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Registros recuperados: 11 | |
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Rodríguez Fuerte,Verónica; Marín Montoya,Mauricio; Morales Osorio,Juan Gonzalo; Cotes Torres,José Miguel; Gutiérrez Sánchez,Pablo Andrés. |
Con el fin de contribuir a un mejor conocimiento de los mecanismos que rigen la interacción entre Solanum phureja Juz. et. Buk. y Spongospora subterranea (Wallr.) Lagerh, agente causal de la sarna polvosa de la papa, se realizó en esta investigación el análisis del transcriptoma de dos cultivares: Criolla Colombia (susceptible) y Criolla Latina (tolerante), mediante pirosecuenciación 454. Los resultados indicaron diferencias entre los genes sobreexpresados en cada cultivar ante la infección con el patógeno. En el cultivar susceptible, la respuesta ocurre a partir de la activación transcripcional de genes asociados a la integridad de la pared celular, transducción de señales y genes involucrados en la respuesta a diferentes tipos de estrés. Los genes que... |
Tipo: Journal article |
Palavras-chave: NGS; PCR en tiempo real; Sarna polvosa; Transcriptoma. |
Ano: 2014 |
URL: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1010-27522014000100003 |
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Corrales-Cabra,Eríka; Higuita,Mónica; Restrepo,Andrea; Gallo,Yuliana; Gutiérrez,Pablo; Marín,Mauricio. |
Resumen La uchuva es una de las frutas promisorias para la zona andina de Colombia gracias a su alta demanda internacional. En Antioquia, su siembra se concentra en el oriente, aunque otras subregiones como el norte y suroeste presentan condiciones óptimas para su cultivo. Ya que las enfermedades de origen viral son uno de los problemas emergentes de este frutal, en este estudio se evaluó la infección de virus de RNA que infectan los cultivos de uchuva en el suroeste de Antioquia. Para esto se utilizaron pruebas de RT-qPCR en muestras foliares de plantas sintomáticas y asintomáticas obtenidas en ocho lotes, así como en ocho muestras de semillas extraídas de frutos comercializados en esta subregión. Los resultados indicaron la presencia en al menos una... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Certificación de semilla; Fitopatología; PCR en tiempo real; Solanaceae; Virus de plantas. |
Ano: 2022 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122022000100088 |
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GIRALDO RAMÍREZ,Susana; SIERRA MEJÍA,Andrea; OSPINA ORTIZ,María Isabella; HIGUITA VALENCIA,Mónica; GALLO GARCÍA,Yuliana; GUTIÉRREZ SÁNCHEZ,Pablo Andrés; MARÍN MONTOYA,Mauricio. |
RESUMEN La papa criolla es uno de los principales productos agrícolas de la región Andina de Colombia. Este cultivo es afectado por diferentes enfermedades de origen viral, siendo los virus PYVV, PVS, PLRV y PVV algunos de los agentes causales más importantes. Con el fin de aportar nueva información al conocimiento del viroma de la papa criolla en Colombia, en este estudio se utilizó secuenciación de alto rendimiento (HTS) y RT-PCR cuantitativa (RT-qPCR) para la detección y caracterización molecular del Potato virus B (PVB), a partir de muestras de tejido foliar de plantas procedentes de diferentes lotes de papa criolla en Antioquia. Mediante análisis bioinformáticos fue posible el ensamblaje de la mayor parte del genoma de PVB, consistente de dos... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Fitopatología; Nepovirus; Secuenciación de nueva generación; PCR en tiempo real; Virus de plantas. |
Ano: 2022 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2022000200258 |
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GARCÍA BASTIDAS,NEVAR; GONZALO MORALES,JUAN; GONZÁLEZ JAIMES,PAOLA; GUTIÉRREZ,PABLO ANDRÉS; MARÍN MONTOYA,MAURICIO. |
La sarna polvosa de la papa (Solanum tuberosum, S. phureja) causada por Spongospora f. sp. subterranea (Sss), es una de las enfermedades más limitantes de este cultivo. En Colombia, se han empleado diferentes métodos de detección asintomática de Sss, incluyendo bioensayos con plantas señuelo, PCR de ITS y pruebas de ELISA. Sin embargo, sus niveles de sensibilidad son bajos o requieren tiempos extensos. Una alternativa para complementar dichas herramientas es la PCR cuantitativa en tiempo real (qPCR). En este trabajo se evaluó dicha técnica utilizando los juegos de cebadores SsTQF1-SsTQR1; Spon421F-Spon494R y SscolF-SscolR (diseñados en este estudio), bajo la metodología de SYBR Green®; mientras que con Taqman® se evaluaron los cebadores SponFSponR y la... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: PCR en tiempo real; Sarna polvosa; Solanum phureja; Solanum tuberosum. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-548X2013000100009 |
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Davies,Carolina; Poma,Ramiro Hugo; Marino Cardozo,Rubén; Mora,María Celia; Ramos,Federico; Rajal,Verónica Beatriz; Basombrío,Miguel Ángel. |
El objetivo del presente trabajo fue comparar la detección de ADN de Trypanosoma cruzi mediante PCR en tiempo real (qPCR) y PCR convencional en sangre periférica (n=25) y músculo esquelético (n=20) de ratones tratados con drogas tripanomicidas luego de 6 meses post-tratamiento. En las muestras de sangre se detectaron un total de 7 positivas por qPCR, mientras que por PCR convencional sólo se detectaron 2. En músculo esquelético, 15 muestras fueron positivas por qPCR y 3 por PCR convencional. Los resultados obtenidos demuestran que la fuerza de concordancia es débil entre las técnicas de PCR utilizadas para la detección de ADN de T. cruzi (k=0,37; 49% positivas por qPCR vs. 11% por PCR convencional, p=0,0001). En las muestras de sangre, los valores... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: PCR convencional; PCR en tiempo real; Ratones; Carga parasitaria; Sangre periférica; Músculo esquelético; Trypanosoma cruzi. |
Ano: 2014 |
URL: http://www.scielo.org.ar/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0325-29572014000400004 |
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García Espinoza, Jesús Antonio. |
Los esteroles son compuestos que los nematodos fitopatógenos son incapaces de sintetizar y que deben obtenerlos de su hospedante. Los genes SS y CAS codifican las enzimas escualeno sintasa y cicloartenol sintasa, respectivamente, que son clave en la síntesis de esteroles en chile. Este trabajo tuvo por objetivos, comparar la expresión de ambos genes mediante PCR en tiempo real, en la interacción compatible CM-334-Nacobbus aberrans y en la incompatible CM-334-Meloidogyne incognita, a los 2, 7, 14, 21 y 28 días después de la inoculación (ddi), así como cuantificar el número de nematodos por raíz a los 2, 7, 14, 21, 28, 35 y 42 ddi. N. aberrans completó su ciclo de vida a los 42 ddi e indujo la sobreexpresión de SS y CAS hasta dos veces más que el testigo; su... |
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Palavras-chave: Capsicum annuum; Cicloartenol sintasa; Escualeno sintasa; Nematodos agalladores; PCR en tiempo real; Cycloartenol synthase; Real-time PCR; Root-knot nematodes; Squalene synthase; Maestría; Fitopatología. |
Ano: 2011 |
URL: http://hdl.handle.net/10521/492 |
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García Espinoza, Jesús Antonio. |
Los esteroles son compuestos que los nematodos fitopatógenos son incapaces de sintetizar y que deben obtenerlos de su hospedante. Los genes SS y CAS codifican las enzimas escualeno sintasa y cicloartenol sintasa, respectivamente, que son clave en la síntesis de esteroles en chile. Este trabajo tuvo por objetivos, comparar la expresión de ambos genes mediante PCR en tiempo real, en la interacción compatible CM-334-Nacobbus aberrans y en la incompatible CM-334-Meloidogyne incognita, a los 2, 7, 14, 21 y 28 días después de la inoculación (ddi), así como cuantificar el número de nematodos por raíz a los 2, 7, 14, 21, 28, 35 y 42 ddi. N. aberrans completó su ciclo de vida a los 42 ddi e indujo la sobreexpresión de SS y CAS hasta dos veces más que el testigo; su... |
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Palavras-chave: Capsicum annuum; Cicloartenol sintasa; Escualeno sintasa; Nematodos agalladores; PCR en tiempo real; Cycloartenol synthase; Real-time PCR; Root-knot nematodes; Squalene synthase; Maestría; Fitopatología. |
Ano: 2011 |
URL: http://hdl.handle.net/10521/492 |
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Registros recuperados: 11 | |
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