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Problèmes de santé publique liés à la consommation de fruits de mer ArchiMer
Lupo, Coralie; Angot, J.-l..
Seafood could be a solution to meet global food demand that will double by 2050. Seafood includes a wide variety of edible marine organisms, except fish and mammals. These are molluscs, crustaceans, echinoderms and algae. Like any food, seafood can involve hazards transmitted to humans through food, which affect the health of the consumer. These hazards are both biological (viruses, bacteria, parasites) and chemical (toxins, allergens, chemicals, microplastics). The exposure of populations to these hazards through seafood consumption can be notably explained by their mode of production and the dietary habits. Firstly, the sanitary quality of products reflects the quality of the aquatic environment from which they are taken, which can be contaminated by...
Tipo: Text Palavras-chave: Crustacea; Food safety; Mollusca; Seaweed; Shellfish.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00656/76812/77984.pdf
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Les surmortalités des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas : acquis des recherches en 2010 ArchiMer
Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Soletchnik, Patrick; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Pernet, Fabrice; Bachere, Evelyne; Bedier, Edouard; Petton, Bruno; Gaussem, Florian; Stanisiere, Jean-yves; Degremont, Lionel.
Depuis 2008, la filière ostréicole française doit faire face à des surmortalités exceptionnelles des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas, (huîtres de moins d’un an) comprises entre 60 et 90% dans tous les sites d’élevage. Des cas de mortalité similaires ont été décrits en Irlande, dans les îles anglo-normandes, au Portugal en 2009 et au Royaume-Uni en 2010. Récemment deux épisodes de mortalité, associés à la présence d’un virus OsHV1 μvar (ou un variant très proche) ont été également décrits en Nouvelle Zélande (décembre 2010) et en Australie (janvier 2011) soulignant la vulnérabilité de la filière ostréicole dans le monde. L’objectif de ce document est de faire un point sur les recherches menées depuis l’apparition de ce phénomène et de...
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14423/11719.pdf
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Signalez par SMS les mortalités de vos huîtres ArchiMer
Lupo, Coralie; Dutta, Bhagat Lal; Osta Amigo, Axel.
Un outil de signalement des hausses de mortalité d’huîtres par SMS a été testé en Normandie entre le 1er juin et le 31 décembre 2016. Il localise, en temps quasi-réel, les regroupements spatio-temporels de mortalité d’huîtres, qui reflètent potentiellement un foyer infectieux. Cet outil permet de cibler les interventions telles que les prélèvements de coquillages à envoyer au laboratoire d’analyses diagnostiques, pour détecter rapidement une maladie émergente ou exotique dans les eaux françaises.
Tipo: Text
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00386/49779/50324.pdf
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Compte-rendu des journées de la surveillance de la santé des mollusques marins 2013 ArchiMer
Garcia, Celine; Francois, Cyrille; Renault, Tristan; Lupo, Coralie.
Les 12 et 13 novembre 2013, les journées de la surveillance de la santé des mollusques marins ont rassemblé les acteurs de la santé des mollusques marins (Ifremer, DGAl, DPMA, DDTM, CNC, CRC, laboratoires d'analyses agréés et reconnus, centres techniques). Les objectifs de cette réunion étaient de faire un bilan des activités 2013 du Laboratoire National de Référence (LNR), des réseaux de surveillance (REPAMO) et d'Observation (RESCO et réseaux de centres techniques).
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau Surveillance; Mollusques marins; Maladie; Organismes pathogènes; Détection.
Ano: 2013 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00170/28146/26371.pdf
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Contribution of Meat Inspection to the surveillance of poultry health and welfare in the European Union ArchiMer
Huneau-salaun, A.; Staerk, K. D. C.; Mateus, A.; Lupo, Coralie; Lindberg, A.; Le Bouquin-leneveu, S..
In the European Union, Meat Inspection (MI) aims to protect public health by ensuring that minimal hazardous material enters in the food chain. It also contributes to the detection and monitoring of animal diseases and welfare problems but its utility for animal surveillance has been assessed partially for some diseases only. Using the example of poultry production, we propose a complete assessment of MI as a health surveillance system. MI allows a long-term syndromic surveillance of poultry health but its contribution is lowered by a lack of data standardization, analysis and reporting. In addition, the probability of case detection for 20 diseases and welfare conditions was quantified using a scenario tree modelling approach, with input data based on...
Tipo: Text Palavras-chave: Animal welfare; Disease surveillance; Meat Inspection; Poultry.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00273/38472/37200.pdf
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Enhanced surveillance of shellfish mortality to improve early detection and investigation of outbreaks of exotic or emerging infectious diseases: An example of a mass mortality outbreak of mussels, France 2014 ArchiMer
Lupo, Coralie; Prou, Jean.
This paper explores the relevance and feasibility of enhanced surveillance of mussel-related mortality based on regular telephone interviews of a key informant in a farming community. Based on qualitative analyses of data collected through semi-structured interviews, this method of participatory disease surveillance enabled the retrieval of high quality data during an outbreak of mussel mortality which occurred in Pertuis Charentais, France, in 2014. The findings illustrated that such an enhanced surveillance approach compared with the institutional shellfish health surveillance system could improve the early detection of outbreaks of mussel mortality by one week. This approach enabled a detailed description of the outbreak, showing higher incidence...
Tipo: Text Palavras-chave: Early warning; Perception; Enhanced clinical surveillance; Shellfish diseases; Participative disease surveillance; Qualitative methods.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00348/45914/45708.pdf
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REPAMO. Bulletin de Surveillance. Janvier-Décembre 2020 ArchiMer
Canier, Lydie; Garcia, Celine; Lupo, Coralie.
Le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est le réseau de surveillance de l’état de santé des coquillages du littoral français mis en œuvre par l’Ifremer pour le compte du ministère chargé de l’agriculture. L’objectif du réseau est de  détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes émergents et/ou exotiques affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. La surveillance de la santé des coquillages, sauvages et d’élevage, est mise en œuvre au travers d’une approche d’épidémiosurveillance événementielle s’appuyant sur la déclaration obligatoire des hausses de mortalité de mollusques par les conchyliculteurs/pêcheurs auprès des Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM). Dès lors que les...
Tipo: Text
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00667/77876/80023.pdf
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Revue systématique de la littérature relative aux facteurs de risque de mortalité des moules exploitées en France ArchiMer
Lupo, Coralie; Le Bouquin, Sophie.
La recherche bibliographique maximalisée réalisée dans le cadre de cette revue systématique de la littérature a permis de décrire le paysage de la connaissance existante sur les facteurs de risque de mortalité des espèces de moules M. edulis et M. galloprovincialis. Ces travaux ont abouti à la formalisation d’une méthodologie rigoureuse, transparente et reproductible pour la réalisation de revue systématique relative aux facteurs de risque de mortalité chez les coquillages marins. Cette revue a décrit la diversité des définitions de la mortalité des moules et ses facteurs de risque. Elle a également permis d’apprécier la quantité et la qualité des preuves recensées. Cette revue systématique a recensé 125 facteurs étudiés pour leur relation avec la...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusques marins; Coquillages bivalves; Moules; Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Mortalité; Facteurs de risque; Epidémiologie; Revue systématique; Bibliographie; Marine molluscs; Bivalve shellfish; Mussels; Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Mortality; Risk factors; Epidemiology; Systematic review; Bibliography.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00487/59916/63099.pdf
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Bilan 2018 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins. REPAMO ArchiMer
Combette, Agnes; Canier, Lydie; Garcia, Celine; Lupo, Coralie.
Le réseau REPAMO est le réseau de surveillance de la santé des mollusques marins sauvages et d’élevage mis en place en 1992 et géré par Ifremer. Ce réseau assure une mission réglementaire (Directive Européenne 2006/88/CE) et une activité de service public déléguée par le Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation à travers la Direction Générale à l’Alimentation (DGAL). La surveillance assurée est une surveillance événementielle  basée sur les déclarations obligatoires de hausse de mortalité par les éleveurs et pêcheurs à pied auprès des Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM). En 2018 ont eu lieu 28 activations du réseau avec 24 prélèvements effectués et 4 prélèvements annulés. Parmi les prélèvements réalisés, 9 ont concerné les...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Mortalité; Maladie; Épidémiosurveillance.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00624/73651/73094.pdf
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Participatory case definition between stakeholders and implication for early detection: a case study of the oyster production in France ArchiMer
Lupo, Coralie; Osta Amigo, Axel; Marce, Clara; Prou, Jean.
Aquatic animal health surveillance is notably based on the observation of any increased shellfish mortality by shellfish farmers and its immediate mandatory notification to the local competent authority. According to current EU regulation, increased mortality is defined using a participatory approach: case reporting is based on individual farmer perception, which then can be turned into notification in cooperation between the farmer and the competent authority. All the challenge relies on starting from individual perception and knowledge of increased mortality to a collective alert onset informing potential control actions having a community interest. We made an inventory of the criteria used by surveillance stakeholders to define and detect increased...
Tipo: Text Palavras-chave: Aquatic animal surveillance; Mortality; Shellfish; Early warming surveillance; Case definition.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00195/30600/29057.pdf
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Défis de la surveillance des maladies chez les coquillages marins en France ArchiMer
Lupo, Coralie; Francois, Cyrille; Arzul, Isabelle; Garcia, Celine; Joly, Jean-pierre; Renault, Tristan.
The basic concepts and objectives of animal disease surveillance are common to all types of animal production. Yet, the procedures for implementation have been mostly developed for terrestrial animal productions. Disease surveillance in marine shellfish calls for specific measures in view of the peculiarities of marine biology and rearing techniques. The main objective of disease surveillance in marine shellfish is to detect as early as possible exotic and newly emerging diseases. With this objective in mind, a national surveillance network for surveillance of mollusc diseases called Repamo has been developed. It combines passive reporting and risk-based surveillance.
Tipo: Text Palavras-chave: Surveillance; Coquillage; Milieu marin; Détection précoce; Epidémiologie; Surveillance; Shellfish; Marine environment; Early detection.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00109/22023/19653.pdf
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Bilan 2013 du réseau Repamo - Réseau national de surveillance de la santé des mollusques marins ArchiMer
Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Lupo, Coralie; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Chollet, Bruno; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Dubreuil, Christine; Serpin, Delphine; Renault, Tristan; Cordier, Remy; Hebert, Pascale; Le Gagneur, Eric; Parrad, Sophie; Gerla, Daniel; Cheve, Julien; Penot, Julia; Le Gal, Dominique; Lebrun, Luc; Le Gac-abernot, Chantal; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Palvadeau, Hubert; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Robert, Stephane; Seugnet, Jean-luc; Rumebe, Myriam; Le Gall, Patrick; Bouchoucha, Marc; Baldi, Yoann; Masson, Jean-claude.
Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Repamo a pour objectif de détecter précocement les infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’étude des hausses de mortalités a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la collecte d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités d’huîtres creuses (Crassostrea gigas) (44 interventions) ont été recensées dans la majorité des bassins de production de mai à...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé.
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00197/30798/29167.pdf
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Modeling the Transmission of Vibrio aestuarianus in Pacific Oysters Using Experimental Infection Data ArchiMer
Lupo, Coralie; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Barthélémy, Clement; Beaunée, Gaël; Ezanno, Pauline.
Vibrio aestuarianus is a bacterium related to mortality outbreaks in Pacific oysters, Crassostrea gigas, in France, Ireland, and Scotland since 2011. Knowledge about its transmission dynamics is still lacking, impairing guidance to prevent and control the related disease spread. Mathematical modeling is a relevant approach to better understand the determinants of a disease and predict its dynamics in imperfectly observed pathosystems. We developed here the first marine epidemiological model to estimate the key parameters of V. aestuarianus infection at a local scale in a small and closed oyster population under controlled laboratory conditions. Using a compartmental model accounting for free-living bacteria in seawater, we predicted the infection dynamics...
Tipo: Text Palavras-chave: Marine epidemiology; Parameter estimation; Compartmental model; ABC method; Global sensitivity analysis; Basic reproduction number R-0; Crassostrea gigas; Oyster mortality.
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00495/60652/64148.pdf
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Comment améliorer la précocité de l'alerte en conchyliculture ? Exemple des mortalités de moules en 2014 dans les Pertuis Charentais ArchiMer
Lupo, Coralie; Prou, Jean.
Surveillance of shellf ish health is based on clinical surveillance of shellfish mortality, including a detection phase and a mandatory notification phase. While control measures are limited, early detection of pathogens is a challenge which needs to be met. The relevance and feasibility of an enhanced clinical surveillance based on phone interviews were studied. The results made it possible to reconstruct the spatial and temporal evolution of the outbreaks of mussel mortality which occurred in Pertuis Charentais in 2014. Moreover, a qualitative analysis of the interviews revealed contextual elements that were used to enhance the previous description and to devise causal scenarios which could be used as research hypotheses. By incorporating the...
Tipo: Text Palavras-chave: Coquillages; Moules; Investigation épidémiologique; Perception; Alerte précoce; Surveillance événementielle renforcée; Shellfish; Mussels; Epidemiological investigation; Perception; Early warning; Enhanced clinical surveillance.
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00270/38091/36237.pdf
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Sensitivity of mortality reporting by the French oyster farmers ArchiMer
Lupo, Coralie; Osta Amigo, Axel; Mandard, Y. V.; Peroz, C.; Arzul, Isabelle; Francois, Cyrille; Garcia, Celine; Renault, Tristan.
As diseased shellfish show only very seldom symptoms, any mortality event can be a disease suspicion. In theory, monitoring of mortality events in shellfish can thus provide a tool for early detection of infectious diseases in order to implement effective control measures. This consists in passive mortality event reporting by shellfish farmers to the local competent authority. Sensitivity of the detection of mortality events is a key quality indicator for this type of surveillance. Since 2008, increased mortality outbreaks occur in Pacific oysters Crassostrea gigas in France, leading to economic losses. It is important to evaluate how much the outbreaks have altered the quality indicators of the reporting system and if this modification is long-standing,...
Tipo: Text Palavras-chave: Early detection; Passive surveillance; Aquaculture; Capture-recapture methods.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00102/21343/18966.pdf
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Bilan 2019 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins. REPAMO ArchiMer
Canier, Lydie; Combette, Agnes; Lupo, Coralie; Garcia, Celine.
Le réseau REPAMO est le réseau de surveillance de la santé des mollusques marins sauvages et d’élevage du littoral Français, géré par Ifremer. Ce réseau assure une mission réglementaire (Directive Européenne 2006/88/CE) et une activité de service public déléguée par le Ministère de l’Agriculture et de l’Alimentation à travers la Direction Générale de l’Alimentation (DGAL). La surveillance assurée est une surveillance événementielle basée sur les déclarations obligatoires de hausse de mortalité des coquillages par les éleveurs et pêcheurs à pied auprès des Directions Départementales des Territoires et de la Mer (DDTM). Lorsqu’un évènement de mortalité est jugé anormal, des animaux sont prélevés et font l’objet d’analyses diagnostiques afin de rechercher la...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Mortalité; Maladie; Épidémiosurveillance.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00624/73652/73095.pdf
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REPAMO 2016. Bulletins de la surveillance. Janvier à juin et décembre 2016 ArchiMer
Osta Amigo, Axel; Robert, Stephane; Fleury, Elodie; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Geairon, Philippe.
Ce document compile l’ensemble des bulletins de la surveillance de la santé des mollusques marins émis au cours de l’année 2016 par le réseau REPAMO. Ces bulletins, édités à fréquence mensuelle, relatent les événements de mortalité notifiés au réseau ainsi que les résultats des analyses effectuées lors des prélèvements d’animaux réalisés sur les lieux des mortalités. Les bulletins sont diffusés aux instances professionnelles concernées (CRC, CNC, CDPMEM, CNPMEM, centres techniques), à la DGAL, à la DPMA, aux laboratoires d’analyses, à Ifremer ainsi que sur le site internet du REPAMO. Ils ont pour objectif de tenir les destinataires informés des épisodes de mortalités anormales de mollusques marins rencontrés sur le littoral français métropolitain et corse.
Tipo: Text Palavras-chave: REPAMO; Surveillance zoosanitaire; Mollusques marins; Mortalités.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00480/59210/61902.pdf
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Les huîtres sauvages sont-elles contaminées par le virus de l’herpes (OsHV-1 microvar) dans les pertuis charentais ? ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Lupo, Coralie; Robert, Stephane; Geairon, Philippe; Bernard, Ismael; Pepin, Jean-francois.
Tipo: Text
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00442/55354/56866.pdf
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Space-time clustering of mortality notifications in Pacific oysters of Charente sluices, France, 2008-2010 ArchiMer
Lupo, Coralie; Mandard, Yann-vari; Arzul, Isabelle; Francois, Cyrille; Garcia, Celine; Renault, Tristan; Bareille, Nathalie.
Current monitoring of exceptional mortality events of oysters in France consists in passive surveillance, leading to delayed investigation of causation by scientists and management by policy makers. Early detection of clusters of mortality events in time and space would increase possibilities for their investigation and management. A space-time cluster analysis of existing mortality notifications in Pacific oysters was conducted in France, Charente sluices, from 2008 to 2010. As an example of potential demographic confounder of clustering, the analyses were adjusted on oyster age. Several clusters were identified in space and time each studied year. Patterns of mortality notifications were consistent with the introduction and spread of a contagious disease...
Tipo: Text Palavras-chave: Notification; Oyster; Mortality; Cluster analysis; Saptiotemporal.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00058/16915/14393.pdf
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Stakeholders' perceptions, attitudes and practices towards risk prevention in the food chain ArchiMer
Lupo, Coralie; Wilmart, O.; Van Huffel, X.; Dal Pozzo, F.; Saegerman, C..
An online survey was conducted to describe stakeholders' perceptions, attitudes and practices towards risk prevention in the food chain and to explore if common features could be extracted from different fields of competency or groups of stakeholders. Out of 80 participants, 60% believed that pathogenic microorganisms were the main hazard to prevent. Twenty-four percent perceived climate change as the main risk factor. Seventy-three percent believed that hazards in the food chain are preventable and they often showed a positive attitude towards risk prevention measures. The opinion of 75% of stakeholders was that prevention measures should be compulsory and under the shared responsibility of both food business operators and competent authority....
Tipo: Text Palavras-chave: Risk perception; Animal health; Plant health; Food safety; Online survey; Web survey.
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00313/42396/41742.pdf
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