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| Registros recuperados: 37 | |
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| MENDES, L. W.; MENDES, R.; TSAI, S. M.. |
| The rhizosphere is the narrow zone of soil around the living plant roots that is influenced by the activity of the plants. Many beneficial microorganisms in the rhizosphere provide plants with mineral nutrients, phytohormones, and also help to protect the plant against soil-borne pathogens. Microbiological studies are addressed to understand how rhizosphere microorganisms are recruited from soil and either benefit or harm plant growth, nutrition and health. Here, we aimed to identify potential microbial groups and functional traits correlated to the suppression of the soil borne pathogen Fusarium oxysporum, the causal agent of Fusarium wilt on common beans. We used shotgun metagenomics to investigate the rhizosphere microbiome of two common bean cultivars... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Shotgun metagenomics; Soil born pathogen.; Feijão; Fusarium Oxysporum.; Microbiome.; Microbial ecology. |
| Ano: 2015 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1036665 |
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| PASSOS, S. R.; REIS JÚNIOR, F. B. dos; RUMJANEK, N. G.; MENDES, I. de C.; BAPTISTA, M. J.; XAVIER, G. R.. |
| O objetivo deste trabalho foi avaliar o efeito da solarização e da biofumigação sobre a comunidade microbiana do solo, por meio da atividade da enzima beta-glicosidase e do perfil do 16S rDNA, determinado com PCR-DGGE. A solarização do solo, com cobertura de plástico, foi feita por períodos de dois, quatro e seis meses, e a biofumigação foi realizada pela incorporação de 2 e 5% (v/v) de cama-de-frango ao solo. Logo após a retirada da cobertura de plástico e aos 30 dias após a remoção, a atividade da beta-glicosidase foi menor em relação ao tratamento não solarizado. Aos 60 dias, não foram mais observadas diferenças entre os tratamentos. A adição de cama-de-frango a 5% estimulou a atividade da beta-glicosidase. O perfil da estrutura da comunidade bacteriana... |
| Tipo: Separatas |
Palavras-chave: Solarização; Beta-glicosidase; Cama-de-frango; Diversidade microbiana; Ecologia microbiana; Solarization; Chicken litter; Microbial diversity.; Manejo do Solo.; Beta-glucosidase; Microbial ecology; Soil management.. |
| Ano: 2008 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/630059 |
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| CARAVIERI, F. A.; FERREIRA, A. J.; FERREIRA, A.; CLIVATI, D.; MIRANDA, V. F. O. de; ARAÚJO, W. L.. |
| The species of bacteria associated with the traps of the carnivorous plants Utricularia hydrocarpa Vahl and Genlisea filiformis A. St.-Hil. were identified by analysing 16S rRNA gene libraries. We observed larger bacterial diversity inside the traps of U. hydrocarpa than in G. filiformis. The Clostridium genus (Firmicutes) was the dominant group in G. filiformis, while Aeromonas (γ-Proteobacteria) and Acidobacterium (Acidobacteria) were the dominant genera in U. hydrocarpa. In general, the microbial community observed in these carnivorous plants was composed of Firmicutes (46.8%), Proteobacteria (33.9%), Acidobacteria (9.3%), Actinobacteria (4.4%), Bacteroidetes (0.8%), Chloroflexi (0.4%), Gemmatimonadetes (0.4%), Cyanobacteria (0.4%), Chlamydiae... |
| Tipo: -- |
Palavras-chave: Microbiologia; Microbial ecology. |
| Ano: 2014 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1003311 |
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| Chagas Junior, Aloisio Freitas; Universidade Federal do Tocantins; Oliveira, Luiz Antonio de; Intituto Nacional de Pesquisas da Amazônia; Oliveira, Arlem Nascimento de; Universidade Federal do Amazonas, Manaus; Willerding, André Luiz; Centro de Biotecnologia da Amazônia. |
| Em solos com baixa disponibilidade de fósforo, como os de terra firme da Amazônia, a habilidade de estirpes de rizóbio de solubilizar compostos de fosfato inorgânico é extremamente importante. Assim, o objetivo deste trabalho foi determinar a capacidade de solubilização de fosfato de cálcio (P-Ca) e fosfato de alumínio (P-Al) de isolados de rizóbio de solos na Amazônia em laboratório e a eficiência simbiótica dos isolados em aumentar os conteúdos de N e P em caupi. Os isolados de rizóbio foram avaliados em meios específicos para solubilização desses fosfatos por um período de 15 dias, obtendo-se os seus índices de solubilização (I.S.). Dos 205 isolados avaliados, 68 solubilizaram P-Ca, 47 solubilizaram P-Al e 32 solubilizaram tanto P–Ca quanto P–Al. Entre... |
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Palavras-chave: 5.01.02.04-4 Fósforo; Amazônia; Ecologia microbiana Microbiologia e bioquímica do solo Phosphorus; Amazon; Microbial ecology. |
| Ano: 2010 |
URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/3185 |
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| Reij,Martine W.; van Schothorst,Michiel. |
| Although numerous papers on Microbiological Risk Assessment (MRA) of food products have been published, a number of issues related to it remain unresolved. This paper explains the role of Microbiological Risk Assessment in the context of Risk Analysis as outlined by Codex Alimentarius. It reviews some representative work in the area, with particular emphasis on the objectives, outputs and conclusions of the studies, and on how researchers propose using the resulting Risk Estimate for decision making. Several problems and sources of confusion concerning MRA are identified, such as terminology, the application of Risk Estimates to establish Food Safety Objectives and microbiological criteria for foods, lack of data, and the difference between Risk Assessment... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Risk assessment; Food microbiology; Microbial ecology; Codex Alimentarius. |
| Ano: 2000 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822000000100002 |
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| Lima,Felipe Rezende; Ferreira,Almir José; Menezes,Cristine Gobbo; Miranda,Vitor Fernandes Oliveira; Dourado,Manuella Nóbrega; Araújo,Welington Luiz. |
| ABSTRACT Carnivorous plant species, such as Utricularia spp., capture and digest prey. This digestion can occur through the secretion of plant digestive enzymes and/or by bacterial digestive enzymes. To comprehend the physiological mechanisms of carnivorous plants, it is essential to understand the microbial diversity related to these plants. Therefore, in the present study, we isolated and classified bacteria from different organs of Utricularia breviscapa (stolons and utricles) and from different geographic locations (São Paulo and Mato Grosso). We were able to build the first bacterium collection for U. breviscapa and study the diversity of cultivable bacteria. The results show that U. breviscapa bacterial diversity varied according to the geographic... |
| Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Utricularia breviscapa; Microbial ecology; Aquatic microbiota; Microbial communities. |
| Ano: 2018 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1517-83822018000400714 |
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| Richert, Laurent; Golubic, Stjepko; Le Guedes, Roland; Herve, Annie; Payr, Claude. |
| Cyanobacterial populations, the primary producers and builders of 'kopara' microbial mats were studied in four selected ponds along the rim of the Rangiroa Atoll, French Polynesia using a polyphasic approach. Seven isolates were maintained in uni-cyanobacterial cultures, characterized morphotypically and phylogenetically by evaluating sequences of the 16S rRNA gene of about 620 base pairs in length. Cyanobacteria in natural populations were analyzed microscopically, characterized morphotypically, and compared with cultured strains. Three of the isolates were identified in the field samples: Lyngbya aestuarii, Johannesbaptistia pellucida and Chroococcus submarinus were present in the mats only as minor components, whereas the species of Schizothrix that... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: 16S rRNA; Polyphasic approach; Phylogeny; Microbial mats; Microbial ecology; Kopara; Diversity; Cyanobacteria; Culture. |
| Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-2050.PDF |
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| Romero Yam, Lourdes Alejandra. |
| Se estudió la dinámica microbiana y el contenido de nitrógeno mineral y total durante el proceso de compostaje de cachaza reactivada con gallinaza. Se evaluaron cuatro tratamientos con diferentes proporciones de cachaza y gallinaza (10:0, 9:1, 7:3 y 5:5), en contenedores de 68 L durante 87 días. Las variables evaluadas fueron: temperatura, poblaciones de bacterias, hongos, microorganismos ligninolíticos, evolución de CO2, nitrógeno total, amonio y nitratos. La adición de gallinaza a la cachaza almacenada, incrementó las poblaciones de bacterias, hongos y microorganismos ligninolíticos, estos grupos microbianos mostraron poblaciones de 9.9, 5.5 y 6.4 unidades logarítmicas (ULog), respectivamente. El tratamiento 5:5 presentó una disminución en NH+4 –N (de... |
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Palavras-chave: Ecología microbiana; Lignocelulosa; Biotransformación de cachaza; Compost; Microbial ecology; Lignocellulose; Biotransformation of filter cake; Compost; Maestría; Edafología. |
| Ano: 2013 |
URL: http://hdl.handle.net/10521/2093 |
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| LAMMEL, D. R.; BARTH, G.; OVASKAINEN, O.; CRUZ, L. M.; ZANATTA, J. A.; RYO, M.; SOUZA, E. M. de; PEDROSA, F. O.. |
| Background: pH is frequently reported as the main driver for prokaryotic community structure in soils. However, pH changes are also linked to ?spillover effects? on other chemical parameters (e.g., availability of Al, Fe, Mn, Zn, and Cu) and plant growth, but these indirect effects on the microbial communities are rarely investigated. Usually, pH also co-varies with some confounding factors, such as land use, soil management (e.g., tillage and chemical inputs), plant cover, and/or edapho-climatic conditions. So, a more comprehensive analysis of the direct and indirect effects of pH brings a better understanding of the mechanisms driving prokaryotic (archaeal and bacterial) community structures. Results: We evaluated an agricultural soil pH gradient (from 4... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Sub-tropical soil; 16S rRNA; Illumina sequencing; Ecologia microbiana; Solo sub tropical; Ph; Bactéria; Química do Solo; Microbial ecology; Soil chemistry; Archaea. |
| Ano: 2018 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1099575 |
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| Kivela, Mikko; Arnaud-haond, Sophie; Saramaki, Jari. |
| The recent application of graph-based network theory analysis to biogeography, community ecology and population genetics has created a need for user-friendly software, which would allow a wider accessibility to and adaptation of these methods. EDENetworks aims to fill this void by providing an easy-to-use interface for the whole analysis pipeline of ecological and evolutionary networks starting from matrices of species distributions, genotypes, bacterial OTUs or populations characterized genetically. The user can choose between several different ecological distance metrics, such as Bray-Curtis or Sorensen distance, or population genetic metrics such as FST or Goldstein distances, to turn the raw data into a distance/dissimilarity matrix. This matrix is... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Biogeography; Biological communities; Graph theory; Microbial ecology; Network analysis; Population genetics. |
| Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30853/29217.pdf |
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| NISHI, C. Y. M.; HUNGRIA, M.. |
| Foram conduzidos tres experimentos em um Latossolo Roxo, no Estado do Parana, com populacao de Bradyrhizobium estabelecida (2,21x105 celulas/g de solo, para verificar os efeitos da reinoculacao na soja [Glycine max (L.) Merrill] na fixacao biologica do N2 e na produtividade. Todas as seis estirpes testadas, duas da especie B. japonicum e quatro da especie B. elkanii, foram capazes de se estabelecer na rizosfera, aumentando a porcentagem de ocupacao dos nodulos. Na safra de 92/93 foram obtidos, pela inoculacao, incrementos na produtividade da soja de ate 420 kg/ha, com 13,5% mais de N total nos graos, em relacao ao controle sem inoculacao e com fertilizacao nitrogenada. Quando o trigo (Triticum aestivum L.) foi plantado como cultura de inverno, nas mesmas... |
| Tipo: Artigo de periódico |
Palavras-chave: Ecologia microbiana; Fixacao biologica do N2; Metabolismo do N; Brasil; Parana; Soybean; Nitrogen fertilization; Biological fixation N2.; Fertilizante Nitrogenado; Glycine Max; Nodulação; Triticum Aestivum; Trigo; Soja.; Bradyrhizobium; Brazil; Nodulation; Nitrogen metabolism; Microbial ecology; Wheat.. |
| Ano: 1996 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/444790 |
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| VASCONCELOS, E. A. F. de. |
| Técnicas de biologia molecular aplicadas em digestão anaeróbia permitem estudar a ecologia microbiana e estrutura de comunidades em biorreatores. O glicerol é um subproduto da transesterificação e pode ser usado para produzir hidrogênio por digestão anaeróbia, portanto, conhecer as interações microbianas permite compreender a relação entre os fatores biológicos, operacionais e funcionais, aperfeiçoando os processos envolvidos e o desempenho do sistema. Esta pesquisa teve como objetivo estudar as variações de diversidade, riqueza e organização funcional da comunidade microbiana, relacionando os parâmetros ecológicos, operacionais, a funcionalidade e a produtividade de reatores anaeróbios. Reatores UASB hidrogênicos foram operados e monitorados, sob aumentos... |
| Tipo: Teses |
Palavras-chave: PCR DGGE; Digestão Anaeróbia; Hidrogênio; Microbial ecology; Bioreactors; Hydrogen. |
| Ano: 2017 |
URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1101766 |
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| Brandt, Miriam; Pradillon, Florence; Trouche, Blandine; Henry, Nicolas; Liautard-haag, Cathy; Cambon-bonavita, Marie-anne; Cueff-gauchard, Valerie; Wincker, Patrick; Belser, Caroline; Poulain, Julie; Arnaud-haond, Sophie; Zeppilli, Daniela. |
| Despite representing one of the largest biomes on earth, biodiversity of the deep seafloor is still poorly known. Environmental DNA metabarcoding offers prospects for fast inventories and surveys, yet requires standardized sampling approaches and careful choice of environmental substrate. Here, we aimed to optimize the genetic assessment of prokaryote (16S), protistan (18S V4), and metazoan (18S V1–V2, COI) communities, by evaluating sampling strategies for sediment and aboveground water, deployed simultaneously at one deep-sea site. For sediment, while size-class sorting through sieving had no significant effect on total detected alpha diversity and resolved similar taxonomic compositions at the phylum level for all markers studied, it effectively... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Biodiversity; Ecological genetics; Microbial ecology; Molecular ecology. |
| Ano: 2021 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00689/80094/83149.pdf |
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