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A segment and epithelium specific messenger ribonucleic acid fragment up-regulated by estradiol in the rat oviduct Biol. Res.
RIOS,MARIANA; OJEDA,SUANY; VELASQUEZ,LUIS A; MAISEY,KEVIN; CROXATTO,HORACIO B.
Estradiol accelerates oviductal embryo transport in the rat through changes of genomic expression in oviductal cells. However, the genes involved are unknown. We used a differential display by reverse transcription-polymerase chain reaction to detect estradiol (E2)-dependent genes in the rat oviduct. Rats on day 2 of pregnancy were untreated or treated with 10 µg of E2 and the oviducts were extracted at 30, 180 and 360 min later and used to isolate RNA. Products of reverse transcriptase-PCR, made with pairs of arbitrary and oligo-deoxythymidine primers, were separated on denaturing polyacrylamide gels and candidate bands were excised and reamplified. Truly positive cDNA fragments determined by a single strand conformation polymorphism assay were cloned and...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Differential display; Estradiol; Gene; MRNA; Oviduct.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0716-97602001000100011
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A SNP in 5′ untranslated region of CD40 gene is associated with an increased risk of ischemic stroke in a Chinese population: a case-control study Genet. Mol. Biol.
Huang,Hua-Tuo; Guo,Jing; Xiang,Yang; Chen,Jian-Ming; Luo,Hong-Cheng; Meng,Lan-Qing; Wei,Ye-Sheng.
Abstract Cluster of differentiation 40 (CD40), the receptor for CD154, is a member of the tumor necrosis factor (TNF) receptor superfamily. Several studies have been conducted to investigate the effect of the CD40 rs1883832 polymorphism on atherosclerotic disease in different population; however, inconsistent results were obtained. In this study, we investigated the association of four polymorphisms (rs1883832, rs13040307, rs752118 and rs3765459) of CD40 gene and their effect on CD40 expression with the risk of ischemic stroke (IS) in a Chinese population. Three hundred and eighty patients with IS and 450 control subjects were included in the study. The CD40 polymorphisms were discriminated by Snapshot SNP genotyping assay. Serum soluble CD40 (sCD40)...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: CD40; Gene; Polymorphism; Ischemic stroke.
Ano: 2017 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572017000300442
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Anotação funcional de sequências com BLAST2GO. Infoteca-e
NODA, R. W.; DAMASCENO, C. M. B.; SOUSA, S. M. de.
bitstream/item/29525/1/circ-150.pdf
Tipo: Circular Técnica (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bioinformática; Gene; Genoma.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/880839
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Associação de bioensaios e caracterização molecular para seleção de novos isolados de Bacillus thuringiensis efetivos contra Spodoptera frugiperda (J.E. Smith) (Lepidoptera: Noctuidae) Neotropical Entomology
Fatoretto,Júlio C.; Sena,Janete A.D.; Barreto,Marliton R.; Lemos,Manoel V.F.; Boiça Junior,Arlindo L..
A lagarta de Spodoptera frugiperda (J. E. Smith) é uma das principais pragas do milho e para seu controle o Bacillus thuringiensis se destaca por sua atividade entomopatogênica. Este trabalho objetivou a caracterização molecular de isolados de B. thuringiensis quanto à presença do gene cry1 e a avaliação da sua eficiência no controle de lagartas de S. frugiperda. Nas análises da PCR, foi utilizado o Gral-cry1 para confirmação da presença do gene cry1 nos 115 isolados. Uma suspensão de 3 x 10(8) esporos/ml banhou a dieta utilizada para alimentação de 30 lagartas por isolado, com três repetições. A identificação do tipo de genes cry1 dos diferentes isolados foi realizada para cinco sub-classes de genes e análises de regressão linear foram realizadas para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Lagarta-do-cartucho; Cry1; Bactéria; Prospecção; Gene.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2007000500015
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Association of the 894G>T polymorphism of the endothelial constitutive nitric oxide synthase gene with unstable angina BJMBR
Iturry-Yamamoto,G.R.; Moriguchi,E.H.; Zago,A.C.; Alho,C.S.; Zago,A.J..
The 894G>T polymorphism of the endothelial constitutive nitric oxide synthase gene consists of the substitution of a guanine base by a thymine at the 894th nucleotide of the gene. An association of this polymorphism with acute coronary syndromes has been described, only when in combination with other polymorphisms of this gene. The aim of the present study was to search for an association between this polymorphism and unstable angina in a southern Brazilian population. In a case-control study, 156 patients (group 1 (N = 83): unstable angina, group 2 (N = 73): stable angina) were genotyped by PCR and digestion of the product. Univariate analysis demonstrated that the minimal luminal diameter and the degree of stenosis of the culprit lesion differed...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Nitric oxide synthase; Gene; Polymorphism; Unstable angina; Coronary.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X2007000400005
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Ativação do promotor AtPT2 de Arabidopsis thaliana sob estresse de fósforo em plantas transgênicas de milho. Infoteca-e
CARNEIRO, A. A.; CARVALHO, C. H. S.; COELHO, G. T. C. P.; SOUZA, I. R. P.; PAIVA, L. V.; CARNEIRO, N. P.; SCHAFFERT, R. E.; BRANDAO, R. L.; ALVES, V. M. C..
x
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Milho; Zea mays; Gene; Planta Transgênica..
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/865599
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Avaliação agronômica do milho geneticamente modificado com o gene SbMATE, que confere tolerância ao alumínio: processo de biossegurança para o primeiro estudo de campo. Infoteca-e
VASCONCELOS, M. J. V. de; CARNEIRO, A. A.; MAGALHAES, J. V. de; GUIMARÃES, C. T..
O desenvolvimento de uma planta geneticamente modificada envolve a introdução de um ou vários genes exógenos nesse organismo, sem que haja fecundação ou cruzamento. As plantas que tiveram seu código genético alterado pela introdução de uma ou mais sequências de DNA provenientes de outra espécie devem passar por rigorosas análises que comprovam suas características agronômicas e de segurança, tanto para o meio ambiente, como para os seres vivos, cujo conjunto de práticas são chamadas de biossegurança. A biossegurança de uma planta transgênica, além de trabalhos em regime de contenção, passa por liberações planejadas no meio ambiente para se obter dados agronômicos, físico-químicos e ambientais, visando o preparo de um dossiê para a liberação comercial. O...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Biossegurança; Zea Mays; Genética; Gene; Planta Transgênica; Biotecnologia.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1100096
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Avaliação de cultivares de arroz (Oryza sativa L.) para cultivo in vitro. Infoteca-e
BEVITORI, R..
Este estudo teve o objetivo de avaliar cinco cultivares elite de arroz quanto ao potencial de produzir calos e regenerar plantas: BRS Bonança, BRS Sertaneja, BRS Esmeralda, BRS Talento e BRS CIRAD 302 (híbrido), que apresentam diferentes características quanto a ciclo, porte, produtividade, dentre outras. A cultivar BRS Bonança foi incluída no estudo para servir de comparação entre as cultivares testadas por apresentar alta capacidade de resposta à indução de calos e regeneração em plantas.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Transformação genética; Regeneração em planta; Arroz; Oryza sativa; Calo; Gene.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1019019
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Bases moleculares e genética da fixação de nitrogênio. Infoteca-e
TEIXEIRA, K. R. dos S..
Genes nif e suas funções. Envolvimento de outros genes no processo de FBN Organização estrutural dos genes nif em diversos diazotrófos. Organização dos genes nif em microrganismos não simbióticos. Organização de genes nif em microrganismos simbióticos.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Fixação biológica de nitrogênio; FBN.; Gene; Genética; Microrganismo..
Ano: 1997 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/624230
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Between the cross and the sword: the crisis of the gene concept Genet. Mol. Biol.
El-Hani,Charbel Niño.
Challenges to the gene concept have shown the difficulty of preserving the classical molecular concept, according to which a gene is a stretch of DNA encoding a functional product (polypeptide or RNA). The main difficulties are related to the overlaying of the Mendelian idea of the gene as a ‘unit’: the interpretation of genes as structural and/or functional units in the genome is challenged by evidence showing the complexity and diversity of genomic organization. This paper discusses the difficulties faced by the classical molecular concept and addresses alternatives to it. Among the alternatives, it considers distinctions between different gene concepts, such as that between the ‘molecular’ and the ‘evolutionary’ gene, or between ‘gene-P’ (the gene as...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gene; Classical molecular gene concept; Mendelian gene; Genomic complexity.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300001
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Biologia sintética. Infoteca-e
VASCONCELOS, M. J. V. de; FIGUEIREDO, J. E. F..
A Biologia Sintética, em franca expansão nos dias de hoje, consiste no uso de bioinformática e técnicas de engenharia genética e bioquímica com o objetivo de desenhar circuitos biológicos modulares, por meio do redirecionamento ou construção de novas rotas metabólicas e a criação de organismos artificiais, visando maximizar o seu funcionamento. Não se trata de uma técnica específica, mas de um conceito que pode utilizar diferentes abordagens de edição genômica para alcançar a meta final. Esse documento tem como objetivo fornecer uma visão abrangente desse novo ramo da biologia, de modo a ampliar a nossa percepção sobre as possibilidades futuras que podem ser vislumbradas sobre o desenvolvimento e as aplicações dessa nova abordagem científica.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Genética; Gene; Synthetic biology; Genetics.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1037794
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Caracterização do gene 25k FP de Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus. Infoteca-e
SOUZA, M. L. de; CASTRO, M. E. B. de; SIHLER, W.; DALMOLIN, C. C.; PEDRINI, M. R. da S.; SILVA, F. R. da.
bitstream/CENARGEN/24691/1/bp044.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus; Produção in vitro; Sequenciamento.; Controle Biológico; Gene; Identificação; Lagarta..
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/185380
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Characterization of a highly thermostable alkaline phosphatase from the euryarchaeon Pyrococcus abyssi ArchiMer
Zappa, Sebastien; Rolland, Jean-luc; Flament, Didier; Gueguen, Yannick; Boudrant, Joseph; Dietrich, Jacques.
This work reports the first isolation and characterization of an alkaline phosphatase (AP) from a hyperthermophilic archaeon. An AP gene from Pyrococcus abyssi, a euryarchaeon isolated from a deep-sea hydrothermal vent, was cloned and the enzyme expressed in Escherichia coli. Analysis of the sequence showed conservation of the active site and structural elements of the E. coli AP. The recombinant AP was purified and characterized. Monomeric and homodimeric active forms were detected, with a monomer molecular mass of 54 kDa. Apparent optimum pH and temperature were estimated at 11.0 and 70 degreesC, respectively. Thus far, P. abyssi AP has been demonstrated to be the most thermostable AP, with half-lives at 100 and 105 degreesC of 18 and 5 h, respectively....
Tipo: Text Palavras-chave: Escherichia coli; Characterization; Isolation; Gene; Alkaline phosphatase; Pyrococcus abyssi; Archaeon.
Ano: 2001 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-1268.pdf
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Clinical and molecuar characterization of Brazilian patients with growth hormone gene deletions BJMBR
Arnhold,I.J.P.; Osorio,M.G.F.; Oliveira,S.B.; Estefan,V.; Kamijo,T.; Krishnamani,M.R.S.; Cogan,J.D.; Phillips III,J.A.; Mendonça,B.B..
Genomic DNA from 23 patients with isolated growth hormone (GH) deficiency (12 males and 11 females: heights -4.9 ± 1.4 SDS) was screened for GH gene deletions by restriction endonuclease analysis of polymerase chain reaction amplification products. Three unrelated patients had typical features of severe GH deficiency and deletions (6.7 kb in two and 7.6 kb in one) of the GH gene. The two patients with 6.7-kb deletions developed growth-attenuating anti-GH antibodies whereas the patient with the 7.6-kb deletion continued to grow with GH replacement therapy. Our finding that 3/23 (~13%) Brazilian subjects had GH gene deletions agrees with previous studies of severe isolated GH deficiency subjects in other populations. Two of three subjects (67%) with...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Growth; Growth hormone; Dwarfism; Gene.
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-879X1998000400003
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CNV: uma ferramenta promissora para aplicação em programas de melhoramento genético de bovinos. Infoteca-e
SIQUEIRA, F.; GIACHETTO, P. F..
Variações no número de cópias de regiões específicas do DNA, ou simplesmente CNVs (Copy Number Variations), constituem um tipo de marcador molecular que é encontrado com frequência nos genomas de mamíferos e plantas. Em humanos, o impacto das CNVs sobre os fenótipos já foi relatado em características adaptativas, mortalidade embrionária e em algumas doenças complexas como autismo, esquizofrenia, doença de Chron, artrite reumatoide, diabetes tipo I e obesidade. Comparada aos SNPs (Single Nucleotide Polymorphism), as CNVs envolvem um número maior de sequências genômicas, apresentando, potencialmente, um impacto mais pronunciado na expressão gênica, em função de alterações na estrutura e na dosagem gênica. Assim, acredita-se que esse marcador também exerça um...
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Bovino; DNA; Fenótipo; Gene; Genética Animal; Marcador Molecular; Variação Genética; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2019 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1118279
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COMBATE ao carrapato com seleção de genes resistentes: programa 01. Infoteca-e
bitstream/item/100329/1/PGM-05-S-COMBATE-AO-CARRAPATO-COM-SELECAO-DE-GENES-RESISTENTES.mp3
Tipo: Prosa Rural (INFOTECA-E) Palavras-chave: Seleção genômica; Gado Braford; Gene; Carrapato; Gado de corte; Tristeza parasitária; Sanidade animal; Gado Hereford; Acaricida.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/983602
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Development of a polymerase chain reaction and its comparison with agar gel immunodiffusion test in the detection of bovine leukemia virus infection Braz. J. Vet. Res. Anim. Sci.
Camargos,Marcelo Fernandes; Stancek,Daniel; Lessa,Leandro Moreira; Reis,Jenner Karlisson Pimenta; Rocha,Maurílio Andrade; Leite,Rômulo Cerqueira.
Polymerase chain reaction (PCR) was used for bovine leukemia virus (BLV) detection in the peripheral leukocytes of the infected bovines. The primers used were designed to amplify a part of env gene of BLV. PCR products were analyzed by agarose gel electrophoresis stained by ethidium bromide. The analytical specificity of PCR was confirmed by enzymatic restriction analysis of the PCR product with Bam HI and also by nucleotide sequence analysis of three PCR samples. Sixty five animals were tested for anti-BLV antibody, by agar gel-immunodiffusion test (AGID) and for direct BLV detection by PCR. There was a 73.80% concordance rate between the two tests. Four animals positive in AGID were PCR negative, while 13 AGID negative animals were found PCR positive....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Immunodiffusion; Bovine leukemia virus; Gene; Polymerase chain reaction.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-95962003000500005
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Development of mussel-specific expression vectors suitable for transgenic organisms: implication on the establishment of mollusc continuous cell lines ArchiMer
Delsert, Claude; Cancela Da Fonseca, Leonor.
The main objective of this project was to develop the tools for the in-depth understanding of mollusc biology and pathology. Such a goal has been reached in other biological systems through the development of molecular biology and cell culture. Indeed, development of a mollusc cell culture system is an essential step to approach many of the problems related to mollusc pathology, in particular to use molecular biology tools to study viral infection of these organisms. No continous cell line is available from bivalves and while cell cultures have been obtained from these organisms they are difficult to develop and labor intensive, survival cultures being maintained only for a few weeks. Our goal has been to study in detail many of the parameters involved in...
Tipo: Text Palavras-chave: Pathology; Mussel-specific expression vectors; Cell culture; Mytilus galloprovincialis; Gene; Genetic marker.
Ano: 1998 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00044/15540/12917.pdf
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Engenharia genética: conceitos básicos, ferramentas e aplicações. Infoteca-e
CORDEIRO, M. C. R..
ABSTRACT: Basic concepts and methodologies concerning genetic engineering are presented in this review and is directed to people or professionales not familiarized to it. Moreover, it can be a document to clarity what is genetic engineering, the importance of its contributions to modern agriculture, medicine or livestock research and to support discussions on genetic research ethics. Covers information on structure of nucleic acids, types, functions and main processes such us DNA duplication, transcription and traduction. Important methodologies are covered about DNA/RNA extraction, electrophoresis, PCR, nucleic acid libraries production, cloning, sequencing, gene characterization in connection to main historical events of genetic engineering. It...
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Ácido Nucléico; Biologia Molecular; Biotecnologia; Clonagem; DNA; Engenharia Genética; Gene; Marcador Genético; RNA; Organismo Transgênico..
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/568132
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Gene expression pattern of digestive and antioxidant enzymes during the larval development of reared Atlantic bluefin tuna (ABFT), Thunnus thynnus L. ArchiMer
Mazurais, David; Coves, Denis; Papandroulakis, Nikos; Ortega, Aurelio; Desbruyeres, Elisabeth; Huelvan, Christine; Le Gall, Marie-madeleine; De La Gandara, Fernando; Cahu, Chantal.
The aim of this study was to determine whether mortality observed during the larval development of reared bluefin tuna (Thunnus thynnus) could be related to improper expression profiles of key genes involved in digestive or antioxidant response capabilities. Tuna larvae were sampled at hatching, 2, 5, 10, 15 and 20 dph (days post hatching) for the relative quantification of transcripts encoded by genes involved in digestive [trypsinogen 1 (TRYP1), alpha-amylase (AMY), aminopeptidase N (ANPEP)] and antioxidant [catalase (CAT)] functions. The levels of expression of ANPEP related to the development and maturation of intestinal function increased from 5 to 20 dph. Furthermore, AMY and TRYP1 genes, which are pancreatic enzymes implicated in carbohydrate and...
Tipo: Text Palavras-chave: Tuna; Gene; Expression; Development; Digestion; Antioxidant.
Ano: 2015 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00171/28264/26521.pdf
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