SABIIA - Sistema Aberto e Integrado de Informação em Agricultura (Sabiia)

VERARDI, C. K.; RESENDE, M. D. V. de; COSTA, R. B. da; GONÇALVES, P. de S..

Os objetivos deste trabalho foram determinar a interação genótipo x ambiente e a estabilidade e adaptabilidade da produção de borracha em progênies de seringueira (Hevea brasiliensis (Willd. ex A. Juss.) Müll. Arg.), bem como estimar o ganho genético com a seleção dos materiais mais produtivos. Foram utilizadas três populações de progênies de meios-irmãos de seringueira, cultivadas em três municípios do Estado de São Paulo. Os experimentos foram instalados em delineamento de blocos ao acaso com 22 progênies, 6 repetições e 10 plantas por parcela, com espaçamento de 1,5x1,5 m. Aos três anos de idade, as progênies foram avaliadas quanto à produção de borracha seca utilizando-se o teste precoce de produção Hamaker Morris-Mann. As análises de estabilidade e...

Avaliação de modelos para estimativa de componentes de (co)variância em características reprodutivas de suínos

Palavras-chave: Hevea brasiliensis; BLUP; Interação genótipo x ambiente; Modelo misto; REML; Seleção genética; Borracha; Produção; Seringueira; Progênie.

Ano: 2009

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/580002

Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Regazzi,Adair José; Costa,André Ribeiro Corrêa da.

Foram analisados dados de características reprodutivas de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White, para avaliar a importância de inclusão dos efeitos genético materno e comum de leitegada em modelos animais. As características tamanho de leitegada ao nascimento, tamanho de leitegada ao desmame, peso de leitegada ao nascimento, peso de leitegada aos 21 dias de idade e taxa de mortalidade foram avaliadas pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML), obtendo-se um valor de verossimilhança para cada característica e raça. O teste da razão de verossimilhança foi aplicado para se verificar qual o modelo mais adequado na avaliação genética animal: o modelo 1, que continha o efeito genético direto; o modelo 2, que continha os efeitos genéticos...

Avaliação genética de indivíduos e progênies de cupuaçuzeiro no Estado do Pará e estimativas de parâmetros genéticos.

Palavras-chave: Efeito materno; Modelo animal; REML; Teste da razão de verossimilhança.

Ano: 2000

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600013

ALVES, R. M.; RESENDE, M. D. V. de.

O presente trabalho relata a avaliação genotípica de progênies de cupuaçuzeiro, no Estado do Pará, para os caracteres número de frutos (NF) em quatro safras, intensidade de ocorrência de vassoura- de-bruxa na inflorescência (VBI) e nos frutos (VBF), e peso de vassoura-de-bruxa (PVB). Apresenta também estimativas de parâmetros genéticos que permitem inferir sobre o controle genético e nível de variabilidade genética presente no material avaliado. Todos os caracteres apresentaram considerável variabilidade genética, com coeficientes de variação genética variando de 27% a 88% no âmbito de progênie e de 38% a 123% no âmbito individual. Isto revela excelentes possibilidades para a seleção nessa população experimental híbrida. As estimativas de herdabilidade...

Avaliação genética de indivíduos e progênies de cupuaçuzeiro no Estado do Pará e estimativas de parâmetros genéticos.

Palavras-chave: Theobroma grandiflorum; Cupuaçuzeiro; Herdabilidade; Repetibilidade; Método de seleção; REML; BLUP.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/314931

ALVES, R. M.; RESENDE, M. D. V. de..

Avaliação genética para peso corporal em um rebanho Nelore

Palavras-chave: Theobroma grandiflorum; Cupuaçuzeiro; Herdabilidade; Repetibilidade; Método de seleção; REML; BLUP.

Ano: 2008

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/409964

Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.

Gonçalves,F.M; Pires,A.V; Pereira,I.G; Garcia,D.A; Farah,M.M; Meira,C.T; Cruz,V.A.R.

Estimaram-se as herdabilidades para os efeitos genéticos direto e materno e as correlações genéticas entre essas variáveis para os pesos ao desmame (P205), ao ano (P365) e ao sobreano (P550) em um rebanho Nelore do norte de Minas Gerais. O modelo estatístico incluiu os efeitos aditivos direto e materno, os efeitos fixos de grupo de contemporâneos (fazenda, sexo, regime alimentar, estação (seca e água) e ano de nascimento do animal) e o efeito da covariável idade da vaca ao parto (linear e quadrático). Os componentes de variância e os valores genéticos foram estimados utilizando-se o método REML. A tendência genética foi obtida utilizando-se a regressão do valor genético médio anual em relação ao ano de nascimento dos animais. As estimativas de...

Comparação de metodologias para estimação de parâmetros genéticos em população de aves submetida à seleção

Palavras-chave: Bovino de corte; Tendência genética; Herdabilidade; REML.

Ano: 2011

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352011000100024

Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.

Azevedo Jr,P.C.; Silva,M.A.; Fridrich,A.B.; Lopes,P.S.; Euclydes,R.F.; Torres,R.A; Duarte,R.G.; Teixeira,L.V..

O trabalho utilizou peso corporal de 11.700 aves de corte e conversão alimentar de 2.400 aves e produção de pintos de 560 fêmeas selecionadas para reprodução, em cada uma de quatro gerações de seleção (1992-1995) para comparar estimativas de parâmetros genéticos obtidas por meio do Método III de Henderson, incluindo todas as observações disponíveis de peso corporal no 42º dia de idade (PC), conversão alimentar (CA) e produção de pintos (PP) com as obtidas pela máxima verossimilhança restrita - REM, em diferentes composições de arquivos, definidos em: 1 - análise de uma geração de seleção com todas as informações (RUC) de PC, CA e PP; 2 - análise de duas gerações de seleção incluindo ou não PP; 3 - análise de três gerações de seleção incluindo ou não PP; e...

Covarianzas genéticas y fenotípicas para días abiertos y características de la curva de lactancia en vacas Holstein en el norte de México

Palavras-chave: Ave de corte; Estimativa; Parâmetro genético; REML; Henderson.

Ano: 2002

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352002000500010

Veterinaria México

López-Ordaz,Reyes; Castillo-Juárez,Héctor; Montaldo,Hugo H..

El objetivo de este estudio fue estimar covarianzas genéticas y fenotípicas para características de la curva de lactancia y días abiertos en vacas Holstein. Los datos incluyeron 1 579 lactancias de 766 vacas, hijas de 126 sementales, en un hato en el norte de México. Las características estudiadas por lactancia fueron días abiertos (DO), producción máxima de leche (PMÁX), días a la producción máxima (DPMÁX), producción de leche de 305 días (MP305), persistencia de la lactancia por Wood (PERSW), persistencia de Wood expresada como logaritmo natural (LNPERSW) y persistencia medida como ((producción al día 305/PMÁX) x 100) (PERS). Los componentes de covarianza fueron obtenidos mediante el uso de modelos univariados y bivariados con máxima verosimilitud...

URL: http://www.scielo.org.mx/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0301-50922009000400001

Palavras-chave: Ganado lechero; Parámetros genéticos; Producción máxima de leche; Producción de leche; Persistencia de la lactancia; Modelo animal; REML.

Ano: 2009

Desempenho genotípico de linhagens de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos

Bragantia

Borges,Vanderley; Soares,Antonio Alves; Reis,Moizés Souza; Resende,Marcos Deon Vilela; Cornélio,Vanda Maria Oliveira; Leite,Natália Alves; Vieira,Antonio Rodrigues.

Avaliou-se o desempenho de genótipos de arroz de terras altas utilizando metodologia de modelos mistos. Foram utilizados dados de produtividade de grãos dos ensaios de valor de cultivo e uso (VCU) do programa cooperativo de melhoramento de arroz de terras altas, desenvolvido em Minas Gerais, no período de 1997/1998 a 2007/2008. Realizou-se análise de deviance para verificar a significância dos efeitos de genótipos e suas interações com locais e anos, obtendo-se a estabilidade e a adaptabilidade genotípicas, com os métodos da média harmônica dos valores genotípicos. Os efeitos de genótipos, genótipos x locais e genótipos x anos foram estatisticamente significativos (p<0,05). As linhagens e cultivares mais estáveis foram: Curinga-3, CNA 8983, Guarani,...

Desempenho genotípico de linhagens de arroz irrigado no Estado do Mato Grosso do Sul, via modelos mistos.

Palavras-chave: Oryza sativa; REML; BLUP; Estabilidade genotípica; Adaptabilidade.

Ano: 2010

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052010000400008

COLOMBARI FILHO, J. M.; OLIVEIRA, J. P. de; CASTRO, A. P. de; MORAIS, O. P. de.

O presente trabalho teve como objetivo realizar a avaliação genotípica de 56 genótipos (cultivares e linhagens-elite) de arroz irrigado tropical em três locais do estado do Mato Grosso do Sul, em quatro anos agrícolas. Para isso, foram estimados os valores preditos e genotípicos de cada genótipo, para caráter produção de grãos (kg ha-1), para o ambiente médio dos locais, para o estudo da estabilidade e adaptabilidade dos valores genotípicos preditos pelo procedimento da melhor predição linear não viesada (BLUP).

Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE)

Palavras-chave: Mato Grosso do Sul; Blup; REML; Arroz irrigado; Oryza sativa; Melhoramento genético vegetal; Genótipo.

Ano: 2011

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/899061

Early assessment of first year height data from five Acacia mearnsii (black wattle) sub populations in South Africa using REML/BLUP.

DUNLOP, R. W.; RESENDE, M. D. V. de.; BECK, S. L..

Recent research has shown, Acacia mearnsii (black wattle) to be a source of high quality pulp. This led to a change in the emphasis in the breeding programme at the Institute for Commercial Forestry Research, from improving bark yield and quality, to improving timber yield and quality while maintaining an acceptable bark quality. A Multiple Population Breeding Strategy was implemented to cater for these changes. Five sub-populations were established across different sites in KwaZulu- Natal and were determined by origin of seed. Each sub-population was established as a progeny trial with a seedling seed orchard adjacent to it. The management of the seed orchards will be determined according to the performance of the families within the progeny trials. This...

Estimação de componentes de variância sob influência de genes de efeito principal, comparando-se metodologias Bayesiana e clássica sob diferentes cenários

Palavras-chave: Acácia mearnsii; BLUP; REML.

Ano: 2005

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/312021

Assis,Giselle Mariano Lessa de; Carneiro Júnior,José Marques; Euclydes,Ricardo Frederico; Torres,Robledo de Almeida; Lopes,Paulo Sávio.

Quatro diferentes tipos de população foram simulados com o objetivo de verificar a influência de genes de efeito principal e do tamanho da população na estimação de componentes de variância sob seleção. A estimação foi realizada por meio da utilização e comparação das metodologias clássica e Bayesiana (a Bayesiana com três níveis de informação a priori). As metodologias REML e Bayesiana com prior não-informativo, em geral, produziram resultados bastante semelhantes. Em populações cuja característica é governada por genes de efeito principal, as estimativas dos componentes de variância genética aditiva foram pouco acuradas, exceto quando se utilizou metodologia Bayesiana com prior informativo. A inclusão das informações de parentesco e dos registros de...

Estimação de parâmetros genéticos de características reprodutivas em suínos

Palavras-chave: Amostragem de Gibbs; Modelo infinitesimal; Modelos mistos; REML; Simulação computacional; Viés da seleção.

Ano: 2007

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982007000600007

Pires,Aldrin Vieira; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Euclydes,Ricardo Frederico; Costa,André Ribeiro Corrêa da.

Com o objetivo de estimar os parâmetros genéticos e fenotípicos de características reprodutivas de suínos, foram utilizados dados de peso da leitegada ao nascimento (PLN), peso da leitegada ajustado para 21 dias (PL21), tamanho de leitegada ao nascimento (TLN), tamanho de leitegada ao desmame (TLD) e taxa de mortalidade (TM), de três raças de suínos, Duroc, Landrace e Large White. Variâncias e covariâncias genéticas e fenotípicas foram estimadas pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML), usando modelo que inclui os efeitos genéticos direto e materno e comum de leitegada. Estes componentes foram usados para calcular as herdabilidades direta (<img src="http:/img/fbpe/rbz/v29n6/5698fr7.gif">), materna (<img...

Estimação de parâmetros genéticos de medidas de conformação, produção de leite e idade ao primeiro parto em vacas da raça Gir Leiteiro

Palavras-chave: Efeito materno; Leitegada; Modelo animal; REML; Suíno.

Ano: 2000

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000600015

Wenceslau,Amauri Arias; Lopes,Paulo Sávio; Teodoro,Roberto Luiz; Verneque,Rui da Silva; Euclydes,Ricardo Frederico; Ferreira,William José; Silva,Martinho de Almeida e.

RESUMO - Foram utilizados 573 registros zootécnicos de vacas primíparas da raça Gir Leiteiro para estimar os componentes de (co)variância das características de conformação, produção de leite em até 305 dias de lactação (PLEI) e idade ao primeiro parto (IPP) pelo Método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo dos coeficientes de herdabilidade e nas correlações genéticas, fenotípicas e residuais. As medidas de conformação, circunferência torácica (CTOR), altura na garupa (AG), comprimento corporal (CC), comprimento de tetas (CT), diâmetro de tetas (DT) e altura de úbere (AU) foram realizadas em vacas à primeira lactação, com idade média de 4,05 anos. As correlações genéticas e fenotípicas entre PLEI e IPP...

Estimação de parâmetros genéticos em características de desempenho de suínos das raças Large White, Landrace e Duroc

Palavras-chave: Bovino de leite; Correlação genética; Raça Gir; REML.

Ano: 2000

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982000000100021

Costa,André Ribeiro Corrêa da; Lopes,Paulo Sávio; Torres,Robledo de Almeida; Regazzi,Adair José; Silva,Martinho de Almeida e; Euclydes,Ricardo Frederico; Pires,Aldrin Vieira.

Dados de suínos Large White (LW), Landrace (LD) e Duroc (DU) foram utilizados na estimação dos componentes de variância para peso ajustado aos 70 dias (PA70), ganho de peso diário (GPD) e espessura de toucinho (ET). Os componentes de (co)variância foram estimados pelo método de máxima verossimilhança restrita (REML). Esses componentes foram utilizados no cálculo das estimativas das herdabilidades, do efeito comum de leitegada e das correlações genéticas, de leitegada e residual. As características apresentaram valores de herdabilidades de médio a alto, indicando a possibilidade de ganhos genéticos por meio de seleção. As correlações genéticas entre PA70 e GPD (LW = 0,46; LD = 0,08; e DU = -0,47) e entre PA70 e ET (LW = 0,48; LD = 0,31; e DU = 0,47) indicam...

Estimação de parâmetros genéticos em tamanho de leitegada de suínos utilizando análises de características múltiplas

Palavras-chave: Parâmetros genéticos; REML; Suíno.

Ano: 2001

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982001000100009

Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Junior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.

Registros de animais da raça Large White foram utilizados para estimar componentes de co-variâncias e parâmetros genéticos para a característica número de leitões nascidos como medida do tamanho de leitegada. Na obtenção dos componentes de co-variâncias e dos parâmetros genéticos, utilizou-se o método da Máxima Verossimilhança Restrita, com o algoritmo Livre de Derivadas, por meio do programa MTDFREML. O modelo misto continha o efeito fixo de grupo contemporâneo e os efeitos aleatórios genético aditivo direto e residual. Dados das primeiras quatro parições foram usados em duas análises: análises unicaracterísticas e análise multicaracterística separada em séries de análises bicaracterísticas, na qual cada parição foi tratada como característica diferente....

Estimates of repeatability coefficients and the number of the optimum measure to select superior genotypes in Annona muricata L.

Palavras-chave: Características reprodutivas; Correlação genética; Herdabilidade; Número de leitões nascidos; REML.

Ano: 2008

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008001100007

SANCHÉZ, C. F. B.; ALVES, R. S.; GARCIA, A. d. P.; TEODORO, P. E.; PEIXOTO, L. A.; SILVA, L. A.; BHERING, L. L.; RESENDE, M. D. V. de.

The aim of this study was to evaluate repeated measures over the years to estimate repeatability coefficient and the number of the optimum measure to select superior genotypes in Annona muricata L. The fruit production was evaluated over 16 years in 71 genotypes without an experimental design. The estimation of variance components and the prediction of the permanent phenotypic value were performed using REML/BLUP proceedings. The coefficient of determination, accuracy, and selective efficiency increased when measures increased. The coefficient of determination of 80% was reached beyond 8 crop seasons with high accuracy and selective efficiency. Thus, the evaluation of 8 crop seasons can be suitable to select superior genotypes in the A. muricata L....

Estimating variance components in Stata

Palavras-chave: REML.

Ano: 2017

URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1085408

AgEcon

Marchenko, Yulia V..

This article gives a brief overview of the popular methods for estimating variance components in linear models and describes several ways to obtain such estimates in Stata for various experimental designs. The article’s emphasis is on using xtmixed to estimate variance components. Prior to Stata 9, loneway could be used to estimate variance components for one-way random-effects models. For other experimental designs, variance components could be computed manually using saved results after anova. The latter approach is viable but requires tedious computations for complicated experimental designs. Instead, as of Stata 9, variance components are easily obtained by using xtmixed.

Tipo: Journal Article

Palavras-chave: Variance components; Experimental design; ANOVA; REML; ML; Multilevel; Random coefficients; Mixed models; Research Methods/ Statistical Methods.

Ano: 2005

URL: http://purl.umn.edu/117553

Estimation of variance components, genetic parameters and genetic trends for litter size of swines

Barbosa,Leandro; Lopes,Paulo Sávio; Regazzi,Adair José; Torres,Robledo de Almeida; Santana Júnior,Mário Luiz; Veroneze,Renata.

Records of Large White breed animals were used to estimate variance components, genetic parameters and trends for the character total number of born piglets (TNBP) as measure of litter size. For obtaining variance components and genetic parameters, it was used the Restricted Maximum Likelihood Method using MTDFREML software. Two mixed models (additive and repeatability) were evaluated. The additive model contained fixed effect of the contemporary group and the following random effects: direct additive genetic and residual effect for the first parturition. Repeatability model had the same effects of the additive model plus parturition order fixed effect and non-correlated animal permanent environment random effect for the second, third and forth...

Estimativa de parâmetros genéticos para características de carcaça em um rebanho de suínos Large White

Palavras-chave: Genetic trend; Heritability; Number of piglets; REML; Repeatability model; Reproductive traits.

Ano: 2010

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982010001000008

Fernandez Giné,Gastón Andrés; Freitas,Rilke Tadeu Fonseca de; Oliveira,Antonio Ilson Gomes de; Pereira,Idalmo Garcia; Gonçalves,Tarcísio de Moraes.

Com o objetivo de estimar parâmetros genéticos para características de carcaça de suínos, foram utilizados dados de rendimento de carcaça (RC), comprimentos de carcaça pelo método Brasileiro (CCMB) e pelo método americano (CCMA), espessuras de toucinho média (ETM) e a 6,5 cm da linha dorsal (P2), área de olho de lombo (AOL), relação carne:gordura (RCG), rendimento de pernil (RP), porcentagens de carne (PC), gordura (PG) e cortes magros (PCM), relação peso da gordura/peso da carne (RGC) e taxa de crescimento em músculo (TCM), obtidos de 711 suínos Large White. Os componentes de (co)variância foram estimados pelo método da Máxima Verossimilhança Restrita (REML), incluindo no modelo efeitos fixos (sexo e grupo contemporâneo) e aleatórios (efeitos genéticos e...

Estimativas de parâmetros e tendências genéticas para algumas características de importância econômica em linhagem paterna de frangos de corte sob seleção

Palavras-chave: Parâmetros genéticos; REML; Suínos; Carcaça.

Ano: 2004

URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982004000200009

Vayego,Stela Adami; Dionello,Nelson José Laurino; Figueiredo,Elsio Antonio Pereira de.

Estimativas dos parâmetros genéticos e fenotípicos de algumas características produtivas em linhagem paterna de matrizes de frango de corte foram obtidas utilizando-se a metodologia de modelos mistos. Utilizaram-se dados de aproximadamente 46.000 aves, originados de 12 gerações no período de 1992 a 2003, fornecidos pela EMBRAPA Suínos e aves. Nos machos foram avaliadas as características peso corporal aos 42 dias de idade (P42), comprimento de peito (CPeito), largura maior do peito (Larg1) e largura menor do peito (Larg2) aos 42 dias de idade. Os componentes de variância e co-variância foram estimados utilizando-se o programa DFREML. As estimativas de herdabilidade obtidas foram moderadas e variaram de 0,29 a 0,53. As correlações genéticas foram: 0,68...