em folhas de citros (Citrus sinensis) causada por Xanthomonas axonopodis pv. citri, foram elaboradas quatro escalas diagramáticas, considerando a ocorrência de lesões isoladas pequenas (LP), médias (LM) e grandes (LG) e de lesões associadas com o ataque da larva minadora dos citros (LMC). Cada escala possui oito níveis de porcentagens da área foliar lesionada: 0,2 a 16% para LP; 0,6 a 25% para LM; 1,8 a 30% para LG e 0,5 a 30% para LMC. Inicialmente, seis avaliadores estimaram a severidade de 447 imagens digitalizadas de folhas sintomáticas com o auxílio das quatro escalas. Após treinamento, foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fitopatometria; Citrus sinensis; Xanthomonas axonopodis pv. citri; Avaliação de doenças.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582005000400008
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Relações entre intensidade da doença, refletância da radiação solar e rendimento de grãos no patossistema ferrugem da folha de trigo Embrapa 16 Trop. Plant Pathol.
Reis,Erlei M.; Leites,Airton; Forcelini,Carlos A..
Em experimentos com o cultivar de trigo Embrapa 16 conduzidos em Passo Fundo e Não-Me-Toque nas safras de 1999 e 2000 houve uma relação inversa entre a incidência foliar da ferrugem da folha do trigo, a severidade, o número de pústulas por centímetro quadrado e a área abaixo da curva de progresso da doença com o rendimento de grãos, e uma relação direta entre a refletância da radiação solar, na faixa de 810 nm, com o rendimento de grãos. A refletância da radiação solar na faixa permitiu estimar o rendimento de grãos do trigo, a severidade da doença e o número de pústulas cm-2. As equações da função de dano com maior R² obtidas pela análise de regressão permitem o cálculo do limiar de dano econômico (LDE) em diferentes estádios fenológicos da cultura. O LDE...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fitopatometria; Limiar de dano econômico; Radiometria.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-41582006000500003
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Standard area diagram set for bacterial spot assessment in fruits of yellow passion fruit. Repositório Alice
COSTA, A. P.; PIRES, M. de C.; PEIXOTO, J. R.; BLUM, L. E. B.; FALEIRO, F. G..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Passiflora edulis Sims; Xanthomonas axonopodis pv passiflorae; Fitopatometria; Passiflora Edulis; Bacteriose; Fruto.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115135
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