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In vitro and in silico validation of CA3 and FHL1 downregulation in oral cancer. Repositório Alice
PEREIRA, C. M.; CARVALHO, A. C. de; SILVA, F. R. da; MELENDEZ, M. E.; LESSA, R. C.; ANDRADE, V. C. C.; KOWALSKI, L. P.; VETTORE, A. L.; CARVALHO, A. L..
Abstract. Background: Aberrant methylation is a frequent event in oral cancer. Methods: In order to better characterize these alterations, a search for genes downregulated by aberrant methylation in oral squamous cell carcinoma (OSCC) was conducted through the mining of ORESTES dataset. Findings were further validated in OSCC cell lines and patients? samples and confirmed using TCGA data. Differentially expressed genes were identified in ORESTES libraries and validated in vitro using RT-PCR in HNSCC cell-lines and OSCC tumor samples. Further confirmation of these results was performed using mRNA expression and methylation data from The Cancer Genome Atlas (TCGA) data. Results: From the set of genes selected for validation, CA3 and FHL1 were downregulated...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Expressão gênica; ORESTES; Carcinogênese; Validação in vitro; Validação in silico; Open reading expressed sequence tags; Oral squamous cell carcinoma; Metilação; Gene expression; Methylation.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1105692
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