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An EST-based analysis identifies new genes and reveals distinctive gene expression features of Coffea arabica and Coffea canephora. Repositório Alice
MONDEGO, J. M. C.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; TOKUDA, E. K.; PARIZZI, L. P.; COSTA, G. G. L.; PEREIRA, L. F. P.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, G. A. G..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Café arabica.; Coffea Arábica; Coffea Canephora; Genoma.; Genes..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/902404
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Análise da expressão diferencial de genes de raízes de Arachis stenosperma Krapov. & W.C. Gregory infectadas com o fitonematóide Meloidogyne arenaria (Neal) Chitwood raça 1. Infoteca-e
PROITE, K.; LEAL-BERTIOLI, S. C.; PIC-TAYLOS, A.; BERTIOLI, D.; GUIMARÃES, P. M..
bitstream/CENARGEN/29401/1/bp172.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Arachis stenosperma; Fitonematóide.; Meloidogyne Arenaria.; Genes..
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/183344
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Associação entre polimorfismos de única base (SNP) dos genes PPARGC1A e PSMC1 com espessura de gordura subcutânea em animais da raça Canchim. Repositório Alice
TIZIOTO, P. C.; VENERONI, G. B.; MEIRELLES, S. L.; GASPARIN, G.; IBELLI, A. M. G.; OLIVIERA, H. N.; ALENCAR, M. M. de; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Polimorfismos; Raça Canchim; Espessura de gordura.; Genes..
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/573412
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Candidate genes for growth traits in beff cattle crosses Bos taurus X Bos indicus. Repositório Alice
TAMBASCO, D. D.; PAZ, C. C. P.; TAMBASCO-STUDART, M.; PEREIRA, A. P.; ALENCAR, M. M. de; FREITAS, A. R. de; COUTINHO, L. L.; PACKER, I. U.; REGITANO, L. C. de A..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bos taurus X Bos indicus.; Genes..
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/46159
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Development of a computational pipeline to detect positive selection. Repositório Alice
CINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P..
P1007.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Genomas; Software.; Genomes; Bioinformatics; Genes..
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/932798
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Differential expression of dormancy-associated genes in fastigiata and hypogaea peanut. Repositório Alice
SILVA, M. F. C.; SILVA, C. R. C.; LIMA, L. M. de; SANTOS, R. C. dos; RAMOS, J. P. C..
Seed dormancy is a temporary replacement state observed in some higher plants, which prevents germination under unfavorable conditions. In several species, dormancy process is triggered by hormonal factors, initiated by ABA and precursor enzymes. In this work, we investigated the relationship between dormancy and the expression of ARP, DMR1, and NCED genes in upright and runner peanut seeds. Eight dormancy-contrasting genotypes were previously phenotyped based on germination traits, during three storage periods. Expression of ARP, DMR1 and NCED transcripts was analyzed by qRT-PCR, from endosperm and embryo tissues. Higher expression of NCED and ARP were found in embryo tissues from runner genotypes, IAC Caiapo and LGoPE-06, confirming findings in...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Molecular markers.; Embryo; Arachis Hypogaea; Dormência da semente; Embrião; Endosperma; Amendoim; Marcador molecular; Peanuts; Seed dormancy; Endosperm; Genes..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084266
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Estimativas de parâmetros genéticos clássicos para proteínas totais em feijão-caupi. Repositório Alice
COSTA, D. C. C. da; SANTOS, C. A. F.; SOUZA, S. S. da S..
Neste trabalho foram estimados parâmetros genéticos para subsidiar trabalhos de melhoramento do feijão-caupi para maior teor de proteínas total. Linhagens F6 e gerações dos cruzamentos IT97K-1042-3 x Canapu e IT97K-1042-3 x BRS Tapaihum foram quantificadas para o teor de proteína total pelo método microKjeldhal. As linhagens F6 foram avaliadas em condições de sequeiro, em blocos ao acaso com duas repetições, enquanto as gerações foram avaliadas em ambiente irrigado, sem delineamento experimental. Todas as variáveis analisadas nas linhagens F6 apresentaram significância, com coeficientes de variação de 2,9% a 50,7%. Os valores da variância de dominância foram considerados como zero, por causa das estimativas negativas obtidas. Os valores da herdabilidade no...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Proteínas; Herdabilidade; Melhoramento genético; Feijão caupi.; Feijão; Cruzamento; Vigna Unguiculata.; Genes..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/905404
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Expressão gênica diferencial envolvida com Condronecrose bacteriana com osteomielite em frangos de corte com 35 dias de idade. Repositório Alice
PEIXOTO, J. de O.; IBELLI, A. M. G.; CANTAO, M. E.; ZANELLA, R.; JAENISCH, F. R. F.; GIACHETTO, P. F.; SETTLES, M. L.; PANDOLFI, J. R. C.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Resumo: A incidência de problemas ósseos é considerada uma das principais preocupações para a indústria avícola devido à perdas econômicas significativas e ao impacto negativo no bem-estar. As vias metabólicas e os genes envolvidos nas patologias ósseas permanecem desconhecidos. A condronecrose bacteriana com osteomielite (BCO) é uma das principais doenças ligadas a problemas locomotores em frangos. Na tentativa de esclarecer os mecanismos genéticos envolvidos na manifestação da BCO, objetivou-se identificar os genes diferencialmente expressos no fêmur de frangos de corte normais e afetados por esta desordem, por meio da tecnologia de RNA-Seq. Neste estudo foram utilizados frangos de corte comerciais machos aos 35 dias de idade sendo 4 normais e 4 com BCO...
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: BCO; Differentially expressed genes; RNA-Seq; Bacterial Chondronecrosis with Osteomyelitis; Patologia óssea; Ontologia gênica.; Genes..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1024034
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Expressão relativa dos genes CAPN1, CAST, DGAT e leptina relacionados à maciez de carne e à deposição de gordura em bovinos. Repositório Alice
GROMBONI, J. G. G.; MELLO, S. S. de; ROCHA, M. I. P.; IBELLI, A. M.; VENERONI, G. B.; NICIURA, S. C. M..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bovino; Carne.; Genes..
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/910291
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Genes que codificam a lactato desidrogenase em peixes das ordens das ordens cypriniformes, siluriformes e perciformes. Repositório Alice
PANEPUCCI, L. L.; SCHAWANTES, M. L. B.; LUCA, P. H. de; SCHAWANTES, A. R.; VAL, A. L. L.; ALMEIDA, V. M. F..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Formas moleculares; Codificação Peixes.; Genes..
Ano: 1981 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/42368
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Genome wide association analysis for birth and weaning weight in Canchim beef cattle. Repositório Alice
BUZANSKAS, M. E.; GROSSI, D. A.; SCHENKEL, D. A.; VENTURA, R.; REGITANO, L. C. de A.; ALENCAR, M. M. de; MUNARI, D. P..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Genomic selection; SNP.; Alleles; Beef cattle; Genes..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/963172
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Identification of genes involved in cattle-tick response mechanism by differentiall co-expression. Repositório Alice
IBELLE, A. M. G.; REGITANO, L. C. de A.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Tick.; Cattle; Genes..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/894774
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Open access resources for genome-wide association mapping in rice. Repositório Alice
MCCOUCH, S. R.; WRIGHT, M. H.; TUNG, C.-W.; MARON, L. G.; MCNALLY, K. L.; FITZGERALD, M.; DECLERCK, G.; AGOSTO-PEREZ, F.; KORNILIEV, P.; GREENBERG, A. J.; NAREDO, M. E. B.; MERCADO, S. M. Q.; HARRINGTON, S. E.; SHI, Y.; BRANCHINI, D. A.; FALCAO, P. R. K.; LEUNG, H.; EBANA, K.; YANO, M.; EIZENGA, G.; SINGH, N.; MCCLUNG, A.; MEZEY, J..
Increasing food production is essential to meet the demands of a growing human population, with its rising income levels and nutritional expectations. To address the demand, plant breeders seek new sources of genetic variation to enhance the productivity, sustainability and resilience of crop varieties. Here we launch a high-resolution, open-access research platform to facilitate genome-wide association mapping in rice, a staple food crop. The platform provides an immortal collection of diverse germplasm, a high-density single-nucleotide polymorphism data set tailored for gene discovery, well-documented analytical strategies, and a suite of bioinformatics resources to facilitate biological interpretation. Using grain length, we demonstrate the power and...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Dados genótipicos; Biologia computacional.; Genoma; Genome; Chromosome mapping; Genetic resources; Alleles; Genetic improvement; Bioinformatics; Genes..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1068128
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Pesquisa de genes relacionados à produção de cápsula e biofilme em staphylococcus aureus isolados de leite bovino Repositório Alice
BARRETO, D. K.; SALIMENTA, A. P. S.; DIAS, J. A.; LOPES, L. B.; ZAFALON, L. F.; DANTAS, T. V. M.; LANGE, C. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gado de leite.; Isolamento; Staphylococcus Aureus.; Genes..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030244
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Preparação de ovários de Brachiaria para LCM (Laser Capture Microdissection) - microdissecção por captura a laser. Infoteca-e
SILVEIRA, E. D.; DUSI, D. M. de A.; CARNEIRO, V. T. de C..
bitstream/CENARGEN/29520/1/bp196.pdf
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Desenvolvimento apomítico; Desenvolvimento sexual; Vias moleculares; Desenvolvimento reprodutivo; Genômica funcional.; Biotecnologia; Apomixia; Brachiaria.; Genes..
Ano: 2007 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/189373
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Sequenciamento do DNA mitocondrial de Chlamydomonas biconvexa revela um mitogenoma compacto. Repositório Alice
PASCOAL, P. V.; HADI, S. I. I. A.; STEINDORFF, A. S.; FORMIGHIERI, E. F.; BRASIL, B. dos S. A. F..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Microalgas; Mitogenoma; Filogenômica.; Genes..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1075986
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SHORT-COMMUNICATION: Evaluation of perfused bovine udder for gene expression studies in dairy cows. Repositório Alice
PINTO, I. S. B.; FONSECA, I.; BRANDAO, H. de M.; GERN, J. C.; GUIMARAES, A. S.; CARVALHO, W. A.; BRITO, M. A. V. P. e; VICCINI, L. F.; MARTINS, M. F..
Abstract Intramammary infections are one of the main causes of productivity loss in dairy cows. To better understand the immune system response and to avoid the use of live animals, we validated the use of isolated bovine udder as an ex situ model. Six mammary glands were collected from cows ready for culling. Three udders were perfused with Tyrode's solution and three were not-perfused. During six hours, we collected perfusate samples for biochemical analysis. We also collected alveolar and teat canal tissue to evaluate gene expression. The biochemical parameters indicated that the perfused udders remained viable for the entire period of the experiment. A real-time polymerase chain reaction showed an increase in 18S rRNA gene expression in the alveolar...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Ex-situ model; Mammary gland.; Genes..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1080581
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Stress tolerance in peanuts: a genomic approach using wild Arachis Repositório Alice
BRASILEIRO, A. C. M.; MORGANTE, C. V.; ARAUJO, A. C. G. de; GUIMARÃES, L. A.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; BERTIOLI, D.; FONSECA, L. N.; SARAIVA, M. A. de P.; MARTINS, A. C. A; GUIMARAES, P. M..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Cultivo.; Amendoim; Arachis Hypogaea.; Peanuts; Genes..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/973430
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