SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

Vieira,Eduardo Alano; Carvalho,Fernando Irajá Félix de; Bertan,Ivandro; Kopp,Mauricio Marini; Zimmer,Paulo Dejalma; Benin,Giovani; Silva,José Antônio Gonzalez da; Hartwig,Irineu; Malone,Gaspar; Oliveira,Antônio Costa de.

Molecular and morphological data analyses matrices are very informative tools for the estimation of genetic distances. We used AFLP markers, morphological traits and combined analysis to estimate the genetic distances between wheat genotypes and ascertain any associations between the two techneques. Nineteen wheat (Triticum aestivum L.) genotypes were analyzed using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers and field evaluated for two years. The matrices obtained by morphological and molecular marker data analyses revealed a significant but moderate correlation (r = 0.47), indicating that such techniques sample distinct genome regions. The combined analysis was found to be highly correlated with AFLP (r = 0.97) and moderately correlated with...

Avaliação da variabilidade das gerações G0 e F1 da linhagem GIFT de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus) por RAPD - DOI: 10.4025/actascianimsci.v30i2.4708

Palavras-chave: Reeding; Genetic divergence; Molecular markers; Morphological traits.

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572007000300016

Animal Sciences

Lupchinski Junior, Enio; UEM; Vargas, Lauro; UEM; Povh, Jayme Aparecido; UEM; Ribeiro, Ricardo Pereira; UEM; Mangolin, Claudete Aparecida; UEM; Barrero, Nelson Maurício Lopera; UEM.

Este trabalho teve como objetivo analisar, pela técnica RAPD, a variabilidade e a divergência genética de duas gerações da linhagem GIFT. Foram estimados parâmetros para os reprodutores (G0) e para a progênie (F1). A variabilidade genética foi determinada pela porcentagem de loci polimórficos e pelo índice de Shannon. As gerações apresentaram 69,6% de loci polimórficos (G0) e 60,0% de polimorfismo (F1). Os valores para o índice de Shannon foram de 0,367 para a geração G0 e de 0,317 para a F1. Os valores de divergência genética, calculados pelo teste de Mantel, foram de 0,213 para a G0 e 0,208 para a geração F1. Os resultados obtidos indicaram que houve perda da variabilidade genética da geração G0 para a F1. No entanto, um fato a ser destacado foi a alta...

Palavras-chave: 5.05.04.00-2 Reprodução Animal índice de Shannon; Gerações de cultivo; Divergência genética; Variabilidade genética. Shannon index; Cultivated generations; Genetic divergence; Genetic variability.

Ano: 2008

URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAnimSci/article/view/4708

Caracterização e uso da variabilidade genética de banco ativo de germoplasma de Coffea canephora Pierre ex Froehner.

Characterization and genetic diversity between guarana progenies.

ROCHA, R. B.; VIEIRA, D. dos S.; RAMALHO, A. R.; TEIXEIRA, A. L..

Objetivou-se, neste trabalho, quantificar a diversidade genética de acessos de C. canephora do Banco Ativo de Germoplasma da Embrapa Rondônia, visando à identificação de plantas de maior divergência genética e maior potencial produtivo para hibridização.

Tipo: Artigo de periódico

Palavras-chave: Genetic divergence; Productive potential; Robusta; Conilon; Divergência genética; Potencial produtivo.; Coffea Canephora..

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/983944

FAJARDO, J. D. V.; ATROCH, A. L.; PINTO, C. E. D. L.; NASCIMENTO FILHO, F. J. do.

Caracterização e diversidade genética entre progênies do guaraná: o objetivo do estudo foi estimar a diversidade genética, estimar componentes de variância para caracteres morfoagronômicos, e da produção de progênies de guaranazeiro.

Tipo: Artigo de periódico

Palavras-chave: Genetic divergence; Melhoramento genético; Paullinia Cupana; Breeding; Genetic similarity; Genetic resources.

Ano: 2019

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118217

Comparison between multivariate methods applied for the evaluation of genetic divergence in Cacao (Theobroma cacao L.)

BABT

Dias,Luiz Antônio dos Santos; Kageyama,Paulo Yoshio.

Several multivariate methods have been used in divergence analyses of populations. Consistency and relative association among four methods were assessed using a 5 x 5 complete-diallel data involving cacao cultivars. Over a 5-year period, five cultivars were analyzed based upon five yield components. In assessing the divergence of parents only the data obtained from five cacao cultivars were analyzed. Four multivariate statistics presented close association when considered in pairs, in this case the Mahalanobis' (D²) with the mean Euclidean distance obtained from canonical variates (d cv), and mean Euclidean distance (d e) with the mean Euclidean distance obtained from principal components (d pc). In both cases, high correlations (r > 0.95) were...

Comparison of similarity coefficients used for cluster analysis with dominant markers in maize (Zea mays L)

Palavras-chave: Cacao cultivars; Canonical variates; Genetic divergence; Mahalanobis' and mean Euclidean distances; Principal components.

Ano: 1998

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-89131998000200005

Meyer,Andréia da Silva; Garcia,Antonio Augusto Franco; Souza,Anete Pereira de; Souza Jr.,Cláudio Lopes de.

The objective of this study was to evaluate whether different similarity coefficients used with dominant markers can influence the results of cluster analysis, using eighteen inbred lines of maize from two different populations, BR-105 and BR-106. These were analyzed by AFLP and RAPD markers and eight similarity coefficients were calculated: Jaccard, Sorensen-Dice, Anderberg, Ochiai, Simple-matching, Rogers and Tanimoto, Ochiai II and Russel and Rao. The similarity matrices obtained were compared by the Spearman correlation, cluster analysis with dendrograms (UPGMA, WPGMA, Single Linkage, Complete Linkage and Neighbour-Joining methods), the consensus fork index between all pairs of dendrograms, groups obtained through the Tocher optimization procedure and...

Cytotaxonomy of some species and of interspecific hybrids of Pennisetum (Poaceae, Poales)

Palavras-chave: Genetic divergence; Heterotic groups; AFLP; RAPD; Multivariate analysis.

Ano: 2004

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572004000100014

Techio,Vânia Helena; Davide,Lisete Chamma; Pereira,Antônio Vander; Bearzoti,Eduardo.

Cytotaxonomic studies were carried out on 26 accessions of Pennisetum spp. originating from the Active Germplasm Bank of Embrapa Gado de Leite-Juiz de Fora, Minas Gerais, Brazil.This study presents cytogenetics and reproductive morphological data for each one of these accessions, which allowed groupings and suggest botanical identifications to be established. The metaphases of the accessions characterized as P. purpureum confirmed the presence of 2n = 28 chromosomes that have already been described for this species. For the hybrids between P. purpureum and P. glaucum and for the hexaploids, resulting from the chromosome duplication of these hybrids, 2n = 21 and 2n = 42 chromosomes were confirmed, respectively. The wild accession identified as P. setosum...

Disentangling the Influence of Mutation and Migration in Clonal Seagrasses Using the Genetic Diversity Spectrum for Microsatellites

Palavras-chave: Pennisetum; Cytogenetic; Taxonomy; Germplasm; Genetic divergence.

Ano: 2002

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572002000200014

ArchiMer

Arnaud-haond, Sophie; Moalic, Yann; Hernandez-garcia, Emilio; Eguiluz, Victor M.; Alberto, Filipe; Serrao, Ester A.; Duarte, Carlos M..

The recurrent lack of isolation by distance reported at regional scale in seagrass species was recently suggested to stem from stochastic events of large-scale dispersal. We explored the usefulness of phylogenetic information contained in microsatellite loci to test this hypothesis by using the Genetic Diversity Spectrum (GDS) on databases containing, respectively, 7 and 9 microsatellites genotypes for 1541 sampling units of Posidonia oceanica and 1647 of Cymodocea nodosa. The simultaneous increase of microsatellite and geographic distances that emerges reveals a coherent pattern of isolation by distance in contrast to the chaotic pattern previously described using allele frequencies, in particular, for the long-lived P. oceanica. These results suggest...

Tipo: Text

Palavras-chave: Clonality; Genetic Diversity Spectrum; Genetic divergence; Microsatellites; Seagrass; Stepwise mutation.

Ano: 2014

URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00182/29292/27733.pdf

YOKOMIZO, G. K.-I.; FARIAS NETO, J. T. de; OLIVEIRA, M. do S. P. de.

O consumo do suco de açaí tem aumentado no país e no exterior, principalmente por ser um alimento funcional, havendo a necessidade de pesquisas de melhoramento para atender essa crescente demanda. Com o objetivo de avaliar a dissimilaridade para fins de seleção, 30 progênies de meios-irmãos de açaizeiros provenientes do município de Anajás e cultivadas em Tomé-Açu, Pará, foram avaliados para as seguintes características: peso médio do cacho (PMC), em gramas; peso total de frutos (PTF), em gramas; peso médio do cacho vazio (PMCV), em gramas; tamanho médio da ráquis/cacho (TMR), em centímetros; peso médio de 100 frutos (PCF), em gramas; número total de cachos (NTC) e; peso total do cacho (PTC), sendo obtida pela multiplicação entre PMC e NTC. Os resultados...

Tipo: Artigo de periódico

Palavras-chave: Divergência genética; Medidas de dissimilaridade; Análise multivariada; UPGMA; Genetic divergence; Dissimilarity measure; Multivariate analisys; Açaí; Euterpe Oleracea; Alimento; Morfologia Vegetal.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092286

Divergência fenotípica entre linhagens de abobóra para caracteres associados à morfologia da planta.

SANTOS, H. J. B.; MIRANDA, J. S. da S.; BORGES, R. M. E.; LIMA, M. A. C. de.

O objetivo deste trabalho foi determinar a divergência fenotípica entre linhagens de abóbora com base em caracteres relacionados à morfologia da planta.

Tipo: Parte de livro

Palavras-chave: Divergência genética; Descritores qualitativos; Genetic divergence; Qualitative descriptors.; Abóbora; Melhoramento genético vegetal; Melhoramento vegetal; Cucúrbita Moschata.; Plant breeding..

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1028993

Divergencia genetica em acessos de feijao de corda avaliados em dois ambientes distintos.

SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; ARAUJO, F. P. de.

A selecao de progenitores tendo como um dos criterios a distancia genetica, tem sido usada em diversos programas de melhoramento. Os efeitos do ambiente na expressao genica, entretanto, podem influenciar na divergencia, sendo recomendavel a avaliacao dos genotipos em ambientes diferentes. Neste trabalho, 50 acessos de feijao de corda foram avaliados em Petrolina,PE, em dois ambientes distintos: 1) plantio irrigado, no segundo semestre de 1994 (A1), e 2) plantio dependente de chuvas, no primeiro semestre de 1995 (A2). O delineamento foi em blocos ao acaso, com duas repeticoes, sendo as parcelas formadas por uma linha com 16 plantas, no espacamento de 1,0 x 0,5 m, para os dois ambientes. Foram analisados 10 caracteres quantitativos, tendo como medida de...

Tipo: Artigo de periódico

Palavras-chave: Divergencia genetica; Genetic divergence; Cowpea; Feijão de corda; Vigna Unguiculata.

Ano: 1995

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/133141

Divergência genética entre genótipos de sorgo sacarino baseado em caracteres agroindustriais.

Divergência genética entre progênies de Pinus caribaea var. caribaea com base em caracteres quantitativos

FAGUNDES, T. G.; NUNES, J. A. R.; PARRELLA, R. A. da C.; BRUZI, A. T.; DURAES, N. N. L.; LOMBARDI, G. M. R..

Tipo: Parte de livro

Palavras-chave: Agribusiness characters; Genetic divergence; Sorghum bicolor; Melhoramento genético vegetal; Plant breeding.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/974781

PFB - Pesquisa Florestal Brasileira

Silva, Janete Motta da; Aguiar, Ananda Virgínia de; Mori, Edson Seizo; Moraes, Mario Luiz Teixeira de.

O objetivo desse trabalho foi quantificar a dissimilaridade genética entre progênies de P. caribaea var. caribaea para identificar genitores divergentes, visando gerar genótipos mais produtivos e avaliar a variabilidade total por meio de alguns caracteres fenotípicos de importância comercial. Assim, um teste de progênies de P. caribaea var. caribaea foi implantado em delineamento experimental látice 10 x 10 triplo, com 99 progênies e uma testemunha comercial em Selvíria, MS. Foram avaliados os caracteres quantitativos antes e após desbaste aos 14 anos, tais como: altura total de plantas (m), diâmetro à altura do peito - DAP (cm); volume (m3 árvore-1); forma do fuste das árvores, densidade básica da madeira, na altura do DAP - DBM-1, e na metade da altura...

Estimates of genetic parameters between and within black oat populations

Palavras-chave: Parâmetros genéticos; Divergência genética; Pinheiros tropicais; Teste de progênies Genetic parameters; Genetic divergence; Tropical pines; Progeny trial.

Ano: 2012

URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/194

Bragantia

Meira,Daniela; Meier,Carine; Olivoto,Tiago; Nardino,Maicon; Klein,Luís Antônio; Moro,Ederson Duranti; Fassini,Fabrício; Marchioro,Volmir Sergio; Souza,Velci Queiróz de.

ABSTRACT The aims of this study were to characterize black oat populations by estimating between- and within-populations variance components and genetic parameters, as well as to distinguish the populations using multivariable statistics. The experiment was carried out in randomized blocks design with three repetitions, with 14 black oat populations collected in several municipalities of Rio Grande do Sul state. Agronomic important traits were assessed at physiological maturation stage. Variance components and genetic parameters were estimated considering within-block information. In addition, Mahalanobis distance, relative contribution of traits, and canonical variables were used to distinguish the populations. Selection based on panicle length, number of...

Evaluation of common bean accesses with multi-category variables - doi: 10.4025/actasciagron.v33i4.6944

Palavras-chave: Avena strigosa; Genetic divergence; Genotypic variance.

Ano: 2019

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052019000100043

Agronomy

Albuquerque, Amanda Nogueira de; Universidade do Estado do Mato Grosso; Barelli, Marco Antônio Aparecido; Universidade do Estado do Mato Grosso; Neves, Leonarda Grillo; Universidade do Estado do Mato Grosso; Arantes, Vinícius Ribeiro; Universidade do Estado do Mato Grosso; Silva, kleberson Luiz Miranda da; Universidade do Estado do Mato Grosso.

The morphologic traits of the common bean genotype (Phaseolus vulgaris L.) in Cáceres MT, Brazil, are evaluated to optimize genotypes for future improvement breeding cultures. Sixteen genotypes were evaluated through 33 morphological characters. The experiment was carried out in randomized blocks with four replicates at the Mato Grosso Company for Research and Extension (EMPAER) in Cáceres, Mato Grosso State. A dendrogram was produced by Unweighted Pair Group Method with Arithmetic Mean (UPGMA) and Plan projection. Results showed the occurrence of genetic variability among the genotypes and the dendrogram revealed the formation of two main groups, one comprised genotypes of the black group and the other comprised genotypes of the Cores and Carioca group,...

Palavras-chave: 5.01.03.05-9 Phaseolus vulgaris; Morphological description; UPGMA; Genetic divergence Melhoramento Vegetal Phaseolus vulgaris; Morphological description; UPGMA; Genetic divergence.

Ano: 2011

URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/6944

Genetic characterization of Xylella fastidiosa isolated from citrus and coffee plants

Scientia Agricola

Miranda,Vicente Savonitti; Farias,Paulo Roberto Silva; Roberto,Sérgio Rufo; Lacava,Pedro Magalhães.

The Citrus Variegated Chlorosis and the Coffee Leaf Scorch are some of the many destructive diseases caused by Xylella fastidiosa, a gram-negative bacterium limited to the xylem of affected plants. As its genetic characterization is still not well established, different isolates of X. fastidiosa from citrus and coffee were evaluated through RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA) technique to characterize and classify these isolates based on similarity coefficients. Sixteen isolates of X. fastidiosa were used on this trial, obtained from citrus, coffee and almond. The genetic polymorphism evaluation was performed using six arbitrary 10-base primer pairs. It was possible to establish a dendogram in which the isolates were classified into five groups (A, B,...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/report

Palavras-chave: RAPD; Gram-negative bacterium; Genetic divergence.

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162007000500005

Genetic differentiation, origin and dispersal of Gammarus gauthieri from the Iberian peninsula and North Africa (Crustacea, Amphipoda)

Naturalis

Scheepmaker, Maarten.

Genetic differentiation among population samples of G. gauthieri on both sides of the Strait of Gibraltar was investigated by enzyme electrophoresis at 20 enzyme loci with reference to G. gauthieri and G. ibericus from different areas in the Iberian peninsula. Levels of divergence resolved suggest that G. gauthieri reached North Africa from the Iberian peninsula, and not vice versa. With reference to geological evidence, this was likely to occur during the Messinian (6—5 My ago). As the opening of the Strait of Gibraltar represents a well dated geological event, an attempt has been made to calibrate the molecular clock for the G. pulex-group. Indirect estimations of gene flow levels were shown to be extremely low. Probably as a consequence of frequently...

Tipo: Article / Letter to the editor

Palavras-chave: Distribution; Genetic divergence; Gene flow; Molecular clock; Gammarus.

Ano: 1990

URL: http://www.repository.naturalis.nl/record/503962

Genetic divergence among populations and accessions of the spineless peach palm from Pampa Hermosa landrace used in the heart-of-palm agribusiness in Brazil

Alves-Pereira,Alessandro; Clement,Charles R.; Picanço-Rodrigues,Doriane.

Although originally domesticated for its fruit, exploitation of the peach palm (Bactris gasipaes Kunth) in the production of gourmet heart-of-palm has also become an important activity, hence the need for improved material for large-scale production, on employing the Pampa Hermosa landrace as the seed source. In this study 11 microsatellite markers were used to evaluate genetic divergence among 96 elite plants representing four populations of spineless peach palm from the above cited source. Genetic variability was high (H T = 0.82). The low levels of divergence [F ST (0.023), G ST' (0.005)] and the high number of migrants (Nm -3.8 to 52.2) indicated significant interpopulation gene flow. Some of the plants presented high levels of genetic divergence, but...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/other

Palavras-chave: Bactris gasipaes; Heart-of-palm; Microsatellites; Genetic divergence; Genetic improvement.

Ano: 2012

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572012000300015

Genetic divergence between populations of the stingless bee uruçu amarela (Melipona rufiventris group, Hymenoptera, Meliponini): is there a new Melipona species in the Brazilian state of Minas Gerais?

Tavares,Mara Garcia; Dias,Luiz Antonio dos Santos; Borges,Andréia Arantes; Lopes,Denilce Meneses; Busse,Angélica Helene Pereira; Costa,Ronaldo Guimarães; Salomão,Tânia Maria Fernandes; Campos,Lucio Antonio de Oliveira.

Allozyme, microsatellite and random amplified polymorphic DNA (RAPD) molecular markers were used to investigate the within and between population genetic variability and between population genetic differentiation of the Brazilian stingless bee uruçu amarela (nominally Melipona rufiventris Lepeletier, 1836) present in savanna and Atlantic forest habitats of the Brazilian state of Minas Gerais (MG). We found low levels of within population variability, although there were a large number of private alleles that specifically characterized these populations. The F ST values indicated a high level of genetic diversity between populations. Analysis of molecular variance (AMOVA) showed a high degree of population differentiation between the savanna and Atlantic...