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Bayesian inference in genetic parameter estimation of visual scores in Nellore beef-cattle Genet. Mol. Biol.
Faria,Carina Ubirajara de; Koury Filho,William; Magnabosco,Cláudio Ulhôa; Albuquerque,Lúcia Galvão de; Bezerra,Luiz Antônio Framartino; Lôbo,Raysildo Barbosa.
The aim of this study was to estimate the components of variance and genetic parameters for the visual scores which constitute the Morphological Evaluation System (MES), such as body structure (S), precocity (P) and musculature (M) in Nellore beef-cattle at the weaning and yearling stages, by using threshold Bayesian models. The information used for this was gleaned from visual scores of 5,407 animals evaluated at the weaning and 2,649 at the yearling stages. The genetic parameters for visual score traits were estimated through two-trait analysis, using the threshold animal model, with Bayesian statistics methodology and MTGSAM (Multiple Trait Gibbs Sampler for Animal Models) threshold software. Heritability estimates for S, P and M were 0.68, 0.65 and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Morphological traits; Threshold model; Genetic parameters; Nellore.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1415-47572009000400015
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Estimation of Heritability for Somatic Cell Score of Holstein Cows in Hokkaido OAK
三浦, 伸也; 鈴木, 三義.
(社)北海道酪農検定検査協会の検定日記録を用い,体細胞スコアに対する影響要因を明らかにし,遺伝率を推定した.データは北海道酪農検定検査協会により,1991年2月から2003年3月までに集積された初産の869,114頭からの8,986,351の検定日記録,2産は619,883頭(6,370,190記録),3産は409,320頭(4,194,475記録)に関する泌乳量と体細胞スコアである.体細胞スコアの上昇により,乳量,乳成分量は減少を示し,とくにスコア6以上で急激な減少を示した.体細胞スコアの遺伝率は,Wilminkの泌乳曲線を利用した反復率モデルで,初産〜3産まで0.08,0.07,0.07と推定され,産次間での大きな変動は認められなかった.ルシャンドル多項式を利用した変量回帰モデルを用いた遺伝率推定値は,Wilminkの関数により得られたものより高く,とくに分娩直後および,乾乳前において高く推定された.モデル内の次数を2次から5次まで変化させることによる大幅な遺伝率の変化は認められなかったので,計算時間等を考慮すると3次程度が妥当な次数と考えられる.閾値モデルによる推定遺伝率は分析の中ではもっとも高く推定され,その有効性が示唆されたが,これに関してはさらに実用的な見地からの研究が望まれる.
Palavras-chave: Somatic cell score; Heritability; Random regression; Threshold model; Holstein.
Ano: 2006 URL: http://ir.obihiro.ac.jp/dspace/handle/10322/2598
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Genetic correlations between visual slaughter conformation scores and growth and reproductive traits in Canchim cattle. Repositório Alice
BORBA, L. H. F.; REY, F. S. B.; FEITOSA, F. L. B.; SILVA, L. O. C. da; PEREIRA, A. S. C.; ALENCAR, M. M. de.
We obtained heritability and (co)variance component estimates for slaughter conformation scores at 420 days of age (SCS420), age at calving (first, AFC; second, ASC), calving occurrence until 38 months of age (CP38), weight at 420 days of age (W420), and scrotal circumference at 420 days (SC420) in Canchim (5/8 Charolais + 3/8 Zebu) cattle. A total of 23,168 records of Canchim animals, including 12,493 females and 10,675 males, were analyzed. SCS420 indicated carcass structure, muscle development, and subcutaneous fat deposition. The slaughter conformation score of each animal was relative to the whole contemporary group; 1 corresponded to the lowest expression of the trait and 6 to the highest. Heritabilities, and genetic and residual correlation...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Bayesian inference; Conformation score; Threshold model; Beef cattle; Heritability.
Ano: 2016 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1047612
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Genomic evaluation for novel stayability traits in Nellore cattle. Repositório Alice
RAMOS, P. V. B.; SILVA, F. F. e; SILVA, L. O. C. da; SANTIAGO, G. G.; MENEZES, G. R. de O.; VIANA, J. M. S.; TORRES JUNIOR, R. A. de A.; GONDO, A.; LUIZ F. BRITO.
Cow stayability plays a major role on the overall profitability of the beef cattle industry, as it is directly related to reproductive efficiency and cow's longevity. Stayability (STAY63) is usually defined as the ability of the cow to calve at least three times until 76 months of age. This is a late-measured and lowly heritable trait, which consequently constrains genetic progress per time unit. Thus, the use of genomic information associated with novel stayability traits measured earlier in life will likely result in higher prediction accuracy and faster genetic progress for cow longevity. In this study, we aimed to compare pedigree-based and single-step GBLUP (ssGBLUP) methods as well as to estimate genetic correlations between the proposed stayability...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Cow fertility; Genomic selection; Threshold model; Longevity; Reproductive traits.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1120235
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Modelos de limiar em regressão aleatória para avaliação genética da probabilidade de prenhez na raça Sindi. Repositório Alice
OLIVEIRA, L. T. de; MENEZES, G. R. de O.; SILVA, F. F. e; OLIVEIRA, H. R. de; VENTURA, H. T..
Objetivou-se estimar parâmetros genéticos para probabilidade de prenhez na raça Sindi em diferentes idades (15, 19, 23, 27, 31, 35, 39 e 43 meses, respectivamente denotadas por PP_15, PP_19, PP_23, PP_27, PP_31, PP_35, PP_39 e PP_43) via modelos de limiar em regressão aleatória. Foram utilizados polinômios ortogonais de Legendre de segunda, terceira e quarta ordem, considerando a homogeneidade e heterogeneidade de variância residual. Os componentes de covariância foram estimados via abordagem Bayesiana por meio do software THRGIBBS3F90. Foram incluídos os efeitos sistemáticos de criador, fazenda do criador, ano de nascimento, estação de nascimento e como covariável (linear) o peso da vaca na idade em que ela concebeu. Além desses efeitos, foram...
Tipo: Artigo em anais de congresso (ALICE) Palavras-chave: Correlação genética; Inferência bayesiana; Modelo threshold; Prenhez precoce; Bayesian inference; Early pregnancy; Threshold model; Gado Sindi; Genetic correlation.
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1077394
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Modelos linear e não linear em análises genéticas para sobrevivência de crias de ovinos da raça Santa Inês. Repositório Alice
SOUSA, W. H.; PEREIRA, C. S.; SILVA, F. L. R..
Resumo: Registros de sobrevivência do nascimento ao desmame de 3846 crias de ovinos da raça Santa Inês foram analisados por modelos de reprodutor linear e não linear (modelo de limiar), para estimar componentes de variância e herdabilidade. Os modelos usados para sobrevivência, analisada como característica da cria, incluíram os efeitos fixos de sexo, da combinação tipo de nascimento-criação da cria e da idade da ovelha ao parto, efeito da covariável peso da cria ao nascer e efeitos aleatórios de reprodutor, da classe rebanho-ano-estação e do resíduo. Componentes de variância para o modelo linear foram estimados pelo método da máxima verossimilhança restrita (REML) e para o modelo não linear por uma aproximação da máxima verossimilhança marginal (MML),...
Tipo: Artigo em periódico indexado (ALICE) Palavras-chave: Ovino; Herdabilidade; Sobrevivência; Modelo reprodutor; Modelo de limiar; Sheep; Survival; Heritability; Sire model; Threshold model.
Ano: 1999 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/handle/doc/931884
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