| Registro completo |
| Provedor de dados: |
PAB
|
| País: |
Brazil
|
| Título: |
Marcadores moleculares derivados de sequências expressas do genoma café potencialmente envolvidas na resistência à ferrugem
|
| Autores: |
Alvarenga,Samuel Mazzinghy
Caixeta,Eveline Teixeira
Hufnagel,Bárbara
Thiebaut,Flávia
Maciel-Zambolim,Eunize
Zambolim,Laércio
Sakiyama,Ney Sussumu
|
| Data: |
2011-08-01
|
| Ano: |
2011
|
| Palavras-chave: |
Coffea arabica
Hemileia vastatrix
Bioinformática
EST-PCR
Genes de resistência
Mineração de dados
|
| Resumo: |
O objetivo deste trabalho foi identificar marcadores moleculares relacionados à resistência do cafeeiro (Coffea arabica) à ferrugem (Hemileia vastatrix). Foram identificadas sequências de DNA potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças, por meio de análise "in silico", a partir das informações geradas pelo Projeto Brasileiro do Genoma Café. A partir das sequências mineradas, foram desenhados 59 pares de iniciadores para amplificá-las. Os 59 iniciadores foram testados em 12 cafeeiros resistentes e 12 susceptíveis a H. vastatrix. Vinte e sete iniciadores resultaram em bandas únicas e bem definidas, enquanto um deles amplificou fragmento de DNA em todos os cafeeiros resistentes, mas não nos suscetíveis. Esse marcador molecular polimórfico amplificou uma região do DNA que corresponde a uma janela aberta de leitura parcial do genoma de C. arabica que codifica uma proteína de resistência a doenças. O marcador CARF 005 é capaz de diferenciar os cafeeiros analisados em resistentes e susceptíveis a H. vastatrix.
|
| Tipo: |
Info:eu-repo/semantics/article
|
| Idioma: |
Português
|
| Identificador: |
http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0100-204X2011000800015
|
| Editor: |
Embrapa Secretaria de Pesquisa e Desenvolvimento
Pesquisa Agropecuária Brasileira
|
| Relação: |
10.1590/S0100-204X2011000800015
|
| Formato: |
text/html
|
| Fonte: |
Pesquisa Agropecuária Brasileira v.46 n.8 2011
|
| Direitos: |
info:eu-repo/semantics/openAccess
|
