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Análise do N-terminal da proteína capsidial de SCMV infectando milho e sorgo no Brasil. Infoteca-e
SOUZA, I. R. P. de; CARNEIRO, N. P.; GIOLITTI, F.; LENARDON, S. L.; SABATO, E. de O.; GOMES, E. A.; NODA, R. W.; SOUZA, F. A. de.
x
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Potyvírus; Sequenciamento; Gene; Fitopatologia; Genética vegetal.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/951986
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Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq Repositório Alice
SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R,; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P..
2017
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Expressão diferencial; Bovinos de leite; Sequenciamento.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072447
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Avaliação e aplicação de métodos de genotipagem para estudo da síndrome da musculatura dupla em bovinos da raça Senepol. Repositório Alice
URQUIZA, A. da S. C..
Em várias raças de bovinos de corte é observada a síndrome da musculatura dupla, caracterizada pela presença do fenótipo de hipertrofia muscular, sendo esta uma condição hereditária e controlada pelo gene GDF-8 (Growth Differentiation Factor-8). Em bovinos da raça Senepol, a mutação nt821, localizada no exon III deste gene, é responsável por esta síndrome. Neste contexto, os objetivos deste trabalho foram avaliar três metodologias de genotipagem desta mutação, com o intuito de verificar qual a mais adequada em relação a custo/benefício e verificar a associação do alelo mutado com características de interesse econômico em touros jovens da raça Senepol. Foram extraídos DNA genômico de amostras biológicas de 17 bezerros, sendo sete com o fenótipo da...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Gene GDF-8; Sequenciamento; Selection; Hipertrofia muscular; Mutação; Seleção; Gado de corte; Fenotipo; Mutation; Sequence analysis.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082405
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Bioinformática aplicada à agricultura. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H..
Este capítulo tem por objetivo colocar o leitor a par do estado da arte das principais aplicações da bioinformática na agricultura, particularmente àquelas relacionadas ao melhoramento genético animal e vegetal, executadas no âmbito da Embrapa.
Tipo: Capítulo em livro científico (ALICE) Palavras-chave: Bioinformática; Sequenciamento; Melhoramento genético; Estudos de associação genômica ampla; Genome-Wide Association Studies; Polimorfismos de base única; Agricultura; Agriculture; Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1010705
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Bioinformática e anotação de genes em Xanthomonas axonopodis pv. citri e Xylella fastidiosa: metabolismo de ferro e biossíntese de pequenas moléculas. Repositório Alice
FORMIGHIERI, E. F..
2011
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Biologia molecular; Genomas; Sequência de aminoácidos; Sequenciamento.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/891185
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Caracterização de bactérias endofíticas isoladas do milho cultivado no agroecossistema cerrado. Repositório Alice
COELHO, V. T. S.; QUINTÃO, P. L.; PAOLI, H. C.; MELO, M. A. V.; LAGE, G. A.; FONSECA, P. C.; BRESSAN, W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; FIGUEIREDO, J. E. F..
2002
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: SDS-PAGE; RAPD-PCR; RDNA; Sequenciamento; Taxinomia.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/485688
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Caracterização do gene 25k FP de Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus. Infoteca-e
SOUZA, M. L. de; CASTRO, M. E. B. de; SIHLER, W.; DALMOLIN, C. C.; PEDRINI, M. R. da S.; SILVA, F. R. da..
2003
Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Anticarsia gemmatalis nucleopolyhedrovirus; Produção in vitro; Controle biológico; Lagarta; Gene; Identificação; Sequenciamento.
Ano: 2003 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/handle/doc/185380
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Caracterização e expressão heteróloga em Escherichia coli dos homólogos em milho do gene OsPSTOL1 Repositório Alice
FERREIRA, N. F.; NEGRI, B. F.; SOUSA, S. M. de.
A baixa disponibilidade de fósforo (P) é um fator limitante para o aumento da produtividade do milho, uma vez que o P é um dos macronutrientes com menor e?ciência de uso pelas plantas. Sendo assim, modi?cações na morfologia do sistema radicular são importantes para aumentar a e?ciência na aquisição de P nas plantas. O gene PHOSPHORUS STARVATION TOLERANCE 1 (PSTOL1), codi?ca uma quinase que ao ser superexpressa em arroz aumenta o crescimento radicular e a aquisição de P e, consequentemente, a produtividade de grãos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar funcionalmente os genes de milho, ZmPSTOL1_8.05, ZmPSTOL1_3.06 e ZmPSTOL1_8.02, homólogos ao OsPSTOL1. A clonagem e sequenciamento da região codi?cante possibilitaram a obtenção das sequências completas...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: E?ciência de fósforo; Quinase; Sequenciamento; Raiz.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115014
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Colapso induzido pelo exercício em um Labrador Retriever Ciência Rural
Basso,Roberta Martins; Oliveira-Filho,José Paes de; Palumbo,Mariana Isa Poci; Zakia,Luiza Stachewski; Araújo Júnior,João Pessoa; Borges,Alexandre Secorun.
O colapso induzido pelo exercício (EIC) é uma enfermidade hereditária caracterizada por fraqueza muscular, dificuldade de locomoção e colapso após atividade física intensa. Esta enfermidade autossômica recessiva afeta principalmente cães jovens da raça Labrador Retriever e decorre da mutação c.767G>T no gene codificador da proteína dinamina 1 (DNM1). O objetivo deste trabalho é relatar o primeiro caso de EIC em Labrador Retriever no Brasil. O teste molecular para detectar a mutação responsável pela EIC confirmou o diagnóstico clínico em um Labrador Retriever com histórico de fraqueza muscular e colapso após exercício. Uma vez diagnosticada no Brasil, ressalta-se a importância de inserir a EIC entre os diagnósticos diferenciais das enfermidades...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Exercício; Mutação; Cães; Sequenciamento; DNM1.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014000901629
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Decifrando o genoma. Repositório Alice
CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; PAIVA, E..
Os genes, unidades biologicas que determinam as caracteristicas de um organismo, estao contidos em moleculas de DNA presentes no nucleo das celulas. Portanto, o estudo do DNA e de fundamental importancia para o entendimento de como as caracteristicas de um organismo sao formadas. Com o grande avanco alcancado pelas tecnicas de Biologia molecular nas ultimas decadas, hoje, somos capazes de isolar e sequenciar moleculas de DNA de maneira rotineira. A partir da otimizacao das tecnicas de sequenciamento, surgiram programas com o objetivo de sequenciar genomas inteiros. atualmente, estao depositados em bancos de dados mais de 3 milhoes de sequencias de DNA e, grande parte delas ainda nao tem sua funcao conhecida. O processo de caracterizacao da funcao genica...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Sequenciamento; CDNA; Genome; DNA sequency.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/484108
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Desvendando o código genético. Repositório Alice
CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; PAIVA, E..
2000
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Genoma; Sequenciamento; Genes; Genome.
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/484693
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Detecção e caracterização molecular de Begomovirus em feijão caupi no estado do Pará. Repositório Alice
BOARI, A. de J.; HAYASHI, E. A. I.; CARVALHO, T. P.; ISHIDA, A. K. N.; BONFIM, K..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Feijão-caupi; Vigna unguiculata; Vírus; Sequenciamento.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002610
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Diversidade genética de Colletotrichum graminicola isolados da cultura do sorgo no ecossistema agrícola tropical revelada por SDS-PAGE, RAPD e análise da sequência do RDNA 18s e região intergênica 18s-28s Repositório Alice
PAOLI, H.C.; QUINTAO, P.L.; COELHO, V.T.S.; LAGE, G.A.; FONSECA, P.C.; FERREIRA, A.S.; CASELA, C.R.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E.A.; FIGUEIREDO, J. E. F..
2002
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: RDNA; RAPD-PCR; ARDRA; Sequenciamento; SDS-PAGE.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/485693
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Identificação de fungos associados a plantas de mangues no estado do Ceará. Repositório Alice
MAIA, L. K. R..
Os fungos endofíticos ocorrem em todas as espécies de plantas já estudadas, e são definidos como organismos que colonizam os tecidos vegetais, inter ou intracelular, sem causarem quaisquer sintomas externos aparentes. Ademais, eles conferem aos seus hospedeiros uma maior resistência a ataque de insetos, de herbívoros e a estresses abióticos e bióticos. Atualmente os fungos endofíticos são considerados uma excelente fonte de produção de compostos bioativos, com potencial utilização na agricultura, na medicina e na indústria de um modo geral. Manguezais são ecossistemas localizados na confluência de terra e mar, característicos de áreas tropicais e subtropicais, cobrindo cerca de 18,1 milhões de hectares do planeta. A grande biodiversidade encontrada nestes...
Tipo: Tese/dissertação (ALICE) Palavras-chave: Endofíticos; Sequenciamento; Filogenia; Patogenicidade; Phylogeny; Pathogenicity; Lasiodiplodia.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1113758
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Identificação de variação no número de cópias em bovinos leiteiros usando dados de NGS. Repositório Alice
CHUD, T. C. S.; ZERLOTINI NETO, A.; CARMO, A. S. do; MUNARI, D. P.; SILVA, M. V. G. B..
2017
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos primigenius indicus; Raça composta; Sequenciamento.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1072284
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Imunorreatividade da p53 associada à ausência de mutações no gene TP53 em linfomas caninos Ciência Rural
Calazans,Sabryna Gouveia; Rodigheri,Sabrina Marin; Fernandes,Simone Crestoni; Amorim,Reneé Laufer; Sequeira,Júlio Lopes; Sena,Janete Apparecida Desidério; Daleck,Carlos Roberto.
Sabendo-se da influência das mutações no gene TP53 no desenvolvimento das neoplasias e da discrepância entre os resultados obtidos pelas técnicas de sequenciamento e imunoistoquímica, esta pesquisa teve como objetivo relacionar a sequência do TP53 com a imunorreatividade da p53. Foram obtidas amostras de linfoma de 12 cães. O diagnóstico histopatológico foi determinado pela classificação de Kiel. O imunofenótipo e a imunomarcação da p53 foram determinados por imunoistoquímica. Para reação com a p53, utilizou-se anticorpo policlonal anti-p53 (CM1) na diluição de 1:500. A região do gene TP53 compreendida entre os exons quatro e nove foi amplificada por PCR e submetida ao sequenciamento. Apesar dos resultados obtidos pela imunoistoquímica, nenhuma mutação foi...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cão; Imunoistoquímica; Linfossarcoma; P53; Sequenciamento.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000600034
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Ocorrência da queima foliar causada por Phomopsis sp. em ariá no estado do Pará. Repositório Alice
CARVALHO, T. P.; BOARI, A. de J.; SILVA, C. B. T..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Hortaliça; Ariá; Calathea allouia Lindl.; Sequenciamento; Fungo; Queima das folhas; Queima foliar; Pará.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002709
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Polimorfismos na região 5' UTR do gene NRAMP1 em equinos da raça pantaneira. Repositório Alice
OLIVEIRA, F. S.; WALKER, C. C.; SANTOS, S. A.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do.
O gene NRAMP1 (Natural Resistance Associated Macrophage Protein 1) foi identificado em várias espécies animais e está relacionado à resistência natural a patógenos intracelulares. Este trabalho teve por objetivo avaliar, via sequenciamento, polimorfismos existentes na região 5' não traduzida (UTR) deste gene.
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Patógenos intracelulares; Sequenciamento; Equinos; Melhoramento genético animal; Horses; Equidae; Animal genetics.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1057204
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Polimorfismos no éxon 3 do gene JY-1 e suas associações com probabilidade de prenhez precoce e características de crescimento em novilhas da raça Nelore. Repositório Alice
CAMARGO, G. M. F. de; CARDOSO, D. F.; FONSECA, P. D. da S.; BALDI, F.; REGITANO, L. C. de A.; TONHATI, H..
A probabilidade de prenhez precoce é uma característica importante devido ao alto valor econômico associado. Marcadores moleculares promovem diminuição do intervalo de gerações e aumento de ganho genético. A proteína JY-1 é uma proteína específica dos oócitos e atua nas células da granulosa e no desenvolvimento embrionário inicial. Marcadores moleculares foram usados para estudar o gene JY-1 e foram encontrados quatro polimorfismos do tipo SNP no éxon 3. As posições dos SNPs no referido éxon e as substituições são: 163 (T/C), 281(T/C), 321(T/C) e 679(T/C). O SNP 163 está em região codificante e causa substituição de uma prolina por uma leucina. Os demais SNPs estão em região 3?UTR. Os SNPs foram genotipados em 297 novilhas da raça Nelore. Os SNPs 163, 321...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Bos taurus indicus; Cromossomo 29; SNP; Sequenciamento.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/943059
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Potyvirus em patchouli no estado do Pará. Repositório Alice
BOARI, A. de J.; HAYASHI, E. A. I.; CARVALHO, T. P.; BONFIM, K.; KITAJIMA, E. W..
2014
Tipo: Resumo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Pogostemon cablin Benth.; Sequenciamento; Vírus; Patchouli.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1002622
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