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ESTIMATIVAS DE PARÂMETROS GENÉTICOS E PREDIÇÃO DE VALORES GENOTÍPICOS NO MELHORAMENTO DO CAFEEIRO PELO PROCEDIMENTO REML/BLUP Bragantia
RESENDE,MARCOS DEON VILELA DE; FURLANI-JÚNIOR,ENES; MORAES,MÁRIO LUÍZ TEIXEIRA DE; FAZUOLI,LUIZ CARLOS.
Objetivou-se aplicar o método REML/BLUP em programas de melhoramento genético do cafeeiro, utilizando-o na estimação de parâmetros genéticos e predição de valores genotípicos para a espécie Coffea arabica. O experimento foi instalado em julho de 1998 pela Universidade Estadual Paulista (UNESP), em Selvíria (MS). As 12 cultivares selecionadas pelo Instituto Agronômico (IAC), Campinas (SP), foram avaliadas no delineamento em blocos ao acaso com quatro repetições e dez plantas por parcela. Os resultados revelaram baixa variabilidade genética entre as cultivares para os caracteres altura da planta, diâmetro do caule e número de ramos plagiotrópicos, avaliados aos 26 meses. Apenas as cultivares Catuaí Amarelo, Icatu Vermelho e Catuaí Vermelho apresentaram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Melhoramento de Coffea arabica; Modelos lineares mistos; Componentes de variância; Melhoramento de plantas perenes; Predição de variáveis aleatórias; Seleção.
Ano: 2001 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052001000300005
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Implementação de 4 métodos de análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
No contexto de estudos de associação genômica ampla (GWAS), métodos para a análise de enriquecimento de um conjunto de genes (GSEA) analisam conjuntos de SNPs associados a genes que compartilham mesma função biológica, localização cromossômica ou via regulatória e buscam identificar SNPs que estão relacionados com variações no fenótipo em estudo. Neste trabalho foram implementados quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura (fenótipos quantitativos)
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Estudos de associação genômica ampla; Polimorfismo de nucleotídeo único; Modelos lineares mistos; Random forests; Mixed models; Single nucleotide polymorphism; Models.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1031168
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Implementação de algoritmo para avaliação genética de grandes populações de animais de interesse agropecuário. Repositório Alice
BARBOZA, D. H.; CUNHA, C. A. V.; HIGA, R. H..
Apresentamos uma versão inicial da solução em desenvolvimento para estimação dos efeitos desejados através do modelo animal univariado, utilizando duas abordagens distintas para a obtenção do melhor estimador linear não viesado (BLUP) dos parâmetros do modelo.
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Sistemas de equações lineares; Modelo animal; Modelos lineares mistos; Melhoramento animal; Python; System of linear equations; Animal model; Linear mixed models; Models; Animal breeding.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1055870
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Melhor predição linear não viciada (Blup) de valores genéticos no melhoramento de Pinus. Repositório Alice
RESENDE, M. D. V de; PRATES, D. F.; JESUS, A. de; YAMADA, C. K..
O presente trabalho comparou cinco procedimentos de estimação/predição de valores genéticos no melhoramento de Pinus. Em situações de dados balanceados e homogeneidade de variâncias genética e ambiental, os métodos de quadrados mínimos ordinários (OLS), quadrados mínimos generalizados (GLS), melhor predição (BP), melhor predição linear (BLP) e melhor predição linear não viciada (BLUP) se eqüivalem para efeitos de ordenamento de materiais genéticos (mas não para estimação/predição de valores genéticos e ganhos genéticos). Em qualquer situação, o método BLUP é igual ou superior aos demais. Em geral, são melhores os seguintes métodos, em ordem decrescente: BLUP, BLP, BP, GLS e OLS.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Predicao de variaveis aleatorias; Quadrados minimos generalizados; Quadrados minimos ordinarios; Modelos lineares mistos; Prediction of random variables; Generalized least square; Ordinary least square; Mixed linear models.
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/282155
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Prediction methods and heterogeneity effects of residual variances within genetic treatments in clone tests PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Martinez, Diego Tyszka; Resende, Marcos Deon Vilela de; Higa, Antonio Rioyei; Costa, Reginaldo Brito da.
The aim of this study was to compare, through simulation, the BLUP and BLUP-HET procedures for breeding values prediction under heterogeneity of residual variances. Random data were generated with spread sheet, considering a variance of 0,10 and variable residual variance, by number of clones, in order toprovide heterogeneity of variances. Actual and residual breeding values obtained were added to the mean 10, in order to obtain positive phenotypic values. Experimental design was random blocks with 100 genotypes, one plant per plot and 2, 5, 10 and 20 repetitions. Data were evaluated using Selegen software, obtaining estimated breeding values through BLUP and BLUP-HET procedures which were compared to actualbreeding values. In this study, using two and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelos lineares mistos; Parâmetros genéticos; Ganho com seleção Mixed linear models; Genetic parameters; Selection gain.
Ano: 2011 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/249
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Reflexo da interação genótipo x ambiente sobre o melhoramento genético de feijão Ciência Rural
Pereira,Thayse Cristine Vieira; Schmit,Rodolfo; Haveroth,Eduardo José; Melo,Rita Carolina de; Coimbra,Jefferson Luís Meirelles; Guidolin,Altamir Frederico; Backes,Rogério Luiz.
RESUMO: O objetivo foi avaliar os componentes da variância fenotípica e estimar a influência da interação genótipo*ambiente no rendimento de grãos em feijão. Os componentes da variância fenotípica foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita e do melhor preditor linear não viesado (REML/BLUP), juntamente com o espaço de inferência específico. As avaliações foram realizadas nas safras agrícolas de 2006/07 a 2011/12 no município de Lages/SC. Durante o período, 104 genótipos foram avaliados. Os dados são desbalanceados, sendo que 13 genótipos permaneceram nos ensaios em todos os anos. Observando os resultados, foi possível visualizar que a grande variação (59,0%) no comportamento dos genótipos ao longo dos anos é atribuída principalmente à...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Efeito do ambiente; Melhoramento vegetal; Modelos lineares mistos; Phaseolus vulgaris L.; REML/BLUP.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782016000300411
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Seleção genética simultânea de progênies de guaranazeiro para produção, adaptabilidade e estabilidade temporal. Repositório Alice
ATROCH, A. L.; NASCIMENTO FILHO, F. J. do; RESENDE, M. D. V. de.
A seleção simultânea para produtividade, adaptabilidade e estabilidade pode ser realizada por meio da média harmônica do desempenho relativo dos valores genéticos (MHPRVG) preditos. O objetivo deste trabalho foi selecionar progênies de meios irmãos de guaranazeiro quanto a esses três atributos, visando ao desenvolvimento de uma cultivar. Foram avaliadas 36 progênies de meios irmãos de guaranazeiro, em delineamento experimental de blocos ao acaso com duas repetições e seis plantas por parcela, dispostas em duas fileiras de três plantas, no espaçamento de 5 × 5 m.
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Guaraná; Melhoramento genético; Ganho de seleção; Valores genéticos; Modelos lineares mistos; Paullinia cupana; Plant breeding; Genetic gain; Genetic values; Linear mixed models.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/973219
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