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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2008 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hubert, Mathias; Cantin, Christian; D'Amico, Florence; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le suivi de la ploïdie du naissain capté dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et d'Arcachon a été réalisé par cytométrie en flux . Les échantillons de naissain naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total de 1002 animaux analysés. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l 'absence d'animaux polyploïdes. triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Ces résultats sont conformes aux prévisions en la matière et n'apportent donc aucune raison de modification des pratiques en cours dans la filière ostréicole triploïde. Cependant, pour la deuxième année consécutive, les deux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Aneuploïdie; Marennes Oléron; Arcachon; Crassostrea gigas.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18131/15679.pdf
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MYTILOBS Campagne 2018 - 2019, Réseau d'observation des moules d'élevage sur la côte Atlantique et dans la Manche ArchiMer
Normand, Julien; Benabdelmouna, Abdellah; Louis, Wilfried; Grizon, James.
La campagne 2018-2019 est la sixième campagne consécutive du MYTILOBS après stabilisation des procédures et des protocoles. Au cours de cette campagne, une action supplémentaire visant à caractériser la qualité cyto-génétique des cheptels a été adossée au réseau. Le suivi des 2 points de Roulières et de Boyard a dû être abandonné, et un lot de moules de 2 ans a été ajouté au cheptel sentinelle pour le suivi des mortalités qui l’ont affecté. Les résultats de l’action d’observation mettent en évidence des mortalités toujours très présentes sur les sites du réseau qui avaient été les plus affectés au cours des années précédentes (principalement, la Baie de Bourgneuf et les secteurs d’élevage des Pertuis Charentais). La croissance des moules s’est avérée...
Tipo: Text Palavras-chave: Moules; Mortalités; Observation; Variation spatio temporelle.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00653/76490/77570.pdf
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Mortality investigation of Mytilus edulis and Mytilus galloprovincialis in France: An experimental survey under laboratory conditions ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Garcia, Celine; Ledu, Christophe; Lamy, Pierre; Maurouard, Elise; Degremont, Lionel.
In the context of mass mortality outbreaks affecting adult and juvenile mussels since 2014 in France, two investigations were conducted to study mussel mortality under laboratory conditions in 2015. The first investigated the horizontal transmission of a putative causal agent of the mortality among two stocks of wild Mytilus edulis and the potential genetic resistance of adults and their progenies. The second evaluated the resistance of pure and hybrid crosses of M. edulis and M. galloprovincialis at the spat stage to a mortality outbreak. For the first time in France, we described several mortality outbreaks affecting spat and adult mussels under laboratory conditions. Mortality was observed for seawater temperatures ranging from 10 to 23 °C, although the...
Tipo: Text Palavras-chave: Mytilus edulis; Mytilus galloprovincialis; Interspecific hybrids; Mortality outbreaks.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00445/55696/57364.pdf
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Niveau de ploïdie des huîtres des bassins de captage de Marennes Oléron et Arcachon (Campagne biovigilance 2007) ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Grouhel, Stephanie; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
The monitoring of spat ploidy collected in the two main collection basins-Marennes Oléron and Arcachon-was realised through flow cytometry. Natural spat samples were collected on 3 sites in each basin and a total of 1 002 animals were analysed. Based on our samples, the results concluded that no polyploid, triploid or tetraploid animals were collected in the two investigated basins. These results comply with our provisions and do not bring any reason for a change in the practices used in triploid oyster culture. However, complementary studies on triploid residual gametogenesis, the nature of their gametes and that of their offsprings will have to be continued in order to fine-tune the estimates of the parameters on which the modeling scenarii of the...
Tipo: Text Palavras-chave: Reproduction; Captage; Arcachon; Marennes Oléron; Génétique; Crassotrea gigas; Huîtres; Naissain; Ploïde.
Ano: 2007 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/rapport-3905.pdf
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Observatoire national du cycle de vie de l’huître creuse en France. Rapport annuel ECOSCOPA 2019 ArchiMer
Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Benabdelmouna, Abdellah; Pouvreau, Stephane.
Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85000 tonnes ces dernières années. Pourtant, depuis 2008, cette espèce est affectée par des épisodes de mortalités massives et récurrentes déclenchées par la présence d'agents infectieux viraux (de type Herpes virus OsHV-1 μVar) en conjonction avec des facteurs environnementaux (i.e. élévation de la température). Cette infection virale induit une altération des défenses antimicrobiennes ainsi qu'une déstabilisation de son microbiote. Ce processus conduit à une infection secondaire par des bactéries opportunistes potentiellement pathogènes qui se multiplient rapidement entrainant...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Cytogénétique; Écologie; Réseau National.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00687/79902/82833.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron, Baie de Bourgneuf et Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2011 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ollier, Simon; Maurouard, Elise; D'Amico, Florence; Seugnet, Jean-luc; Grizon, James.
Comme pour les années précédentes, le réseau biovigilance a réalisé en 2011 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2010. Pour la première fois, en plus des deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon, un bassin additionnel (Vendée) a été prospecté via l'analyse de naissains sauvages captés en 2010 au niveau de la baie de Bourgneuf. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur les sites de chaque bassin pour un total analysé de plus de 1800 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les trois bassins prospectés. Cependant, les bassins de...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Ploïdie; Huître creuse; Crassostrea gigas; Naissain; Analyse cytométrique; Analyse statistique; Bassin de Marennes Oléron; Arcachon; Baie de Bourgneuf.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00107/21837/19427.pdf
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Etude de la CINétique et DIffusion de la MORtalité (CINDIMOR) chez les juvéniles de l'huître creuse Crassostrea gigas ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe; Degremont, Lionel.
Depuis son introduction en France, l’huître creuse du Pacifique Crassostrea gigas subit des épisodes répétés de mortalité estivale touchant principalement les juvéniles. A partir de 2008, un nouveau pallier a été franchi et ces épisodes de mortalité estivale se sont accrus en intensité, touchant jusqu’à 90% des lots. Actuellement, ces mortalités touchent l’ensemble des façades maritimes ainsi que plusieurs pays utilisant des naissains d’origine Française. L’ostréiculture Française est basée sur l’utilisation majoritaire de naissains sauvages issus d’un captage naturel (75 à 80%) réalisé au niveau des bassins d’Arcachon et de Marennes Oléron en complément avec l’utilisation de naissains, principalement triploïdes, produits par diverses écloseries privées...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Condition d'élevage; Historique des lots.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00063/17405/14910.pdf
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CAPRETAR : Etude comparative des caractéristiques cytogénétiques et des performances de survie de naissains sauvages issus du CAPtage PREcoce ou TARdif ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Hemissi, Issam; Bodin, Stephane; Robert, Stephane; Ledu, Christophe; Laporte, Philippe.
L'action de recherche CAPRETAR (CAptage PREcoce ou TARdif: 2009-2010) a été réalisée dans le cadre du Contrat de Plan Etat Région - Poitou Charentes (CPER-PC 2007- 2013) développement durable des Pertuis Charentais. Cette action, s 'inscrit dans le cadre d 'un lien direct qui existerait entre la nature précoce/tardive d 'un captage naturel et la qualité des naissains de l'huître creuse C. gigas qui en sont issus (qualité génétique : « R » résistante ou « S » sensible et qualité génomique : taux des aneuploïdies et des dommages à l'ADN). L'objectif de cette action vise à estimer durant l 'année (2010) les performances relatives de survie de naissains issus d 'un captage précoce ou tardif réalisé l'année précédente (2009). Les résultats escomptés visent à...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Cytogénétique; Captage; Reproduction; Huîtres creuses; Crassostrea gigas.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00062/17283/14794.pdf
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Plan de sauvegarde 2012, 3ème édition : synthèse des résultats 2012-2013 ArchiMer
Degremont, Lionel; Maurouard, Elise; Connes, Coralie; Ledu, Christophe; Benabdelmouna, Abdellah.
Depuis 2008 l’ostréiculture française subit des mortalités massives d'huîtres creuses, Crassostrea gigas, qui menacent les approvisionnements en naissains et, par voie de conséquence, fragilise la filière ostréicole. C’est dans ce contexte qu'a été mis en place à partir de 2010 une opération désignée sous le terme plan de sauvegarde. Cette opération sous forme contractuelle fait intervenir l'Ifremer, des écloseries privées, le Ministère en charge de l'Agriculture et le CNC. Le premier plan de sauvegarde (PS1) a été initié en 2010, suivi par un deuxième en 2011 (PS2), et un troisième en 2012 (PS3). L’objectif premier de ce plan est d’apporter une réponse temporaire au déficit de production grandissant en fournissant aux écloseries des animaux présentant une...
Tipo: Text
Ano: 2014 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00229/34041/32448.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2010 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Guyader, Tanguy; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
Le réseau biovigilance a réalisé en 2010 la caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2009 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon. Les échantillons des naissains sauvages issus du captage naturel ont été prélevés sur 4 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1379 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l'absence d 'animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage prospectés sont caractérisés par la présence de naissains affectés de diverses anomalies génomiques: cassures d 'ADN et Aneuploïdie (hypodiploïdie) ADN c à d une diminution de la taille du...
Tipo: Text Palavras-chave: Génétique; Reproduction; Captage; Ploïdie; Anomalie génomique; Aneuploïdie.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00070/18124/15677.pdf
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Chromosomal organization of simple sequence repeats in the Pacific oyster (Crassostrea gigas): (GGAT)(4), (GT)(7) and (TA)(10) chromosome patterns ArchiMer
Bouilly, Karine; Chaves, R.; Leitao, A.; Benabdelmouna, Abdellah; Guedes Pinto, H..
Chromosome identification is essential in oyster genomic research. Fluorescence in situ hybridization (FISH) offers new opportunities for the identification of oyster chromosomes. It has been used to locate satellite DNAs, telomeres or ribosomal DNA sequences. However, regarding chromosome identification, no study has been conducted with simple sequence repeats (SSRs). FISH was used to probe the physical organization of three particular SSRs, (GGAT)(4), (GT)(7) and (TA)(10) onto metaphase chromosomes of the Pacific oyster, Crassostrea gigas. Hybridization signals were observed in all the SSR probes, but the distribution and intensity of signals varied according to the oligonucleotide repeat. The intercalary, centromeric and telomeric bands were observed...
Tipo: Text Palavras-chave: Simple sequence repeats (SSRs); Mollusks; Fluorescence in situ hybridization (FISH); Crassostrea gigas; Chromosome identification.
Ano: 2008 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-6132.pdf
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Niveau de ploïdie des naissains d'huître creuse captés dans les bassins de Marennes Oléron et d'Arcachon. Réseau Biovigilance, campagne 2009 ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Tourbiez, Delphine; D'Amico, Florence; Cantin, Christian; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc.
En 2009, La caractérisation du niveau de ploïdie des naissains captés en 2008 dans les deux principaux bassins de captage que sont Marennes Oléron et Arcachon a été réalisée dans le cadre du réseau biovigilance. Les échantillons des naissains sauvages issus de ce captage naturel ont été prélevés sur 3 sites dans chaque bassin et pour un total analysé de 1121 animaux. En tenant compte de notre échantillonnage, nos résultats de suivi de ploïdie concluent à l’absence d’animaux polyploïdes, triploïdes ou tétraploïdes, captés dans les deux bassins prospectés. Cependant, les deux bassins de captage rospectés sont caractérisés par la présence accrue de naissains affectés de diverses anomalies génomiques (cassures d’ADN et diminution de la taille du génome,...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Génétique; Ploïdie; Naissain; Bassin Marennes Oléron; Charente-Maritime; Bassin d'Arcachon; Gironde.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14282/11559.pdf
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Genomic abnormalities affecting mussels (Mytilus edulis-galloprovincialis) in France are related to ongoing neoplastic processes, evidenced by dual flow cytometry and cell monolayer analyses ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Saunier, Alice; Ledu, Christophe; Travers, Marie-agnes; Morga, Benjamin.
In the context of the abnormal mass mortality of mussels in France since 2014, Flow CytoMetry (FCM) was used in 2015 and 2016 to study the DNA content and cell cycle characteristics of hemic circulating cells collected from 2000 mussels. The mussels were sampled from 12 wild and cultivated blue mussels stocks distributed along the French Atlantic coast from the south Brittany to Pertuis Charentais areas. During these surveys, various genetic abnormalities were frequently detected, and ploidy characteristics revealed contrasting profiles that corresponded to respective contrasting sanitary status, i.e. healthy mussels with high cytogenetic quality (HCQ) versus diseased mussels with low cytogenetic quality (LCQ). In the present work, FCM and hemocytology...
Tipo: Text Palavras-chave: Mussels; Hemocytes; Flow cytometry; Hemocytology; Cytogenetic quality; Neoplasia.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00455/56623/58443.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles : description et étude des facteurs liés, action – MORBLEU-2018 ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Chasselin, Leo; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Normand, Julien; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015- 2017 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2018, les actions d’observation et de suivis du milieu et des moules ont été fortement réduites et trois axes principaux ont été poursuivis : i) l’étude de la relation entre l’évolution des équilibres microbiens planctoniques et l’apparition de mortalités...
Tipo: Text
Ano: 2019 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00588/70056/67999.pdf
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Mortalités de moules bleues dans les secteurs mytilicoles charentais et vendéens : description et facteurs liés – MORBLEU ArchiMer
Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Degremont, Lionel; Guesdon, Stephane; Le Moine, Olivier; Morga, Benjamin; Bierne, Nicolas; Travers, Marie-agnes; Robert, Stephane; Soletchnik, Patrick.
Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une première année d’étude a été réalisée au travers de l’action MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Elle a été menée dans les Pertuis charentais et la baie de Bourgneuf. Dans ce même contexte, elle a été reconduite en 2016 afin de poursuivre l’analyse des données collectées en 2015, renouveler une campagne d’étude et d’observation in situ, formuler des hypothèses autour de facteurs favorisants ces épisodes de mortalité de moules, développer des essais permettant de tester ces hypothèses dans le futur et produire des lots de moules pour ces essais et pour caractériser le potentiel adaptatif des animaux face aux épisodes de...
Tipo: Text Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Facteurs environnementaux; Mortalité; Equilibre microbien; Populations; Qualité cytogénétique; Anomalies hémocytaires; Expression de gènes; Physiologie.
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00391/50288/50978.pdf
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Procédures d'échantillonnage pour la conservation des espèces aquacoles dans la Cryobanque Nationale ArchiMer
Vandeputte, Marc; Labbe, Catherine; Suquet, Marc; Fauvel, Christian; Goardon, Lionel; Duclos, Delphine; Danchin-burge, Coralie; Vergnet, Alain; Rault, Paul; Degremont, Lionel; Benabdelmouna, Abdellah; Brizard, Raphael; Haffray, Pierrick.
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00098/20975/18597.pdf
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Les pratiques culturales peuvent-elles permettre de réduire la surmortalité du naissain d'huîtres creuses? Récapitulatif des essais d'élevage et expérimentations zootechniques menés sur le territoire français entre 2008 et 2010 ArchiMer
Soletchnik, Patrick; Mazurie, Joseph; Allain, Gwenhael; Bedier, Edouard; Benabdelmouna, Abdellah; Blin, Jean-louis; Bouquet, Anne-lise; Cochet, Hélène; Degremont, Lionel; Gaussem, Florian; Gervasoni, Erika; Glize, Philippe; Petton, Bruno; Roussel, Pierre-yves; Pernet, Fabrice.
This paper summarizes knowledge about relations between husbandry practices and oyster spat mortalities since 2008 in France. These relations are strictly analyzed from a panel of experiments set on the shore (in outdoor experiments) by Ifremer teams and technical institutes all over French coasts. Results show some practices are able to reduce spat mortality with some influencing factors relevant of spat quality (sanitary status, natural or genetic selection) or husbandry practices. Spat “free” of virus is able to survive up to 90% when it is isolated and confined in ponds or nursery, during an epidemic crisis. When outbreaks occurred in oyster beds, natural or nursery spat died in almost same proportions. In 2010, some studies conducted in Mediterranean...
Tipo: Text Palavras-chave: Surmortalité; Naissain; Huître creuse; OsHV-1; Pratiques culturales; Mortality; Spat; Cupped oyster; Crassostrea gigas; OsHV-1; Cultural practices.
Ano: 2011 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00032/14280/25847.pdf
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Blue mussel mortality outbreak in France is associated with heavy genomic abnormalities detected by flow cytometric analysis of hemolymph ArchiMer
Benabdelmouna, Abdellah; Ledu, Christophe.
Since 2014, blue mussel industry in France has been facing heavy mortality outbreaks (90–100%) affecting both juveniles and adults. This report presents evidence of heavy genomic abnormalities associated with mortality outbreaks in blue mussels from the Atlantic coast of France. Ploidy characteristics of hemic cells were investigated using Flow CytoMetry (FCM), revealing an unusual, broad continuum of ploidy distribution from hypodiploidy to tetraploidy. FCM was additionally used to evaluate, at individual and populations levels, different thresholds of genomic abnormality (GA%)using the percentage of non-diploid nuclei. Individual mussels were considered to be abnormal when more than 10% of hemocytes in S–G2/M phase were present. At the population level,...
Tipo: Text
Ano: 2016 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00356/46720/46591.pdf
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