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Acurácia da imputação de marcadores SNPs em bovinos das raças Hereford e Braford. Repositório Alice
MILANO, J. N.; CARVALHO, H. G. de; SOLLERO, B. P.; YOKOO, M. J. -I.; CARDOSO, F. F..
Devido ao alto custo que as genotipagens em larga escala apresentam para estudos na área de genômica, fazem-se necessárias estratégias que viabilizem a genotipagem de forma menos onerosa.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Predição; Marcador molecular; Método de melhoramento; Gado de corte.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1027902
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Aferição dos métodos de avaliação da pureza genética através do peso de 500g e número de sementes em soja. Repositório Alice
ANDREOLI, C.; OLIVEIRA, A. C..
O uso de diferentes metodos para determinacao da pureza varietal em sementes de soja tem ocasionado conflitos entre laboratorios e na comercializacao interestadual de sementes de soja. O objetivo deste trabalho foi testar a afericao de dois metodos de analise de pureza, peso de 500 gramas e 1000 sementes, em dois lotes de soja. No experimento I, as amostras foram enviadas a 10 laboratorios, e no experimento II, o ensaio foi conduzido em 07 laboratorios. Oito amostras constituidas de 998 gramas de sementes puras e duas gramas de sementes de outra cultivar foram preparadas pelos laboratorio. O numero de sementes atipicas variou de 10 a 18 entre os laboratorios no Experimento I e de 11 a 13 sementes no Experimento II, sendo as amostras A1 e A2 de facil...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Mistura varietal; Contaminante; Marcador molecular.
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/480578
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Alchemy Web: uma proposta de interface gráfica para o Sistema Alchemy. Infoteca-e
NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina).
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/984524
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Allelic variation in HCT1 gene expression is associated with lignin content in sorghum. Repositório Alice
LIVIO, D. F.; DINIZ, M. N.; BARROS, B. A.; SOUZA, V. F. de; PASTINA, M. M.; NODA, R. W.; DAMASCENO, C. M. B..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Marcador molecular; Lignina; Bioenergia.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076585
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Análise comparativa da estabilidade do DNA de Dalbulus maidis (DeLong & Wolcott) (Hemiptera: Cicadellidae) sob diferentes métodos de preservação para uso em RAPD-PCR Neotropical Entomology
OLIVEIRA,CHARLES M.; FUNGARO,MARIA H.P.; CAMARGO,LUÍS E.A.; LOPES,JOÃO R.S..
A preservação adequada do DNA de um determinado organismo é fundamental para o sucesso no uso de técnicas moleculares como RAPD-PCR. O objetivo deste trabalho foi comparar métodos simples de preservação de espécimes de Dalbulus maidis (DeLong & Wolcott) (Hemiptera: Cicadellidae) quanto à quantidade e qualidade do DNA para uso em RAPD-PCR, após períodos sucessivos de armazenamento. Avaliaram-se oito métodos: congelamento (-20ºC); álcool etílico 70% (-20ºC e temperatura ambiente); álcool etílico absoluto (-20ºC e temperatura ambiente); secagem ao ar; e preservação em tampão de extração (inseto inteiro e macerado). A intervalos de 10-30 dias, o DNA foi extraído, quantificado e amplificado via RAPD-PCR pelo oligonucleotídeo OPA-04. A qualidade do DNA...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Insecta; Cigarrinha-do-milho; Marcador molecular; Conservação de DNA; Técnica de armazenamento.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2002000200008
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Análise comparativa entre estudos de associação genômica em bovinos das raças Hereford e Braford para resistência ao carrapato. Repositório Alice
OLIVEIRA, K. da S. V.; JUNQUEIRA, V. S.; CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P..
O presente trabalho visou comparar avaliações de associação genômica ampla (GWAS) entre 652 animais da raça Hereford e 2.803 animais Braford, genotipados para 41.045 SNPs, via inferência bayesiana para a característica de resistência ao carrapato.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Gado de corte; Marcador molecular; Genética animal.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1058955
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Análise comparativa para a produtividade em arroz por populações segregantes de Epagri 108 x Irat 122 avançadas por Bulk e SSD. Repositório Alice
RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; MOURA NETO, F. P.; BRONDANI, C..
O objetivo desse trabalho, portanto, foi comparar a produtividade das linhagens avançadas por SSD (F8) com a produtividade das linhagens avançadas por Bulk (F7: 8). Adicionalmente, todas as linhagens estão sendo analisadas por marcadores SNPs, obtidos pela técnica de DArTseq, o que possibilitará inferir a distância genética entre elas e comparar o percentual da variação fenotípica explicada pelos QTLs para produtividade identificados nos dois conjuntos de linhagens (derivadas dos métodos Bulk e SSD).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084439
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Análise da diversidade genética de acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; VIANELLO, R. P.; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BORBA, T. C. de O..
O objetivo deste trabalho foi caracterizar, através de marcadores microssatélites, os acessos da CONFE (Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/941647
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Análise da diversidade genética de cornichão com o uso de marcadores microssatélites R. Bras. Zootec.
Santos,Armando Martins dos; Agnol,Miguel Dall'; Janke,Aline; Bortolini,Fernanda; Huber,Kátia Graziela Costa.
O objetivo neste trabalho foi analisar a diversidade genética de 14 materiais de Lotus corniculatus L. por meio de marcadores microssatélites. Foram analisados quatro cultivares e uma população de L. corniculatus e seus respectivos genótipos selecionados visando tolerância e sensibilidade ao alumínio. Foram utilizados 17 pares de primers que detectaram 36 alelos nos 17 locos microssatélites, com média de 2,25 alelos por loco. O resultado da análise de agrupamento com base nos índices de similaridade mostrou a formação de três grupos: um englobando germoplasmas e genótipos selecionados para sensibilidade ao alumínio e outros dois formados por genótipos selecionados visando tolerância ao alumínio tóxico. A análise molecular foi eficiente para detectar e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Alumínio tóxico; Cornichão; Marcador molecular; Variabilidade genética.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000600005
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Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites. Repositório Alice
PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
No Brasil, foi estabelecida, a partir da década de 70, uma rede de pesquisa com ênfase na conservação e uso dos recursos genéticos do feijoeiro comum. O banco de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão detém aproximadamente 17.345 acessos, dos quais 4.325 são variedades tradicionais (VTs). Esses acessos representam uma rica fonte de genes que conferem adaptação a diferentes ambientes, resistência a doenças e propriedades agronômicas diferenciadas que podem ser exploradas por meio de técnicas moleculares que fornecem medidas bastante eficientes e diretas da variabilidade genética existente dentro e entre os acessos. Esse estudo teve como objetivo a avaliação da variabilidade genética de VTs de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites (SSRs).
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/984476
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Análise da diversidade genética dos acessos componentes da coleção nuclear de feijão da Embrapa através de marcadores SSR. Repositório Alice
CIESLAK, J. F.; BORBA, T. C. de O.; MELO, L. C.; OLIVEIRA, J. P. de; DEL PELOSO, M. J.; COSTA, J. G. C. da.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão através de marcadores SSR fluorescentes.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/912303
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Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.). Repositório Alice
FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/964150
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Análise da variabilidade genética de variedades tradicionais de arroz (Oryza sativa L.) através de marcadores moleculares microssatélites. Repositório Alice
BORBA, T. C. de O.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES, M. R.; BRONDANI, C..
Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética através de marcadores moleculares SSR em uma amostra de variedades tradicionais oriundas de coletas, conduzidas entre os anos de 1978 e 1996, em lavouras de pequenos agricultores no Brasil.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Marcador molecular.
Ano: 2003 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/936126
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Análise de SSRs para retrocruzamento assistido visando introgressão do transgene de resistência ao VMDF. Repositório Alice
MOTA, A. P. S.; MENEZES, I. P. P. de; SOUZA, T. L. P. O. de; FARIA, J. C. de; VIANELLO, R. P..
O objetivo desse estudo foi o de identificar marcadores microssatélites (SSRs) polimórficos entre as cultivares Pérola e BRS Pontal, doadoras do evento 5.1, e as cultivares BRS Estilo, BRS Ametista, BRS Notável e BRS Esplendor, receptoras do transgene, bem como outras cultivares potenciais incluindo BRS Embaixador, Rudá, BRS Agreste, And 277, BRS MG Tesouro, BRSMG Realce, CNFP10729, BRS 9435 Cometa, BRS Horizonte e BRS Esteio.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Doença de planta; Virus; Marcador molecular.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/941377
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Análise fenotípica para produtividade em linhas puras recombinantes de arroz. Repositório Alice
GARCIA, A. L. B.; VIANELLO, R. P.; MENDONÇA, J. A.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho é identificar genes relacionados à produtividade, através da análise de RILs (linhas puras recombinantes) genotipadas por marcadores SNPs.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066201
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Análise morfoanatômica, bioquímica e molecular de dendezeiros (Elaeis guineensis Jacq.) regenerados por embriogênese somática em sistema de imersão temporária. Repositório Alice
GOMES, H. T..
O objetivo do trabalho foi avaliar a utilização de sistemas de imersão temporária na embriogênese somática de dendezeiros (Elaeis guineensis Jacq.), a partir de folhas imaturas de plantas adultas, caracterizar morfoanatômica e bioquimicamente os estádios embriogênicos obtidos no processo, além analisar os clones regenerados por marcadores ISSR e AFLP (MSAP). Num primeiro experimento, calos primários da variedade C2328 foram multiplicados por cinco subcultivos de 30 dias, em quatro diferentes sistemas de cultivo: semi-sólido, líquido sob agitação, além dos biorreatores de imersão temporária R.I.T.A.® e tipo frascos gêmeos (BIT). Em seguida, o biorreator mais eficiente foi avaliado isoladamente na multiplicação de calos de outras três variedades: B35-2932,...
Tipo: Teses Palavras-chave: Biorreatores de imersão temporária; Embrião somático; Variação somaclonal; ISSR; AFLP; MSAP; Ontogênese.; Micropropagação; Marcador molecular; Histologia; Fisiologia; Morfogênese.; Arecaceae..
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1065516
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Análise preliminar de dados de sequenciamento por captura (Capture-seq na identificação de marcadores SNPs associados a tolerância à seca em arroz. Repositório Alice
VIEIRA, A. F.; VALDISSER, P. A. M. R.; LANNA, A. C.; VIANELLO, R. P.; NEVES, L. G.; BRONDANI, C..
O objetivo deste trabalho foi analisar um conjunto de dados de sequenciamento de captura de 300 genótipos de arroz de terras altas para 2.500 unigenes previamente identificados como relacionados a tolerância à seca na espécie.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Marcador molecular; Resistência à seca.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1066152
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Análise proteômica do sêmen de reprodutores caprinos soropositivos para a artrite encefalite caprina Repositório Alice
BEZERRA JÚNIOR, R. Q..
Resumo: A maioria das pesquisas para diagnóstico e avaliação da lentiviroses se baseia na identificação, direta ou indireta, da proteína viral no sangue, leite, sêmen, saliva ou tecidos. Trabalhos com proteômica avaliando as lentiviroses são escassos. A princípio, a análise, detecção e/ou avaliação do vírus são realizadas a partir, principalmente, de amostras de sangue, sendo a maioria dos estudos realizados relacionada ao HIV. O perfil proteico do plasma seminal de pequenos ruminantes associado com índices reprodutivos já foi determinado, mas trabalhos correlacionando a presença dessas proteínas no sêmen à Artrite Encefalite Caprina (CAE) são escassos. Na primeira fase desse trabalho foi avaliada a atividade das metaloproteinases (MMPs) no sangue por meio...
Tipo: Teses Palavras-chave: Zimografia; Eletroforese Bidimensional; Zymography; Two-dimensional electrophoresi; Biomarcadores; Análise proteômica; Artrite encefalite caprina; Vírus da artrite encefalite caprina; CAE; CAEV; Caprine arthritis encephalit virus.; Caprino; Sangue; Sêmen; Doença animal; Marcador molecular; Goats; Blood; Animal diseases; Genetic markers; Proteomics..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1041024
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Analysis of genetic variability of commercial melon cultivars using SSR molecular markers. Repositório Alice
CARVALHO, N.; CANELA, F. M.; LEITE, P. H. S.; FERREIRA, M. A.; OLIVEIRA, V. R.; SANTOS, M. F.; SOUZA, N. O. S.; BUSO, G. S. C..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Commercial cultivars; SSR; Molecular markers.; Genetic variability; Melão; Marcador molecular; Cucumis melo.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1079736
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Anastomosis groups and molecular variation in Pseudocercospora griseola. Repositório Alice
SILVA, K. J. D. e; SOUZA, E. A.; FREIRE, C. N. S.; ISHIKAWA, F. H..
The fungus Pseudocercospora griseola is the causal agent of angular leaf spot, a common bean (Phaseolus vulgaris L.) disease. The successful development of angular leaf spot-resistant cultivars depends on understanding the levels of variability in pathogen populations. P. griseola shows great pathogenic and genetic variation using inoculation on differential bean cultivars and molecular markers. Nevertheless, how this variability develops is not clearly understood. Parasexuality has been presented as a mechanism used by asexual fungi to increase variation. Hyphal fusion is the first step for the parasexual cycle, and it can be considered an additional trait for population studies. The aim of this study was to identify hyphal fusion (anastomosis) among P....
Tipo: Separatas Palavras-chave: Feijoeiro comum; Ciclo parassexual; RAPD markers.; Angular leaf spot; Common bean; Mancha angular; Marcador molecular; Parasexual cycle; Phaeoisariopsis griseola..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030017
Registros recuperados: 272
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