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A host specialized form of Ceratocystis fimbriata causes seed and seedling blight on native Carapa guianensis (andiroba) in Amazonian rainforests. Repositório Alice
VALDETARO, D. C. O. F.; HARRINGTON, T. C.; OLIVEIRA, L. S. S.; GUIMARÃES, L. M. S.; MCNEW, D. L.; PIMENTA, L. V. A.; GONCALVES, R. C.; SCHURT, D. A.; ALFENAS, A. C..
Ceratocystis fimbriata Ellis & Halsted recently was recorded causing seed and seedling blight on Carapa guianensis Aubl. (andiroba), a tree species native to the Amazon Rainforest and prized for its valuable timber and medicinal seed oil. C. fimbriata more commonly causes wilt type diseases in woody hosts, especially on non-native host trees. However, on andiroba the disease occurs on seedlings and seeds, affecting the species regeneration. We studied 73 isolates of C. fimbriata on andiroba from three regions of the Amazon Basin to see if they represented natural or introduced populations. Analysis of ITS rDNA sequences and phylogenetic analysis of mating type genes revealed new haplotypes of C. fimbriata from the Latin American Clade that were closely...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Produto florestal não madeireiro (PFNM); Enfermedades fungales de las plantas; Plantas de semilleros; Semillas; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Marcador microssatélite; Stem blight; Tizón del tallo; Andiroba; Carapa Guianensis; Doença Fúngica; Fungo; Ceratocystis Fimbriata; Plântula; Semente; Variação Genética; Marcador Genético; Nontimber forest products; Fungal diseases of plants; Seedlings; Seeds; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107239
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A putative resistant DNA marker for wool yellowing susceptibility in sheep. Repositório Alice
BENAVIDES, M. V.; DAMAK, S.; MAHER, A. P..
An Australian Merino flock was screened for low (resistant) and high (susceptible) yellow predictive colour (YPC) breeding values in order to compare extreme individuals using the differential display of mRNA technique. One differentially expressed cDNA band was visualised only in the resistant group. This band showed no identity with the DNA sequences of public databases; however, they showed short homologies with three database sequences related to transmembrane signalling functions. The use of these candidate genes as DNA markers needs to be confirmed against sheep with a wide range of susceptibility to wool yellowing to verify the results.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ovino; ; Marcador Genético.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095880
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Análise bibliométrica da aplicação dos marcadores SNP para os estudos da conservação dos recursos genéticos: Capra hircus. Repositório Alice
DINIZ SOBRINHO, F. de A.; MOURA, J. de O.; SILVA, G. R. da; DINIZ, F. M.; ARAUJO, A. M. de..
Esse estudo teve como objetivo analisar a produção científica mundial acerca do uso de marcadores SNPs em Capra hircus (caprinos) a fim de verificar o estado da arte sob aspecto da genética evolutiva e da conservação de diversidade da espécie. Conclui-se que as pesquisas com caprinos usando os marcadores SNPs tendem a concentrar-se na Ásia e estarem voltados a temas referentes aos aspectos produtivos (com destaque para leite) e reprodutivos, provavelmente pela grande importância da espécie no mercado mundial.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Genômica evolutiva; Caprino; Base de Dados; Marcador Genético; Genética Animal; Recurso Genético; Goats; Genetic markers; Animal genetic resources.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102285
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Análise de associação genômica para hérnia umbilical em suínos comerciais utilizando abordagem de marcadores múltiplos. Repositório Alice
LAGOS, E. B.; PIRES, M. P.; ONO, R. K.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; MORES, M. A. Z.; FERNANDES, L. T.; PEDROSA, V. B.; LEDUR, M. C..
bitstream/item/207052/1/final9356.pdf
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Anel umbilical; Blossoc; Defeitos congênitos; Influência genética; Perdas econômicas; Suinocultura; Genética Animal; Marcador Genético.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116904
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Associação entre padrões isoenzimáticos de clones de seringueira (Hevea spp) e resistência ao Microcyclus ulei (P. Henn) v. Arx. Repositório Alice
KALIL FILHO, A. N..
Estudo sobre a existencia de associacao entre a resistencia e fenotipos enzimaticos por meio de eletroforese em gel de amido em extratos de foliolos, para determinacao dos fenotipos de 107 clones para seis sistemas enzimaticos. As associacoes entre classes de fenotipos enzimaticos com resistencia ao M. ulei foram estabelecidas atraves do teste x², e as associacoes entre fenotipos enzimaticos com resistencia ao mal das folhas pelo teste x² de Woolf. Foram verificadas, tambem, a) a existencia de associacao entre heterozigosidade media e resistencia a doenca, e b) algumas associacoes entre fenotipos enzimaticos de locos diferentes. Padroes eletroforeticos evidenciaram a origem alotetraploide (anfidiploide) proposta para o genero Hevea. Algumas discrepancias...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Melhoramento genetico; Brasil; Sao Paulo; Species; Rubber tree; Fungal diseases; Resistance; Isoenzymes; Doença; Espécie; Folha; Hevea; Isoenzima; Mal das Folhas; Marcador Genético; Microcyclus Ulei; Resistência; Seringueira; Breeding; Genetic markers; Leaves.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/667109
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Avaliação da heterogeneidade de variâncias utilizando dados simulados. Repositório Alice
CARNEIRO JUNIOR, J. M..
Estudos de simulação foram conduzidos com o objetivo de realizar uma análise comparativa, via simulação de dados, entre a metodologia clássica de estimação dos componentes de variância e predição dos valores genéticos REML ? BLUP e a metodologia Bayesiana que permite a inclusão de informação a priori e a utilização de distribuições robustas, como a normal contaminada, na avaliação genética dos animais. Foi simulado um genoma de 3000 centimorgans de comprimento, considerando uma única característica quantitativa, governada por 800 locos com dois alelos por loco, na qual a herdabilidade variou conforme a estrutura desejada de heterogeneidade de variâncias. Segundo a estrutura genômica proposta, foram simulados 1500 machos e 1500 fêmeas que formaram a...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Genética Animal; Marcador Genético; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/504313
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Avaliação da transferibilidade para Euterpe precatoria de marcadores microssatélites desenvolvidos para Euterpe edulis. Repositório Alice
AZEVEDO, H. S. F. da S.; RUFINO, P. B.; CAVALCANTE, L. do N.; AZEVEDO, J. M. A. de; WADT, L. H. de O.; CAMPOS, T. de.
Euterpe precatoria, conhecido popularmente como açaí-solteiro apresenta potencial agronômico, tecnológico e econômico e vem ganhando destaque pela comercialização de seus frutos. A produção desse açaizeiro está baseada no extrativismo e por isso práticas de manejo têm sido recomendadas para uma coleta sustentável. Para se recomendar taxas sustentáveis de coleta dos frutos, é fundamental se ter informações sobre a variabilidade genética das populações naturais O açaizeiro apresenta grande importância, devido à crescente demanda por seus frutos nos mercados consumidores: local, regional e nacional. Esta crescente procura, faz com que seja incentivado estudos de diversidade e estrutura genética de populações de açaizeiros nativos, visando a conservação, uma...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Manejo sustentável; Agricultura sustentable; Variación genética; Repeticiones de microsatélite; Novo Segredo; Formoso; Terra Indígena Kaxinawá de Nova Olinda (TIKNO); Feijó (AC); Acre; Amazônia Ocidental; Western Amazon; Amazonia Occidental; Melhoramento Genético Vegetal; Açaí; Euterpe Edulis; Variação Genética; Fruto; Marcador Genético; Sustainable agriculture; Plant breeding; Euterpe precatoria; Arecaceae; Genetic variation; Genetic markers; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107227
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Caracterização da diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira. Repositório Alice
SOUZA, C. S. de.
A seringueira (Hevea brasiliensis) é uma planta popularmente conhecida por ser a principal fonte de borracha natural. Assim, é fundamental que este recurso genético esteja devidamente avaliado e caracterizado. O objetivo desse trabalho foi caracterizar por meio de marcadores microssatélites a diversidade genética de acessos do banco de germoplasma de seringueira da Embrapa Amazônia Ocidental, Embrapa Amazônia Oriental e Embrapa Cerrados. Foram amostrados 318 acessos, pertencentes às espécies Hevea brasiliensis, Hevea pauciflora, Hevea rigidifolia e híbridos interespecíficos. Foram testados 10 marcadores microssatélites. Os produtos amplificados foram genotipados em sequenciador automático. As estimativas genéticas estimadas foram: heterozigosidade esperada...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Marcador microssatélite; Ruber tree; Árbol de goma; Hevea pauciflora; Hevea rigidifolia; Fitomejoramiento; Variación genética; Marcadores genéticos; Repeticiones de microsatélite; Seringueira; Hevea Brasiliensis; Melhoramento Genético Vegetal; Variação Genética; Marcador Genético; Genótipo; Polimorfismo Genético; Plant breeding; Genetic variation; Genetic markers; Genotype; Genetic polymorphism; Microsatellite repeats.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1091127
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Caracterização do desequilíbrio de ligação em uma população de bovinos da raça Nelore. Repositório Alice
KLUSKA, S.; TONUSSI, R. L.; SILVA, R. M. de O.; OLIVERI, B. F.; FEITOSA, F. L. B.; PERIPOLLI, E.; LEMOS, M. V. A.; BERTON, M. P.; CHIAIA, H. L. J.; PEREIRA, A. S. C.; LOBO, R. B.; BEZERRA, L. A.; MAGNABOSCO, C. de U.; AGUILAR, I.; DI CROCE, F.; OSTERSTOCK, J.; BALDI REY, F. S..
Resumo: Tendo em vista a importância da estimação do desequilíbrio de ligação para a seleção genômica, o objetivo deste estudo foi estimar o desequilíbrio de ligação de uma população de bovinos da raça Nelore participantes do programa de melhoramento da ANCP. Foram utilizadas informações de 9.459 animais genotipados com um painel de alta densidade, totalizando 735.044 SNP?s, antes do controle de qualidade. A estimação do desequilíbrio de ligação foi realizada através do programa SNP1101. Os valores de LD observados para os cromossomos autossômicos variaram de 0,18 a 0,25. Para marcadores distanciados até 1 Kb a média de r² foi de 0,53 e para marcadores distanciados entre 90 e 100 Kb 0,14. Para MAF a média variou de 0,23 a 0,25, considerando MAF mínimo de...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Densidade de Marcadores; Marcador Genético; Seleção Genótipa; Cromossoma.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083353
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Coeficiente de trilha no estudo dos componentes primarios e secundarios na producao de graos do guandu (Cajanus cajan (L.) Millsp). Repositório Alice
SANTOS, C. A. F.; MENEZES, E. A.; PAINI, J. N.; CRUZ, C. D..
Cincoenta e seis acessos de guandu foram usados para estudar os efeitos diretos e indiretos dos componentes primarios e secundarios sobre a producao de graos. O estudo do coeficiente de trilha, adotando um diagrama em cadeias, revelou que os componentes primarios, numero de vagens/planta e tamanho dos graos apresentaram maiores efeitos diretos associados a alta correlacao. O numero de vagens/planta foi influenciado por plantas de maturacao precoce altas, enquanto o tamanho de graos foi influenciado pelo comprimento de vagens e pela altura da planta. Recomenda-se na selecao de guandu granifero considerar plantas com maior numero de vagens e sementes maiores como componentes primarios e plantas altas, de vagens compridas, floracao tardia e maturacao precoce...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Pigeonpea; Genetic marker; Guandu; Cajanus Cajan; Grão; Marcador Genético; Produção; Grain yield.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/133144
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Diversidade genética entre linhagens elite de feijão-comum estimada com base em marcadores microssatélites. Repositório Alice
SANTOS, A. R. de S.; COÊLHO, L. M.; SILVA, R. de S.; PEREIRA, H. S.; MELO, L. C.; SOUZA, T. L. P. O. de..
O objetivo desse trabalho foi analisar a diversidade genética de linhagens elite de feijoeiro-comum com marcadores microssatélites. Foram coletadas amostras foliares de 44 cultivares e linhagens elite do programa de melhoramento de feijão da Embrapa, avaliadas no ciclo de ensaios de VCU 2018/19, com grãos de diferentes classes comerciais: carioca, preto, rajado, branco, mulatinho, roxo, entre outras.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão; Phaseolus Vulgaris; Variação Genética; Marcador Genético.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118027
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Diversidade genética entre tipos de cambuizeiro utilizando marcadores ISSR. Repositório Alice
NASCIMENTO, A. L. S.; PEREIRA, C. S. A.; LEDO, A. da S.; MUNIZ, A. V. C. da S..
bitstream/item/195013/1/Diversidade.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Cambui; Marcador Genético; Citogenética Vegetal.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1107498
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Diversity of microsatellites linked to the FSH[beta]; gene, their usefulness for individual identification and association with reproductive. performance. Repositório Alice
DUARTE, L. B. H.; MORAES, J. C. F.; WEIMER, T. de A..
A diversidade genética de três microssatélites (ILSTS027, MBO22, BM4325) mapeados no cromossomo bovino 15 e ligados ao gene do hormônio folículo estimulante, cadeia b (FSHb) foi investigada em fêmeas de um rebanho bovino Brangus Ibagé. Além de estimar a variabilidade genética do rebanho, avaliou-se a eficiência destes marcadores para a identificação individual e controle de paternidade. Verificaram-se também possíveis associações entre os marcadores e o desempenho reprodutivo. Seis alelos foram detectados em BM4325 e ILSTS027 e 12 foram observados em MB022, os mais freqüentes sendo, BM4325*101, BM4325*103, ILSTS027*169 e MB022*229. O conteúdo de informação polimórfica variou entre 0,58 a 0,88 enquanto a heterozigosidade esperada oscilou entre 65% e 89%,...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Brangus Ibagé; Reprodução Animal; Marcador Genético.
Ano: 2005 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1094420
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Estabelecimento de fingerprint molecular em abacaxi via marcadores microssatélites não ancoradoso. Infoteca-e
FERREIRA, C. F.; SILVA, A. G. S.; SANTOS, T. A.; RAMOS, A. P. de S.; OLIVEIRA, S. A. S. de; JUNGHANS, D. T..
A fruticultura é um segmento do agronegócio brasileiro que movimenta bilhões de dólares por ano e se torna cada vez mais um pilar consolidado na geração de empregos e economia do País. A cadeia produtiva do abacaxi (Ananas comosus L. Merr.) possui grande representatividade nesse setor, com amplo mercado interno e excelentes perspectivas no mercado externo. A adoção de cultivares melhoradas de abacaxi, pelos produtores atende demandas dos consumidores e contribui para a rentabilidade da cultura. Entretanto, devido às características de propagação vegetativa e ao comércio informal de materiais propagativos, o rastreamento da adoção e disseminação de uma cultivar é bastante complexo, levandose em consideração a caracterização apenas por aspectos morfológicos....
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Abacaxi; Marcador Genético; Marcador Molecular; Genetic markers; Pineapples.
Ano: 2019 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1112673
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Estudo de associação ampla do genoma (GWAS) para prolificidade em caprinos. Repositório Alice
MONTEIRO, N. V.; NASCIMENTO, M. C. de O.; FACO, O.; SILVA, K. de M..
Atualmente, os marcadores resultantes do polimorfismo de um único nucleotídeo (Single Nucleotide Polymophisms - SNPs) são os mais utilizados nos estudos de associação devido a sua ampla distribuição pelo genoma e a possibilidade de estarem em desiquilíbrio de ligação com a região onde podem existir um ou mais genes (Quantitative Trait Loci - QTL) responsáveis pela expressão da característica em estudo. Os Estudos de Associação Ampla do Genoma (GWAS) oferecem a possibilidade de identificação de regiões associadas com características de interesse econômico a partir de análises combinando informações genotípicas e fenotípicas. O objetivo deste trabalho foi identificar regiões do genoma que possam estar influenciando a prolificidade em caprinos. Foram...
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: GWAS; Prolificidade; Prolificacy; Caprino; Marcador Genético; Melhoramento Genético Animal; Goats; Animal breeding; Genetic markers.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1102220
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Exploiting sorghum genetic diversity for enhanced aluminum tolerance: allele mining based on the AltSB locus. Repositório Alice
HUFNAGEL, B.; GUIMARÃES, C. T.; CRAFT, E. J.; SHAFF, J. E.; SCHAFFERT, R. E.; KOCHIAN, L. V.; MAGALHAES, J. V..
Root damage due to aluminum (Al) toxicity restricts crop production on acidic soils, which are extensive in the tropics. The sorghum root Al-activated citrate transporter, SbMATE, underlies the Al tolerance locus, AltSB, and increases grain yield under Al toxicity. Here, AltSB loci associated with Al tolerance were converted into Amplification Refractory Mutation System (ARMS) markers, which are cost effective and easy to use. A DNA pooling strategy allowed us to identify accessions harboring rare favorable AltSB alleles in three germplasm sets while greatly reducing genotyping needs. Population structure analysis revealed that favorable AltSB alleles are predominantly found in subpopulations enriched with guinea sorghums, supporting a possible Western...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Tolerância; Toxicidade; Alumínio; Germoplasma; Marcador Genético; Sorgo.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093494
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Frequentist p-values for large-scale-single step genome-wide association, with an application to birth weight in American Angus cattle. Repositório Alice
AGUILAR, I.; LEGARRA, A.; CARDOSO, F. F.; MASUDA, Y.; LOURENCO, D.; MISZTAL, I..
Background: Single-step genomic best linear unbiased prediction (SSGBLUP) is a comprehensive method for genomic prediction. Point estimates of marker effects from SSGBLUP are often used for genome-wide association studies (GWAS) without a formal framework of hypothesis testing. Our objective was to implement p-values for singlemarker GWAS studies within the single-step GWAS (SSGWAS) framework by deriving computational algorithms and procedures, and by applying these to a large beef cattle population. Methods: P-values were obtained based on the prediction error (co)variances for single nucleotide polymorphisms (SNPs), which were obtained from the prediction error (co)variances of genomic predictions based on the inverse of the coefficient matrix and...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Gado Angus; Predição Genômica; Bovino; Marcador Genético; Melhoramento Genético Animal.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118159
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Genetic variability of Passiflora spp. based on issr and rapd. Repositório Alice
OLIVEIRA, J. da S.; FALEIRO, F. G.; JUNQUEIRA, N. T. V.; FONSECA, K. G. da; ARAYA, S..
bitstream/item/205147/1/Genetic-variability-of-passiflora-spp.-based-on-issr.pdf
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador Molecular; Marcador Genético; Maracujá.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1114813
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Genotyping by sequencing approach for autotetraploidy urochloa. Repositório Alice
RESENDE, R. M. S.; MARTINS, F. B.; VILELA, M. de M.; MORAES, A. C. L.; FERREIRA, R. C. U.; DÉO, T. G.; PASTINA, M. M.; NODA, R. W.; SOUZA, A. P..
bitstream/item/208638/1/Genotyping-by-sequence-approach.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pastagem; Germoplasma; Progênie; Marcador Genético; DNA; Forage; Urochloa ruziziensis; Tetraploidy.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1118620
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Hierarchical outcrossing among and within fruits in Bertholletia excelsa Bonpl. (Lecythidaceae) open-pollinated seeds. Repositório Alice
GUSTINA, L. D.; BALDONI, A. B.; TONINI, H.; AZEVEDO, V. C. R.; NEVES, L. G.; TARDIN, F. D.; SEBBENN, A. M..
Knowing the mating patterns is important to determine the number of trees necessary for seed collection for conservation ex situ, tree breeding and environmental reforestation purposes. We investigated B. excelsa individuals and fruits, to check mating system index variations in a population by using open-pollinated seeds which were hierarchically sampled within and among fruits from nine trees genotyped for ten microsatellite loci. Outcrossing rate ( tm ) changed between trees (0.49?1.0) and fruits (0.53?1.0), but seeds were predominantly produced by outcrossing (0.92) at mean population level. Mating between related trees ( tm  ts ) was detected in six trees (0.04?0.08) and in 32 fruits in trees (0.03?0.22), thus it suggests that the...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Marcador Genético; Bertholletia Excelsa; Polinização; Semente; Melhoramento; Árvore; Conservação; Genética; Castanha do Para.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1096307
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