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Variabilidade genética em um ensaio de progênies de erva- mate (Ilex paraguariensis St.Hil.) Ciência Rural
Vidor,Mario Angelo; Ruiz,César Pérez; Moreno,Santiago Vázquez; Floss,Paulo Alfonso.
A Epagri (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina S.A) possui uma das maiores coleções brasileiras de erva-mate (Ilex paraguariensis St.Hil.). A partir de ensaios agronômicos preliminares, apresentaram destaque as procedências Barão de Cotegipe e Água Doce. O objetivo deste trabalho foi o de caracterizar geneticamente a variabilidade existente nos germoplasmas oriundos destas procedências. A técnica utilizada foi a de marcadores moleculares para amplificar o DNA, do tipo RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA). Os resultados indicaram não ser possível diferenciar geneticamente as procedências entre si. Em função da distância genética, foi formado um grupo com quatro materiais ou germoplasmas e outro com os demais. Os diferentes...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ilex paraguariensis; Variabilidade genética; Marcadores moleculares; DNA; RAPD; PCR.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782002000400006
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Genetic variability in physic nuts cultivated in Northeastern Brazil Ciência Rural
Oliveira,Vanice Dias; Rabbani,Allivia Rouse Carregosa; Silva,Ana Veruska Cruz da; Lédo,Ana da Silva.
This research had as objective to characterize genetically individuals of physic nut cultivated in experimental areas in Sergipe, Brazil by means of RAPD molecular markers. Leaves of 40 individuals were collected and DNA was isolated using CTAB 2% method. Were used 30 primers RAPD for DNA amplification, and this data was used to estimate the genetic similarity among the pairs of individuals, using Jaccard coefficient, and group them out for the UPGMA method. Also, the genetic structure and diversity of the populations were assessed using AMOVA. Of the 100 fragments generated, 29 of were polymorphic. A similarity average of 0.54 among the individuals was found and the amplitude similarities varied from 0.18 to 1.00. One of them (U5) was unit clusters and...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Jatropha curcas L.; RAPD; Genetic diversity.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000600006
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Marcadores moleculares em estudos de caracterização de erva-mate (Ilex paraguariensis St.Hil.): o sabor Ciência Rural
Vidor,Mario Angelo; Ruiz,César Pérez; Moreno,Santiago Vázquez; Floss,Paulo Alfonso.
A Epagri (Empresa de Pesquisa Agropecuária e Extensão Rural de Santa Catarina S.A) possui uma das maiores coleções brasileiras de erva-mate (Ilex paraguariensis St.Hil.). A partir de ensaios agronômicos preliminares, apresentaram destaque as procedências Barão de Cotegipe e Água Doce. Dentre essas, verificaram-se diferentes sabores (mais amargo e menos amargo), aparentemente, em função do tipo de folha (CL - curta e larga; LE - longa e estreita). O objetivo deste trabalho foi o de tentar associar os padrões obtidos mediante marcadores moleculares, com as procedências ou acessos e características fenotípicas desejáveis - altura de planta, diâmetro de copa, densidade folhar, sobrevivência das plantas e comportamento de rebrota -, dentro do caráter sabor em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Ilex paraguariensis; Marcadores moleculares; Variabilidade genética; PCR; RAPD; DNA; Biotecnologia.
Ano: 2002 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782002000300008
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BSA and molecular markers screening for salt stress tolerant mutant of Petunia obtained in in vitro culture Ciência Rural
Krupa-Małkiewicz,Marcelina; Bienias,Anna.
ABSTRACT: In this study, we performed BSA to identify genetic markers linked to salt tolerance. We tested the genetic diversity among four bulked DNA samples of EMS induced mutant clones and one bulked DNA sample of non-mutated clone of Petunia for salt tolerance in in vitro callus cultures using RAPD and ISSR markers. Out of the 36 RAPD and 16 ISSR primers identified, 25 and 13 were effectively used to amplify genomic DNA of all the five bulked samples, respectively. In total, 114 RAPD amplifications products were obtained, of which 28% were polymorphic and 2% were genotype-specific bands. Out of the 64 ISSR amplification products obtained, 51% were polymorphic and 1% was genotype-specific bands. Results of this study indicated the existence of two...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bulk segregant analysis; Chemical mutagenesis; ISSR; RAPD; Petunia × atkinsiana D. Don; Salt stress; Tissue culture..
Ano: 2018 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018001200400
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Aspectos fenotípicos, genotípicos e de diagnóstico da bactéria A. pleuropneumoniae Ciência Rural
Costa,Mateus Matiuzzi da; Klein,Cátia Silene; Collares,Roberta Mattos; Vaz,Clarissa Silveira Luiz; Balestrim,Raquel; Schrank,Augusto; Silva,Sergio Ceroni da; Piffer,Itamar Antônio; Shrank,Irene Silveira.
A pleuropneumonia suína (PPS) provoca prejuízos significativos na suinocultura no mundo. O agente etiológico é a bactéria Actinobacillus pleuropneumoniae (App), que apresenta 15 sorotipos descritos, os quais variam consideravelmente em relação a sua patogenicidade. Nesse sentido, a precisa caracterização patotípica desta bactéria é de grande importância para a adoção de medidas de controle e profilaxia. O diagnóstico e a sorotipificação deste patógeno são realizados pelas técnicas microbiológicas convencionais. Entretanto, problemas nestes esquemas podem ser observados, especialmente em isolados de rebanhos sem histórico de PPS. No Brasil, diversos esforços vêm sendo aplicados no sentido de desenvolver técnicas moleculares que auxiliem no diagnóstico da...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: A. pleuropneumoniae; Diagnóstico; PCR; RDNA 16S; RAPD.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782004000400057
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Diversidade genética molecular entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum Ciência Rural
Almeida,Mariana Castro da Costa; Chiari,Lucimara; Jank,Liana; Valle,Cacilda Borges do.
A utilização de marcadores moleculares pode servir para direcionar cruzamentos, confirmar novos híbridos e identificar genótipos para fins comerciais. Nesse contexto, o objetivo deste trabalho foi analisar a diversidade genética entre cultivares e híbridos de Brachiaria spp. e Panicum maximum usando marcadores moleculares do tipo RAPD (Polimorfismos de DNA amplificados ao acaso). Foram 22 genótipos analisados com 10 primers, os quais amplificaram 178 fragmentos polimórficos de DNA, que foram usados para estimar a similaridade genética por meio do coeficiente de Jaccard. Os valores de similaridade obtidos variaram de 0,066 a 0,841. A estrutura genética entre todos os genótipos estudados foi estimada pelo método UPGMA (Método de agrupamento com médias...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Brachiaria spp.; Forrageiras; Marcadores moleculares; Panicum maximum; RAPD.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011001100024
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Marcadores moleculares e sua aplicação no melhoramento genético de plantas Ciência Rural
Bered,Fernanda; Barbosa Neto,José Fernandes; Carvalho,Fernando Irajá Félix de.
Na implantação de um programa de melhoramento, uma das principais necessidades do melhorista é a capacidade de identificar genótipos superiores em uma população segregante. O conhecimento das relações genéticas e a capacidade geral e específica de combinação entre os indivíduos é essencial para a seleção de genitores. Os marcadores genéticos poderão auxiliar na identificação de indivíduos através de suas diferenças genéticas. Estes marcadores podem ser divididos em morfológicos e moleculares (enzimáticos e de DNA). Os marcadores de DNA como o RFLP e o RAPD poderão contribuir para incrementar a eficiência do melhoramento de plantas através do mapeamento de espécies de interesse e de caracteres agronômicos. Além disto, diversos autores têm comprovado a sua...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores de DNA; RFLP; RAPD.
Ano: 1997 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84781997000300026
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Avaliação da fidelidade genotípica por marcadores RAPDs de brotações de pereira (Pyrus communis L.) cv. Carrick, regeneradas in vitro Ciência Rural
Erig,Alan Cristiano; Schuch,Márcia Wulff.
O objetivo deste trabalho foi avaliar a fidelidade genotípica de brotações de pereira (Pyrus communis L.) cultivar Carrick, regeneradas in vitro, utilizando marcadores RAPDs. O DNA genômico foi extraído de folhas oriundas das brotações de pereira regeneradas a partir de diferentes tratamentos e de plantas matrizes micropropagadas (planta controle), utilizando-se o protocolo descrito por FERREIRA & GRATTAPAGLIA (1996). Para triagem dos primers foram utilizados os kits OPAN, OPA e OPF (Operon Technologies, Inc.) e, destes, foram escolhidos sete primers: OPAN-03, OPAN-14, OPAN-15, OPAN-16, OPA-02, OPA-08 e OPF-04. A separação dos produtos da amplificação foi realizada através de eletroforese horizontal em gel de agarose 1,2%, corado com brometo de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Pereira; Variação somaclonal; Marcadores moleculares; RAPD.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782003000300009
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Variabilidade genética de isolados do cogumelo Agaricus blazei por meio de marcadores RAPD Ciência e Agrotecnologia
Tomizawa,Márcia Mayumi; Dias,Eustáquio Souza; Assis,Leandro José de; Gomide,Plínio Henrique Oliveira; Santos,João Bosco dos.
Agaricus blazei (Murrill) ss. Heinem. é um cogumelo nativo do Brasil que vem despertando a atenção de vários pesquisadores em todo o mundo, devido às suas propriedades farmacológicas e nutricionais. Este trabalho teve por objetivo, analisar a variabilidade genética de alguns isolados utilizados comercialmente, por meio de marcadores RAPD. Foram analisados nove isolados de A. blazei, provenientes de diferentes regiões do Brasil e, como controle, dois isolados de A. bisporus. Todos eles fazem parte da coleção de fungos do Laboratório de Cogumelos Comestíveis e Medicinais do DBI/UFLA. Diferentes primers aleatórios foram utilizados, gerando um total de 139 bandas polimórficas. Procedeu-se a avaliação de similaridade genética entre os isolados pelo coeficiente...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/other Palavras-chave: Variabilidade; RAPD; Cogumelo; Agaricus blazei.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542007000400045
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Molecular characterization of elephantgrass accessions through RAPD markers Ciência e Agrotecnologia
Passos,Leônidas Paixão; Machado,Marco Antonio; Vidigal,Maria Coletta; Campos,Ana Lúcia.
Elephantgrass pastures are limited by yield variations and reductions in forage quality and availability, thus making the search for genotypes with reduced seasonality a major concern. In order to verify the extent of genetic variability among contrasting cultivars, ten elephantgrass accessions were analyzed through DNA amplification by RAPD technique. A total of 160 DNA bands were generated with the use of 44 random primers and 23% of these bands were monomorphic for all accessions. Gel-obtained binary data (1 for presence and 0 for absence) were used for generating a genetic distance matrix, which was utilized in a UPGMA grouping analysis. Elephantgrass cultivars Cameroon and Vruckwona were the accessions mostly divergent from the others, with an average...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Molecular markers; Elephantgrass; RAPD; DNA.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542005000300009
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Identificação de variantes somaclonais em bananeiras 'Prata Anã', utilizando técnicas moleculares e citogenéticas Ciência e Agrotecnologia
Guimarães,Nilson César Castanheira; Torga,Paula Pereira; Resende,Eliane Cristina de; Chalfun Júnior,Antônio; Paiva,Edílson; Paiva,Luciano Vilela.
Variação somaclonal é uma variação fenotípica de origem genética, ou seja, uma variação cromossômica que se torna herdável nas gerações seguintes, ou epigenética, que é uma variação transitória devido ao estresse fisiológico que o material sofre, quando submetido ao cultivo in vitro. Um problema específico envolvendo a variação somaclonal em bananeiras 'Prata Anã' foi observado em Andradas, Minas Gerais, em plantas oriundas de micropropagação. A maior dificuldade na separação dos indivíduos normais e variantes é que os caracteres morfológicos, que são inerentes a este tipo de variação, só se tornam evidentes quando a planta está adulta, o que impossibilita a eliminação dos indivíduos variantes ainda em viveiro. Com o objetivo de identificar, ainda em...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Variação somaclonal; Bananeira; SSR; RAPD; Citogenética.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000200013
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Diversidade genética de cultivares de alho (Allium sativum L.) por meio de marcador molecular rapd Ciência e Agrotecnologia
Mota,José Hortêncio; Souza,Rovilson José de; Yuri,Jony Eshi; Resende,Geraldo Milanez de; Paiva,Luciano Vilela.
Realizou-se este estudo com o objetivo de determinar a diversidade genética entre doze cultivares de alho, por meio de marcadores moleculares RAPD. Foram utilizados seis cultivares nobres e seis cultivares seminobres. A análise de agrupamento das similaridades genéticas foi realizada pelo método UPGMA, gerando um dendrograma utilizando o índice de Jaccard. Houve a formação de dois grupos, sendo o primeiro grupo formado pelas cultivares nobres (Roxo Pérola de Caçador, Chonan, Contestado 12, Caçador 30, Caçador 40 e Quitéria 595), ou seja, cultivares que precisam de vernalização para a formação do bulbo, e um segundo formado pelas cultivares seminobres (Gigante Curitibanos, Gigante Roxo, Gigante Roxão, Gravatá, Amarante e Cateto Roxo) ou que não precisam de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Allium sativum; RAPD; Cultivares; Divergência genética.
Ano: 2004 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542004000400006
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Similaridade genética de cultivares de mandioca (Manihot esculenta) por meio de marcadores RAPD Ciência e Agrotecnologia
Costa,Maria Rosa; Cardoso,Eloisa Ramos; Ohaze,Miriã Mutsumi Minato.
O objetivo deste trabalho foi analisar a divergência genética entre 27 acessos de mandioca provenientes do banco ativo de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental. Foram utilizados 12 primers, onde todos apresentaram polimorfismo. Foram analisadas 73 bandas polimórficas de um total de 211 bandas amplificadas. A análise de divergência genética foi realizada a partir do programa NTSYS-pc, 2.02, utilizando o coeficiente de Jaccard. Na análise do dendograma, foram observados dois grupos principais. No primeiro grupo, que se subdividiu em dois subgrupos, com coeficiente de similaridade, variando de 8% a 78%, incluem-se 20 materiais, oriundos de diferentes localidades. O segundo grupo dividiu-se em dois subgrupos, com similaridade genética, variando de 9% a 38%....
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcadores moleculares; RAPD; Mandioca; Biologia molecular; Manihot esculenta.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542003000100019
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