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Bayesian random regression threshold models for genetic evaluation of pregnancy probability in Red Sindhi heifers. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. T. de; BONAFÉ, C. M.; SIVA, F. F. e; VENTURA, H. T.; OLIVEIRA, H. R. de; MENEZES, G. R. de O.; RESENDE, M. D. V. de; VIANA, J. M. S..
We proposed a Bayesian random regression threshold model for genetic evaluation of pregnancy probability (PP) in Red Sindhi heifers over different months. Since this breed was recently introduced in Brazil, the age of 14 months usually preconized for Nellore cattle may not reflect the reality of the fertility indicator. In this context, the pregnancy success was evaluated at other ages aiming to understand its genetic variability pattern over time. A total of 4828 phenotyped heifers belong to 657 contemporary groups were used for the analysis. The estimated connectedness was equal to 99.75% considering 6189 individuals in the final pedigree. The random regression threshold models were implemented by combining second, third and fourth order Legendre...
Tipo: Nota Técnica/Nota Científica (ALICE) Palavras-chave: Heifer pregnancy; Legendre polynomials; Prenhez; Novilho; Bos indicus; Gado nelore; Zebu; Pedigree; Genetic heterogeneity.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077375
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Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Baynesiana e clássica sob diferentes cenários. Repositório Alice
ASSIS, G. M. L. de; CARNEIRO JUNIOR, J. M.; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S..
Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Avaliação genética; Genetic parameters; Amostragem de Gibbs; Gibbs sampling; Inferência Bayesiana; Bayesian inference; Metodologia REML; Informação a priori; Heterogeneidade de variância; Componentes de variância; Gene de efeito principal (NGEP); Sistema Genesys; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Estimatica; Análise estatística; Genoma; Modelo de simulação; Animal breeding; Genome; Genetic variance; Major genes; Genetic heterogeneity; Statistical analysis; Computer simulation; Cruce de animales; Varianza genetica; Genes mayores; Heterogeneidad genética; Análisis estadístico; Simulación por computadora.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/501455
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Estimação de componentes de variância utilizando-se inferência Bayesiana e frequentista em dados simulados sob heterogeneidade de variâncias. Repositório Alice
CARNEIRO JUNIOR, J. M.; ASSIS, G. M. L. de; EUCLYDES, R. F.; TORRES, R. de A.; LOPES, P. S..
Foi simulado um genoma de 3.000 centimorgans de comprimento considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1.500 machos e 1.500 fêmeas que formaram a população-base. A partir da população-base foram formadas duas populações iniciais, uma grande e outra pequena. Dois tipos de estruturas de heterogeneidade de variâncias foram inseridos nas populações iniciais: heterogeneidade de variância genética aditiva e heterogeneidade de variâncias genética aditiva e ambiental. Para obtenção destas estruturas, foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Avaliação genética; Genetic parameters; Amostragem de Gibbs; Gibbs sampling; Inferência Bayesiana; Bayesian inference; Metodologia REML; Informação a priori; Heterogeneidade de variância; Componentes de variância; Sistema Genesys; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Estimativa; Análise estatística; Genoma; Modelo de simulação; Animal breeding; Genome; Genetic variance; Genetic heterogeneity; Statistical analysis; Computer simulation; Cruce de animales; Varianza genética; Heterogeneidad genética; Análisis estadístico; Simulación por computadora.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/505159
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Floristic diversity of the shrub-arboreal stratum of homegardens in the Mariana re-settlement, Tocantins State, Brazil PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Santos, Ícaro Gonçalves; Nunes, Enderson Alves; Souza, Priscila Bezerra de; Previero, Conceição Aparecida.
The objective was to analyze the floristic, diversity and equability of the tree shrub stratum of home gardens (QA) in Mariana re-settlement located between Palmas and Porto Nacional municipalities in Tocantins State, Brazil. Three 20 x 30 m plots were installed in each home garden, totalizing 0.72 ha of sampled area. All shrub-tree individuals had its circumference at 1.3 m above ground level (CBH) measured when CBH ≥ 10 cm. A total of 477 individuals, 81 species, 34 families and 73 genera were verified in all QA. Shannon diversity index (H’) was 3.68 and Pielou equability indice (J’) was 0.83, for all sampled area. Individually, QA1, QA2, QA3 and QA4 presented H’ = 2.52; 3.27; 2.66 and 2.94, and J’ = 0.78; 0.90; 0.77 and 0.85, respectively. It was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Biodivesity; Genetic heterogeneity; Dominance Ciências Agrárias; Recursos Florestais; Botânica Biodiversidade; Heterogeneidade; Dominância.
Ano: 2017 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/1412
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Predição de valores genéticos utilizando inferência bayesiana e frequência em dados simulados. Repositório Alice
CARNEIRO JUNIOR, J. M.; ASSIS, G. M. L. de; EUCLYDES, R. F.; MARTNS, W. M. de O.; WOLTER, P. F..
Dados simulados foram utilizados para comparar as metodologias Eblup e Bayesiana, em dados com homogeneidade de variâncias, heterogeneidade de variância genética e heterogeneidade de variância genética e ambiental. Para obtenção dessas estruturas foram feitos descartes estratégicos dos valores genéticos aditivos e ambientais de acordo com o tipo de heterogeneidade e o nível de variabilidade desejada (alta, média ou baixa), sendo utilizados dois tamanhos de população (grande e pequena). Para a metodologia Bayesiana foram utilizados três níveis de informação a priori: não informativo, pouco informativo e informativo. A presença da heterogeneidade de variâncias causa problemas para a seleção dos melhores indivíduos, principalmente se a heterogeneidade estiver...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Avaliação genética; Genetic parameters; Inferência Bayesiana; Bayesian inference; Metodologia Eblup; Informação a priori; Heterogeneidade de variância; Componentes de variância; Melhoramento genético animal; Parâmetro genético; Estimativa; Análise estatística; Método estatístico; Modelo de simulação; Animal breeding; Genetic variance; Genetic heterogeneity; Statistical analysis; Computer simulation; Cruce de animales; Varianza genética; Heterogeneidad genética; Análisis estadístico; Simulación por computadora.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866226
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