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Diversite de populations microbiennes thermophiles d'une cheminée hydrothermale océanique profonde : cultures d'enrichissement en bioréacteur et isolement d'espèces nouvelles ArchiMer
Postec, Anne.
To explore the microbial diversity at deep sea vents, molecular techniques based on the analysis of the gene coding the 16S ribosomal RNA permitted to highlight a large archaeal and bacterial diversity. Nevertheless, the diversity of the hydrothermal microorganisms cultivated to date remains much lower than the diversity described with molecular tools. Innovative methods should therefore be used in order to cultivate new microorganisms, and also determine their metabolic properties and their potential role in the ecosystem. That was the purpose of this study: a bioreactor gas-lift was used to perform enrichment cultures in continuous, during 50 days, in thermophilic (60°C) and hyperthermophilic (90°C) conditions. A hydrothermal chimney sample (Rainbow...
Tipo: Text Palavras-chave: Strain isolation and characterization; Hybridization; Sequencing; Cloning; DGGE; Gas lift bioreactor; Enrichment cultures; Deep sea hydrothermal vents; Bacteria; Archaea; Diversity; Isolement et caractérisation de souche; Hybridation; Séquençage; Clonage; DGGE; Bioréacteur gas lift; Cultures d'enrichissement; Sources hydrothermales océaniques profondes; Bacteria; Archaea; Diversité.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/these-367.pdf
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Structuration génétique d'une collection de souches de Vibrio. Contribution à la mise au point d'outils de typage moléculaire pour l'aide au diagnostic ArchiMer
Jaffres, Emmanuel.
Les bactéries du genre Vibrio représentent le groupe le plus fréquemment associé à des maladies infectieuses chez les mollusques marins. Ainsi chez l'huître creuse Crassostrea gigas, la majorité des Vibrios isolés d'animaux sains ou malades sont phénotypiquement classés dans un groupe de souches apparentées à Vibrio splendidus. Les récentes études phylogénétiques pars séquençage du gène gyrB, ont permis de distinguer plusieurs espèces au sein de ce groupe (V. splendidus, V. chagasii, V. cyclitrophicus, V. crassostreae, V. gigantis). Toutefois, il subsiste toujours des imprécisions dans l'arbre phylogénétique gyrB. En effet, un groupe polyphylétique de 4 espèces reste jusqu'à présent on distinguables (V. tasmaniensis, V. kanaloae, V. pomeroyi, V. lentus)....
Tipo: Text Palavras-chave: Mortalités estivales; Huître creuse; Crassostrea gigas; Vibrio spendidus; PCR-RFLP; Séquençage; Gène ADNr-16S; GyrB; Macroarrays.
Ano: 2005 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00034/14479/11779.pdf
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