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Aspectos introdutórios de um modelo baseado no indivíduo para estudo da dinâmica espacial do HLB do citros. Repositório Alice
SERVIDONE, G.; TERNES, S.; VILAMIU, R.; LARANJEIRA, F. F..
RESUMO - O Huanglongbing (HLB) é uma doença incurável que afeta plantas de citros em todo o país. Como o Brasil é um dos maiores produtores de citros do mundo, essa doença pode causar um grande impacto econômico na agricultura brasileira. Visando contribuir para novas estratégias de controle da doença, estão sendo realizados estudos focados na modelagem baseada no indivíduo (MBI) para avaliar a propagação espaço-temporal da doença em áreas de plantio com a presença de um novo hospedeiro alternativo mais atrativo. Este trabalho tem como objetivo desenvolver a estrutura computacional de um MBI, utilizando o software R e o pacote Shiny que possibilita executar as simulações via web, a partir de premissas e estudos biológicos prévios da doença. As simulações...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Modelagem baseada no indivíduo; Huanglongbing; Software R; R Shiny; Image recognition; Coffee production; Greening disease; Citrus; Artificial intelligence; Image analysis.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1055877
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Disseminando a aplicação do R-Shiny em métodos quantitativos e computação científica na web. Repositório Alice
ROCHA, B. F.; TERNES, S.; ROSSI, M..
Neste trabalho é apresentada uma alternativa para a disseminação via web de aplicações que envolvem técnicas de métodos quantitativos e computação científica, a ser usada por profissionais que não estão completamente familiarizados com linguagens de programação em seu cotidiano. Para tal, utilizando o software R e o pacote Shiny, ambas ferramentas open source, foi criada uma aplicação web para mostrar os resultados obtidos na avaliação da dinâmica de propagação da Anemia Infecciosa Equina (AIE), expressa por um sistema de equações diferenciais ordinárias previamente desenvolvidas. A aplicação web ofereceu melhor interação e maior facilidade no manuseio e na interpretação do modelo determinístico por profissionais de diversas formações, em especial os das...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Software R; Pacote Shiny; Anemia infecciosa equina; Aplicação web.
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/1038869
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Estimativas de variância genética aditiva em populações selecionadas e não-selecionadas via simulação Monte Carlo utilizando o software R Ciência e Agrotecnologia
Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Aquino,Luiz Henrique de.
Para disponibilizar um sistema de fornecimento de dados que objetivando-se subsidiar pesquisas de Melhoramento Genético Animal direcionadas à comparação de metodologias de avaliação genética, foi avaliado o comportamento da variância genética aditiva de populações selecionadas e não selecionadas, por seis gerações sucessivas, via simulação Monte Carlo. Por meio de um modelo genético aditivo, foram simuladas populações de 40 animais (20 machos e 20 fêmeas), sob seleção e acasalamento aleatório. Da geração zero até a quinta geração notou-se na população selecionada uma redução de 44,4% na variância genética aditiva, devido a um aumento de 11,58% no coeficiente de endogamia. Na população não selecionada a redução da variância genética aditiva foi menor...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Modelo genético aditivo; Simulação Monte Carlo; Variância genética aditiva; Software R.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000100039
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IPAgrIDados: tutorial para criação de cluster virtual R. Infoteca-e
NAKAI, A. M.; CORREA, J. L.; MACIEL, R. J. S..
Este documento exemplifica o uso da IPAgrIDados, apresentando o passo a passo da criação de um cluster virtual pré-configurado para processamento distribuído com o software R.
Tipo: Comunicado Técnico (INFOTECA-E) Palavras-chave: OpenStack; Software R; Software estatístico; Cluster Virtual; Computer software.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1101886
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Split double factorial with additional treatment and the post-harvest of Niagara grapes Ciência Rural
Cavalcanti,Pórtya Piscitelli; Ferreira,Eric Batista; Storti,Laís Brambilla.
ABSTRACTThis study aims to discuss and explain how to deal with the analysis of experiments conducted in completely randomized design (CRD) and subdivided into double factorial with additional treatment in the plot. In addition it was illustrate the discussion by analyzing data from an experiment on post-harvest of Niagara grapes. The sums of squares for each source of variation are presented, while discussing how the additional treatment affects the whole variation. Niagara grapes were treated in the pre-harvest with three preservatives (calcium chloride, calcium nitrate and calcium lactate) at 0%, 0.5%, 1% and 2% and stored for 0, 10, 20 and 30 days.All the preservatives evaluated at 0% represented the control (additional) treatment.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Analysis of variance; Software R; Experimental statistics.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015000901538
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Uso de modelos lineares mistos na avaliação genética de escores visuais: estudo de simulação Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Duitama,L.O.; Farah,M.M.; Utsunomiya,A.T.H.; Ono,R.K.; Pires,M.P.; Fonseca,R..
Objetivou-se avaliar a aplicação da metodologia de modelos lineares mistos em características de escores visuais por meio de simulação, considerando-se duas estruturas populacionais (com e sem seleção), dois níveis de herdabilidade (0,1 e 0,4) e quatro níveis de conectabilidade (8, 20, 38 e 60%). As populações com e sem seleção estavam constituídas por 6660 e 3360 animais, respectivamente, dos quais os últimos 2460 animais tinham fenótipo para o escore visual. Assumiu-se uma variável contínua adjacente ao escore visual, a partir da qual foram definidos os intervalos correspondentes a cada categoria de escore visual. O processo de simulação foi feito por meio do software R, e a estimação de parâmetros e predição de valores genéticos pelo software Wombat,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Gado de corte; Parâmetros genéticos; Software R.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352014000401139
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