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Variabilidade genética de Colletotrichum guaranicola usando marcadores AFLP Acta Amazonica
Bentes,Jânia Lilia da Silva; Costa Neto,Pedro Queiroz.
Foi detectada a variabilidade genética de vinte isolados de Colletotrichum guaranicola (Albuq.) provenientes de diferentes localidades produtoras de guaraná no Amazonas, utilizando-se marcadores moleculares AFLP. Foi possível separar os isolados em dois grupos. O coeficiente de variação genética entre os isolados foi de 0,0216 e a similaridade genética foi de 94,95%, confirmando que os isolados pertencem à mesma espécie, no entanto, foi observada variabilidade intra-específica.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Antracnose; Guaranazeiro; Marcador molecular.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0044-59672011000200009
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IDENTIFICACIÓN DE QTLs ASOCIADOS A CARACTERES DE ARQUITECTURA VEGETAL EN YUCA (Manihot esculenta) Acta biol.Colomb.
MORA MORENO,Ruben Eduardo; SOTO,Johana Carolina; LÓPEZ,Camilo.
La yuca (Manihot esculenta) es el cuarto cultivo en importancia a nivel mundial como fuente de calorías para la población humana después del arroz, el azúcar y el maíz, posicionándose por esta razón como un cultivo primordial para la seguridad alimentaria. Su arquitectura ha sido considerada como un factor clave que subyace a la fisiología del rendimiento, relacionando características morfológicas con productividad. En este trabajo se evaluaron diferentes características de arquitectura vegetal en yuca. Los caracteres fueron evaluados en una población F1 compuesta por 133 hermanos completos (familia K) sembrados en dos lugares biogeográficamente diferentes: La Vega (Cundinamarca) y Arauca (Arauca) en Colombia. Las características evaluadas relacionadas con...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arquitectura vegetal; Grupo de ligamiento; Mapeo genético; Marcador molecular; QTLs; Yuca.
Ano: 2016 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2016000100010
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Mapeamento de QTL nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X em suínos: características de carcaça e qualidade de carne Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Paixão,D.M.; Carneiro,P.L.S.; Paiva,S.R.; Sousa,K.R.S.; Verardo,L.L.; Braccini Neto,J.; Pinto,A.P.G.; Hidalgo,A.M.; Nascimento,C. Souza do; Périssé,I.V.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F..
A realização do presente estudo teve como objetivo mapear Quantitative Trait Loci (QTL) de carcaça e qualidade de carne em uma população F2 de suínos desenvolvida pelo cruzamento de dois reprodutores da raça brasileira Piau com 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa de ligação para essa população foi construído após a genotipagem de 684 animais para 35 marcadores microssatélites. Os dados foram analisados pelo mapeamento por intervalo usando-se sexo, lote e genótipo halotano como efeitos fixos e peso de carcaça ao abate, peso da carcaça direita e idade ao abate como covariáveis. Um total de 18 QTLs foi encontrado; os QTLs para maior espessura de toucinho na região da copa, na linha dorsolombar, e a perda por cozimento foram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Suínos; Raça Piau; Marcador molecular; Microssátelites.
Ano: 2012 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352012000400026
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Detecção de locos de características quantitativas nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X de suínos: características de desempenho Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Paixão,D.M.; Braccini Neto,J.; Paiva,S.R.; Carneiro,P.L.S.; Pinto,A.P.G.; Sousa,K.R.S.; Nascimento,C. Souza do; Verardo,L.L.; Hidalgo,A.M.; Lopes,P.S.; Guimarães,S.E.F..
Mapeou-se quantitative trait loci (QTL) associados a características de desempenho nos cromossomos 1, 2, 3, 12, 14, 15 e X de suínos pertencentes a uma população F2, formada a partir do cruzamento entre dois machos da raça naturalizada brasileira Piau e 18 fêmeas comerciais (Landrace x Large White x Pietrain). O mapa genético de ligação da população foi construído após a genotipagem dos animais para 35 marcadores microssatélites. As estimativas do conteúdo de informação polimórfica indicaram que os marcadores microssatélites foram adequados para as análises de QTL. Os dados foram analisados pelo mapeamento por intervalo usando-se o programa GridQTL. Encontraram-se seis QTL, sendo que o QTL genômico para idade ao abate atingiu a significância de 5% de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Raça Piau; Marcador molecular; Nível genômico; Suíno.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352013000100031
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Relação entre polimorfismo do gene do hormônio do crescimento e características de precocidade em novilhas da raça Nelore Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Andrea,M.V; Gomes,M.V.M; Marcondes,C.R; Oliveira,K.N; Ramos,E.S; Fonteles,S.B.
Avaliaram-se as relações entre o polimorfismo do gene do hormônio do crescimento (GH) e as características de precocidade, em novilhas da raça Nelore. Amostras de sangue periférico foram obtidas de 181 animais de três rebanhos distintos do estado da Bahia, nas quais foi realizada a extração de DNA e a amplificação por PCR, seguidas por digestão com enzima de restrição AluI. Os fragmentos resultantes da digestão enzimática foram analisados em gel de agarose 2% para determinação dos respectivos genótipos. A frequência do alelo Leu nas amostras analisadas foi estimada em 100%. Em decorrência da alta incidência de homozigose para o alelo Leu, sugere-se que o restriction fragment lenght polymorphism AluI do gene GH não possa ser considerado como marcador...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bovino de corte; Marcador molecular; Precocidade.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352011000100023
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Detecção de QTL em dados de famílias estruturadas como as de um núcleo MOET por meio do método da regressão Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Peixoto,M.G.C.D.; Martinez,M.L.; Teodoro,R.L.; Machado,M.A.; Carvalho,M.R.S.; Gomes,F.C.; Verneque,R.S..
O objetivo deste trabalho foi avaliar a eficiência do método de regressão em detectar QTL com base na utilização de dados da estrutura de família (irmãos completos e meios-irmãos), como aqueles gerados em um núcleo MOET. Foram simulados dados fenotípicos e genotípicos em uma estrutura de núcleo MOET fechado de seleção. Três arquivos foram analisados, contendo: a) informações conjuntas de irmãos completos e meios-irmãos; b) apenas informações de irmãos completos e c) apenas informações de meios-irmãos. Verificou-se que o método da regressão, para dados discretos ou contínuos, foi capaz de detectar associações entre marcador e QTL em níveis bastante expressivos de significância (P<0.001 e P<0,0001), quando se utilizou o arquivo que continha informações...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: QTL; Poder de detecção; Marcador molecular; Estrutura de família.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352009000400024
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Comparação de metodologias de seleção sob oscilação genética Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Carneiro,P.L.S.; Malhado,C.H.M.; Affonso,P.R.A.M.; Euclydes,R.F.; Carneiro,A.P.S.; Cunha,E.E.; Souza,L.G.R..
Determinou-se o número adequado de repetições na comparação de métodos de seleção tradicionais e associados a marcadores moleculares, com diferentes tamanhos efetivos e sob diferentes sistemas de acasalamento dos reprodutores selecionados, usando simulação com o programa GENESYS. Para comparar os diferentes métodos de seleção utilizaram-se populações com tamanhos efetivos de 18,18 (TE1) e de 66,66 (TE2) e uma, 10 e 30 repetições por geração, avaliando-se os valores fenotípicos médios. Para as situações com apenas uma repetição, os resultados apresentaram incoerências, independentemente do tamanho efetivo (TE1 ou TE2) ou do sistema de acasalamento (RAA - reprodutores acasalados aleatoriamente, EIC - exclusão de irmãos completos ou EICMI - exclusão de irmãos...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: BLUP; Marcador molecular; Tamanho efetivo de população; Sistema de acasalamento.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352008000400024
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Mapeo de loci de caracteres cuantitativos (QTL) usando un enfoque multivariado Ciencia e Investigación Agraria
Mora,Freddy; Santos,Alexandra I; Scapim,Carlos A.
Los procedimientos usados en el mapeo de loci de característica cuantitativa (QTL) son continuamente estudiados ya que son fundamentales para mejorar la precisión del análisis genético. El presente estudio tuvo como objetivo examinar QTLs a través de métodos muí ti variados, considerando el principio de mapeo por intervalo simple. Se simuló un conjunto de datos de marcadores moleculares microsatélites provenientes de una población F2. Al mismo tiempo se consideró que los QTLs controlan características de distribución normal y binomial. En el caso normal se consideraron cinco modelos con las siguientes estructuras de covarianzas residuales: Componentes de varianza (VC), simetría compuesta (CS), no estructurada (UN), diagonal principal (Banded Main Diagonal;...
Tipo: Journal article Palavras-chave: Análisis multivariado; Binario; Ecuaciones generalizadas; Marcador molecular; Mejoramiento genético; QTL.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.cl/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0718-16202008000200003
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Seleção de clones de batata com resistência múltipla à pinta preta e aos vírus X e Y Ciência Rural
Neder,Diogo Gonçalves; Pinto,César Augusto Brasil Pereira; Melo,Dheyne Silva; Lepre,Andre Luiz; Peixouto,Leandro dos Santos.
O objetivo do presente trabalho foi selecionar clones de batata com elevado desempenho agronômico e resistência à pinta preta e aos vírus X e Y. Para tanto, foram realizados 57 cruzamentos entre clones portadores dos alelos Ry adg e Rx1, e a cultivar 'Chiquita', resistente à pinta preta (Alternaria solani). Na safra das águas de 2004, 57 famílias clonais foram avaliadas em campo e 331 clones selecionados considerando a aparência de tubérculos. Desse total de clones, avaliados em mais dois experimentos no verão de 2005, 180 foram selecionados por meio do marcador SCAR RYSC3 como portadores do alelo Ry adg,. Também foram realizadas uma avaliação de desempenho agronômico na safra de inverno de 2006 e uma avaliação de resistência à pinta preta nas safras de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Avaliação agronômica; Marcador molecular; Resistência genética; Potato virus X; Potato virus Y; Alternaria solani.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782010000800005
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Estimativa da similaridade genética e identificação de cultivares do morangueiro por análise de RAPD Horticultura Brasileira
Conti,José Henrique; Minami,Keigo; Gomes,Luiz Humberto; Tavares,Flavio Cesar A..
Caracteres moleculares do morango foram avaliados para conhecer cultivares que estão sendo introduzidas no Brasil. Utilizou-se o método do polimorfismo de DNA amplificado ao acaso (RAPD). Os caracteres moleculares com maior poder de discriminação foram os "marcadores" gerados pelos "primers" Operon B8, Operon B19 e Operon G5, que foram eficientes para discriminar as vinte e seis cultivares estudadas. Os dados foram interpretados com o auxílio de dendograma, mapa de bandas, quadro de identificação e chave dicotômica. Foi possível distinguir seis grupos de similaridade, dois deles com cultivares selecionadas no Brasil, sendo um com 'Campinas', 'Agf 80', 'Piedade', 'Jundiaí' e 'Monte Alegre' e o outro com 'Obaira' e 'Mantiqueira'; três grupos com cultivares...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fragaria X ananassa Duch.; Marcador molecular; Germoplasma.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362002000200005
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Caracterização e diversidade genética de cultivares de morangueiro Horticultura Brasileira
Radmann,Elizete Beatriz; Bianchi,Valmor João; Oliveira,Roberto P. de; Fachinello,José Carlos.
O objetivo deste trabalho foi caracterizar a diversidade genético-molecular, por marcadores RAPD, das dez principais cultivares de morangueiro utilizadas no País: Aromas, Bürkley, Camarosa, Campinas, Dover, Milsei-Tudla, Oso Grande, Santa Clara, Sweet Charlie e Vila Nova. O DNA foi extraído de folhas maduras, as análises RAPD foram realizadas com 26 primers e os produtos de amplificação separados por eletroforese. O coeficiente de Dice foi utilizado para estimar a similaridade genética entre as cultivares e o método UPGMA para gerar o fenograma por meio do NTSYS. Houve amplificação de fragmentos consistentes com 19 primers, tendo sido encontrado polimorfismo em 14. Dos 116 fragmentos gerados, 84 foram polimórficos. As cultivares foram classificadas em dois...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Fragaria x ananassa Duch.; RAPD; Fingerprint; Marcador molecular.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-05362006000100017
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Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite: resultados do Teste de Progênie, do Arquivo Zootécnico Nacional e do Núcleo MOET. Infoteca-e
Este documento vem sendo, anual e regularmente, publicado desde 2000, como fruto de um esforço conjunto da coordenação do Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite (PNMGuL), apoiada por parceiros de distintas instituições nacionais de ensino e pesquisa e de diversas fazendas leiteiras colaboradoras do teste de progênie. Esta interação fortalece e estimula todos os envolvidos a dar continuidade à iniciativa, para tão somente valorizar este importante recurso genético tropical por meio de seu melhoramento genético para objetivos específicos de seleção. Nesta edição, está disponível o mérito genético de 765 touros e 586 matrizes da raça Guzerá na forma de classificação (ranking) para leite, além de seus constituintes (gordura, proteína e sólidos...
Tipo: Livros Palavras-chave: ABCZ; Bos taurus indicus; Bovino de leite; Bovinos de leite; Gado de leite; Guzerá; Melhoramento genético; Núcleo MOET; Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá; Raça Guzerá; Zebuíno; Zebus; Marcador molecular; Melhoramento; Melhoramento genético animal; Teste de progenie.
Ano: 2021 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1132854
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Alchemy Web: uma proposta de interface gráfica para o Sistema Alchemy. Infoteca-e
NARCISO, M. G.; VALDISSER, P. A. M. R.; BENÍCIO, C. G.; BORBA, T. C. de O.; BRONDANI, C.; VIANELLO, R. P..
A Embrapa Arroz e Feijão utiliza a plataforma de genotipagem BeadXpress Reader (Illumina), que utiliza a fluorescência como método de detecção. A interface gráfica foi construída utilizando-se a linguagem JavaScript. Para exemplificar o acesso e o uso do Alchemy Web, foram utilizados dados obtidos em feijoeiro comum (Phaseolus vulgaris L.), no Laboratório de Biotecnologia da Embrapa Arroz e Feijão, através da plataforma BeadXpress (Illumina).
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Software; Interface gráfica; Marcador molecular.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/984524
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Validação de marcadores moleculares para introgressão da característica nervura marrom (bmr6) em linhagens de sorgo biomassa utilizando retrocruzamento assistido. Infoteca-e
DAMASCENO, C. M. B.; PARRELLA, R. A. da C.; RODRIGUES, J. A. S.; SCHAFFERT, R. E..
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Genética; Marcador molecular; Recurso energético.
Ano: 2012 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/953124
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Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite: resultados do Teste de Progênie, do Programa de Melhoramento Genético de Zebuínos da ABCZ e do Núcleo MOET. Infoteca-e
BRUNELI, F. A. T.; PEIXOTO, M. G. C. D.; SANTOS, G. G. dos; ARBEX, W. A.; PENNA, V. M.; ZADRA, L. E. F.; JOSAHKIAN, L. A.; VERNEQUE, R. da S.; MACHADO, M. A.; PANETTO, J. C. do C.; LÔBO, R. B.; CARVALHO, M. R. S..
O Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá para Leite é um trabalho executado pela Embrapa Gado de Leite e pelo Centro Brasileiro de Melhoramento Genético do Guzerá. Ele envolve a participação de diversos órgãos públicos e privados. Esse Programa tem como base a integração de modernas ferramentas do melhoramento animal para imprimir rapidez e confiabilidade à seleção. A importância econômica das diversas características avaliadas e apresentadas neste sumário é muito diferente nos diversos nichos de mercado e sistemas em que a raça é utilizada. Optou-se por apresentar avaliações para o maior número possível de características para que cada produtor escolha as que são adequadas e importantes para seu objetivo particular e utilize informações confiáveis em...
Tipo: Livros Palavras-chave: ABCZ; Bos taurus indicus; Bovino de leite; Bovinos de leite; Gado de leite; Guzerá; Melhoramento genético; Núcleo MOET; Programa Nacional de Melhoramento do Guzerá; Raça Guzerá; Zebuíno; Zebus; Marcador molecular; Melhoramento; Melhoramento genético animal; Teste de progenie.
Ano: 2018 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1091136
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Diversidade genética estimada através de marcadores ISSR de Colletotrichum graminicola no Brasil. Infoteca-e
COSTA, R. V. da; SILVA, D. D. da; COTA, L. V.; PARREIRA, D. F.; ZAMBOLIM, L.; GOMES, E. A.; LANA, U. G. de P.; NEVES, W. dos S.; FIGUEIREDO, J. E. F..
A antracnose do milho causada pelo fungo Colletotrichum graminicola é uma das principais doenças da cultura no Brasil e no mundo, atacando praticamente todas as partes da planta. Neste trabalho foi avaliada a variabilidade genética de 95 isolados monospóricos de C. graminicola, provenientes dos estados brasileiros de Goiás, Minas Gerais, Santa Catarina, São Paulo, Paraná e Rio Grande do Sul. O DNA de cada isolado foi amplificado via PCR, utilizando-se 15 primers ISSR (do inglês, inter-simpled sequence repeat) como marcadores moleculares. Os fragmentos de DNA gerados pelo PCR-ISSR foram avaliados por eletroforese em gel de agarose com a visualização da posição das bandas formadas nos géis. Do total de 15, nove primers foram selecionados em função do maior...
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Variabilidade genética; UPGMA; Marcador molecular; Antracnose; Zea mays; Doença de planta; Plant diseases and disorders; Anthracnose.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/1012069
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BIOTECNOLOGIA. Infoteca-e
Tipo: Folders Palavras-chave: Marcador molecular; Genética.
Ano: 2004 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/489399
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Perspectivas do uso de marcadores moleculares no aumento da eficiência do uso de reprodutores caprinos e ovinos em centrais de inseminação artificial. Infoteca-e
ELOY, A. M. X..
Tipo: Teses Palavras-chave: Caprino; Ovino; Marcador molecular; Seleção genética.
Ano: 2009 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/962293
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Um estudo comparativo de softwares para alinhamento e detecção de Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs). Infoteca-e
NARCISO, M. G.; RODRIGUES, A. M.; CIESLAK J. F.; SILVEIRA, R. D. D.; VIANELLO, R. P.; BRONDANI, C..
Introdução. Materiais e Métodos. Resultados e Discussão. BWA e SAMtools. Bowtie2 e SAMtools. Panati. Mosaik. VarScan. GATK. CLC Genomics. Tempo de execução do software. Resumo sobre cada software. Conclusões. Referências.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Software; Alinhamento de sequencia; Detecção de SNPs; Marcador molecular; Polimorfismo genético; Marcador genético.
Ano: 2014 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/990798
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Otimização dos microssatélites DIK4755, INRA192 e DIK4913 em multiplexes. Infoteca-e
BENAVIDES, M. V..
Descrição sucinta da técnica; Caracterização; Impactos esperados.
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Marcador molecular.
Ano: 2010 URL: http://www.infoteca.cnptia.embrapa.br/infoteca/handle/doc/884044
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