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A first generation integrated map of the rainbow trout genome Inra
Palti, Y.; Genet, C.; Luo, M.C.; Charlet, A.; Gao, G.; Hu, Y.; Castaño-Sánchez, C.; Tabet-Canale, K.; Krieg, F.; Yao, J.; Vallejo, R.L.; Rexroad III, C.E..
Background: Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss) are the most-widely cultivated cold freshwater fish in the worldand an important model species for many research areas. Coupling great interest in this species as a researchmodel with the need for genetic improvement of aquaculture production efficiency traits justifies the continueddevelopment of genomics research resources. Many quantitative trait loci (QTL) have been identified forproduction and life-history traits in rainbow trout. An integrated physical and genetic map is needed to facilitatefine mapping of QTL and the selection of positional candidate genes for incorporation in marker-assisted selection(MAS) programs for improving rainbow trout aquaculture production.Results: The first generation...
Tipo: Journal Article Palavras-chave:  Rainbow trout (Oncorhynchus mykiss); Genomic research; QTL; Genome; Genetic maps.
Ano: 2011 URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD201141cecd7b&uri=/notices/prodinra1/2011/06/
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Apport de la génétique pour une meilleure connaissance des populations naturelles et une amélioration des populations cultivées d'huîtres plates et creuses ArchiMer
Lapegue, Sylvie.
In the framework of the French diploma "Habilitation à Diriger des Recherches", Sylvie Lapègue's synthesis of research includes ten years (1998-2007) of work in bivalve genetics, and mainly cupped and flat oysters. This research has been developed in (1) flat oyster population genetics at the European level and cupped oyster populations and species genetics at a global scale, (2) the characterization of a cytogenetic particularity observed in oysters that corresponds to a high rate of aneuploidy in somatic cells, and (3) more recently in the use of molecular markers for the construction or improvement of genetic maps, allowing (4) the identification of areas of the genome related to the resistance to summer mortality in the Pacific oyster and the...
Tipo: Text Palavras-chave: Ostrea; Crassostrea; Oysters; QTLs; Genetic maps; Breeding; Aneuploidy; Population genetics; Ostrea; Crassostrea; Huître; QTLs; Cartes génétiques; Amélioration; Aneuploïdie; Génétique des populations.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/these-3478.pdf
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Caracterização de linhagens endogâmicas recombinantes e mapeamento de locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum. Repositório Alice
FALEIRO, F.G.; SCHUSTER, I.; RAGAGNIN, V.A.; CRUZ, C.D.; CORRÊA, R.X.; MOREIRA, M.A.; BARROS, E.G. de.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar 154 linhagens endogâmicas recombinantes por meio da avaliação de características quantitativas, morfológicas, moleculares e de resistência a doenças e mapear locos de características quantitativas associados a ciclo e produtividade do feijoeiro-comum. Adotando o valor do limite de detecção (LOD) de 4,0 e uma freqüência máxima de recombinação de 0,40, foram mapeados 43 marcadores em nove grupos de ligação cobrindo uma distância de recombinação total de 247,8 cM. A distância entre marcadores adjacentes variou entre 0 e 28 cM, com média de 7,3 cM. Os grupos de ligação variaram em tamanho de 2,3 a 61,2 cM. Os genes de resistência à ferrugem e à antracnose ficaram localizados no mesmo grupo de ligação. Foram mapeados...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; QTL; Mapa genético; Progênie; Marcador genético; Método de melhoramento; Genetic maps; Progeny; Genetic markers; Breeding methods.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/109685
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Current genomic resources in melon and other cucurbits National Institute of Agronomic Research
Garcia-Mas, J..
In recent years there has been an effort towards the development of genomic resources in several cucurbit species, mainly in melon, cucumber and watermelon. The number of available sequences for these species in public databases has increased recently. This has allowed the design of microarrays for transcriptome analysis and the discovery of SNP markers for genotyping. Other genomic tools are also available in melon as BAC libraries, mutant populations and saturated genetic maps. Some international initiatives have emerged that will probably lead to the sequencing of the complete genomes of some cucurbit species during the next years.
Tipo: Conference Paper Palavras-chave: Genomic tool; Microarray; EST; Mutants; Physical map; SNP markers; BAC libraries; Genetic maps; EST databases; Genome; QTL.
Ano: 2008 URL: http://hdl.handle.net/2174/213
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Genetic linkage maps of chicken chromosomes 6, 7, 8, 11 and 13 from a Brazilian resource population Scientia Agricola
Ambo,Marcel; Campos,Raquel de Lello Rocha; Moura,Ana Sílvia Meira Tavares; Boschiero,Clarissa; Rosário,Millor Fernandes do; Ledur,Mônica Corrêa; Nones,Kátia; Coutinho,Luiz Lehmann.
A linkage map is essential not only for quantitative trait loci (QTL) mapping, but also for the organization and location of genes along the chromosomes. The present study is part of a project whose major objective is, besides from construction the linkage maps, the whole genome scan for mapping QTL for performance traits in the Brazilian experimental chicken population. Linkage maps of chicken chromosomes 6 to 8, 11 and 13 were constructed based on this population. The population was developed from two generations of crossbreeding between a broiler and a layer line. Fifty-one microsatellite markers were tested, from which 28 were informative: 4, 8, 7, 4 and 5 for chromosomes 6, 7, 8, 11 and 13, respectively. A SNP located in the leptin receptor gene was...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gallus gallus; Quantitative trait loci (QTL); Genetic maps; Microsatellite markers; Animal breeding.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162008000500001
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Marcadores morfológicos em coqueiros (Cocos nucifera L.): coloracão do coleto. Infoteca-e
ARAGAO, W. M.; CAMARA, T. M.; RIBEIRO, F. E..
Os marcadores de coloracao do coleto da plantula do coqueiro sao utilizados na certificacao de cruzamentos, baseado na heranca genetica das cores amarela, verde e marrom do coqueiro. Sua adequacao na certificacao e questionada.
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Marcadores genéticos; Mapas genéticos; Coco; Cor; Fenotipo; Hereditariedade genética; Melhoramento genético vegetal; Hibridação; Cruzamento; Genetic markers; Genetic maps; Cocos nucifera L; Colour; Fenotypes; Genetic inheritance; Plant breeding; Hybridization; Crossbreeding.
Ano: 1999 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/370884
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New molecular marker technologies for pearl millet improvement Open Agri
Gale, M.D..
Palavras-chave: Millets; Genomes; Genes; DNA; Genetic polymorphism; Genetic structures; Genetic markers; Locus; Genetic maps; Chromosomes.
Ano: 2005 URL: http://agropedia.iitk.ac.in/openaccess/?q=node/3219
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Programa de melhoramento de citros por hibridação controlada no centro apta citros "Sylvio Moreira"/IAC em 1997-2005. Repositório Alice
CRISTOFANI, m.; NOVELLI, V. M.; PERIN, M. S.; OLIVEIRA, A. C. de.; OLIVEIRA, R. P. de; BASTIANEL, M.; MACHADO, M. A..
2005
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Citrus; Resistance; Diseases; Genetic maps; Germplasm.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022047
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