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A cost-effective approach to DNA methylation detection by Methyl Sensitive DArT sequencing. Repositório Alice
PEREIRA, W. J.; PAPPAS, M. de C. R.; GRATTAPAGLIA, D.; PAPPAS JUNIOR, G. J..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: DNA Sequencing; Epigenetic Inheritance; Genome; Transposons; Sulfites; Methylation; Genes; Genomics.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1124582
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A web-based bioinformatics interface applied to the GENOSOJA Project: databases and pipelines. Repositório Alice
NASCIMENTO, L. C. do; COSTA, G. G. L.; BINNECK, E.; PEREIRA, G. A. G.; CARAZZOLLE, M. F..
The Genosoja consortium is an initiative to integrate different omics research approaches carried out in Brazil. Basically, the aim of the project is to improve the plant by identifying genes involved in responses against stresses that affect domestic production, like drought stress and Asian Rust fungal disease. To do so, the project generated several types of sequence data using different methodologies, most of them sequenced by next generation sequencers. The initial stage of the project is highly dependent on bioinformatics analysis, providing suitable tools and integrated databases. In this work, we describe the main features of the Genosoja web database, including the pipelines to analyze some kinds of data (ESTs, SuperSAGE, microRNAs, subtractive...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bioinformática; Expressão genética; Soja; Gene; Soybeans; Genes; Bioinformatics; Gene expression.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/926586
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Achieving high groundnut yields Open Agri
C.L.L..
Palavras-chave: Groundnuts; Electrophoresis; Leaf area; Oilseeds; Area; Genes; Tropical zones; Seasons; Fungi; Insecticides.
Ano: 1996 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4186
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Ajuste de modelos não lineares para dados de associação de genes candidatos com peso corporal de bovinos de corte. Repositório Alice
PAZ, C. C. P. de; FREITAS, A. R. de; PACKER, I. U.; TAMBASCO, D. D.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Peso corporal; Gado de Corte; Genes.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/46108
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Alternative cytoplasmic male sterility systems in sorghum and their utilization Open Agri
A.A. ( A. Ashok Kumar ).
Palavras-chave: Cytoplasm; Genes; Sorghum; Hybrids; Heterosis; Transcription; DNA; Genetic structures; Segregation; Genomes.
Ano: 2008 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3149
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Aluminum tolerance in tobacco plants transformed with a plant and a bacterial citrate sinthase genes regulated by root specific and constitutive promoters. Repositório Alice
BELELE, C. L.; CANCADO, G. M.; CARNEIRO, A. A.; PAIVA, E.; PURCINO, A. A. C.; LOPES, M. A.; CARNEIRO, N. P..
Edição dos resumos do 45º Congresso Nacional de Genética, Gramado, 1999.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Tabaco; Citrato sintase; Promotor; Aluminium; Root; Promoters; Citrate sinthase.; Alumínio; Gene; Raiz.; Genes; Tobacco..
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/483518
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Aluminum-induced genes in grass species. Repositório Alice
NODA, R. W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; CARNEIRO, N. P.; LANA, U. G. de P.; MAGALHAES, J. V. de; COSTA, M. M. do C.; SILVA, F. R. D.; BRAMMER, S. P.; LÂNGARO, N. C.; CARVALHO, L. J. C. B.; BEVITORI, R.; PURCINO, A. A. C..
AB3C X-meeting 2010.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Tolerância a alumínio; Sequence analysis; Genetics; Aluminum; Genes.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/873120
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AN ANNOTATED BIBLIOGRAPHY OF PIGEONPEA Open Agri
B.S..
Palavras-chave: Pigeonpeas; Crops; Legumes; Genes; Peas; Mutants; Grain legumes; Fungi; Cowpeas.
Ano: 1980 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3959
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An effective method for cloning of partial MADS-box genes related to flower development in groundnut Open Agri
Yuan, M..
Palavras-chave: Genes; PCR; DNA; Cloning; Transcription factors; Genomes; Transcription; Genetic structures; Nucleotides; Molecular cloning.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3213
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An overall evaluation of the resistance (R) and pathogenesis-related (PR) superfamilies in soybean, as compared with Medicago and Arabidopsis. Repositório Alice
WANDERLEY-NOGUEIRA, A. C.; BELARMINO, L. C.; SOARES-CAVALCANTI, N. da M.; BEZERRA-NETO, J. P.; KIDO, E. A.; PANDOLFI, V.; ABDELNOOR, R. V.; BINNECK, E.; CARAZZOLE, M. F.; BENKO-ISEPPON, A. M..
Plants have the ability to recognize and respond to a multitude of pathogens, resulting in a massive reprogramming of the plant to activate defense responses including Resistance (R) and Pathogenesis-Related (PR) genes. Abiotic stresses can also activate PR genes and enhance pathogen resistance, representing valuable genes for breeding purposes. The present work offers an overview of soybean R and PR genes present in the GENOSOJA (Brazilian Soybean Genome Consortium) platform, regarding their structure, abundance, evolution and role in the plantpathogen metabolic pathway, as compared with Medicago and Arabidopsis. Searches revealed 3,065 R candidates (756 in Soybean, 1,142 in Medicago and 1,167 in Arabidopsis), and PR candidates matching to 1,261 sequences...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bioinformática; Pathogen response.; Soja; Resposta da planta; Doença de planta; Gene; Genoma; Soybeans; Bioinformatics; Plant diseases and disorders; Genome; Genes; Biotic stress..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/926612
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Análise filogenética do gene nodY/K revela coevolução e transferência horizontal entre Bradyrhizobium e leguminosas. Repositório Alice
DELAMUTA, J. R. M.; MENNA, P.; HUNGRIA, M..
Plantas da família Leguminosae (Fabaceae) ocupam uma ampla variedade de biomas terrestres, com algumas delas estabelecendo simbiose com um grupo de bactérias coletivamente chamadas de rizóbios, cuja característica mais importante é a capacidade de fixar o nitrogênio atmosférico (N2). No caso do Brasil, bactérias do gênero Bradyrhizobium representam a grande maioria dos isolados de leguminosas tropicais nativas, além de apresentarem relevância como simbiontes de culturas de importância econômica, como é o caso da soja. Estudos taxonômicos com essas bactérias têm demonstrado uma elevada diversidade genética entre as estirpes e, nos últimos anos, várias espécies já foram descritas. Contudo, quando a filogenia dos genes envolvidos no processo de nodulação e...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Gene; Genes.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010714
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Análise funcional do gene At4g10250 em resposta à infecção por Meloidogyne javanica em Arabidopsis thaliana. Repositório Alice
SILVA, A. G.; HISHINUMA-SILVA, S. M.; LOPES-CAITAR, V. S.; NOMURA, R. G.; DIAS, W. P.; LOPES, I. de O. N.; CARVALHO, M. C. C. G.; MARCELINO-GUIMARÃES, F. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Soja; Gene; Meloidogyne Javanica; Nematóide; Praga de Planta; Doença de Planta; Soybeans; Genes; Plant diseases and disorders.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096079
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Análisis de virulencia de la roya amarilla (Puccinia striiformis f. sp. tritici) del trigo (Triticum aestivum L. ) en los Valles Altos de México Agrociencia
Rodríguez-García,M. Florencia; Huerta-Espino,Julio; Villaseñor-Mir,Héctor E.; Sandoval Islas,José S.; Singh,Ravi P..
La roya amarilla (Puccinia striiformis f. sp. tritici) del trigo (Triticum aestivum L.) causa pérdidas importantes en rendimiento en los Valles Altos de México, debido a que el hongo puede evolucionar y vencer la resistencia de las nuevas variedades. Por tanto, se estudio la virulencia de este patógeno en los ciclos Primavera-Verano (P-V)/2005, 2006 y 2007 en los Valles Altos de México. Se recolectaron hojas y espigas infectadas con el hongo causante de la roya amarilla de zonas productoras de los estados de Tlaxcala, Hidalgo, Puebla y el Estado de México. Las muestras se procesaron en el Centro Internacional de Mejoramiento de Maíz y Trigo (CIMMYT) ubicado en El Batán, Texcoco, Estado de México. Para identificar las razas fisiológicas se usaron 14 líneas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: P. striiformis f. sp. tritici; Genes; Variedades; Raza fisiológica; Trigo; Yr.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1405-31952010000400009
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Analyse moléculaire des relations Phylogénétiques au sein des six espèces de Mugilidae en Tunisie OceanDocs
Blel, H.; Said, K.; Durand, J.D..
Afin d’étudier les relations phylogénétiques chez les six espèces méditerranéennes de la famille de Mugilidé en Tunisie (Mugil cephalus, Chelon labrosus, Liza aurata, Liza ramada, Liza saliens et Oedalechilus labeo), un fragment de 589pb du gène mitochondrial ARN 16S a été analysé. Ce gène à été amplifié, séquencé puis analysé chez les différentes espèces. La détermination des différentes espèces de mugilidé réalisée dans cette étude est en accord avec les données de séquences disponibles dans GenBank et confirme la présence de l’espèce Oedalechilus labeo dans les côtes tunisiennes malgré sa rareté. L’arbre phylogénétique établit confirme la grande divergence de Mugil cephalus par rapport aux autres espèces présentes en Méditerranée. Le genre Oedalechilus...
Tipo: Journal Contribution Palavras-chave: Genes.
Ano: 2013 URL: http://hdl.handle.net/1834/5903
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Analysis of preharvest sprouting in three Brazilian wheat populations PAB
Bassoi,Manoel Carlos; Flintham,John; Riede,Carlos Roberto.
The objective of this work was to evaluate the possibility of obtaining recombinant inbred wheat lines more resistant to preharvest sprouting, independently of colour genes, in three red-grained Brazilian wheat populations. The results showed statistical significance among lines within all populations, which presented a normal distribution and transgressive segregation for preharvest sprouting. The normal distribution of the lines from all red-grained populations suggests that sprouting, excluding the genes expressing seed coat pigmentation, is, probably, controlled by many genes. These findings also indicate that it may be possible to improve resistance to preharvest sprouting, independently of the colour genes.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Triticum aestivum; Dormancy; Grain colour; Genes; Genetic variation.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2006000400006
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Apple FLC and TBRR genes regulate dormancy integrating hormonal stimulus and molecular responses. Repositório Alice
REVERS, L. F.; CATTANI, A. M.; SARTOR, T.; SILVEIRA, C. P..
Type‐B response regulators (TBRRs) act in the final steps of the cytokinin‐signaling pathway. Previous studies revealed the presence of TBRR binding sites at the promoter region of MdoDAM1 and MdoFLC , important genes for apple dormancy regulation. The aim of this study is to understand the MdoDAM1/MdoFLC gene expression regulation through TBRRs in response to cytokinin stimulus.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Apples; Genes; Dormancy.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1104005
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Artificial Hybridization in Groundnut Open Agri
S.N..
Palavras-chave: Hybridization; Self pollination; Artificial hybridization; Groundnuts; Hybrids; Cross pollination; Planting; Crop management; Genes; Crossing over.
Ano: 1990 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/4085
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Bancos de germoplasma de café no Brasil: base do melhoramento para produtividade e qualidade. Repositório Alice
EIRA, M. T. S. da; FAZUOLI, L. C.; GUERREIRO FILHO, O.; SILVAROLLA, M. B.; FERRAO, M. A. G.; FONSECA, A. F. A. da; FERRÃO, R. G.; SERA, T.; PEREIRA, A. A.; SAKIYAMA, N. S.; ZAMBOLIM, L.; CARVALHO, C. H. S. de; PADILHA, L.; SOUZA, F. de F..
O melhoramento genético do café visa o desenvolvimento de cultivares que atendam as novas exigências do mercado consumidor. Isto é alcançado com a introdução de novas características mediante hibridações dentro ou entre espécies, aumentando, assim, a variabilidade genética do material a ser trabalhado. A utilização de materiais genéticos com características agronômicas desejáveis, tais como resistência a pragas e doenças, tolerância a seca, solos pobres em nutrientes, a baixos/altos teores de compostos químicos e melhor qualidade de bebida, entre outras, é de fundamental importância para o sucesso do agronegócio café. Este fato ressalta a grande importância da preservação dos acessos nos bancos de germoplasma, a fim de evitar a perda desses genes valiosos.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Coffee; Brasil; Germoplasm; Genebank; Vegetal improvement.; Armazenamento; Banco de Germoplasma; Café; Criopreservação; Germoplasma; Melhoramento Vegetal.; Coffea; Genes; Cryopreservation; Storage..
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906096
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Biological activity of lectins from grain legumes and garlic against the legume pod borer, Helicoverpa armigera Open Agri
Arora, R.,( Richa Arora ).
Palavras-chave: Garlic; Pigeonpeas; Proteins; Transgenics; Transgenic plants; Chickpeas; Genes; Enzymes; Animal developmental stages; Genetic transformation.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3230
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Biotechnology's Potential Contribution to Global Wood Supply and Forest Conservation AgEcon
Sedjo, Roger A..
Over the past 30 years, industrial plantation forests have become a major supplier of industrial wood. There are several reasons for this, including the improved economics of planted forests due to biotechnological innovations, the increases in natural forest wood costs due to increasing inaccessibility, and rising wood costs from natural forests due to new environmental restrictions related to logging. Forestry today is on the threshold of the widespread introduction of biotechnology into its operational practices. In many cases, the biotechnology likely to be introduced is simply an extension of that being utilized in agriculture, such as herbicide-tolerant genes. However, biotechnology in forestry also is developing applications unique to forestry,...
Tipo: Working or Discussion Paper Palavras-chave: Biotechnology; Breeding; Forestry; Tree plantations; Timber; Fiber; Genes; GMOs; Industrial wood; Economics; Benefits; Costs; Resource /Energy Economics and Policy; Q21; Q23; Q16; O32; L73.
Ano: 2001 URL: http://purl.umn.edu/10708
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