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A host specialized form of Ceratocystis fimbriata causes seed and seedling blight on native Carapa guianensis (andiroba) in Amazonian rainforests. Repositório Alice
VALDETARO, D. C. O. F.; HARRINGTON, T. C.; OLIVEIRA, L. S. S.; GUIMARÃES, L. M. S.; MCNEW, D. L.; PIMENTA, L. V. A.; GONCALVES, R. C.; SCHURT, D. A.; ALFENAS, A. C..
Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted recently was recorded causing seed and seedling blight on Carapa guianensis Aubl. (andiroba), a tree species native to the Amazon Rainforest and prized for its valuable timber and medicinal seed oil. C. fimbriata more commonly causes wilt type diseases in woody hosts, especially on non-native host trees. However, on andiroba the disease occurs on seedlings and seeds, affecting the species regeneration. We studied 73 isolates of C. fimbriata on andiroba from three regions of the Amazon Basin to see if they represented natural or introduced populations. Analysis of ITS rDNA sequences and phylogenetic analysis of mating type genes revealed new haplotypes of C. fimbriata from the Latin American Clade that were closely...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Produto florestal não madeireiro (PFNM); Enfermedades fungales de las plantas; Plantas de semilleros; Semillas; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Marcador microssatélite; Stem blight; Tizón del tallo; Andiroba; Carapa Guianensis; Doença Fúngica; Fungo; Ceratocystis Fimbriata; Plântula; Semente; Variação Genética; Marcador Genético; Nontimber forest products; Fungal diseases of plants; Seedlings; Seeds; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107239
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A putative resistant DNA marker for wool yellowing susceptibility in sheep. Repositório Alice
BENAVIDES, M. V.; DAMAK, S.; MAHER, A. P..
An Australian Merino flock was screened for low (resistant) and high (susceptible) yellow predictive colour (YPC) breeding values in order to compare extreme individuals using the differential display of mRNA technique. One differentially expressed cDNA band was visualised only in the resistant group. This band showed no identity with the DNA sequences of public databases; however, they showed short homologies with three database sequences related to transmembrane signalling functions. The use of these candidate genes as DNA markers needs to be confirmed against sheep with a wide range of susceptibility to wool yellowing to verify the results.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ovino; ; Marcador Genético.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095880
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Análise bibliométrica da aplicação dos marcadores SNP para os estudos da conservação dos recursos genéticos: Capra hircus. Repositório Alice
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; SILVA, G. R. da; DINIZ, F. M.; ARAUJO, A. M. de..
Esse estudo teve como objetivo analisar a produção científica mundial acerca do uso de marcadores SNPs em Capra hircus (caprinos) a fim de verificar o estado da arte sob aspecto da genética evolutiva e da conservação de diversidade da espécie. Conclui-se que as pesquisas com caprinos usando os marcadores SNPs tendem a concentrar-se na Ásia e estarem voltados a temas referentes aos aspectos produtivos (com destaque para leite) e reprodutivos, provavelmente pela grande importância da espécie no mercado mundial.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genômica evolutiva; Caprino; Base de Dados; Marcador Genético; Genética Animal; Recurso Genético; Goats; Genetic markers; Animal genetic resources.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102285
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Análise da variabilidade genética molecular de uma coleção de trabalho de guandu (Cajanus cajan) como apoio na seleção de acessos para testes agronômicos em sistemas de integração lavoura-pecuária e recuperação de pastagens degradadas. Infoteca-e
FALEIRO, F. G.; FERNANDES, F. D.; BARCELLOS, A. O.; ANDRADE, R. P.; BELLON, G.; JUNQUEIRA, K. P.; AMABILE, R. F.; MARTHA JÚNIOR, G. B.; VILELA, L.; RAMOS, A. K. B.; KARIA, C. T.; GODOY, R..
bitstream/CPAC-2009/27696/1/p2006_35.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: Feed legumes.; Biotecnologia; Marcador Molecular; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Variação Genética.; Genetic variation.; Biotechnology; Genetic markers.
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/570173
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Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores múltiplos. Repositório Alice
LAGOS, E. B.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; FERNANDES, L. T.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C..
bitstream/item/207052/1/final9356.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Anel umbilical; Blossoc; Defeitos congênitos; Influência genética; Perdas econômicas; Suinocultura; Genética Animal; Marcador Genético.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116904
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Análise de DNA dos caprinos no nordeste mostra que ainda há diversidade genética. Infoteca-e
ARAÚJO, A. M. de; SILVA, F. L. R. da.
bitstream/item/86434/1/Midia-Analise-de-DNA.pdf
Tipo: Artigo de divulgação na mídia (INFOTECA-E) Palavras-chave: Diversidade genética.; Caprino; Genética Animal; Marcador Genético; Recurso Genético..
Ano: 2008 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/534088
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Análise do genoma funcional de Arachis pintoi e desenvolvimento de novos marcadores moleculares. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de.
O amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov. e W.C. Greg.) tem apresentado resultados importantes na pecuária por seu alto valor nutritivo, o que tem contribuído no aumento da produção de leite, ganho de peso no gado de corte e redução no tempo de abate em até nove meses. Além disso, seu uso como cobertura verde em consórcios com culturas comerciais tem contribuído na redução da erosão, manutenção da umidade do solo, ciclagem de nutrientes, fixação biológica de nitrogênio e baixas emissões de óxido nitroso. O uso de sequenciamento nova geração (NGS) pode auxiliar no conhecimento da biologia da espécie e desenvolvimento de novas cultivares. O objetivo do presente trabalho foi analisar o genoma funcional de Arachis pintoi por meio de dados de RNA-Seq e...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Amendoim forrageiro; Forage peanut; Cacahuetes forrajeros; Marcador microssatélite; Genetic analysis; RNA-Seq; Leguminosas forrajeras; Fitomejoramiento; Polimorfismo de nucleótido simple; Repeticiones de microsatélite; Análisis genético; Leguminosa Forrageira; Melhoramento Genético Vegetal; Marcador Genético; Genoma; Análise; Forage legumes; Plant breeding; Genetic markers; Single nucleotide polymorphism; Microsatellite repeats; Genome.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127550
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Aplicação de marcadores SNP em estudos de diversidade genética em Capra hircus: tendencias, vieses e progressos. Repositório Alice
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. O.; SILVA, G. R. da; DINIZ, F. M.; ARAUJO, A. M. de.
Os caprinos (Capra hircus) estão distribuídos mundialmente favorecidos por sua capacidade de se adaptar a condições ambientais adversas. A sua importância socioeconômica, têm recebido atenção em pesquisas com o uso de marcadores genéticos (SNP), que possibilitam esclarecer questões envolvendo mudanças evolutivas e auxiliam na conservação da biodiversidade populacional. Com esta revisão, objetivou-se analisar a contribuição de marcadores SNP em estudos com caprinos, com foco na produção e na conservação genética. Utilizou-se o software de pesquisa bibliométrica Bibexcel para análise das publicações da Web of Science TM, até agosto de 2018, rastreando artigos com marcador genético SNP. Das 53.000 produções científicas registradas para a espécie C. hircus,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Raças locais; Genômica evolutiva; Conservação; Recurso Genético; Marcador Genético.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126071
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Aplicação de tecnologias genômicas baseadas em marcadores microssatélites para discriminação de cultivares e análise de pureza genética em feijoeiro comum. Infoteca-e
BRONDANI, R. P. V.; BRONDANI, C..
A Embrapa Arroz e Feijão está atuando na condução de ações de pesquisa voltadas para o desenvolvimento e implementação de práticas de genotipagem molecular que possibilitem consolidar estratégias mais eficientes de proteção de cultivares e seus derivados. Novos sistemas de genotipagem utilizando análise multiplex e detecção semi-automatizada encontram-se em fase avançada de desenvolvimento, integrando locos microssatélites com elevado conteúdo informativo e poder de discriminação.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Feijão; Marcador Genético; Melhoramento Genético Vegetal; Phaseolus Vulgaris..
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/215773
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Associação entre padrões isoenzimáticos de clones de seringueira (Hevea spp) e resistência ao Microcyclus ulei (P. Henn) v. Arx. Repositório Alice
KALIL FILHO, A. N..
Estudo sobre a existencia de associacao entre a resistencia e fenotipos enzimaticos por meio de eletroforese em gel de amido em extratos de foliolos, para determinacao dos fenotipos de 107 clones para seis sistemas enzimaticos. As associacoes entre classes de fenotipos enzimaticos com resistencia ao M. ulei foram estabelecidas atraves do teste x², e as associacoes entre fenotipos enzimaticos com resistencia ao mal das folhas pelo teste x² de Woolf. Foram verificadas, tambem, a) a existencia de associacao entre heterozigosidade media e resistencia a doenca, e b) algumas associacoes entre fenotipos enzimaticos de locos diferentes. Padroes eletroforeticos evidenciaram a origem alotetraploide (anfidiploide) proposta para o genero Hevea. Algumas discrepancias...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genetico; Brasil; Sao Paulo; Species; Rubber tree; Fungal diseases; Resistance; Isoenzymes; Doença; Espécie; Folha; Hevea; Isoenzima; Mal das Folhas; Marcador Genético; Microcyclus Ulei; Resistência; Seringueira; Breeding; Genetic markers; Leaves.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/667109
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Avaliação da heterogeneidade de variâncias utilizando dados simulados. Repositório Alice
CARNEIRO JUNIOR, J. M..
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de realizar uma análise comparativa, via simulação de dados, entre a metodologia clássica de estimação dos componentes de variância e predição dos valores genéticos REML ? BLUP e a metodologia Bayesiana que permite a inclusão de informação a priori e a utilização de distribuições robustas, como a normal contaminada, na avaliação genética dos animais. Foi simulado um genoma de 3000 centimorgans de comprimento, considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco, na qual a herdabilidade variou conforme a estrutura desejada de heterogeneidade de variâncias. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1500 machos e 1500 fêmeas que formaram a...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Genética Animal; Marcador Genético; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/504313
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Avaliação da transferibilidade para Euterpe precatoria de marcadores microssatélites desenvolvidos para Euterpe edulis. Repositório Alice
AZEVEDO, H. S. F. da S.; RUFINO, P. B.; CAVALCANTE, L. do N.; AZEVEDO, J. M. A. de; WADT, L. H. de O.; CAMPOS, T. de.
Euterpe precatoria, conhecido popularmente como açaí-solteiro apresenta potencial agronômico, tecnológico e econômico e vem ganhando destaque pela comercialização de seus frutos. A produção desse açaizeiro está baseada no extrativismo e por isso práticas de manejo têm sido recomendadas para uma coleta sustentável. Para se recomendar taxas sustentáveis de coleta dos frutos, é fundamental se ter informações sobre a variabilidade genética das populações naturais O açaizeiro apresenta grande importância, devido à crescente demanda por seus frutos nos mercados consumidores: local, regional e nacional. Esta crescente procura, faz com que seja incentivado estudos de diversidade e estrutura genética de populações de açaizeiros nativos, visando a conservação, uma...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Manejo sustentável; Agricultura sustentable; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Novo Segredo; Formoso; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Açaí; Euterpe Edulis; Variação Genética; Fruto; Marcador Genético; Sustainable agriculture; Plant breeding; Euterpe precatoria; Arecaceae; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107227
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Caracterização da diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira. Repositório Alice
SOUZA, C. S. de.
A seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Ruber tree; Árbol de goma; Hevea pauciflora; Hevea rigidifolia; Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Seringueira; Hevea Brasiliensis; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Marcador Genético; Genótipo; Polimorfismo Genético; Plant breeding; Genetic variation; Genetic markers; Genotype; Genetic polymorphism; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091127
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Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. C. de; SILVA, A. L. D. da; SILVA, C. C. da; SOUZA, A. P. de; FORMIGHIERI, E. F.; CAMPOS, T. de.
O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Marcador Genético.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415
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Caracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
KLUSKA, S.; TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; BALDI REY, F. S..
Resumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Densidade de Marcadores; Marcador Genético; Seleção Genótipa; Cromossoma.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083353
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Coeficiente de trilha no estudo dos componentes primarios e secundarios na producao de graos do guandu (Cajanus cajan (L.) Millsp). Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; PAINI, J. N.; CRUZ, C. D..
Cincoenta e seis acessos de guandu foram usados para estudar os efeitos diretos e indiretos dos componentes primarios e secundarios sobre a producao de graos. O estudo do coeficiente de trilha, adotando um diagrama em cadeias, revelou que os componentes primarios, numero de vagens/planta e tamanho dos graos apresentaram maiores efeitos diretos associados a alta correlacao. O numero de vagens/planta foi influenciado por plantas de maturacao precoce altas, enquanto o tamanho de graos foi influenciado pelo comprimento de vagens e pela altura da planta. Recomenda-se na selecao de guandu granifero considerar plantas com maior numero de vagens e sementes maiores como componentes primarios e plantas altas, de vagens compridas, floracao tardia e maturacao precoce...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pigeonpea; Genetic marker; Guandu; Cajanus Cajan; Grão; Marcador Genético; Produção; Grain yield.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/133144
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Determinação da pureza varietal de sementes da cultivar de soja BRS Raimunda utilizando marcadores moleculares. Infoteca-e
MOREIRA, C. T.; BROGIN, R. L.; SOUZA, P. I. M. de; FARIAS NETO, A. L. de; ABUD, S.; TEIXEIRA, R. N..
bitstream/CPAC-2009/26810/1/p2005_18.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: DNA; Glycine Max; Marcador Molecular; Marcador Genético; Melhoramento Genético Vegetal; Soja.; Genetic markers; Plant breeding; Soybeans..
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/569437
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Distribuição da variabilidade genética Stylosanthes macrocephala coletadas na região de cerrado e semi-árido brasileiro. Infoteca-e
BARROS, A. M.; FALEIRO, F. G.; KARIA, C. T.; SHIRATSUCHI, L. S.; ANDRADE, R. P.; LOPES, G. K. B..
bitstream/CPAC-2009/26788/1/p2005_25.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: RAPD; Feed legumes.; Biotecnologia; Leguminosa Forrageira; Marcador Genético; Marcador Molecular; Variação Genética.; Genetic variation.; Biotechnology; Genetic markers.
Ano: 2006 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/567165
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Diversidade genetica de especies silvestres de maracujazeiro com resistencia multipla a doencas com base em marcadores RAPD. Infoteca-e
FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; BELON, G.; BORGES, T. A.; ANJOS, J. de R. N. dos; PEIXOTO, J. R.; BRAGA, M. F.; SANTOS, D. G..
bitstream/CPAC-2009/24951/1/p2004_05.pdf
Tipo: Fôlder / Folheto / Cartilha (INFOTECA-E) Palavras-chave: RAPD; Plant diseases.; Biotecnologia; Doença de Planta; Marcador Molecular; Maracujá; Marcador Genético; Passiflora Edulis; Variação Genética; Variedade Resistente.; Biotechnology; Genetic markers; Genetic variation; Disease resistance; Passion fruits..
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/567929
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Diversidade genética de galinhas comerciais e nativas genotipadas com chip de alta densidade. Repositório Alice
ABREU JUNIOR, P. B. de; XAVIER SILVA, J.; ARAUJO, A. C.; LEDUR, M. C.; PAIVA, S. R.; BRITO, L.; IBELLI, A. M. G.; CARNEIRO, P. L. S..
bitstream/item/219225/1/final9626.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genética Animal; Marcador Genético; Gene; Gene Marcador; Espécie Nativa.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1128158
Registros recuperados: 72
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