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A genomewide association mapping study using ultrasound-scanned information identifies potential genomic regions and candidate genes affecting carcass traits in Nellore cattle. Repositório Alice
SANTANA, M. H. A.; GOMES, R. da C.; BONIN, M. N..
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Candidate genes; Genomewide association studies; Single nucleotide polymorphisms.; Bos Indicus.; Fat thickness; Ultrasonography..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1030961
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Análise de associação genômica ampla baseada em conjunto de genes: implementação em R. Repositório Alice
GUERREIRO, A. T.; HIGA, R. H..
O objetivo deste trabalho é a criação de um pacote R (R CORE TEAM, 2014) que implemente quatro diferentes métodos de GSEA no contexto de GWAS, considerando adaptações para aplicação em espécies animais de interesse para a agricultura.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Modelos mistos; Genome Wide Association Studies; Random forests; Mixed models; Single nucleotide polymorphisms..
Ano: 2014 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1009826
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Initial analysis of copy number variations in canchim beef cattle with extreme phenotypes for ribeye area. Repositório Alice
GIACHETTO, P. F.; PEREIRA, F. C. P.; MOKRY, F. B.; HIGA, R. H.; MUDADU, M. A.; SILVA, M. V.; NICIURA, S. C. M.; CARDOSO, F. F.; ALENCAR, M. M.; MEIRELLES, S. L. C.; LIMA, A. O.; REGITANO, L. C. A..
Genomic structural variation, in the form of large-scale insertions and deletions, as well as inversions and translocations, are referred to as copy number variations (CNVs). Compared to single nucleotide polymorphisms (SNPs), CNVs have potentially greater effects on gene structure, dosage and regulation, being an important source of phenotypic variation. In humans, CNVs are widespread in the genome and have been shown to be associated with complex traits. In livestock species, the characterization of this genetic variation is an important step toward linking genes or genomic regions with phenotypic traits of economic importance. Studies in cattle have revealed some CNVs associated with differences in host parasite resistance and breed-specific differences...
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Polimorfismo de nucleotídeo único; Bioinformática; Copy number variations; Single nucleotide polymorphisms.; Variação Genética.; Genetic variation; Bioinformatics..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/980708
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