SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

PAIVA, S. R.; PAIVA, D. A. de F.; SILVÉRIO, V. C.; McMANUS, C.; OLIVEIRA, A. A.; DERGAM, J. A.; GUIMARÃES, S. E. F.; PEREIRA, M. S.; EGITO, A. A. do; AZEVEDO, H. C. A.; LOBO, R. N. B.; ALBUQUERQUE, M. S. M.; CASTRO, S. R.; MARIANTE, A. da S..

0 objetivo deste trabalho foi caracterizar a distribuiçao da variabilidade genetica dentro de um Nucleo de Conservaçao da raça Santa Ines a partir do usa de marcadores moleculares. Foram utilizados 17 locos em 191 individuos do rebanho de Santa Ines da Embrapa Tabuleiros Costeiros, Sergipe. Os resultados obtidos mostraram que existe variabilidade genetica significativa existente dentro do nucleo com valores de Heterezigosidade media observada de 0,702 e de conteudo de informaçao polimorfica (PIC) de 0,704. Outras analises intrapopulacionais mostraram que 29% dos locos analisados nao estao em Equilfbrio de Hardy-Weinberg (p<0,01) e apresentaram excesso de homozigotos (p<0,05). A partir do fndice de proporçao de alelos compartilhados entre todos os...

Aspectos bioecológicos e genético-comportamentais envolvidos na conservação da abelha Jandaíra, Melipona subnitida Ducke (Apidae, Meliponini), e o uso de ferramentas moleculares nos estudos de diversidade.

Palavras-chave: Ovino; Melhoramento genético animal; Biologia molecular; Marcador molecular; Variabilidade genética; Microssatélite; Conservação.

Ano: 2005

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/531812

SILVA, G. R. da; PEREIRA, F. de M.; SOUZA, B. de A.; LOPES, M. T. do R.; CAMPELO, J. E. G.; DINIZ, F. M..

A abelha sem ferrão Melipona subnitida atualmente está presente em quase toda a região nordeste, em função da boa adaptabilidade ao semiárido nordestino e do potencial econômico-ecológico proporcionado pela produção de mel e pela polinização de cultivos em condições de confinamento. Apesar disso, é uma espécie ameaçada devido a processos de degradação ambiental, dentre os quais estão o desmatamento, o uso indiscriminado de agrotóxicos e o extrativismo. Tais interferências tendem a isolar as populações de Jandaíra, provocando uma queda na variabilidade genética e, consequentemente, uma redução na capacidade adaptativa da espécie. Porém, técnicas de biologia molecular estão sendo implementadas, possibilitando que populações desse tipo sejam avaliadas quanto...

Caracterização da raça Nelore com base com seis marcadores moleculares.

Palavras-chave: Abelha nativa; Microssatélite; Transferibilidade; Diversidade genética; Conservação; Native bees; Microsatellites; Transferability; Genetic diversity; Conservation.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017704

TAMBASCO, D. D.; ALENCAR, M. M. de; COUTINHO, L. L.; TAMBASCO, A. J.; TAMBASCO, M. D.; REGITANO, L. C. de A..

1999

Caracterização de genótipos de tomateiro resistentes a begomovírus por marcador molecular co-dominante ligado ao gene Ty-1.

Palavras-chave: Bovino; DNA; Marcador; Microssatélite; Nelore; RFLP.

Ano: 1999

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/44823

NIZIO, D. A. de C.; MALUF, W. R.; FIGUEIRA, A. dos R.; NOGUEIRA, D. W.; SILVA, V. de F.; GONÇALVES NETO, A. C..

O objetivo deste trabalho foi avaliar genótipos de tomateiro, quanto Ó resistência a begomovírus, e caracterizar, por meio do marcador molecular SSR-47, híbridos de tomate de mesa portadores do alelo de resistência ao begomovírus Ty-1, com potencial comercial. Os 24 híbridos experimentais, heterozigotos no loco Ty-1, depois de infectados via enxertia, apresentaram sintomas intermediários, em comparação aos identificados pelas linhagens homozigotas Ty-1/Ty-1 e pelos genótipos suscetíveis Ty-1+/Ty-1+, o que indica a dominância incompleta do alelo Ty-1. Esses híbridos foram considerados como parcialmente tolerantes a begomovírus. Os híbridos experimentais TEX-246, TEX-261, TEX-253, TEX-256, TEX-262, TEX-252, TEX-251 e TEX-268 aliaram médias elevadas de...

Caracterização de genótipos de tomateiro resistentes a begomovírus por marcador molecular co-dominante ligado ao gene Ty-1

Palavras-chave: Lycopersicon esculentum; Geminivírus; Microssatélite; Resistência.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/125699

PAB

Nizio,Daniela Aparecida de Castro; Maluf,Wilson Roberto; Figueira,Antônia dos Reis; Nogueira,Douglas Willian; Silva,Vanisse de Fátima; Gonçalves Neto,Álvaro Carlos.

O objetivo deste trabalho foi avaliar genótipos de tomateiro, quanto à resistência a begomovírus, e caracterizar, por meio do marcador molecular SSR-47, híbridos de tomate de mesa portadores do alelo de resistência ao begomovírus Ty-1, com potencial comercial. Os 24 híbridos experimentais, heterozigotos no loco Ty-1, depois de infectados via enxertia, apresentaram sintomas intermediários, em comparação aos identificados pelas linhagens homozigotas Ty-1/Ty-1 e pelos genótipos suscetíveis Ty-1+/Ty-1+, o que indica a dominância incompleta do alelo Ty-1. Esses híbridos foram considerados como parcialmente tolerantes a begomovírus. Os híbridos experimentais TEX-246, TEX-261, TEX-253, TEX-256, TEX-262, TEX-252, TEX-251 e TEX-268 aliaram médias elevadas de...

Caracterização e otimização de Primers SSR para B.brizantha, B.humidicola e B.decumbens.

Palavras-chave: Geminivírus; Microssatélite; Resistência.

Ano: 2008

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2008001200009

Caracterização genética de caprinos Moxotó e Canindé por meio de microssatélites de DNA.

CARVALHO, N.; LEITE, P. H. dos S.; CANELA, F. M.; DUSI, D. M. de A.; TOGAWA, R. C.; AMARAL, Z. P. de S.; CHIARI, L.; CARNEIRO, V. T. de C.; BUSO, G. S. C..

2016

Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Microssatélite; Brachiaria; Polimorfismo.

Ano: 2016

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1067941

ARAUJO, A. M. de; SILVA, F. L. R. da; VILLELA, L. C. V.; LIMA, S. E. F.; BRITO, D. FURTADO, K.; COSTA, M. S.; MORAES, J. de B.; CUNHA, R. M. S. da..

O Nordeste do Brasil possui o maior plantel caprino do País, quase sempre associado à agricultura familiar e a sistemas de produção pouco tecnificados. O ambiente natural onde o caprino do nordeste está inserido é o semi-árido, áreas geralmente impróprias para a produção pecuária intensiva. Este trabalho teve o objetivo de caracterizar as raças caprinas naturalizadas Moxotó e Canindé por meio de marcadores de microssatélite. Os animais avaliados pertencem ao Núcleo de Conservação da Embrapa Caprinos. O DNA extraído foi amplificado mediante a reação em cadeia polimerase (PCR), em multiplex e genotipados através do programa Fragment Profile (Amersham Biosciences). A heterosigozidade esperada sob equilíbrio de Hardy-Weinberg (HE) foi calculada através do...

Caracterização genética de seis plantéis comerciais de tilápia (Oreochromis) utilizando marcadores microssatélites

Palavras-chave: Caprino; Raça Moxotó; Canindé; Genética animal; Caracterização genética; Microssatélite; DNA; Polimorfismo; Heterozigosidade; Conservação animal.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/534372

Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.

Melo,D.C.; Oliveira,D.A.A.; Ribeiro,L.P.; Teixeira,C.S.; Sousa,A.B.; Coelho,E.G.A.; Crepaldi,D.V.; Teixeira,E.A..

Foram caracterizados geneticamente, utilizando-se cinco locos de microssatélites, 235 indivíduos de seis plantéis de tilápia (Ceará, Chitralada, Israel, Nilótica, Taiwan e Vermelha) da região Sudeste do Brasil. Verificou-se diferença genética entre os seis plantéis, obtida pelo cálculo do índice de fixação de alelos (Fst=0,3263). De modo geral, está ocorrendo perda de heterozigose nos plantéis, segundo mostrou a estimativa do coeficiente de endogamia intrapopulacional (Fis=0,0486). Os plantéis Israel e Nilótica foram os mais semelhantes geneticamente (Ig=0,6663). Os plantéis Chitralada e Taiwan foram os que menos apresentaram genes em comum (Ig=0,2463). O plantel denominado Vermelha foi o mais distinto entre todos.

Caracterização molecular de animais da raça Nelore utilizando microssatélites e genes candidatos.

Palavras-chave: Tilápia; Microssatélite; Distância genética.

Ano: 2006

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352006000100013

TAMBASCO, D. D.; ALENCAR, M. M. de; COUTINHO, L. L.; TAMBASCO, M. D.; REGITANO, L. C. de A..

No presente trabalho 180 fêmeas da raça Nelore provenientes de oito rebanhos, foram analisadas quanto aos marcadores microssatélites TEXAN15BM1224 e CSFM50 e aos polimorfismo de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) nos locosk-caseína B-lactoglobulina e hormônio de crescimento (GH). Com exceção de GH, todos os marcadores foram polimórficos na amostra estudada. Os valores de heterizigosidade, diversidade gênica conteúdo de informação polimórfica (PIC) e probabilidade de exclusão de partenidade (PE) foram estimados. Os maiores valores de PIC (0.685) e PE (0.521) foram para o marcador BM1224.

Caracterização molecular de animais da raça Nelore utilizando microssatélites e genes candidatos

Palavras-chave: Bovino; DNA; Marcadores genéticos; Microssatélite; Nelore; RFLP; Gado Nelore; Bovine; Molecular markers; Nellore.

Ano: 2000

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/45285

R. Bras. Zootec.

Tambasco,Daniella Debenedetti; Alencar,Maurício Mello de; Coutinho,Luiz Lehmann; Tambasco,Antonio Junqueira; Tambasco,Marina Debenedetti; Regitano,Luciana Correia de Almeida.

No presente trabalho, 180 fêmeas da raça Nelore, provenientes de oito rebanhos, foram analisadas quanto aos marcadores microssatélites TEXAN15, BM1224 e CSFM50 e aos polimorfismos de comprimento de fragmentos de restrição (RFLP) nos locos k-caseína, beta-lactoglobulina e hormônio de crescimento (GH). Com exceção de GH, todos os marcadores foram polimórficos na amostra estudada. Os valores de heterozigosidade, diversidade gênica, conteúdo de informação polimórfica (PIC) e probabilidade de exclusão de paternidade (PE) foram estimados. Os maiores valores de PIC (0,685) e PE (0,521) foram obtidos para o marcador BM1224.

Caracterização molecular de linhagens de pimenta do tipo Jalapeño amarelo

Palavras-chave: Bovino; DNA; Marcador; Microssatélite; Nelore; RFLP.

Ano: 2000

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000400014

Horticultura Brasileira

Ulhoa,Arlysson B; Pereira,Telma N; Silva,Raimundo N; Ragassi,Carlos F; Rodrigues,Rosana; Pereira,Messias G; Reifschneider,Francisco JB.

A variabilidade genética no gênero Capsicumé ampla, tanto nas características quantitativas como nas qualitativas. O mercado de pimentas tem expressiva importância socioeconômica devido ao grande número de agricultores familiares que as cultivam. A pimenta do tipo Jalapeño tem tido uma crescente demanda nos últimos anos pela grande quantidade de polpa que essa pimenta pode produzir, característica importante para a produção de molhos de pimenta. Vinte e quatro linhagens S4de pimenta Jalapeño amarelo do programa de melhoramento da Embrapa Hortaliças, e duas testemunhas oriundas do Banco de Germoplasma da Universidade Estadual Norte Fluminense Darcy Ribeiro (UENF) foram submetidas à análise molecular com marcadores SSR com o objetivo de estudar a...

Caracterização molecular dos acessos de feijoeiro comum que compõem os ensaios de Valor de Cultivo e Uso (VCU) dos anos de 2009/2010.

Palavras-chave: Capsicum annuumvar. annuum; Extração de DNA; Microssatélite.

Ano: 2014

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362014000100035

Caracterização molecular e análise de transferibilidade de marcadores microssatélites em leguminosas.

VEIGA, M. M. A.; VALDISSER, P. A. M. R.; BRONDANI, R. P. V.; CIESLAK, J. F.; PEREIRA, H. S.; MELO, L. C.; BORBA, T. C. O..

O objetivo foi o de caracterizar a variabilidade genética de linhagens de feijoeiro comum que compõem experimentos de VCU conduzidos nos anos de 2009/2010.

Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Diversidade genética; Microssatélite; Feijão; Phaseolus vulgaris; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/866743

GARCIA, R. A. V.; BRONDANI, C.; SILVA, H. T.; BRONDANI, R. P. V..

Os objetivos deste estudo foram avaliar um conjunto de SSRs desenvolvidos a partir do genoma do feijoeiro comum quanto ao conteúdo de informatividade gênica e a capacidade de transferibilidade para espécies de leguminosas, incluindo organismos-modelo e espécies de interesse comercial.

Construção de mapa de ligação para o cruzamento interespecífico Oryza glumaepatula (GEN 1233) x Oryza sativa (cv. Curinga) com base em marcadores microssatélites e in-del.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Conpeex; Genoma; Marcador molecular; Microssatélite.

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/216026

RANGEL, P. N.; BRONDANI, R. P. V.; RANGEL, P. H. N.; BRONDANI, C..

O objetivo deste trabalho foi construir um mapa genético para uma população segregante RC1F1 proveniente do cruzamento interespecífico entre um acesso da espécie silvestre brasileira Oryza glumaepatula (GEN1233) e a cultivar Curinga (Oryza sativa) usando marcadores moleculares microssatélites e marcadores baseados em polimorfismo de in-del. Este mapa será usado para mapeamento de QTLs relacionados a tolerância à seca na população RC2F2 proveniente deste cruzamento interespecífico.

Construção de mapa genético de Eucalyptus utilizando microssatélites.

Palavras-chave: Arroz; Oryza sativa; Rice; Conpeex; Mapa genético; Construção; Marcador molecular; Microssatélite.

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/216025

CHEDIAK, G. L. de C.; COELHO, A. S. G.; BRONDANI, R. P. V..

O objetivo principal deste trabalho é a construção de mapas genéticos baseados em locos microssatélites e identificação de regiões genômicas associadas a características físico-químicas da madeira utilizando um cruzamento entre a espécies E. grandis e um híbrido E. Urophylla x E. Globulus.

Desenvolvimento de um sistema de genotipagem molecular para determinação da identidade genética de cultivares de feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris).

Palavras-chave: Eucalipto; Melhoramento genético vegetal; Marcador molecular; Microssatélite; Conpeex.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/217546

CARDOSO, P. C. B.; GARCIA, R. A. V.; FARIA, L. C. de; DEL PELOSO, M. J.; BRONDANI, C.; BRONDANI, R. P. V..

O objetivo desse trabalho foi desenvolver um sistema de genotipagem multiloco semi-automatizado baseado em marcadores microssatélites e determinar a identidade genética de um grupo de cultivares de feijoeiro comum.

Development of herbicide-tolerant irrigated rice cultivars.

Palavras-chave: Feijão; Phaseolus vulgaris; Microssatélite; Rastreabilidade; Variedade; Conpeex.

Ano: 2007

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/216031

RANGEL, P. H. N.; MOURA NETO, F. P.; FAGUNDES, P. R. R.; MAGALHAES JÚNIOR, A. M. de; MORAIS, O. P. de; SCHMIDT, A. B.; MENDONÇA, J. A.; SANTIAGO, C. M.; RANGEL, P. N.; CUTRIM, V. dos A.; FERREIRA, M. E..

The objective of this work was to develop new irrigated rice lines tolerant to imidazolinone herbicides. The backcross breeding procedure was used to transfer the imidazolinone tolerance allele from mutant 93AS3510 to the recurrent parents 'BRS 7 Taim' and 'BRS Pelota'. Individual herbicide-tolerant plants were selected in each generation, for three backcrossings (RC1 to RC3), followed by three selfing generations (RC3F1 to RC3F3). The best four RC3F3 lines for agronomic traits were genotyped with 44 microsatellite markers. The observed conversion index of the new imidazolinone-tolerant lines varied from 91.86 to 97.67%. Pairwise genetic distance analysis between these lines and 22 accessions from the Embrapa?s Rice Germplasm Bank clustered the new lines...

Development of microsatellite markers for Hoplias malabaricus (Erythrinidae).

Palavras-chave: Arroz Clearfield; Microssatélite; Arroz; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Retrocruzamento; Arroz vermelho; Rice; Red rice; Microsatellite repeats.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/861297

GONDIM, S. G. C. A.; RESENDE, L. V.; BRONDANI, R. P. V.; COLLEVATTI, R. G.; SILVA-JÚNIOR, N. J.; PEREIRA, R. R.; TELLES, M. P. C..

We identified 14 microsatellite loci for the wolf fish, Hoplias malabaricus (Erythrinidae), from a genomic shotgun library. Twenty-five primers were designed, and 48 individuals of H. malabaricus from four localities of northwest Goiás, in central Brazil, were genotyped to characterize the polymorphism at each locus. Fourteen primers amplified clearly interpretable products using a single PCR protocol; six loci were polymorphic, but with a low number of alleles per locus (2 or 3). Expected heterozygosities for polymorphic loci ranged from 0.136 to 0.505. Combined paternity exclusion probability (0.638) was low and combined genetic identity (0.056) was high in studies of parentage. The low polymorphism may be due to the small microsatellite size and the...

Development of novel simple sequence repeat markers from a genomic sequence survey database and their application for diversity assessment in Jatropha curcas germplasm from Guatemala.

Palavras-chave: Microssatélite; Cerrado; Traira; Hoplias malabaricus; Marcador molecular.

Ano: 2010

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/862333

RAPOSO, R. S.; SOUZA, I. G. B.; VELOSO, M. E. da C.; KOBAYASHI, A. K.; LAVIOLA, B. G.; DINIZ, F. M..

The last few years have seen a significant increase in the number of large-scale sequencing projects generating whole genome databases. These sequence databases can be surveyed (genome sequence survey) for tandem repeats as an alternative means to develop microsatellites for monitoring and selecting natural populations and cultivars of Jatropha curcas. A total of 100 tandem repeats were revealed from mining 368 genomic surveyed sequences available in the Kazusa DNA Research Institute database. Twenty microsatellite sequences were successfully amplified, resulting in repeatable and scorable polymerase chain reaction products. Genotyping of J. curcas accessions from the Guatemalan population revealed 18 polymorphic loci. The average number of alleles per...

Palavras-chave: Microssatélite; Cultura energética; Planta oleaginosa; Pinhão de purga; Biocombustível; Microsatellites; Energy crop; Physic nut; Biofuel; Genetic diversity; Euphorbiaceae.

Ano: 2014

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1017730