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A genômica funcional no âmbito da produção animal: estado da arte e perspectivas R. Bras. Zootec.
Furlan,Luiz Roberto; Ferraz,André Luiz Julien; Bortolossi,Julio César.
Os últimos vinte anos caracterizaram-se pela proliferação de tecnologias que tornaram possível decifrar o genoma das espécies, localizar e identificar particularidades na sua seqüência, elucidar as suas funções dentro dos sistemas biológicos e, sobretudo, começar a entender os mecanismos que controlam as interações entre os genótipos e os estímulos ambientais, que são responsáveis pela diversidade fenotípica. Estes estudos sobre as bases moleculares da variabilidade fenotípica abriram uma nova abordagem científica, caracterizada pela multiplicidade das questões envolvidas, que resultou no surgimento de novas áreas de pesquisa, cujos conhecimentos estão sendo aplicados em diversos campos da biologia, inclusive na zootecnia. Tendo em vista o grande impacto...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovinos; Expressão gênica; Genômica funcional; Microarrays; Nutrição; Polimorfismo.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007001000030
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Agrobacterium-mediated genetic transformation of Vitis sp. somatic embryogenesis. Repositório Alice
QUECINI, V.; SINSKI, I.; BOSCO, D. D.; REVERS, L. F.; BERND, R. B.; RITSCHEL, P. S.; CAMARGO, U. A..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viticultura; Uva; Engenharia genética; Genômica funcional; BRS Clara; Chardonnay.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/543181
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Análise de associação quanto à produtividade e seus caracteres componentes em linhagens e cultivares de arroz de terras altas. Repositório Alice
MENDES, C. dos A.; BORBA, T. C. de O.; BUENO, L. G.; CRUZEIRO, G. A. V.; MENDONÇA, J. A.; PANTALIÃO, G. F.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi identificar, por meio da análise de mapeamento associativo, os marcadores moleculares relacionados à produtividade do arroz de terras altas e aos seus caracteres componentes. Foram usadas 113 linhagens e cultivares de arroz de terras altas, da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa, com reduzido vínculo genético entre si. Os seguintes caracteres componentes da produtividade foram avaliados: número de panículas por metro, número de grãos por panícula e peso de 100 grãos. Dos 115 marcadores utilizados, 25 (21,7%) associaram-se significativamente a um ou mais caracteres. Entre os 29 SSR ("simple sequence repeats") colocalizados em QTL ("quantitative trait loci") de produtividade de arroz, 12 foram associados aos caracteres avaliados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Coleção nuclear; Desequilíbrio de ligação; Genômica funcional; Mapeamento associativo; Seleção assistida por marcadores; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético; Germoplasma; Marcador genético.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1001903
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Análise de associação quanto à produtividade e seus caracteres componentes em linhagens e cultivares de arroz de terras altas PAB
Mendes,Clistiane dos Anjos; Borba,Tereza Cristina de Oliveira; Bueno,Luíce Gomes; Cruzeiro,Gustavo Alencastro Veiga; Mendonça,João Antônio; Pantalião,Gabriel Feresin; Vianello,Rosana Pereira; Brondani,Claudio.
O objetivo deste trabalho foi identificar, por meio da análise de mapeamento associativo, os marcadores moleculares relacionados à produtividade do arroz de terras altas e aos seus caracteres componentes. Foram usadas 113 linhagens e cultivares de arroz de terras altas, da Coleção Nuclear de Arroz da Embrapa, com reduzido vínculo genético entre si. Os seguintes caracteres componentes da produtividade foram avaliados: número de panículas por metro, número de grãos por panícula e peso de 100 grãos. Dos 115 marcadores utilizados, 25 (21,7%) associaram-se significativamente a um ou mais caracteres. Entre os 29 SSR ("simple sequence repeats") colocalizados em QTL ("quantitative trait loci") de produtividade de arroz, 12 foram associados aos caracteres avaliados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Oryza sativa; Coleção nuclear; Desequilíbrio de ligação; Genômica funcional; Mapeamento associativo; Seleção assistida por marcadores..
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2014001000771
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Decifrando o genoma em grande escala. Repositório Alice
SOUSA, S. M. de; CARNEIRO, A. A.; CARNEIRO, N. P..
A determinação das funções gêni~~stem de~andado um grande avanço das ciências genômicas, cujas tecnologias concentram-se, principalmente, na geração e no estudo de uma grande quantidade de dados. O ponto de apoio para o entendimento da função gênica e da estrutura do genoína tem sido o sequenciamento de genomas completos e do genoma expresso em grande escala. Mapas físicos e genéticos têm sido integrados com informações genôrnicas e de expressão, resultando em bancos de dados públicos altamente informativos para diferentes espécies animais evegetais. Tais informações auxiliam em vários aspectos a análise·de expressão gênica, a determinação dos efeitos de processamento de éxons.e do número de cópias gênicas e cromossômicas, culminando na determinação das...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: DNA; Fenotipagem; Sequenciamento de DNA; Genômica funcional.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/580299
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Expressão gênica induzida por estresses abióticos em nódulos de feijão-caupi PAB
Silva,Helder Anderson Pinto da; Galisa,Péricles de Souza; Oliveira,Roselaine Sanches da Silva; Vidal,Marcia Soares; Simões-Araújo,Jean Luiz.
O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito isolado ou simultâneo dos estresses hídrico e térmico na expressão gênica em nódulos de feijão-caupi. A bactéria Bradyrhizobium japonicum (estirpe BR 3267) foi inoculada em sementes de feijão-caupi da cultivar IPA 206 e, 35 dias após a germinação, as plantas foram submetidas a diferentes regimes de disponibilidade hídrica e a estresse térmico, em casa de vegetação. Para a identificação dos genes diferencialmente expressos, foi utilizada a técnica de cDNA-AFLP, tendo-se isolado 67 fragmentos derivados de transcritos (FDTs) diferencialmente expressos. Após o sequenciamento dos FDTs e das análises de similaridade, com uso do programa Blastx, foram identificados 14 genes diferencialmente expressos envolvidos em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Vigna unguiculata; CDNA-AFLP; Fixação biológica de nitrogênio; Genômica funcional.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2012000600010
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Gene transfer to Vitis sp. via co-cultivation of shoot apices with Agrobacterium tumefaciens. Repositório Alice
QUECINI, V.; SINSKI, I.; BOSCO, D. D.; REVERS, L. F.; RITSCHEL, P. S.; CAMARGO, U. A..
2008
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Viticultura; Uva; Engenharia genética; Genômica funcional; BRS Clara; Chardonnay.
Ano: 2008 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/543186
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Ionoma de plantas: cenário atual e perspectivas Ciência Rural
Silva,Adriano Alves da; Delatorre,Carla Andrea; Moraes,Marcelo Gravina de.
Os sistemas biológicos são governados pela soma de todos os genes expressos, proteínas, metabólitos e elementos de um organismo. A análise do ionoma de um tecido auxilia a identificar, entre outros aspectos, genes que contribuam para maior ou menor acúmulo de elementos essenciais e metais pesados, bem como a interação entre processos metabólicos. O conhecimento do ionoma, aliado ao uso de técnicas de biologia molecular, formam um sistema muito eficiente para mapeamento gênico, para estudos de genômica funcional e para caracterização geral do estado fisiológico das plantas em uma determinada condição. Além disso, o estudo do ionoma permite avaliar as interações existentes entre os mais diversos íons das plantas e como a disponibilidade de um íon afeta a...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Genômica funcional; Transportadores de íons; Nutrientes minerais.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000800015
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Metabolômica e espectrometria de massas. Infoteca-e
ABDELNUR, P. V..
2011
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Metabolômica; Genômica funcional; Genômica; Transcriptômica; Proteômica; Metabolômica; Biologia sistêmica.
Ano: 2011 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/917736
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Photoreceptor and circadian-clock genes in Vitis vinifera: genome-wide identification, organization and expression profiling. Repositório Alice
QUECINI, V.; DAL BOSCO, D.; SINSKI, I.; GIRARDI, C. L.; CAMARGO, U. A..
Plants growth and development are synchronized to the environment by the integration of endogenous processes and envitonmental cues, mainly light and temperature.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genômica funcional; Desenvolvimento; Fotoreceptor; Identificação genômica; Perfil de expressão; Organização; Viticultura; Uva; Engenharia genética; Embriogênese; Gene; Genoma.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/580893
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Preparação de ovários de Brachiaria para LCM (Laser Capture Microdissection) - microdissecção por captura a laser. Infoteca-e
SILVEIRA, E. D.; DUSI, D. M. de A.; CARNEIRO, V. T. de C..
2007
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Biotecnologia; Brachiaria; Desenvolvimento apomítico; Desenvolvimento sexual; Vias moleculares; Genes; Desenvolvimento reprodutivo; Apomixia; Genômica funcional.
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/189373
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Sequenciamento de DNA de nova geração e suas aplicações na genômica de plantas Ciência Rural
Carvalho,Mayra Costa da Cruz Gallo de; Silva,Danielle Cristina Gregorio da.
As plataformas de sequenciamento de nova geração são uma alternativa poderosa para estudos de genômica estrutural e funcional. Na genômica de plantas, os trabalhos com as novas plataformas têm sido destinados ao sequenciamento de transcritos, ressequenciamento ou sequenciamento de novo de genomas plastidiais. Neste trabalho, são detalhadas as tecnologias das plataformas mais utilizadas atualmente, bem como é revisada a aplicação dessas tecnologias na genômica estrutural e funcional de plantas.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Leituras curtas; Ressequenciamento; Sequenciamento de novo; Genômica estrutural de plantas; Transcritômica de plantas; Genômica funcional.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000300040
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