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Análise do N-terminal da proteína capsidial de SCMV infectando milho e sorgo no Brasil. Infoteca-e
SOUZA, I. R. P. de; CARNEIRO, N. P.; GIOLITTI, F.; LENARDON, S. L.; SABATO, E. de O.; GOMES, E. A.; NODA, R. W.; SOUZA, F. A. de.
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Tipo: Boletim de Pesquisa e Desenvolvimento (INFOTECA-E) Palavras-chave: Sequenciamento; Fitopatologia.; Genética vegetal; Gene.; Potyvirus..
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/951986
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Avaliação de abordagens estatísticas para análise da expressão gênica diferencial em dados reais de RNA-seq Repositório Alice
SBARDELLA, A. P; FONSECA, I.; WELLER, M. A. DEL C. A.; STAFUZZA, N. B.; OLIVEIRA, J. R.; WATANABE, R. N.; COSTA, R, M. da; CARVAJAL, A. B.; SILVA, M. V. G. B.; MARTINS, M. F.; MUNARI, D. P..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Expressão diferencial; Bovinos de leite; Sequenciamento.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072447
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Avaliação e aplicação de métodos de genotipagem para estudo da síndrome da musculatura dupla em bovinos da raça Senepol. Repositório Alice
URQUIZA, A. da S. C..
Em várias raças de bovinos de corte é observada a síndrome da musculatura dupla, caracterizada pela presença do fenótipo de hipertrofia muscular, sendo esta uma condição hereditária e controlada pelo gene GDF-8 (Growth Differentiation Factor-8). Em bovinos da raça Senepol, a mutação nt821, localizada no exon III deste gene, é responsável por esta síndrome. Neste contexto, os objetivos deste trabalho foram avaliar três metodologias de genotipagem desta mutação, com o intuito de verificar qual a mais adequada em relação a custo/benefício e verificar a associação do alelo mutado com características de interesse econômico em touros jovens da raça Senepol. Foram extraídos DNA genômico de amostras biológicas de 17 bezerros, sendo sete com o fenótipo da...
Tipo: Teses Palavras-chave: Gene GDF-8; Sequenciamento; Selection; Hipertrofia muscular; Mutação; Seleção; Gado de corte; Fenotipo; Mutation; Sequence analysis.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1082405
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Bactérias endofíticas de pupunheira na promoção do desenvolvimento e crescimento de plantas: análise filogenética. Repositório Alice
BUGNHAKI, W. F.; DEGENHARDT, J.; SILVA, K. da; QUISEN, R. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Sequenciamento; 16S rRNA; Interação bactéria-planta; Bactris Gasipaes; Palmito; Pupunha.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1138170
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Bioinformática aplicada à agricultura. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H..
Este capítulo tem por objetivo colocar o leitor a par do estado da arte das principais aplicações da bioinformática na agricultura, particularmente àquelas relacionadas ao melhoramento genético animal e vegetal, executadas no âmbito da Embrapa.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Bioinformática; Sequenciamento; Melhoramento genético; Estudos de associação genômica ampla; Genome-Wide Association Studies; Polimorfismos de base única; Agricultura; Agriculture; Bioinformatics; Single nucleotide polymorphism.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1010705
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Caracterização de bactérias endofíticas isoladas do milho cultivado no agroecossistema cerrado. Repositório Alice
COELHO, V. T. S.; QUINTÃO, P. L.; PAOLI, H. C.; MELO, M. A. V.; LAGE, G. A.; FONSECA, P. C.; BRESSAN, W.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; FIGUEIREDO, J. E. F..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: SDS-PAGE; RAPD-PCR; RDNA; Sequenciamento; Taxinomia.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/485688
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Caracterização e expressão heteróloga em Escherichia coli dos homólogos em milho do gene OsPSTOL1 Repositório Alice
FERREIRA, N. F.; NEGRI, B. F.; SOUSA, S. M. de.
A baixa disponibilidade de fósforo (P) é um fator limitante para o aumento da produtividade do milho, uma vez que o P é um dos macronutrientes com menor e?ciência de uso pelas plantas. Sendo assim, modi?cações na morfologia do sistema radicular são importantes para aumentar a e?ciência na aquisição de P nas plantas. O gene PHOSPHORUS STARVATION TOLERANCE 1 (PSTOL1), codi?ca uma quinase que ao ser superexpressa em arroz aumenta o crescimento radicular e a aquisição de P e, consequentemente, a produtividade de grãos. O objetivo deste trabalho foi caracterizar funcionalmente os genes de milho, ZmPSTOL1_8.05, ZmPSTOL1_3.06 e ZmPSTOL1_8.02, homólogos ao OsPSTOL1. A clonagem e sequenciamento da região codi?cante possibilitaram a obtenção das sequências completas...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: E?ciência de fósforo; Quinase; Sequenciamento; Raiz.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1115014
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Colapso induzido pelo exercício em um Labrador Retriever Ciência Rural
Basso,Roberta Martins; Oliveira-Filho,José Paes de; Palumbo,Mariana Isa Poci; Zakia,Luiza Stachewski; Araújo Júnior,João Pessoa; Borges,Alexandre Secorun.
O colapso induzido pelo exercício (EIC) é uma enfermidade hereditária caracterizada por fraqueza muscular, dificuldade de locomoção e colapso após atividade física intensa. Esta enfermidade autossômica recessiva afeta principalmente cães jovens da raça Labrador Retriever e decorre da mutação c.767G>T no gene codificador da proteína dinamina 1 (DNM1). O objetivo deste trabalho é relatar o primeiro caso de EIC em Labrador Retriever no Brasil. O teste molecular para detectar a mutação responsável pela EIC confirmou o diagnóstico clínico em um Labrador Retriever com histórico de fraqueza muscular e colapso após exercício. Uma vez diagnosticada no Brasil, ressalta-se a importância de inserir a EIC entre os diagnósticos diferenciais das enfermidades...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report Palavras-chave: Exercício; Mutação; Cães; Sequenciamento; DNM1.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014000901629
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Decifrando o genoma. Repositório Alice
CARNEIRO, N. P.; CARNEIRO, A. A.; GUIMARAES, C. T.; PAIVA, E..
Os genes, unidades biologicas que determinam as caracteristicas de um organismo, estao contidos em moleculas de DNA presentes no nucleo das celulas. Portanto, o estudo do DNA e de fundamental importancia para o entendimento de como as caracteristicas de um organismo sao formadas. Com o grande avanco alcancado pelas tecnicas de Biologia molecular nas ultimas decadas, hoje, somos capazes de isolar e sequenciar moleculas de DNA de maneira rotineira. A partir da otimizacao das tecnicas de sequenciamento, surgiram programas com o objetivo de sequenciar genomas inteiros. atualmente, estao depositados em bancos de dados mais de 3 milhoes de sequencias de DNA e, grande parte delas ainda nao tem sua funcao conhecida. O processo de caracterizacao da funcao genica...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Sequenciamento; CDNA; DNA sequency.; Genoma.; Genome..
Ano: 2000 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/484108
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Descobertas de variantes envolvidas na ocorrência de hérnia escrotal em suínos pela análise do exoma. Repositório Alice
ROMANO, G. de S.; IBELLI, A. M. G.; PEIXOTO, J. de O.; CANTAO, M. E.; WEBER, T.; MORES, M. A. Z.; MORES, N.; PEDROSA, V. B.; COUTINHO, L. L.; LEDUR, M. C..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Doenças congênitas; Sequenciamento; Suinocultura; Genética Animal; Hérnia; Sus Scrofa Domesticus.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1116906
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Diversidade genética de Colletotrichum graminicola isolados da cultura do sorgo no ecossistema agrícola tropical revelada por SDS-PAGE, RAPD e análise da sequência do RDNA 18s e região intergênica 18s-28s Repositório Alice
PAOLI, H. C.; QUINTAO, P. L.; COELHO, V. T. S.; LAGE, G. A.; FONSECA, P. C.; FERREIRA, A. S.; CASELA, C. R.; GUIMARAES, C. T.; GOMES, E. A.; FIGUEIREDO, J. E. F..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: RDNA; RAPD-PCR; ARDRA; Sequenciamento; SDS-PAGE.
Ano: 2002 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/485693
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Identificação de variação no número de cópias em bovinos leiteiros usando dados de NGS. Repositório Alice
CHUD, T. C. S.; ZERLOTINI NETO, A.; CARMO, A. S. do; MUNARI, D. P.; SILVA, M. V. G. B..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bos primigenius indicus; Raça composta; Sequenciamento.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1072284
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Imunorreatividade da p53 associada à ausência de mutações no gene TP53 em linfomas caninos Ciência Rural
Calazans,Sabryna Gouveia; Rodigheri,Sabrina Marin; Fernandes,Simone Crestoni; Amorim,Reneé Laufer; Sequeira,Júlio Lopes; Sena,Janete Apparecida Desidério; Daleck,Carlos Roberto.
Sabendo-se da influência das mutações no gene TP53 no desenvolvimento das neoplasias e da discrepância entre os resultados obtidos pelas técnicas de sequenciamento e imunoistoquímica, esta pesquisa teve como objetivo relacionar a sequência do TP53 com a imunorreatividade da p53. Foram obtidas amostras de linfoma de 12 cães. O diagnóstico histopatológico foi determinado pela classificação de Kiel. O imunofenótipo e a imunomarcação da p53 foram determinados por imunoistoquímica. Para reação com a p53, utilizou-se anticorpo policlonal anti-p53 (CM1) na diluição de 1:500. A região do gene TP53 compreendida entre os exons quatro e nove foi amplificada por PCR e submetida ao sequenciamento. Apesar dos resultados obtidos pela imunoistoquímica, nenhuma mutação foi...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cão; Imunoistoquímica; Linfossarcoma; P53; Sequenciamento.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000600034
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Ocorrência da queima foliar causada por Phomopsis sp. em ariá no estado do Pará. Repositório Alice
CARVALHO, T. P.; BOARI, A. de J.; SILVA, C. B. T..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Ariá; Calathea allouia Lindl.; Sequenciamento; Queima das folhas; Queima foliar; Pará.; Fungo; Hortaliça..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1002709
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Polimorfismos na região 5' UTR do gene NRAMP1 em equinos da raça pantaneira. Repositório Alice
OLIVEIRA, F. S.; WALKER, C. C.; SANTOS, S. A.; JULIANO, R. S.; EGITO, A. A. do.
O gene NRAMP1 (Natural Resistance Associated Macrophage Protein 1) foi identificado em várias espécies animais e está relacionado à resistência natural a patógenos intracelulares. Este trabalho teve por objetivo avaliar, via sequenciamento, polimorfismos existentes na região 5' não traduzida (UTR) deste gene.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Patógenos intracelulares; Sequenciamento; Equinos.; Melhoramento genético animal.; Horses; Equidae; Animal genetics.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1057204
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Polimorfismos no éxon 3 do gene JY-1 e suas associações com probabilidade de prenhez precoce e características de crescimento em novilhas da raça Nelore. Repositório Alice
CAMARGO, G. M. F. de; CARDOSO, D. F.; FONSECA, P. D. da S.; BALDI, F.; REGITANO, L. C. de A.; TONHATI, H..
A probabilidade de prenhez precoce é uma característica importante devido ao alto valor econômico associado. Marcadores moleculares promovem diminuição do intervalo de gerações e aumento de ganho genético. A proteína JY-1 é uma proteína específica dos oócitos e atua nas células da granulosa e no desenvolvimento embrionário inicial. Marcadores moleculares foram usados para estudar o gene JY-1 e foram encontrados quatro polimorfismos do tipo SNP no éxon 3. As posições dos SNPs no referido éxon e as substituições são: 163 (T/C), 281(T/C), 321(T/C) e 679(T/C). O SNP 163 está em região codificante e causa substituição de uma prolina por uma leucina. Os demais SNPs estão em região 3?UTR. Os SNPs foram genotipados em 297 novilhas da raça Nelore. Os SNPs 163, 321...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Bos taurus indicus; Cromossomo 29; SNP; Sequenciamento.
Ano: 2012 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/943059
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Potyvirus em patchouli no estado do Pará. Repositório Alice
BOARI, A. de J.; HAYASHI, E. A. I.; CARVALHO, T. P.; BONFIM, K.; KITAJIMA, E. W..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Pogostemon cablin Benth; Sequenciamento; Patchouli.; Vírus..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1002622
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RNA-Seq para análise de genes diferencialmente expressos em micrósporos de trigo. Repositório Alice
BUENO, P.; LAU, E. Y.; BINNECK, E.; NHANI JUNIOR, A.; SCAGLIUSI, S. M. M..
Sendo o trigo (Triticum aestivum) uma das principais commodities agrícolas do mundo, técnicas de melhoramento genético são empregadas na busca contínua de melhores características agronômicas, nutricionais e de resistência a estresses bióticos e abióticos.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Sequenciamento; Recalcitrância à embriogênese; Triticum Aestivum.
Ano: 2021 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1132460
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Sobrevivência de Pantoea ananatis, agente causal da mancha branca do milho, em restos culturais de milho. Repositório Alice
SAUER, A. V.; FIGUEIREDO, J. E. F.; BABA, V. Y.; PEDRO, E. S; MEIRELLES, W. F.; PACCOLA-MEIRELLES, L. D..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Sequenciamento; Pinta branca do milho; Inoculo.; Palha..
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/868305
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Spinning gland transcriptomics from two main Clades of Spiders (Order: Araneae) - insights on their molecular, anatomical and behavioral evolution. Repositório Alice
PROSDOCIMI, P; BITTENCOURT, D.; SILVA, F. R. da; KIRST, M.; MOTA, P. C.; RECH, E. L..
Characterized by distinctive evolutionary adaptations, spiders provide a comprehensive system for evolutionary and developmental studies of anatomical organs, including silk and venom production. Here we performed cDNA sequencing using massively parallel sequencers (454 GS-FLX Titanium) to generate ~80,000 reads from the spinning gland of Actinopus spp. (infraorder: Mygalomorphae) and Gasteracantha cancriformis (infraorder: Araneomorphae, Orbiculariae clade). Actinopus spp. retains primitive characteristics on web usage and presents a single undifferentiated spinning gland while the orbiculariae spiders have seven differentiated spinning glands and complex patterns of web usage. MIRA, Celera Assembler and CAP3 software were used to cluster NGS reads for...
Tipo: Separatas Palavras-chave: Sequencia de DNA; Sequenciamento; Aranhas.
Ano: 2011 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/920286
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