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| Registros recuperados: 49 | |
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| ARDISSON-ARAÚJO, D. M. P.; PEREIRA, B. T.; MELO, F. L.; RIBEIRO, B. M.; BÁO, S. N.; ZANOTTO, P. M. de A.; MOSCARDI, F.; KITAJIMA, E. W.; SOSA-GÓMEZ, D. R.; WOLFF, J. L. C.. |
| A betabaculovirus (DisaGV) was isolated from Diatraea saccharalis (Lepidoptera: Crambidae), one of the most important insect pests of the sugarcane and other monocot cultures in Brazil. The complete genome sequence of DisaGV was determined using the 454-pyrosequencing method. The genome was 98,392 bp long, which makes it the smallest lepidopteran-infecting baculovirus sequenced to date. It had a G + C content of 29.7 % encoding 125 putative open reading frames (ORF). All the 37 baculovirus core genes and a set of 19 betabaculovirus-specific genes were found. A group of 13 putative genes was not found in any other baculovirus genome sequenced so far. A phylogenetic analysis indicated that DisaGV is a member of Betabaculovirus genus and that it is a sister... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Cana.; Genoma.; Betabaculovirus; Lepidoptera.. |
| Ano: 2016 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059049 |
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| CÔNSOLI, F. L.; ROSSI, G. G.; MERLIN, B. L.; PRADO, S. de S.; DOSSI, F. C. A.. |
| Cotesia flavipes (Hymenoptera, Braconidae) in an efficient larval parasitoid of the sugarcane borer Diatraea saccharalis (Lepidoptera, Crambidae). C. flavipes was introduced and is successfully used in applied biological control programs over extensive areas of sugarcane production in Brazil. The successful exploitation of host larvae by Cotesia flavipes is related to a plethora of regulatory molecules this wasp injects into the host or that is produced by parasitoid-derived tissues and associated symbiotic virus (Polydnavirus ? PDV). PDVs produce several proteins that allow host colonization by immature parasitoids, as they affect the host immune system, regulate host metabolism and growth. PDV-derived proteins are an interesting source of molecules that... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Genoma.; Cotesia flavipes; Polydnaviridae. |
| Ano: 2016 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073407 |
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| MONDEGO, J. M. C.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; TOKUDA, E. K.; PARIZZI, L. P.; COSTA, G. G. L.; PEREIRA, L. F. P.; ANDRADE, A. C.; COLOMBO, C. A.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, G. A. G.. |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Café arabica.; Coffea Arábica; Coffea Canephora; Genoma.; Genes.. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/902404 |
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| MEDA, A. R.; PEREIRA, L. F. P.; SANTOS, T. B. dos. |
| O nitrogênio (N) é o nutriente mais requerido pelo cafeeiro, sendo adquirido principalmente pelas raízes. As formas de N mais abundantes em solos agrícolas são nitrato (NO3-) e amônio (NH4+), enquanto que a uréia [CO(NH)2 O nitrato (NO] é a principal forma de N utilizada na adubação do cafeeiro. Devido a participação significativa da adubação nitrogenada nos custos de produção do café, é de interesse a identificação de genes envolvidos na absorção radicular e translocação de nitrogênio no cafeeiro, visando uma otimização da eficiência do uso do nitrogênio pela cultura. Neste trabalho foram encontradas etiquetas de sequências expressas (ESTs) no banco de dados do Projeto Genoma Café relacionadas ao transporte das formas mais relevantes na aquisição do N. O... |
| Tipo: Anais e Proceedings de eventos |
Palavras-chave: Nutrição mineral do cafeeiro; Proteína transportadora.; Genoma.. |
| Ano: 2009 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903260 |
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| VIDAL, R.; FERREIRA, L. P.; LANNES, S. D.; VIEIRA, L. G. E.; MONDEGO, J.; CARAZZOLLE, M. F.; PEREIRA, G. A.; POT, D.; PEREIRA, L. F. P.. |
| Polimorfismos de modificações nucleotídicas (SNPs ? Single Nucleotide Polymorphisms, INDELs ? Insertion / Deletions) têm uma alta freqüência nos genomas da maioria dos organismos, incluindo plantas. Eles vêm se tornando a escolha principal de marcador para trabalhos de melhoramento, genotipagem e diagnóstico. A identificação destes polimorfismos irá fornecer marcadores que poderão ser utilizados para o mapeamento genético, estudos de genética de população e de associação. Portanto, os objetivos deste trabalho foram: 1) identificar in silico SNPs e INDELS existentes em seqüências de ESTs disponíveis; e 2) analisar a diversidade nucleotídica em Coffea spp. Um pipeline para identificação de SNPs e INDELs foi desenvolvido utilizando seqüências de ESTs... |
| Tipo: Anais e Proceedings de eventos |
Palavras-chave: SNP; INDEL; Mapeamento.; Genoma.. |
| Ano: 2009 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903595 |
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| ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; ZAMBOLIM, E. M.; ZAMBOLIM, L.; SAKIYAMA, N. S.. |
| O CafEST é a base de dados que armazena as 200 mil ESTs geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. Em trabalho anterior, sequências potencialmente associadas com a defesa do cafeeiro a doenças foram identificadas. Entre essas sequências, genes de quitinases. As proteínas codificadas por esses genes são enzimas que podem desempenhar funções como metabolismo de quitina, mecanismos de defesa contra patógenos e estresse abiótico, nutrição, parasitismo entre outras. Dada a importância desta enzima para a planta, o objetivo do presente trabalho foi analisar as ESTs de quitinase identificadas previamente. Para isso foi realizada uma caracterização funcional das sequências e construído um perfil de expressão in silico. Os resultados mostraram que essas... |
| Tipo: Anais e Proceedings de eventos |
Palavras-chave: Bioinformática.; Genoma.; Coffea.. |
| Ano: 2011 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/903963 |
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| CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; PAIVA, E.. |
| Os genes, unidades biologicas que determinam as caracteristicas de um organismo, estao contidos em moleculas de DNA presentes no nucleo das celulas. Portanto, o estudo do DNA e de fundamental importancia para o entendimento de como as caracteristicas de um organismo sao formadas. Com o grande avanco alcancado pelas tecnicas de Biologia molecular nas ultimas decadas, hoje, somos capazes de isolar e sequenciar moleculas de DNA de maneira rotineira. A partir da otimizacao das tecnicas de sequenciamento, surgiram programas com o objetivo de sequenciar genomas inteiros. atualmente, estao depositados em bancos de dados mais de 3 milhoes de sequencias de DNA e, grande parte delas ainda nao tem sua funcao conhecida. O processo de caracterizacao da funcao genica... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Sequenciamento; CDNA; DNA sequency.; Genoma.; Genome.. |
| Ano: 2000 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/484108 |
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| CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C.. |
| A produção mundial de café é altamente afetada pelas mudanças climáticas, consequentemente, obter plantas adaptadas a este cenário de clima alterado torna-se muito importante. Com os recentes avanços na genômica do cafeeiro, como o sequenciamento do genoma de C. canephora, o objetivo deste trabalho foi desenvolver e validar o chip de genotipagem de DNA para C. canephora (26K Axiom SNP array), visando uma plataforma de genotipagem confiável e de alto rendimento, a ser utilizada nos programas de melhoramento da espécie. A construção do chip foi feita utilizando-se dados gerados a partir do resequenciamento genômico de pools formados por indivíduos dos diferentes grupos de diversidade encontrados na espécie e por indivíduos de C. canephora Conilon,... |
| Tipo: Anais e Proceedings de eventos |
Palavras-chave: Genotipagem; SNP array; Melhoramento genético.; Coffea canephora; DNA; Gene; Genoma.. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084718 |
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| Registros recuperados: 49 | |
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