SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

A transcriptional approach for identifying genes related to drought stress.

CHIARI, L.; RESENDE, R. M. S.; JANK, L.; VALLE, C. B. do; JUNGMANN, L..

Neste trabalho procurou-se apresentar e discutir, de forma ampla, o uso da biotecnologia e seu potencial para os programas de melhoramento de forrageiras tropicais realizados na Embrapa Gado de Corte. O uso da biotecnologia nesses programas é uma atividade recente, mas importantes resultados vêm sendo gerados a fim de auxiliar o processo de obtenção de novas cultivares forrageiras. A maioria dos trabalhos apresentados utiliza marcadores Random Amplification of Polymorphic DNA (RAPD) para aplicações em curto prazo: estudos de diversidade em acessos de bancos de germoplasma, identificação de híbridos e estimação da taxa de cruzamento. Aplicações em médio e longo prazos do uso de marcadores, como mapeamento genético e seleção auxiliada por marcadores...

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Pastagem; Melhoramento genético vegetal; Biotecnologia; Forrageira tropcial; Gramínea; Leguminosa; Híbrido; Marcador molecular; RAPD.

Ano: 2007

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326872

MARTINS, A. C. Q.; MORGANTE, C. V.; SANTOS, C. M. R.; SILVA, F. R. da; ARAÚJO, A. C. G.; BERTIOLI, D. J.; BERTIOLI, S. C. de M. L.; GUIMARAES, P. M.; BRASILEIRO, A. C. M..

2011

Acurácia da imputação de marcadores SNPs em bovinos das raças Hereford e Braford.

Palavras-chave: Estresse hídrico; Diversidade genética; Marcador molecular; Planta; Amendoim.

Ano: 2011

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/903303

MILANO, J. N.; CARVALHO, H. G. de; SOLLERO, B. P.; YOKOO, M. J. -I.; CARDOSO, F. F..

Devido ao alto custo que as genotipagens em larga escala apresentam para estudos na área de genômica, fazem-se necessárias estratégias que viabilizem a genotipagem de forma menos onerosa.

Aferição dos métodos de avaliação da pureza genética através do peso de 500g e número de sementes em soja.

Palavras-chave: Predição; Marcador molecular; Método de melhoramento; Gado de corte.

Ano: 2015

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1027902

ANDREOLI, C.; OLIVEIRA, A. C..

O uso de diferentes metodos para determinacao da pureza varietal em sementes de soja tem ocasionado conflitos entre laboratorios e na comercializacao interestadual de sementes de soja. O objetivo deste trabalho foi testar a afericao de dois metodos de analise de pureza, peso de 500 gramas e 1000 sementes, em dois lotes de soja. No experimento I, as amostras foram enviadas a 10 laboratorios, e no experimento II, o ensaio foi conduzido em 07 laboratorios. Oito amostras constituidas de 998 gramas de sementes puras e duas gramas de sementes de outra cultivar foram preparadas pelos laboratorio. O numero de sementes atipicas variou de 10 a 18 entre os laboratorios no Experimento I e de 11 a 13 sementes no Experimento II, sendo as amostras A1 e A2 de facil...

Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE)

Palavras-chave: Mistura varietal; Contaminante; Marcador molecular.

Ano: 1996

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/480578

Alchemy Web: uma proposta de interface gráfica para o Sistema Alchemy.

Allelic variation in HCT1 gene expression is associated with lignin content in sorghum.

NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..

A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina).

Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular.

Ano: 2014

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984524

LIVIO, D. F.; DINIZ, M. N.; BARROS, B. A.; SOUZA, V. F. de; PASTINA, M. M.; NODA, R. W.; DAMASCENO, C. M. B..

bitstream/item/164586/1/Allelic-variation.pdf

Análise comparativa da estabilidade do DNA de Dalbulus maidis (DeLong & Wolcott) (Hemiptera: Cicadellidae) sob diferentes métodos de preservação para uso em RAPD-PCR

Palavras-chave: Marcador molecular; Lignina; Bioenergia.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1076585

Neotropical Entomology

OLIVEIRA,CHARLES M.; FUNGARO,MARIA H.P.; CAMARGO,LUÍS E.A.; LOPES,JOÃO R.S..

A preservação adequada do DNA de um determinado organismo é fundamental para o sucesso no uso de técnicas moleculares como RAPD-PCR. O objetivo deste trabalho foi comparar métodos simples de preservação de espécimes de Dalbulus maidis (DeLong & Wolcott) (Hemiptera: Cicadellidae) quanto à quantidade e qualidade do DNA para uso em RAPD-PCR, após períodos sucessivos de armazenamento. Avaliaram-se oito métodos: congelamento (-20ºC); álcool etílico 70% (-20ºC e temperatura ambiente); álcool etílico absoluto (-20ºC e temperatura ambiente); secagem ao ar; e preservação em tampão de extração (inseto inteiro e macerado). A intervalos de 10-30 dias, o DNA foi extraído, quantificado e amplificado via RAPD-PCR pelo oligonucleotídeo OPA-04. A qualidade do DNA...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/article

Palavras-chave: Insecta; Cigarrinha-do-milho; Marcador molecular; Conservação de DNA; Técnica de armazenamento.

Ano: 2002

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1519-566X2002000200008

Análise comparativa entre estudos de associação genômica em bovinos das raças Hereford e Braford para resistência ao carrapato.

OLIVEIRA, K. da S. V.; JUNQUEIRA, V. S.; CARDOSO, F. F.; SOLLERO, B. P..

O presente trabalho visou comparar avaliações de associação genômica ampla (GWAS) entre 652 animais da raça Hereford e 2.803 animais Braford, genotipados para 41.045 SNPs, via inferência bayesiana para a característica de resistência ao carrapato.

Análise comparativa para a produtividade em arroz por populações segregantes de Epagri 108 x Irat 122 avançadas por Bulk e SSD.

Palavras-chave: Gado de corte; Marcador molecular; Genética animal.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1058955

RAMOS, M. R. F.; MENDONÇA, J. A.; MOURA NETO, F. P.; BRONDANI, C..

O objetivo desse trabalho, portanto, foi comparar a produtividade das linhagens avançadas por SSD (F8) com a produtividade das linhagens avançadas por Bulk (F7: 8). Adicionalmente, todas as linhagens estão sendo analisadas por marcadores SNPs, obtidos pela técnica de DArTseq, o que possibilitará inferir a distância genética entre elas e comparar o percentual da variação fenotípica explicada pelos QTLs para produtividade identificados nos dois conjuntos de linhagens (derivadas dos métodos Bulk e SSD).

Análise da diversidade genética de acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1084439

CIESLAK, J. F.; VIANELLO, R. P.; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; MELO, L. C.; DEL PELOSO, M. J.; BORBA, T. C. de O..

O objetivo deste trabalho foi caracterizar, através de marcadores microssatélites, os acessos da CONFE (Coleção Nuclear de Feijão da Embrapa).

Análise da diversidade genética de cornichão com o uso de marcadores microssatélites

Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.

Ano: 2012

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/941647

R. Bras. Zootec.

Santos,Armando Martins dos; Agnol,Miguel Dall'; Janke,Aline; Bortolini,Fernanda; Huber,Kátia Graziela Costa.

O objetivo neste trabalho foi analisar a diversidade genética de 14 materiais de Lotus corniculatus L. por meio de marcadores microssatélites. Foram analisados quatro cultivares e uma população de L. corniculatus e seus respectivos genótipos selecionados visando tolerância e sensibilidade ao alumínio. Foram utilizados 17 pares de primers que detectaram 36 alelos nos 17 locos microssatélites, com média de 2,25 alelos por loco. O resultado da análise de agrupamento com base nos índices de similaridade mostrou a formação de três grupos: um englobando germoplasmas e genótipos selecionados para sensibilidade ao alumínio e outros dois formados por genótipos selecionados visando tolerância ao alumínio tóxico. A análise molecular foi eficiente para detectar e...

Tipo: Info:eu-repo/semantics/article

Palavras-chave: Alumínio tóxico; Cornichão; Marcador molecular; Variabilidade genética.

Ano: 2011

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982011000600005

Análise da diversidade genética de variedades tradicionais de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites.

PRADO, G. S.; COELHO, G. R. C.; MENEZES, I. P. P. de; OLIVEIRA, J. P. de; COSTA, J. G. C. da; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..

No Brasil, foi estabelecida, a partir da década de 70, uma rede de pesquisa com ênfase na conservação e uso dos recursos genéticos do feijoeiro comum. O banco de germoplasma da Embrapa Arroz e Feijão detém aproximadamente 17.345 acessos, dos quais 4.325 são variedades tradicionais (VTs). Esses acessos representam uma rica fonte de genes que conferem adaptação a diferentes ambientes, resistência a doenças e propriedades agronômicas diferenciadas que podem ser exploradas por meio de técnicas moleculares que fornecem medidas bastante eficientes e diretas da variabilidade genética existente dentro e entre os acessos. Esse estudo teve como objetivo a avaliação da variabilidade genética de VTs de feijoeiro comum utilizando marcadores microssatélites (SSRs).

Análise da diversidade genética dos acessos componentes da coleção nuclear de feijão da Embrapa através de marcadores SSR.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/984476

CIESLAK, J. F.; BORBA, T. C. de O.; MELO, L. C.; OLIVEIRA, J. P. de; DEL PELOSO, M. J.; COSTA, J. G. C. da.

O objetivo deste trabalho foi caracterizar acessos componentes da Coleção Nuclear de Feijão através de marcadores SSR fluorescentes.

Análise da diversidade genética e estruturação populacional entre marcadores SSRs e SNPs em germoplasma de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.).

Palavras-chave: Diversidade genética; Coleção nuclear; Feijão; Phaseolus vulgaris; Marcador molecular.

Ano: 2011

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/912303

FARIA, B. M. S. de; MENEZES, I. P. P. de; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; VALDISSER, P. A. M. R.; COELHO, G. R. C.; BORBA, T. C. de O.; ABREU, A. G. de; BRONDANI, C.; BARROS, E. G. de; VIANELLO, R. P..

O objetivo desse estudo foi avaliar o poder de informação genética dos marcadores SSRs e SNPs para aplicações no melhoramento genético do feijoeiro comum.

Análise da diversidade genética em Stylosanthes guianensis utilizando marcadores RAPD.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Germoplasma; Marcador molecular.

Ano: 2013

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/964150

Análise da recuperação do genitor recorrente em maracujazeiro-azedo por meio de marcadores RAPD

CHIARI, L.; VALLE, J. V. R. do; RESENDE, R. M. S.; CANÇADO, L. J.; SALGADO, L. R.; LEGUIZÁMON, G. O. de C..

O conhecimento da variabilidade genética e da relação entre diferentes acessos de Stylosanthes guianensis é importante para maximizar o uso dos recursos genéticos disponíveis. Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética em 20 acessos dessa espécie, pertencentes ao banco de germoplasma da Embrapa Gado de Corte, usando marcadores RAPD (DNA Polimórfico Amplificado ao Acaso). Foram selecionados 40 primers randômicos, que produziram um total de 210 bandas; destas, 82 polimórficas (39,05%). Os dados obtidos foram utilizados para gerar uma matriz de similaridade genética usando o coeficiente de Jaccard. A similaridade genética variou de 0,747 a 0,945, o que indicou uma variabilidade genética pouco acentuada entre os acessos estudados. Os...

Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Pastagem; Melhoramento genético vegetal; Leguminosa forrageira; Stylosanthes guianensis; Marcador molecular; RAPD; Campo Grande; Mato Grosso do Sul; Brasil.

Ano: 2006

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326900

UnB - FAB

Fonseca, Kenia Gracielle da; Faleiro, Fábio Gelape; Peixoto, José Ricardo; Junqueira, Nilton Tadeu Vilela; Silva, Marília Santos; Bellon, Graciele; Junqueira, Keize Pereira; Vaz, Carolina de Faria.

O Brasil é o maior produtor mundial de maracujá, entretanto tem-se observado redução na produtividade do maracujazeiro nos últimos anos, devido, principalmente, a fatores fitossanitários. Na Embrapa Cerrados, a transferência de genes de resistência de espécies silvestres para as comerciais de maracujazeiro tem sido feita por meio de hibridações interespecíficas seguidas de um programa de retrocruzamentos auxiliados por marcadores moleculares. Este trabalho teve por objetivo verificar a recuperação do genoma recorrente nas plantas RC4 e RC5 [(Passiflora edulis x Passiflora setacea) x Passiflora edulis ] com base em marcadores RAPD. O estudo foi desenvolvido no Laboratório de Genética e Biologia Molecular da Embrapa Cerrados. Amostras de DNA de cada material...

Tipo: Article

Palavras-chave: Genética vegetal; Marcador molecular; Genoma vegetal; Passiflora edulis; Passiflora setacea; Maracujá.

Ano: 2009

URL: http://hdl.handle.net/10482/6771

Análise da variabilidade genética de variedades tradicionais de arroz (Oryza sativa L.) através de marcadores moleculares microssatélites.

BORBA, T. C. de O.; ZUCCHI, M. I.; BRONDANI, R. V.; RANGEL, P. H. N.; MAGALHÃES, M. R.; BRONDANI, C..

Este trabalho teve como objetivo avaliar a variabilidade genética através de marcadores moleculares SSR em uma amostra de variedades tradicionais oriundas de coletas, conduzidas entre os anos de 1978 e 1996, em lavouras de pequenos agricultores no Brasil.

Análise da variabilidade intra-espécie dos genes pld e rpoB de Corynebacterium pseudotuberculosis por meio de marcadores PCR-RFLP.

Palavras-chave: Coleção nuclear; Arroz; Oryza sativa; Recurso genético; Marcador molecular.

Ano: 2003

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/936126

Análise da variação genética entre progênies de Ilex paraguariensis St. Hil. utilizando marcadores RAPD.

ROSINHA, G. M. S.; ELISEI, C.; BASTOS, R.; FORNER, O.; SOARES, C. O.; ARAÚJO, F. R.; MADUREIRA, R. C.; MOTA, R. A.; ABREU, S. R. de O..

Corynebacterium pseudotuberculosis é o agente etiológico da linfadenite caseosa em ovinos e caprinos, uma doença infectocontagiosa crônica caracterizada por abscessos em linfonodos superficiais ou internos. Os animais acometidos podem apresentar lesões internas ou externas, o que representa perdas econômicas graves na caprinovinocultura, como o comprometimento da produção de lã em ovinos, deficiência reprodutiva, condenação da carne ou morte do animal. Uma vez estabelecida a infecção no rebanho, torna-se difícil sua erradicação. Com o objetivo de avaliar a variabilidade genética intra-espécie em C. pseudotuberculosis, 31 isolados provenientes de seis municípios do Estado de Pernambuco, sendo 23 de caprinos e oito de ovinos, tiveram os seus DNAs genômicos...

Tipo: Documentos (INFOTECA-E)

Palavras-chave: Sanidade animal; Imunologia; Caprino; Ovino; Linfadenite caseosa; Pseudotuberculose; Corynebacterium pseudotuberculosis; Marcador molecular; RFLP-PCR.

Ano: 2007

URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/326870

FRIEDRICH, J. C.; GONELA, A.; VIDIGAL, M. C. G.; VIDIGAL FILHO, P. S.; CARDOZO JUNIOR, E. L.; KVISTCHAL, M. V.; STURION, J. A..

2011