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	Provedor de dados Repositório Alice (26) Autor FARIAS, J. R. B. (4) NEPOMUCENO, A. L. (4) NEUMAIER, N. (4) BORÉM, A. (3) EMYGDIO, B. M. (3) GIRARDI, C. L. (3) MARCELINO-GUIMARÃES, F. C. (3) MARRACCINI, P. (3) NAKAYAMA, T. J. (3) OLIVEIRA, A. C. B. de (3) RODRIGUES, F. A. (3) ROMBALDI, C. V. (3) STORCH, T. T. (3) AFONSO, J. (2) ANDRADE, A. C. (2) BUSS, C. E. (2) CESAR, A. S. M. (2) COUTINHO, L. L. (2) DINIZ, W. J. da S. (2) FINATTO, T. (2) Mais... Palavra-chave Gene expression. (26) Expressão gênica (5) Endogenous genes (3) Flooding (3) Housekeeping genes (3) Café (2) Coffea Arábica. (2) Coffee (2) Internal control genes. (2) Network analysis (2) Sheep (2) 1-methylcyclopropene (1) A-L-Arabinofuranosidase (1) Abiotic stress (1) Amadureceimento (1) Análises moleculares (1) Armazenamento refrigerado (1) Arroz (1) Beans (1) Biomarcadores (1) Mais... Tipo do documento Artigo de periódico (11) Separatas (7) Anais e Proceedings de eventos (5) Parte de livro (3) Ano 2018 (1) 2017 (8) 2016 (2) 2015 (2) 2014 (4) 2013 (2) 2011 (4) 2010 (1) 2009 (1) 2007 (1) Mais... País Brazil (26) Idioma Inglês (17) Português (9)		Ordenar por:  Relevância Autor Título Ano Registros recuperados: 26 Primeira ... 1 2 ... Última An improved method for RNA extraction from common bean seeds and validation of reference genes for qPCR. Repositório Alice PEREIRA, W. J.; BASSINELLO, P. Z.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P.. An RNA extraction method with high integrity and purity as well as the selection of adequate reference genes are prerequisites for gene expression analysis. For common bean seeds, there is no well-defined protocol that can be used in a laboratory routine for gene expression analysis. In this study, an extraction protocol for RNA from common bean seeds, which produced material with good integrity for qPCR (RIN ≥ 6.5), was optimized. In addition, 10 reference genes were evaluated under qPCR standard conditions using different tissue samples of common beans. Gene stabilities were analyzed using the delta-CT method, Bestkeeper, NormFinder and geNorm approaches. The genes β-tubulin and T197 were ranked as the most stable among the sample sets... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Gene normalization; Molecular breeding; Grain RNA extraction; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento; RNA; Beans; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076282 Analise da expressão do gene manose 6 fosfato redutase em cafeeiros submetidos ao déficit hídrico. Repositório Alice FREIRE, L. P.; MARRACCINI, P.; RODRIGUES, G. C.; ANDRADE, A. C.. RESUMO: Os efeitos do déficit hídrico sobre a expressão do gene CaM6PR, codificando a manose-6-fosfato redutase, foram avaliados em cafeeiros em fase de formação das cultivares IAPAR59 (Villa Sarchi x hibrido de Timor HT832/2) e RUBI MG 1192 (Mundo Novo x Catuaí) de Coffea arabica, consideradas respectivamente como tolerante e sensível ao estresse hídrico. As cultivares foram plantadas em dezembro de 2007 no campo experimental da Embrapa Cerrados ? DF (CPAC) e cultivadas durante dois anos (2008 e 2009) com (I) e sem (NI) irrigação. Para cada ano, foram realizadas duas avaliações (P1, não estressado, durante a estação chuvosa e P2, estação seca). Para as duas cultivares, a expressão do gene CaM6PR foi medido em folhas por meio da técnica de PCR... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Expressão de genes; Expressão gênica; Estresse abiótico; Genes candidatos; PCR quantitativo; Coffea Arábica.; Abiotic stress; Gene expression.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/970675 Análises da expressão gênica por PCR quantitativo em tempo real (QPCR) de genes candidatos para a tolerância à seca em cafeeiro. Repositório Alice VINECKY, F.; ALVES, G. S. C.; VIEIRA, N. G.; FREIRE, L. P.; HEIMBECK, I. G. R.; FERRÃO, R. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRAO, M. A. G.; SILVA, V. A.; MARRACCINI, P.; ANDRADE, A. C.. A seca é uma das principais limitações climáticas à produção do cafeeiro. A importância dessa limitação deve aumentar, em função das mudanças reconhecidas no clima global e, também, porque a cafeicultura vem sendo expandida para regiões marginais onde a baixa pluviosidade e temperaturas desfavoráveis se constituem grandes limitações à produção do café. A seca induz diversas respostas fisiológicas e moleculares nas plantas, incluindo alterações da expressão gênica, visando atingir ajuste osmótico, a indução de reparadores de sistemas moleculares e a expressão de diversas proteínas protetoras. Existem diversas formas de se avaliar a expressão gênica em plantas submetidas ao estresse hídrico. Uma técnica amplamente utilizada nos últimos anos, para a análise... Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Expressão gênica; Gene candidato; Candidate genes.; Coffea Canephora; Seca.; Drought; Gene expression.. Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903864 Co-expression network analysis identifies genes associated with iron content in bovine muscle. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; ROCHA, M. I. P.; LIMA, A. O. de; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Editores: Luiz Lehmann Coutinho, ESALQ/USP; Luciana Correia de Almeida Regitano, Embrapa Pecuária Sudeste; Gerson Barreto Mourão, ESALQ/USP; Aline Silva Mello Cesar, ESALQ/USP; Bárbara Silva Vignato, FZEA/USP; Mirele Daiana Poleti, ESALQ/USP; Wellison Jarles da Silva Diniz, UFSCar. Tipo: Separatas Palavras-chave: Network analysis; Systems biology.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075630 Co-expression network analysis identifies genes associated with meat tenderness. Repositório Alice DINIZ, W. J. da S.; CESAR, A. S. M.; GEISTLINGER, L.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; AFONSO, J.; ROCHA, M. I. P.; LIMA, A. O. de; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.. Tenderness is an important trait of meat quality and is known to be influenced by several factors including genetic composition. Tipo: Separatas Palavras-chave: Network analysis; System biology.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080848 Contrasting transcriptional programs control postharvest development of apples (Malus x domestica Borkh.) submitted to cold storage and ethylene blockage. Repositório Alice STORCH, T. T.; FINATTO, T.; BRUNEAU, M; ORSEL-BALDWIN, M.; RENOU, J-P; ROMBALDI, C. V.; QUECINI, V.; LAURENS, F.; GIRARDI, C. L.. Apple is commercially important worldwide. Favorable genomic contexts and postharvest technologies allow year-round availability. Although ripening is considered a unidirectional developmental process toward senescence, storage at low temperatures, alone or in combination with ethylene blockage, is effective in preserving apple properties. Quality traits and genome wide expression were integrated to investigate the mechanisms underlying postharvest changes. Development and conservation techniques were responsible for transcriptional reprogramming and distinct programs associated with quality traits. A large portion of the differentially regulated genes constitutes a program involved in ripening and senescence, whereas a smaller module consists of genes... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Microarray.; 1-methylcyclopropene; Firmness; Fruit quality; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077795 Domestication syndrome in cassava (Manihot esculenta Crantz): assessing morphological traits and differentially expressed genes associated with genetic diversity of storage root. Repositório Alice CARVALHO, L. J. C. B.; ANDERSON, J. V.; CHEN, S.; MBA, C.; DOGRAMACI, M.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: M esculenta subsp flabellifolia; M esculenta subsp esculenta; Domestication syndrome; Genetic diversity.; Manihot; Cassava; Gene expression.. Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1089069 Ethylene-dependent regulation of an alpha-L-arabinofuranosidase is associated to firmness loss in 'Gala' apples under long term cold storage. Repositório Alice STORCH, T. T.; FINATTO, T.; PEGORARO, C.; DAL CERO, P.; LAURENS, F.; ROMBALDI, C. V.; QUECINI, V.; GIRARDI, C. L.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Methylcyclopropene; A-L-Arabinofuranosidase; Cell wall; Malus x domestica.; Gene expression.. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1012162 FSH dose and strategy of administration during ovarian stimulation alter the gene expression profile in ovine cumulus-oocyte complexes. Repositório Alice BRAGANÇA, G. M.; BATISTA, R. I. T. P.; SOUZA FABJAN, J. M. G. de; ALFRADIQUE, V. A. P.; CORTÊS, L. R.; CAMARGO, L. S. de A.; FONSECA, J. F. da; BRANDÃO, F. Z.. Ovarian stimulation is an important tool to increase the number of oocytes obtained by laparoscopy for the in vitro production of embryos (IVP). In sheep, different concentrations of FSH administered in single dose (SD) or multiple doses (MD) have been adopted. In parallel, the oocyte quality is fundamental for IVP success, so strategies to produce more competent oocytes have been evaluated. The aim of this study was to evaluate the gene expression profile of BCB+ COC from different hormonal protocols of ovarian stimulation in Santa Inês ewes. To achieve that, a cross-over design was used, where 12 pluriparous ewes had their follicular wave synchronized (Balaro et al., Domest Anim Endocrinol, 54: 10-14, 2016). At 80 h after progestogen implant removal, all... Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Expressão gênica; Produção de embriões in vitro; FSH; Embryo Technology; In vitro embryo production.; Ovino; Reprodução animal; Transferência de embrião; Sheep; Reproduction; Ova; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1074359 Histological analysis and transcription profiles on somatic embryogenesis in interspecific hybrids of Elaeis guineensis × E. oleifera. Repositório Alice ANGELO, P. C. da S.; STEINMACHER, D. A.; LOPES, R.; CUNHA, R. N. V. da; GUERRA, M. P.. Elaeis guineensis (African oil palm) and E. oleife- ra (American oil palm) are bred to attain high oil yields, disease resistances, and decelerated shoot elongation. We cultivated immature zy- gotic embryos from backcrossed and F1 inter- specific progenies on media containing 110, 150, or 200 mg·l?1 2,4-diclorophenoxyacetic acid (2,4- D) to obtain embryogenic cultures. Tipo: Separatas Palavras-chave: Caiaué; Dendê.; Gene expression.. Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/972574 Identificação e caracterização molecular de genes envolvidos no metabolismo de diterpenos específicos do cafeeiro. Repositório Alice FERREIRA, L. P.; PLENER, L.; MARRACCINI, P.; PEREIRA, L. F. P.; VIEIRA, L. G. E.; POT, D.. Apesar de pouco estudado, os lipídeos do café desempenham papel importante na qualidade da bebida e do aroma. Cerca de dez a vinte por cento da fração lipídica do café corresponde a diterpenos que além da provável relação com a qualidade também estão relacionados com a questão do café e a saúde. As espécies de Coffea são as únicas capazes de sintetizar os diterpenos cafestol, caveol e seus compostos derivados (16-O-metilcafestol, 16-O-metilcaveol). Visando um entendimento maior dos genes envolvidos na formação dos diterpenos de café, foi realizado um estudo in silico da expressão de três genes que codificam para as primeiras etapas da sua via de biossíntese ? copalil difosfato sintase (CPS), caureno sintase (KS) e caureno oxidase (KO). Posteriormente foi... Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Coffee; Expressão gênica; Maturation.; Café; Maturação.; Coffea; Gene expression.. Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906314 Identification and validation of reference genes for the normalization in real-time RT-qPCR on rice and red rice in competition, under different nitrogen doses. Repositório Alice BENEMANN, D. P.; NOHATO, A. M.; VARGAS, L.; AVILA, L. A.; AGOSTINETTO, D.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Arroz; Oryza Sativa.; Rice; Red rice; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1070085 Identification of biomarkers associated to 'Gala' apples ripening and postharvest quality . Repositório Alice PEGORARO, C.; STORCH, T. T.; CRIZEL, G. R.; ROMBALDI, C. V.; GIRARDI, C. L.. Apple is, sociocultural and economically, on of the most important species in the world, and stands out for its high storage potential. However, the monitoring of factors that could result in fruit quality modifications during postharvest is essential to ensure the acceptability and for the development of new storage technologies in order to increase fruit shelf life. Approaches focused on molecular biology, such as RT-qPCR have been used to better understand the mechanisms involved in fruit development and maturation. In this study the use of RT-qPCR to monitoring apple quality during ripening and development in different postharvest conditions such as room temperature, cold storage with or without control of atmosphere and the 1-methylcyclopropene usage... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Molecular analysis; Armazenamento refrigerado; Expressão genética; Análises moleculares; Biomarcadores; Amadureceimento; Maçã gala.; Malus doméstica; Maçã; Pós-Colheita.; Gene expression.; Cold storage. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1078129 Identification of differentially expressed transcripts by Pasteurella multocida iron-starved conditions by RNA-seq. Repositório Alice SILVA, M. I. V.; CHITARRA, C. S.; REIS, I. H. V.; OLIVEIRA FILHO, J. X.; MORES, N.; NAKAZATO, L.; DUTRA, V.. Tipo: Separatas Palavras-chave: Pasteurelosis; Iron limitation.; RNA.; Gene expression.. Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1033849 Identification of new Corynebacterium pseudotuberculosis antigens by immunoscreening of gene expression library. Repositório Alice GALVÃO, C. E.; FRAGOSO, S. P.; OLIVEIRA, C. E. de; FORNER, O.; PEREIRA, R. R. B.; SOARES, C. O.; ROSINHA, G. M. S.. Background: Caseous lymphadenitis (CLA) is a disease that affects sheep, goats and occasionally humans. The etiologic agent is the Corynebacterium pseudotuberculosis bacillus. The objective of this study was to build a gene expression library from C. pseudotuberculosis and use immunoscreening to identify genes that encode potential antigenic proteins for the development of DNA and subunit vaccines against CLA. Results: A wild strain of C. pseudotuberculosis was used for extraction and partial digestion of genomic DNA. Sequences between 1000 and 5000 base pairs (bp) were excised from the gel, purified, and the digested DNA fragments were joined to bacteriophage vector ZAP Express, packaged into phage and transfected into Escherichia coli . For... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: DNA vaccines.; Corynebacterium Pseudotuberculosis.; Caseous lymphadenitis; Sheep; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079448 Identification of reference genes for RT-qPCR analysis in peach genotypes with contrasting chilling requirements. Repositório Alice MARINI, N.; BEVILACQUA, C. B.; BÜTTOW, M. V.; RASEIRA, M. do C. B.; BONOW, S.. Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Housekeeping genes; RT qPCR.; Prunus Persica.; Gene expression.. Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077661 Manganese phosphite in Coffee defence against Hemileia vastatrix, the coffee rust fungus: biochemical and molecular analyses. Repositório Alice MONTEIRO, A. C. A.; RESENDE, M. L. V. de; VALENTE, T. C. T.; RIBEIRO JUNIOR, P. M.; PEREIRA, V. F.; COSTA, J. R. da; SILVA, J. A. G. da. Phosphites (Phi) are inorganic salts of phosphorous acid that have been used as resistance elicitors to activate mechanisms underlying plant defence. This study assessed the effectiveness of manganese phosphite (MnPhi) for the management of rust (Hemileia vastatrix) on coffee seedlings. The effect of this compound on the induction of resistance was also measured by the expression of defence-related genes such as POX (peroxidase), CAT (catalase), GLU (b-1.3-glucanase) and PAL (phenylalanine ammonia-lyase) and by the activity of defence enzymes such as ascorbate peroxidase (APX), superoxide dismutase (SOD) and polyphenol oxidase (PPO). Foliar sprayings of MnPhi on coffee seedlings provided 63% control of rust severity. This compound induced defence responses... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Ferrugem do café; Enzymatic activity; Rust.; Resistance elicitor; Café; Fungo; Coffea Arábica.; Gene expression.. Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067414 Mineração de textos aplicada à análise de dados de expressão gênica por microarranjos. Repositório Alice YASUDA, R. S.; HIGA, R. H.. Este trabalho se insere no projeto "Rede Genômica Animal" e tem por objetivo construir uma ferramenta que utilize técnicas de mineração de textos para apoiar a interpretação biológica de dados de experimentos de expressão gênica. Por isso, os dados de expressão gênica a serem utilizados para validação da ferramenta são aqueles gerados no escopo do projeto "Rede Genômica Animal", referente ao organismo Bos taurus. Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Mineração de textos; Expressão gênica; Microarranjos; Recuperação da informação; Data mining.; Microarray technology; Information retrieval; Gene expression.. Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/868739 Molecular characterization of genetically modified soybean lines developed aiming to obtain drought tolerance. Repositório Alice ROLLA, A. A. P.; KANAMORI, N.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARIN, S. R. R.; ENGLES, C.; YAMAGUCHI-SHINOZAKI; FARIAS, J. R. B.; NEUMAIER, N.; ABDELNOOR, R. V.; MARCELINO, F. C.; NEPOMUCENO, A. L.. Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Gene expression.. Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/913815 Reference genes for quantitative real-time polymerase chain reaction studies in soybean plants under hypoxic conditions. Repositório Alice NAKAYAMA, T. J.; RODRIGUES, F. A.; NEUMAIER, N.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C.; FARIAS, J. R. B.; OLIVEIRA, M. C. N. de; BORÉM, A.; OLIVEIRA, A. C. B. de; EMYGDIO, B. M.; NEPOMUCENO, A. L.. Quantitative real-time polymerase chain reaction (RT-qPCR) is a powerful tool used to measure gene expression. However, because of its high sensitivity, the method is strongly influenced by the quality and concentration of the template cDNA and by the amplification efficiency. Relative quantification is an effective strategy for correcting random and systematic errors by using the expression level of reference gene(s) to normalize the expression level of the genes of interest. To identify soybean reference genes for use in studies of flooding stress, we compared 5 candidate reference genes (CRGs) with the NormFinder and GeNorm programs to select the best internal control. The expression stability of the CRGs was evaluated in root tissues from soybean... Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Endogenous genes; Flooding; Housekeeping genes; Internal control genes.; Gene expression.. Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1001497 Registros recuperados: 26 Primeira ... 1 2 ... Última

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