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Adaptabilidade e estabilidade da produção de borracha e seleção em progênies de seringueira. Repositório Alice
VERARDI, C. K.; RESENDE, M. D. V. de; COSTA, R. B. da; GONÇALVES, P. de S..
Resumo ? Os objetivos deste trabalho foram determinar a interação genótipo x ambiente e a estabilidade e adaptabilidade da produção de borracha em progênies de seringueira (Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Müll. Arg.), bem como estimar o ganho genético com a seleção dos materiais mais produtivos. Foram utilizadas três populações de progênies de meios-irmãos de seringueira, cultivadas em três municípios do Estado de São Paulo. Os experimentos foram instalados em delineamento de blocos ao acaso com 22 progênies, 6 repetições e 10 plantas por parcela, com espaçamento de 1,5x1,5 m. Aos três anos de idade, as progênies foram avaliadas quanto à produção de borracha seca utilizando-se o teste precoce de produção Hamaker Morris-Mann. As análises de...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Blup; Interação genótipo x ambiente; Modelos mistos; Reml; Hevea brasiliensis; Seleção genética.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/661069
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Adaptabilidade e estabilidade da produção de borracha e seleção em progênies de seringueira PAB
Verardi,Cecília Khusala; Resende,Marcos Deon Vilela de; Costa,Reginaldo Brito da; Gonçalves,Paulo de Souza.
Os objetivos deste trabalho foram determinar a interação genótipo x ambiente e a estabilidade e adaptabilidade da produção de borracha em progênies de seringueira (Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Müll. Arg.), bem como estimar o ganho genético com a seleção dos materiais mais produtivos. Foram utilizadas três populações de progênies de meios-irmãos de seringueira, cultivadas em três municípios do Estado de São Paulo. Os experimentos foram instalados em delineamento de blocos ao acaso com 22 progênies, 6 repetições e 10 plantas por parcela, com espaçamento de 1,5x1,5 m. Aos três anos de idade, as progênies foram avaliadas quanto à produção de borracha seca utilizando-se o teste precoce de produção Hamaker Morris-Mann. As análises de estabilidade e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Hevea brasiliensis; Blup; Interação genótipo x ambiente; Modelos mistos; Reml; Seleção genética.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009001000010
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Adaptabilidade e estabilidade de cultivares de milho de baixo custo de sementes. Repositório Alice
UATE, J. V.; CORSI, B. D. B.; NUVUNGA, J. J.; GUIMARAES, L. J. M.; VON PINHO, R. G.; BALESTRE, M..
bitstream/item/182831/1/Adaptabilidade-estabilidade.pdf
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Biplot; Modelos mistos; Interação genótipos por ambiente.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1095557
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Alternativas de análise de ensaios em látice no melhoramento vegetal PAB
BUENO FILHO,JÚLIO SÍLVIO DE SOUSA; VENCOVSKY,ROLAND.
Compararam-se diferentes formas de análise de experimentos em blocos incompletos, abordadas como casos particulares de modelos mistos, quais sejam: (a) análise intrablocos, em que apenas o efeito do erro experimental é suposto aleatório; (b) análise interblocos (látice), com efeitos de blocos supostos aleatórios; (c) análise BLUP, com os efeitos de tratamentos supostos aleatórios, e (d) modelo aleatório. Além disso, montou-se a ANAVA, considerando duas alternativas: (e) usando o quadrado médio de tratamentos ajustados para blocos e o quadrado médio do erro efetivo do látice; (f) tomando as repetições como blocos completos. Um exemplo de análise de um teste de progênies de Eucalyptus grandis (Hill) Maiden ilustra as implicações da escolha dos modelos para...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelos lineares; Delineamentos experimentais; Blocos incompletos parcialmente balanceados; Modelos mistos; BLUP.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2000000200004
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Alternativas para análise dos dados de desempenho e classificação de touros mestiços Charolês × Nelore em provas de ganho de peso. Repositório Alice
TORAL, F. L. B.; ALENCAR, M. M. de..
Avaliaram-se alternativas para análise de dados de desempenho e classificação de tourinhos mestiços Charolês × Nelore. Foram utilizados os dados de peso em seis idades e de ganho médio diário em oito períodos de 883 tourinhos 21/32 Charolês + 11/32 Nelore em provas de ganho de peso. Os valores genéticos aditivos diretos foram preditos em análises unicaracterísticas considerando modelos animais com os efeitos fixos classificatórios de grupo de contemporâneos e idade da vaca ao parto e a idade do animal no momento da pesagem como covariável linear, dependendo da característica. Como aleatórios, foram considerados o efeito genético aditivo direto, o efeito de ambiente permanente materno e o resíduo, para todas as características. Foram obtidos também os...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Modelos mistos; Quadrados mínimos; Seleção; Touros mestiços; Gado de corte.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/859933
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Análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes: implementação em R. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
O objetivo deste trabalho é a criação de um pacote R (R CORE TEAM, 2014) que implemente quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS, considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Modelos mistos; Genome Wide Association Studies; Random forests; Mixed models; Single nucleotide polymorphisms.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1009826
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Avaliação dos efeitos do fungicida sobre perfis de crescimento de ratos durante a amamentação. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. P. de; LIMA, C. G. de; MAIA, A. de H. N.; CASTRO, V. L. S. S. de; DIAS, C. T. S..
2013
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Dados longitudinais; Estruturas matriz covariâncias; Modelos mistos.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/982468
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Avaliação genética de touros pelo modelo animal, modelo touro e método das companheiras de rebanho R. Bras. Zootec.
Verneque,Rui da Silva; Martinez,Mário Luiz; Teodoro,Roberto Luiz; Pimentel,Amaury Alípio; Ferreira,William José.
As capacidades previstas de transmissão (PTA) para a produção de leite de 529 touros, usando o modelo animal (MA), modelo touro (MT) e o método das companheiras de rebanho (MCR), foram calculadas e comparadas por meio da correlação de ordem e valores, da confiabilidade e das diferenças entre PTA e percentual de coincidência na seleção dos melhores touros. Considerando-se dois conjuntos de dados, um contendo até cinco lactações por vaca e outro com os dados de produção à primeira lactação, analisaram-se 12.762 lactações, de 5757 vacas da raça Gir e mestiças Gir-Holandês. Admitindo-se até cinco lactações por vaca, a correlação de ordem entre PTA previstas usando-se MA e MCR foi de 0,69; entre modelo animal e modelo touro, 0,96; e entre MCR e modelo touro,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação genética; Gado de leite; Método das companheiras de rebanho; Modelo animal; Modelos mistos; Modelo touro; Raça Gir.
Ano: 1999 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35981999000200013
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Comparação de metodologias de predição de valores genéticos utilizando dados simulados R. Bras. Zootec.
Braccini Neto,José; Silva,Martinho de Almeida e; Euclydes,Ricardo Frederico; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Regazzi,Adair José.
Foram simuladas, utilizando o programa GENESYS, sete populações com diferentes médias genéticas e estruturas de dados resultantes da substituição de 0, 10, 25, 50, 75, 90 e 100% de reprodutores, com o objetivo de comparar a metodologia de modelos mistos (MMM) com a metodologia GenSys, por meio de suas acurácias e variâncias do erro de predição (PEV), estimadas com base no modelo de reprodutor e no modelo animal. No modelo de reprodutor, à medida que se aumentava a intensidade de seleção, ocorriam diminuição na acurácia e aumento da PEV de ambas as metodologias, em razão da menor acurácia na estimação dos níveis do efeito fixo e da diminuição do número médio de progênies/reprodutor. A superioridade da MMM no modelo de reprodutor foi atribuída à maior...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: GenSys; Modelo animal; Modelo de reprodutor; Modelos mistos.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000700006
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Comparação de métodos no ajustamento de curvas de lactação de bovinos por meio de Simulação Ciência e Agrotecnologia
Ferreira,Eric Batista; Bearzoti,Eduardo.
Curvas de lactação representam a produção de leite de uma fêmea leiteira em função do tempo. Uma vez que tais curvas variam aleatoriamente de animal para animal, devido a fatores tanto genéticos quanto ambientais, o modelo misto conhecido como regressão aleatória é apropriado para ajustar os dados de produção de um rebanho. A regressão aleatória foi avaliada neste estudo mediante simulação de dados. Produções de cinco animais em cinco idades foram simuladas em mil conjuntos de dados independentes, em três níveis de precisão, ou seja, a razão entre a variância de regressão e a total igual a 0,9 (variância alta), 0,5 (variância média) e 0,1 (variância baixa) e três graus médios de parentesco entre os animais. A regressão aleatória foi utilizada de duas...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Regressão aleatória; Modelos mistos; Curva de lactação.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542003000400019
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Esperanças matemáticas dos quadrados médios: uma análise essencial Ciência Rural
Coimbra,Jefferson Luís Meirelles; Souza,Velci Queiroz de; Kopp,Maurício Marini; Silva,João Gilberto Corrêa da; Oliveira,Antônio Costa de; Carvalho,Fernando Irajá Félix de.
Este trabalho teve como objetivo avaliar e identificar qual o tipo de soma de quadrados mais apropriada para testar hipóteses de interesse, assim como discutir alternativas mais adequadas para a solução de inconvenientes expressos por meio da análise da esperança matemática dos quadrados médios utilizados em modelos lineares mistos. A análise das esperanças matemáticas dos quadrados médios pode ser uma ferramenta de grande importância nas inferências a partir de dados experimentais, tanto incompletos (casela vazia) quanto não-balanceados. Desta forma, foram utilizados quatro exemplos, cada qual com sua peculiaridade em função do experimento ser completo ou incompleto com dados balanceados ou não-balanceados e na presença de casela vazia. O pacote...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avena sativa; Análise de variância; Modelos mistos.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782006000600010
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Estimação de componentes de variância e predição de valores genéticos pelo método da máxima verossimilhança restrita (Reml) e melhor predição linear não viciada (Blup) em Pinus. Repositório Alice
RESENDE, M. D. V. de; PRATES, D. F.; YAMADA, C. K.; JESUS, A. de..
Foram comparados três procedimentos de estimação de componentes de variância visando a predição de valores genéticos: quadrados mínimos (LS), máxima verossimilhança (ML) e máxima verossimilhança restrita (REML). A estimação pelo método ML apresentou convergência mais rápida do que pelo método REML. As herdabilidades obtidas pelos métodos ML e REML foram bastante similares e de magnitudes superiores à obtida pelo método LS. O procedimento REML, embora computacionalmente mais complicado, foi o mais preciso. A seleção e estimação de ganhos genéticos devem ser realizadas a partir do procedimento REML iteragindo nas equações de modelo misto (BLUP).
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Maxima verossimilhanca; Inferencia estatistica; Modelos mistos; Parametros geneticos; Maximum likelihood; Statistical inference; Mixed models; Genetic parameters.
Ano: 1996 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/282154
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Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Bayesiana e clássica sob diferentes cenários R. Bras. Zootec.
Assis,Giselle Mariano Lessa de; Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.
Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Modelo infinitesimal; Modelos mistos; REML; Simulação computacional; Viés da seleção.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000600007
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Estimativa de parâmetros genéticos, análise de trilha e seleção em bucha vegetal para caracteres agronômicos. Repositório Alice
BLIND, A. D.; VALENTE, M. S. F.; LOPES, M. T. G.; RESENDE, M. D. V. de.
O objetivo deste trabalho foi estimar parâmetros genéticos e realizar estudos de associação entre caracteres de interesse agronômico em 24 acessos de bucha vegetal (Luffa cylindrica L.) provenientes de sete Estados brasileiros, com o intuito de selecionar genótipos potencialmente promissores para serem introduzidos em programas de melhoramento da cultura. Foram avaliados nove caracteres relacionados a produção e a qualidade de frutos e fibras de importância econômica para a espécie. A presença de variabilidade genética e altas herdabilidades em nível de médias (0,70 - 0,99) indicaram a possibilidade de ganhos expressivos com a aplicação da seleção fenotípica para os caracteres de interesse. Ganho genético de 42,79% foi obtido para produção de fibras após...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Luffa cylindrica; Ganho genético; Herdabilidade; Modelos mistos; Genetic gain; Mixed models; Heritability.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1100076
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Estimativas de parâmetros e tendências genéticas para algumas características de importância econômica em linhagem paterna de frangos de corte sob seleção R. Bras. Zootec.
Vayego,Stela Adami; Dionello,Nelson José Laurino; Figueiredo,Elsio Antonio Pereira de.
Estimativas dos parâmetros genéticos e fenotípicos de algumas características produtivas em linhagem paterna de matrizes de frango de corte foram obtidas utilizando-se a metodologia de modelos mistos. Utilizaram-se dados de aproximadamente 46.000 aves, originados de 12 gerações no período de 1992 a 2003, fornecidos pela EMBRAPA Suínos e aves. Nos machos foram avaliadas as características peso corporal aos 42 dias de idade (P42), comprimento de peito (CPeito), largura maior do peito (Larg1) e largura menor do peito (Larg2) aos 42 dias de idade. Os componentes de variância e co-variância foram estimados utilizando-se o programa DFREML. As estimativas de herdabilidade obtidas foram moderadas e variaram de 0,29 a 0,53. As correlações genéticas foram: 0,68...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Matrizes de frango de corte; Modelos mistos; Parâmetros genéticos; REML; Tendência genética.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000700013
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Ganho genético avaliado com índices de seleção e com REML/Blup em milho-pipoca PAB
Freitas,Ismael Lourenço de Jesus; Amaral Junior,Antonio Teixeira do; Viana,Alexandre Pio; Pena,Guilherme Ferreira; Cabral,Pablo da Silva; Vittorazzi,Cássio; Silva,Thiago Rodrigues da Conceição.
O objetivo deste trabalho foi comparar quatro índices de seleção e o método REML/Blup na avaliação de ganhos genéticos preditos das características de interesse ao programa de melhoramento do milho-pipoca UENF 14. Foram avaliadas 200 progênies de irmãos-completos, em uma safra, em dois ambientes (regiões Norte e Noroeste do Estado do Rio de Janeiro), com duas repetições, o que totalizou 800 observações. Avaliaram-se as características altura média de plantas, altura média de inserção da primeira espiga, estande final, tombamento, diâmetro de colmo, prolificidade, rendimento e capacidade de expansão dos grãos. Entre os índices de seleção testados, o de Mulamba & Mock proporcionou os melhores resultados para a seleção das progênies de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Zea mays; Correlação genética; Modelos mistos; Seleção recorrente; Seleção simultânea.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2013001100007
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Ganhos genéticos preditos por diferentes métodos de seleção em progênies de Eucalyptus urophylla Repositório Alice
ROSADO, A. M.; ROSADO, T. B.; RESENDE JÚNIOR, M. F. R.; BHERING, L. L.; CRUZ, C. D..
Resumo - O objetivo deste trabalho foi avaliar parâmetros genéticos e comparar os ganhos preditos por meio de diferentes métodos de seleção em famílias de meios-irmãos de Eucalyptus urophylla. Foi utilizada seleção entre e dentro, seleção combinada e seleção com base em modelos mistos (REML/BLUP) para os caracteres diâmetro à altura do peito, altura total e volume total com casca. Foi utilizado o teste de progênie constituído de 100 famílias de meios-irmãos com 55 meses de idade, em espaçamento de 3x2 m, em delineamento de blocos ao acaso, com cinco repetições. As progênies apresentaram variabilidade genética significativa e elevada magnitude de herdabilidade para os caracteres estudados, o que evidencia alto controle genético e condições favoráveis para...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ganhos de seleção; Melhoramento florestal; Modelos mistos; Eucalipto.
Ano: 2009 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/662453
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Ganhos genéticos preditos por diferentes métodos de seleção em progênies de Eucalyptus urophylla PAB
Rosado,Antônio Marcos; Rosado,Tatiana Barbosa; Resende Júnior,Márcio Fernando Ribeiro; Bhering,Leonardo Lopes; Cruz,Cosme Damião.
O objetivo deste trabalho foi avaliar parâmetros genéticos e comparar os ganhos preditos por meio de diferentes métodos de seleção em famílias de meios-irmãos de Eucalyptus urophylla. Foi utilizada seleção entre e dentro, seleção combinada e seleção com base em modelos mistos (REML/BLUP) para os caracteres diâmetro à altura do peito, altura total e volume total com casca. Foi utilizado o teste de progênie constituído de 100 famílias de meios-irmãos com 55 meses de idade, em espaçamento de 3x2 m, em delineamento de blocos ao acaso, com cinco repetições. As progênies apresentaram variabilidade genética significativa e elevada magnitude de herdabilidade para os caracteres estudados, o que evidencia alto controle genético e condições favoráveis para seleção....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Eucalipto; Ganhos de seleção; Melhoramento florestal; Modelos mistos.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2009001200014
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Metanálise da relação entre espessura de toicinho e variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes Ciência Rural
Rossi,Carlos Augusto Rigon; Lovatto,Paulo Alberto; Weschenfelder,Volnei Antônio; Lehnen,Cheila Roberta; Fraga,Bruno Neutzling; Andretta,Ines; Ceron,Marcos Speroni.
Uma metanálise foi realizada para avaliar a relação entre a espessura de toicinho e as variáveis nutricionais de porcas gestantes e lactantes. A base de dados contemplou 14 artigos publicados de 2000 a 2006 em revistas indexadas. A metanálise foi realizada através de análises gráfica, de correlação e de variância. A correlação entre espessura de toicinho na gestação (ETg) com consumo de alimento na gestação (CAl G) foi de -0,09 (P=0,04), com CAl na lactação (CAl L) baseado na tabela NRC (1998) foi de -0,09 (P=0,06), com CAl na lactação baseado na tabela Rostagno (2000) foi de -0,08 (P=0,06) e com consumo de proteína bruta na lactação (CAl L PB) foi de -0,08 (P=0,06). A correlação entre espessura de toicinho na lactação (ETl) com CAl na gestação foi de 0,29...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Consumo alimentar; Lisina; Proteína bruta; Modelos mistos.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000400028
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Methods for Simultaneous Evaluation of Productivity, Adaptability and Genotypic Stability in Eucalyptus grandis Progeny Trials in the State of Sao Paulo PFB - Pesquisa Florestal Brasileira
Pinto Júnior, José Elidney; Sturion, José Alfredo; Resende, Marcos Deon Vilela de; Ronzelli Júnior, Pedro.
The estimated Harmonic Mean for Genetic Values (MHVG), Relative Performance of Genetic Values (PRVG) and the Harmonic Mean of Relative Performance of Genetic Values (MHPRVG) were used as measures to provide and facilitate the interpretation of genotypic stability and adaptability of Eucalyptus grandis W. Hill ex Maiden. The different criteria were applied as alternatives to the simulation of selection for productivity, stability, adaptability, as well as for the joint value of these attributes together. The estimates were generated by using the mixed model, assuming genetic effects to be random. The software SELEGEN-REML/BLUP was used to evaluate progeny trials and to estimate statistical parameters. The best trees to be used in seedling and clonal...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Quantitative genetics; Mixed models; Eucalypt improvement; Prediction of genetic values; REML/BLUP. Genética quantitativa; Modelos mistos; Melhoramento de eucalipto; Predição de valores genéticos; REML/BLUP..
Ano: 2011 URL: http://pfb.cnpf.embrapa.br/pfb/index.php/pfb/article/view/204
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