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Mangin, B.; Goffinet, B.; Le Roy, P.; Boichard, D.; Elsen, J.M.. |
Dans ce papier, nous comparons quatre méthodes, qui permettent de résoudre le problème relatif à la phase inconnue des mâles aux marqueurs dans des familles de demi-germains, lorsque aucune information sur les grands-parents n’est disponible. Ces méthodes sont comparées, en utilisant l’approximation gaussienne de la vraisemblance à l’intérieur de chaque descendance à la place de la vraisemblance du mélange de distribution. Dans la première étude par simulation, les propriétés respectives du modèle gaussien et du modèle de mélange sont étudiées pour la méthode la plus simple de reconstruction des gamètes des mâles. Les deux modèles conduisent à des tests comparables au regard de leur puissance mais l’erreur quadratique moyenne d’estimation de... |
Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: FAMILLE DE DEMI-FRERES; PHASE DE LINKAGE INCONNU; TEST DU RAPPORT DE VRAISEMBLANCE HALF-SIB FAMILIES; QTL DETECTION; UNKNOWN LINKAGE PHASE; GAUSSIAN APPROXIMATION; LOG-LIKELIHOOD RATIO TEST. |
Ano: 1999 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD200757228d08&uri=/notices/prodinra1/2007/07/ |
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Gilbert, H.; Le Roy, P.. |
A new multiple trait strategy based on discriminant analysis was studied for efficientdetection of linked QTL in outbred sib families, in comparison with a multivariate likelihoodtechnique. The discriminant analysis technique describes the segregation of a linear combinationof the traits in a univariate likelihood. This combination is calculated for each pair of positionsdepending on the inheritance of the pairs of QTL haplotypes in the progeny. The gainsin power and accuracy for position estimations of multiple trait methods in grid searches wereevaluated in reference to single trait detections of linked QTL. The methods were applied tosimulated designs with two correlated traits submitted to various effects from the linked QTL.Multiple trait strategies... |
Tipo: Journal Article |
Palavras-chave: QTL DETECTION; LINKED QTL; MULTIPLE TRAIT; SIB FAMILIES; SIMULATIONS. |
Ano: 2007 |
URL: http://www.prodinra.inra.fr/prodinra/pinra/doc.xsp?id=PROD2008f13e17f3&uri=/notices/prodinra1/2009/12/ |
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