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A simple and highly efficient Agrobacterium-mediated transformation protocol for Setaria viridis. Repositório Alice
MARTINS, P. K.; RIBEIRO, A. P.; DIAS, B. B. A.; KOBAYASHI, A. K.; MOLINARI, H. B. C..
Abstract: The production and use of sugarcane in Brazil is very important for bioenergy production and is recognized as one of the most efficient in the world. In our laboratory, Setaria viridis is being tested as a model plant for sugarcane. S. viridis has biological attributes (rapid life cycle, small genome, diploid, short stature and simple growth requirements) that make it suitable for use as a model system. We report a highly efficient protocol for Agrobacterium-mediated genetic transformation of S. viridis. The optimization of several steps in tissue culture allowed the rapid regeneration of plants and increased the rate of transformation up to 29%. This protocol could become a powerful tool for functional genomics in sugarcane
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Model system; C4 metabolism; Green millet; Cana de Açúcar; Bioenergia; Milho Verde; Genoma; Bioenergy; Sugarcane; Setaria viridis; Genomics.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1025487
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Análise funcional do gene órfão CcUNK8 de Coffea canephora via transformação genética de Setaria viridis. Repositório Alice
DUARTE, K. E..
O cafeeiro é um dos mais valiosos produtos primários no comércio mundial. Em razão dessa importância econômica, o cafeeiro vem sendo alvo de programas de melhoramento genético visando à introdução de novos caracteres para obtenção de plantas com características agronômicas superiores, por exemplo, com uma maior tolerância à seca. Porém, como melhoramento convencional do cafeeiro é demorado, o uso das últimas técnicas de genômica está sendo desenvolvido para acelerar a criação de novas plantas. Assim, o sequenciamento do genoma e, também, o sequenciamento em larga escala de genes expressos (RNAseq) torna-se algo necessário para analisar o determinismo genético da tolerância à seca e identificar genes candidatos (GCs) atuantes neste determinismo. No...
Tipo: Teses Palavras-chave: Expressão gênica; Gene órfão; Transformação genética; Resistência a seca; Seca; Coffea; Setaria viridis.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067194
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Avaliação funcional do promotor do gene AnatrC de Aspergillus nidulans na planta modelo Setaria viridis. Repositório Alice
VASCONCELOS, V. D. B..
A cana-de-açúcar tem um papel fundamental na economia do Brasil, pois contribui para o setor açucareiro e biocombustível. O bagaço da cana é uma rica fonte para a produção de bioetanol, um processo ainda inviável, em nível comercial, pelo custo benefício. Mas, com o desenvolvimento de alternativas viáveis para a degradação da parede celular da cana-de-açúcar sem a necessidade de altas temperaturas e ácidos fortes, poderia viabilizar economicamente a produção deste biocombustível, sem a necessidade de aumento da área de plantio. Uma das alternativas em estudo é a engenharia genética de plantas com a degradação controlada da parede celular, ao final do ciclo de produção. Desta forma, a identificação de promotores com indução regulada em plantas é...
Tipo: Teses Palavras-chave: Promotor atrC; Cana-de-açúcar; Setaria viridis; Sugarcane.
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1067200
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Effect of salinity stress in Setaria viridis (L.) P. Beauv. accession A10.1 during seed germination and plant development. Repositório Alice
FERREIRA, T. M. M.; SANTOS, M. de L.; LOPES, C. L.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T..
Setaria viridis (L.) P. Beauv. is a species proposed to be used as model plant in reverse genetics studies for the validation of gene function. Soil salinity is a recurring problem present in more than a 100 countries worldwide, and approximately 20% of the agricultural land in the world has saline and/or sodium soils. Saline stress affects all the main processes of the plant, such as germination, growth, and, consequently, the yield. The present study aimed at determining the tolerance levels of S. viridis A10.1 to saline stress and identify its potential as a model plant to validate salt-tolerance candidate genes/alleles as well as promoter sequences from salt-responsive genes. In an initial experiment, the seeds of the plant were sown on a germination...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Estresse abiótico; Agricultura biosalina; Salinidade; Germinação; Biotecnologia; Gene; Setaria viridis; Abiotic stress; Phenomics; Agricultural biotechnology; Salinity.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1127618
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MicroRNAs expression profiles in early responses to different levels of water deficit in Setaria viridis. Repositório Alice
DUARTE, K E. D.; BASSO, M. F.; OLIVEIRA, N. G. de; SILVA, J. C. F. da; GARCIA, B. de O.; DIAS, B. B. A.; CARDOSO, T. B.; NEPOMUCENO, A. L.; KOBAYASHI, A. K.; SANTIAGO, T. R.; SOUZA, W. R. de; MOLINARI, H. B. C..
Water deficit is a major constraint for crops of economic importance in almost all agricultural regions. However, plants have an active defense system to adapt to these adverse conditions, acting in the reprogramming of gene expression responsible for encoding microRNAs (miRNAs). These miRNAs promote the regulation to the target gene expression by the post-transcriptional (PTGS) and transcriptional gene silencing (TGS), modulating several pathways including defense response to water deficit. The broader knowledge of the miRNA expression profile and its regulatory networks in response to water deficit can provide evidence for the development of new biotechnological tools for genetic improvement of several important crops. In this study, we used Setaria...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Setária; Bioenergia; Abiotic stress; Drought; Bioenergy; Setaria viridis.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1149404
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Morphophysiological responses of Setaria viridis to cold stress. Repositório Alice
CARVALHO, C. G. I.; SANTOS, M. de L.; VIEIRA, L. R.; LOPES, A. M.; CARMONA, P. A. O.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T..
ABSTRACT - The objective of this work was to determine the suitability of Setaria viridis as a model plant in studies to validate candidate genes for cold tolerance by evaluating the response of two of its accessions to different durations of abrupt or gradual cold stress in the vegetative and reproductive stages. Plants of accessions A10.1 and Ast-1, cultivated at 25°C, were subjected to the following cold stress treatments: gradual reduction in temperature from 25 to 0°C, 5°C at a time, every 24 hours in a same chamber; or abrupt reduction in temperature, by transferring plants from a chamber at 25°C to another at 0°C. Plants were kept at 0°C for 3, 5, or 10 days, after which temperature was increased back again to 25°C; a control group remained at 25ºC....
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Estresse abiótico; Fluorescência; Troca gasosa; Biomassa; Frio; Setária; Abiotic stress; Cold stress; Cold tolerance; Gas exchange; Setaria viridis.
Ano: 2022 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1145723
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Responses os setaria viridis plants to saline stress. Repositório Alice
FERREIRA, T. M. F.; LOPES, C. L.; SOUSA, C. A. F. de; SOUZA JUNIOR, M. T..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Setaria viridis.
Ano: 2019 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1117547
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WATER USE EFFICIENCY, GROWTH AND YIELD OF WHEAT CULTIVATED UNDER COMPETITION WITH Setaria Planta Daninha
IHSAN,M.Z.; EL-NAKHLAWY,F.S.; ISMAIL,S.M..
ABSTRACT Understanding the critical period of weed competition is indispensable in the development of an effective weed management program in field crops. Current experiment was planned to evaluate the critical growth period ofSetaria and level of yield losses associated with delay in weeding in rain-fed drip irrigated wheat production system of Saudi Arabia. Field experiment was conducted to evaluate the effect of weeding interval (07-21, 14-28, 21-35, 28-42 and 35-49 days after sowing) and drought stress (75% and 50% of field capacity) on Setaria growth, wheat yield and water use efficiency. Season long weedy check and wellwatered (100% FC) plots were also maintained for comparison. Weeding interval and drought stress significantly (p ≤ 0.05) affected...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Weed control; Competition interval; Setaria viridis; Field capacity; Arid land.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-83582015000400679
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