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Characterization and genetic diversity of Coffea canephora accessions in a germplasm bank in Espírito Santo, Brazil. Repositório Alice
FERRAO, M. A. G.; MENDONÇA, R. F. de; FONSECA, A. F. A.; FERRÃO, R. G.; SENRA, J. F. B.; VOLPI, P. S.; VERDIN FILHO, A. C.; COMÉRIO, M..
The state of Espírito Santo is the major producer of Coffea canephora in Brazil. Knowledge of genetic reserves is fundamental to plant breeding. Therefore, the present study characterized and analyzed the genetic diversity of 600 C. canephora accessions from the germplasm bank of Incaper based on 38 traits evaluated in 24-30-month-old plants. Further, the predominant descriptors or traits were identified, and high phenotypic variability was determined. Genetic distances for the grouped (Gower), quantitative, and qualitative datasets were 0.48, 0.61, and 0.92, respectively, with accessions 76 (Conilon) and 407 (Robusta) being the most divergent ones at Incaper. In clustering using the Tocher optimization method, 30 groups were formed, with three accessions...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Coffea Canephora; Banco de Germoplasma; Café Robusta; Plant breeding; Genetic resources; Genetic variance; Plant selection guides.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1133973
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Estimates of geneticparameters and selection gains for phenological and productive characteristics in macaw palm: an important plant for bioenergy. Repositório Alice
COSER, S. M.; MOTOIKE, S. Y.; CORRÊA, T. R.; QUEIROZ, V. de; COSTA, A. M.; NASCIMENTO, H. R. do; MADEIRA, D. D. C.; RESENDE, M. D. V. de.
This study aimed to estimate genetic traits, determine genetic correlation, and predict breeding values as a way to select macaw palm accessions from the Germplasm Bank of the Universidade Federal de Viçosa, Minas Gerais, Brazil. This trial was carried out via REML/BLUP method, which was applied to following parameters: precocity (PREC), height of the first spathe (HFS), total fruit number (TFN), pulp oil content (POC) and oil production per plant (PROD). Thirty-six accessions -comprised of two to ten plants each -were evaluated. Selegen-Reml/Blup software was used for genetic analysis as well as to identify individuals to compose the population to be exploited in macaw breeding in both short-and long-term programs. The highest correlation coefficients...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Plant selection guides; Bioenergy; Plant breeding; Biofuels.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1150857
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Evaluation of a new additive-dominance genomic model and implications for quantitative genetics and genomic selection. Repositório Alice
MIRANDA, T. L. R.; RESENDE, M. D. V. de; AZEVEDO, C. F.; NUNES, A. C. P.; TAKAHASHI, E. K.; SIMIQUELI, G. F.; SILVA, F. F. e; ALVES, R. S..
The Fisher?s infinitesimal model is traditionally used in quantitative genetics and genomic selection, and it attributes most genetic variance to additive variance. Recently, the dominance maximization model was proposed and it prioritizes the dominance variance based on alternative parameterizations. In this model, the additive effects at the locus level are introduced into the model after the dominance variance is maximized. In this study, the new parameterizations of additive and dominance effects on quantitative genetics and genomic selection were evaluated and compared with the parameterizations traditionally applied using the genomic best linear unbiased prediction method. As the parametric relative magnitude of the additive and dominance effects...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Melhoramento Genético Vegetal; Seleção Genética; Molecular models; Plant selection guides; Plant breeding.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139183
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Método de seleção de espécies arbóreas para sistemas silvipastoris. Repositório Alice
SALMAN, A. K. D.; ANDRADE, C. M. S. de; GAMA, M. de M. B.; OLIVEIRA, L. C. de; OLIVEIRA, T. K. de; MENDES, A. M.; ASSIS, G. M. L. de.
No presente capítulo, será apresentado um novo método para seleção de espécies arbóreas para uso em sistemas silvipastoris, baseado na classificação das espécies de acordo com um conjunto de 15 atributos específicos e na importância relativa desses para diferentes modalidades de sistemas. Esse método utiliza critérios objetivos e é especialmente apropriado para ser utilizado como estratégia de pesquisa exploratória para definição das espécies arbóreas a serem testadas em ensaios de introdução e avaliação e em modelos de sistemas silvipastoris, para ensaios de longa duração. Também pode ser utilizado para a identificação de ideótipos de árvores para compor diferentes modalidades de sistemas silvipastoris, em diferentes regiões.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Sistemas silvipastoris; Árvores; Espécie arbórea; Arboreal species; Pastizales; Aforestación; Sistema silvipastoril; Sistemas silvopastoriles; Silvicultura; Pastagem; Arborização; Seleção; Silviculture; Pastures; Afforestation; Silvopastoral systems; Plant selection guides.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1138690
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Multivariate analysis methods improve the selection of strawberry genotypes with low cold requirement. Repositório Alice
BARTH, E.; RESENDE, J. T. V. de; MARIGUELE, K. H.; RESENDE, M. D. V. de; SILVA, A. L. B. R. da; RU, S..
Methods of multivariate analysis is a powerful approach to assist the initial stages of crops genetic improvement, particularly, because it allows many traits to be evaluated simultaneously. In this study, heat-tolerant genotypes have been selected by analyzing phenotypic diversity, direct and indirect relationships among traits were identified, and four selection indices compared. Diversity was estimated using K-means clustering with the number of clusters determined by the Elbow method, and the relationship among traits was quantified by path analysis. Parametric and non-parametric indices were applied to selected genotypes using the magnitude of genotypic variance, heritability, genotypic coefficient of variance, and assigned economic weight as...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Multivariate analysis; Plant selection guides; Genotype; Strawberries.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1150840
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Plantas do Pantanal. Repositório Alice
POTT, A.; POTT, V. J..
E um guia ilustrado com fotografias coloridas para identificacao de 520 espécies da flora do Pantanal, exceto aquaticos, gramineas e ciperaceas. A fotografia geralmente abrange a planta com flor e/ou fruto. As plantas pertencem a 97 famílias, das quais as leguminosae foram as mais contempladas (98 espécies), seguidas de Euphorbiaceae (21), Rubiaceae (21), Compositae (20), Bignomiaceae (15) e Myrtaceae (15). O texto de cada planta, além de nome cientifico e nome vulgar, consta de informacoes sinteticas, originais e bibliograficas, em linguagem de divulgacao, sobre os seguintes itens: etimologia, habito e epoca de flor/fruto, utilização regional e potencial, ecologia (se aumenta ou diminui com gado, fogo, cheia ou seca), eventualmente cultivo, ocorrencia...
Tipo: Livros Palavras-chave: Plant specie; Espécie; Flora; Planta; Pantanal; Plant selection guides.
Ano: 1994 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/783791
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Quantile regression in genomic selection for oligogenic traits in autogamous plants: a simulation study. Repositório Alice
OLIVEIRA, G. F.; NASCIMENTO, A. C. C.; NASCIMENTO, M.; SANT'ANNA, I. de C.; ROMERO, J. V.; AZEVEDO, C. F.; BHERING, L. L.; CAIXETA, E. T..
This study assessed the efficiency of Genomic selection (GS) or genome‐wide selection (GWS), based on Regularized Quantile Regression (RQR), in the selection of genotypes to breed autogamous plant populations with oligogenic traits. To this end, simulated data of an F2 population were used, with traits with different heritability levels (0.10, 0.20 and 0.40), controlled by four genes. The generations were advanced (up to F6) at two selection intensities (10% and 20%). The genomic genetic value was computed by RQR for different quantiles (0.10, 0.50 and 0.90), and by the traditional GWS methods, specifically RR-BLUP and BLASSO. A second objective was to find the statistical methodology that allows the fastest fixation of favorable alleles. In...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Regressão Linear; Seleção Genótipa; Genomics; Plant selection guides; Plant breeding.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1139325
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Selection of Elite Genotypes of Coffee arabica L. to Produce Specialty Coffees Repositório Alice
MALTA, M. R.; OLIVEIRA, A. C. B. de; LISKA, G. R.; CARVALHO, G. R.; PEREIRA, A. A.; SILVA, A. D.; ALVAR, L. N.; MOTA, D. M..
This study aimed to evaluate the cup quality of Coffea arabica elite genotypes submitted to wet processing. C. arabica elite genotypes, which were grouped according to their genealogy: Bourbon, Paraíso Germplasm, and Resistant to Rust. Coffees were sent to wet processing to obtain fully washed coffee. After processing and drying the coffees were subjected to cup quality analysis according to the methodology of the Association of Special Coffees (SCA). To characterize and discriminate the genealogical groups the data were submitted to chemometric analysis, Principal Component Method (PCA) and Partial Least Squares Discriminant Analysis (PLS-DA). The PCA was effective in presenting an overview of the data, demonstrating the variables that most contributed to...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Seleção Genótipa; Coffea Arábica; Produção Agrícola; Genotype; Plant selection guides; Coffee products.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1133735
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