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Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos (BDGF) para suporte a estudos de associação genômica ampla e seleção genômica em programas de melhoramento animal. Infoteca-e
HIGA, R. H.; OLIVEIRA, G. B. de..
Este documento complementa os trabalhos previamente desenvolvidos, apresentando um modelo de dados para armazenamento de dados de genótipos, fenótipos e pedigree de animais de interesse agropecuário para suporte tanto a experimentos de GWAS quanto a programas de melhoramento genético animal, Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos(BDGF).
Tipo: Documentos (INFOTECA-E) Palavras-chave: Melhoramento animal; Associação genômica; Genome-wide association studies; Genótipo; Fenótipo; Genotype; Phenotype; Genetic improvement.
Ano: 2015 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1022327
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Gene expression differences in Longissimus muscle of Nelore steers genetically divergent for residual feed intake. Repositório Alice
TIZIOTO, P. L.; COUTINHO, L. L.; OLIVEIRA, P. S. N.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; LIMA, A. O.; ROCHA, M. I.; DECKER, J. E.; SCHNABEL, R. D.; MOURÃO, G. B.; TULLIO, R. R.; ZERLOTINI NETO, A.; TAYLOR, J. F.; REGITANO, L. C. de A..
Residual feed intake (RFI), a measure of feed efficiency (FE), is defined as the difference between the observed and the predictable feed intake considering size and growth of the animal. It is extremely important to beef production systems due to its impact on the allocation of land areas to alternative agricultural production, animal methane emissions, food demand and cost of production. Global differential gene expression analysis between high and low RFI groups (HRFI and LRFI: less and more efficient, respectively) revealed 73 differentially expressed (DE) annotated genes in Longissimus thoracis (LT) muscle of Nelore steers. These genes are involved in the overrepresented pathways Metabolism of Xenobiotics by Cytochrome P450 and Butanoate and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide association studies; Quantitative trait locus; Gado de corte; Gene expression; Feed conversion; Beef cattle; Nellore.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1073482
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Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of Brazilian Nelore beef cattle. Repositório Alice
MUDADU, M. de A.; PORTO-NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P.; NASCIMENTO, M. L.; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A..
Nelore is the major beef cattle breed in Brazil with more than 130 million heads. Genome-wide association studies (GWAS) are often used to associate markers and genomic regions to growth and meat quality traits that can be used to assist selection programs. An alternative methodology to traditional GWAS that involves the construction of gene network interactions, derived from results of several GWAS is the AWM (Association Weight Matrices)/PCIT (Partial Correlation and Information Theory). With the aim of evaluating the genetic architecture of Brazilian Nelore cattle, we used high-density SNP genotyping data (~770,000 SNP) from 780 Nelore animals comprising 34 half-sibling families derived from highly disseminated and unrelated sires from across Brazil....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide association studies; Association Weight Matrices; Partial Correlation and Information Theory; Gene; Genética; Gado Nelore; Gado de corte; Genótipo; Genotyping; Genotype; Nellore; Beef cattle; Genetic resources.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1059898
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Genomic structure and marker-derived gene networks for growth and meat quality traits of Brazilian Nelore beef cattle. Repositório Alice
MUDADU, M. de A.; PORTO-NETO, L. R.; MOKRY, F. B.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; TULLIO, R. R.; NASSU, R. T.; NICIURA, S. C. M.; THOLON, P.; ALENCAR, M. M. de; HIGA, R. H.; ROSA, A. do N.; FEIJO, G. L. D.; FERRAZ, A. L. J.; SILVA, L. O. C. da; MEDEIROS, S. R. de; LANNA, D. P.; NASCIMENTO, M. L.; CHAVES, A. S.; SOUZA, A. R. D. L.; PACKER, I. U.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; SIQUEIRA, F.; MOURÃO, G. B.; COUTINHO, L. L.; REVERTER, A.; REGITANO, L. C. de A..
Nelore is the major beef cattle breed in Brazil with more than 130 million heads. Genome-wide association studies (GWAS) are often used to associate markers and genomic regions to growth and meat quality traits that can be used to assist selection programs. An alternative methodology to traditional GWAS that involves the construction of gene network interactions, derived from results of several GWAS is the AWM (Association Weight Matrices)/PCIT (Partial Correlation and Information Theory). With the aim of evaluating the genetic architecture of Brazilian Nelore cattle, we used high-density SNP genotyping data (~770,000 SNP) from 780 Nelore animals comprising 34 half-sibling families derived from highly disseminated and unrelated sires from across Brazil....
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genome-wide association studies; Association Weight Matrices; Partial Correlation and Information Theory; Gene; Genética; Gado Nelore; Gado de corte; Genótipo; Genotyping; Genotype; Nellore; Beef cattle; Genetic resources.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1065945
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