|
|
|
| Registros recuperados: 57 | |
|
|
| Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Soletchnik, Patrick; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Pernet, Fabrice; Bachere, Evelyne; Bedier, Edouard; Petton, Bruno; Gaussem, Florian; Stanisiere, Jean-yves; Degremont, Lionel. |
| Depuis 2008, la filière ostréicole française doit faire face à des surmortalités exceptionnelles des naissains d’huîtres creuses, Crassostrea gigas, (huîtres de moins d’un an) comprises entre 60 et 90% dans tous les sites d’élevage. Des cas de mortalité similaires ont été décrits en Irlande, dans les îles anglo-normandes, au Portugal en 2009 et au Royaume-Uni en 2010. Récemment deux épisodes de mortalité, associés à la présence d’un virus OsHV1 μvar (ou un variant très proche) ont été également décrits en Nouvelle Zélande (décembre 2010) et en Australie (janvier 2011) soulignant la vulnérabilité de la filière ostréicole dans le monde. L’objectif de ce document est de faire un point sur les recherches menées depuis l’apparition de ce phénomène et de... |
| Tipo: Text |
|
| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00033/14423/11719.pdf |
| |
|
|
| Varsamos, S; Flik, G; Pepin, Jean-francois; Bonga, S; Breuil, Gilles. |
| In aquaculture management it is important to establish objective criteria to assess health and welfare of the fish. Here we show that European sea bass (Dicentrarchus labrax) confronted with husbandry-associated stress (tank cleaning, i.e. scrubbing, and water temperature variation) during early life stages show poorer survival and disease resistance as juveniles. We evaluated several parameters for stress (plasma cortisol, glucose and lactate, hydromineral status), growth performance, the immune response (plasma IgM levels) and the effects of a nodavirus challenge. Principal component analysis allowed the establishment of a stress panel including plasma cortisol, osmolality, IgM levels and weight. Sea bass juveniles reared during early life in high and... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Dicentrarchus labrax; Nodavirus challenge; Scrubbing; Temperature; Welfare; Health; Allostasis; Stress. |
| Ano: 2006 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2006/publication-2395.pdf |
| |
|
|
| Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Miossec, Laurence; Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Chollet, Bruno; Robert, Maeva; Cobret, Laetitia; Renault, Tristan; Rauflet, Fabienne; Le Gagneur, Eric; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Breerette, Stephane; Chabirand, Jean-michel; Grizon, James; Robert, Stephane; Courtois, Olivier; Rumebe, Myriam. |
| Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Banamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Etat de santé. |
| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19711/17352.pdf |
| |
|
|
| Cochennec-laureau, Nathalie; Baud, Jean-pierre; Bedier, Edouard; Boudry, Pierre; Huvet, Arnaud; Nicolas, Jean-louis; Pepin, Jean-francois; Petton, Bruno. |
| Ce bilan comprend deux parties : la première est dédiée à une synthèse des travaux présentés lors des journées « Surmortalités des huîtres creuses, Crassostrea gigas » les 8 et 9 décembre 2009 et, la seconde partie, à une proposition d'un projet de recherche spécifique 2010-2012 en complément des propositions de « sortie de crise ». Contexte Les mortalités estivales de l'huître creuse, Crassostrea gigas, sont décrites depuis une vingtaine d'années en France mais également au Japon, en Corée, aux USA et en Australie. Ces phénomènes ou « syndrome des mortalités estivales » ont fait l'objet d'une étude pluridisciplinaire en France entre 2001 et 2006 (Défi MOREST). Toutefois, en 2008 et 2009, l'ostréiculture française a du faire face à deux épisodes de... |
| Tipo: Text |
|
| Ano: 2010 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2010/acte-7393.pdf |
| |
|
|
| Pepin, Jean-francois; Riou, Antoine; Renault, Tristan. |
| Herpes and herpes-like virus infections have been reported in various marine mollusc species associated with high mortality rates. Following the characterisation and genome sequencing of ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1), specific diagnostic tools have been developed based on conventional PCR techniques or in situ hybridisation. We have now developed a real-time PCR assay for rapid, sensitive and quantitative detection of OsHV-1, and compared it with a conventional PCR technique described previously. The new assay utilised SYBR® Green chemistry with specific primers C9/C10 targeting the C region. The melt curve analysis of OsHV-1 DNA or DNA extracted from infected material showed only one melting temperature peak (75.75 ± 0.1 °C). The assay had a detection... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: SYBR® Green; Real time PCR; Crassostrea gigas; Ostreid herpesvirus 1; Herpesvirus. |
| Ano: 2008 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2008/publication-3951.pdf |
| |
|
|
| Batista, Frederico; Arzul, Isabelle; Pepin, Jean-francois; Ruano, Francisco; Friedman, Carolyn S.; Boudry, Pierre; Renault, Tristan. |
| Herpes-like viral infections have been reported in different bivalve mollusc species throughout the world. High mortalities among hatchery-reared larvae and juveniles of different bivalve species have been associated often with such infections. The diagnosis of herpes-like viruses in bivalve molluscs has been performed traditionally by light and transmission electron microscopy. The genome sequencing of one of these viruses, oyster herpesvirus 1 (OsHV-1), allowed the development of DNA-based diagnostic techniques. The polymerase chain reaction (PCR) has been used for the detection of OsHV-1 DNA in bivalve molluscs at different development stages. In addition, the PCR used for detection of OsHV-1 has also allowed the amplification of DNA from an OsHV-1... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Oyster; Bivalve molluscs; PCR; Detection; OsHV 1; Herpesvirus. |
| Ano: 2007 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2007/publication-2322.pdf |
| |
|
|
| Francois, Cyrille; Pepin, Jean-francois. |
| Increasing development of aquaculture business has thrown up new requirements in terms of prevention and control of mollusc diseases. In closed structures, one way to reduce infectious risk is to make use of anti-infectives . Specific drugs like antibiotics should be used only for therapeutic purpose against identified agents. Less specific anti-infectives like disinfectants could be employed for preventive and also for curative goals against causal pathogens and opportunist agents. A critical analysis synthesizes the bibliography available on disinfection in mollusc hatcheries and nurseries. Physical and chemical tools are reviewed then selected depending on four criteria: (1) efficiency against most important pathogens of molluscs, (2) safety for... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Antiseptics; Disinfectants; Nurseries; Hatcheries. |
| Ano: 2005 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2005/acte-3312.pdf |
| |
|
| |
|
|
| Pepin, Jean-francois; Emery, Eric. |
| During spring of 1993, an epizootic outbreak occurred in a sea bass farm, located on the French Mediterranean coast. The cumulative mortality reached 25%. First examination of cutaneous lesions revealed filamentous bundles of flexuous bacteria which exhibited gliding motility. Bacterial growth was obtained only from skin lesions. The biochemical characteristics of isolates are described. Pathogenicity tests of representative slrains were carried out. Until fuller data is available, the pathogen here reported was provisionally identified as a Cytophaga·like bacterium (CLB). |
| Tipo: Text |
|
| Ano: 1993 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00271/38252/36441.pdf |
| |
|
|
| Segarra, Amelie; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Pepin, Jean-francois; Tourbiez, Delphine; Trancart, Suzanne; Travers, Marie-agnes; Renault, Tristan. |
| Le premier cas d'infection à virus de type herpès a été rapporté en 1972, aux Etats Unis, chez l'huître américaine, Crassostrea virginica (Farley et al, 1972). A partir de 1991, des mortalités massives associées à la détection de virus de type herpes ont été observées chez plusieurs espèces de bivalves marins, à différents stades de développement (essentiellement chez les larves et le naissain) et dans différentes régions du monde. Sur la base d’observation en microscopie électronique à transmission, ces virus présentaient des caractéristiques morphologiques identiques à celles des Herpesvirus (Roizman, 1982). Les connaissances acquises concernant la taille, la structure et le séquençage du génome d’un virus infectant les larves d’huîtres creuses en... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Herpès virus OsHV-1; Expression gènes; Huître creuse; Crassostrea gigas. |
| Ano: 2012 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00195/30627/29076.pdf |
| |
|
|
| Coeurdacier, Jean-luc; Laporte, Florent; Pepin, Jean-francois. |
| Cette présentation orale aborde les aspects non traités dans la publication relative aux essais de vaccination contre la Nodavirose par peptides synthétiques (https://w3.ifremer.fr/archimer/doc/00000/10600/7038.pdf) dont évaluation par différentes méthodes de la présence ou des traces d’un contact avec le Nodavirus qu’il soit vivant (culture de cellule), sous forme de fraction protéique (ELISA antigène et PCR) ou qu’il ait laissé des traces sériques (séropositivité par ELISA anticorps) ou sous forme de vacuoles encéphaliques (immunohistochimie). |
| Tipo: Text |
|
| Ano: 1999 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00157/26828/24943.pdf |
| |
|
|
| Pepin, Jean-francois; Benabdelmouna, Abdellah; Bierne, Nicolas; Costes, Louis; Degremont, Lionel; Garcia, Celine; Guesdon, Stephane; Lamy, Jean-baptiste; Le Moine, Olivier; Morga, Benjamin; Normand, Julien; Robert, Stephane; Saunier, Alice; Soletchnik, Patrick; Travers, Marie-agnes. |
| Depuis 2014, des épisodes de mortalité anormale affectent les cheptels mytilicoles tant adultes que juvéniles. Dès l’année 2015, une étude spécifique cofinancée par la DPMA et réalisée par l’Ifremer a été initiée, l’action de recherche MORBLEU (Mortalité des moules Bleues). Les années 2015 et 2016 ont permis de dégager des éléments de connaissance et des pistes relatifs aux facteurs biotiques et abiotiques qui semblent intervenir dans le phénomène de hausse de mortalité des moules depuis 2014. Pour l’année 2017, les trois objectifs principaux étaient de : i) poursuivre la description du phénomène de mortalité ainsi que le contexte environnemental associé en effectuant une nouvelle campagne d’études et d’observations in situ, ii) tester des hypothèses... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Moules; Mytilus edulis; Mortalité; Statut cytogénétique; Anomalies génomiques; Populations; Facteurs environnementaux; Ecologie microbienne. |
| Ano: 2018 |
URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00503/61503/65337.pdf |
| |
|
|
| Francois, Cyrille; Joly, Jean-pierre; Garcia, Celine; Lupo, Coralie; Travers, Marie-agnes; Pepin, Jean-francois; Hatt, Philippe-jacques; Arzul, Isabelle; Omnes, Emmanuelle; Tourbiez, Delphine; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Huchet, Eve; Dubreuil, Christine; Chollet, Bruno; Renault, Tristan; Cordier, Remy; Hebert, Pascale; Le Gagneur, Eric; Parrad, Sophie; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Terre-terrillon, Aouregan; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Hittier, Benoist; Grizon, James; Chabirand, Jean-michel; Robert, Stephane; Seugnet, Jean-luc; Rumebe, Myriam; Le Gall, Patrik; Bouchoucha, Marc; Baldi, Yoann; Masson, Jean-claude. |
| Créé en 1992, le réseau Repamo (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s’inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l’introduction et la propagation d’organismes pathogènes, en particulier ceux à réglementés et de surveiller l’évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font partie des missions institutionnelles de l’IFREMER. L’étude des hausses de mortalités (protocole II) a été poursuivie avec 52 interventions complètes ayant conduit au recueil de commémoratifs et à la réalisation d’échantillons de mollusques marins pour analyses en pathologie. Des hausses de mortalités... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Surveillance. |
| Ano: 2013 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00143/25470/23625.pdf |
| |
|
| |
|
| |
|
|
| Pouvreau, Stephane; Petton, Sebastien; Queau, Isabelle; Haurie, Axel; Le Souchu, Pierrick; Alunno-bruscia, Marianne; Palvadeau, Hubert; Auby, Isabelle; Maurer, Daniele; D'Amico, Florence; Passoni, Sarah; Barbier, Claire; Tournaire, Marie-pierre; Rigouin, Loic; Rumebe, Myriam; Fleury, Elodie; Fouillaron, Pierre; Bouget, Jean-francois; Pepin, Jean-francois; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Chabirand, Jean-michel; Le Moine, Olivier; Guesdon, Stephane; Lagarde, Franck; Mortreux, Serge; Le Gall, Patrik; Messiaen, Gregory; Roque D'Orbcastel, Emmanuelle; Quemener, Loic; Repecaud, Michel; Mille, Dominique; Geay, Amelie; Bouquet, Anne-lise. |
| La conchyliculture, et principalement l’élevage de l’huître creuse, Crassostrea gigas, constitue la principale activité aquacole française. Cette activité repose, en grande partie, sur le recrutement naturel de l’espèce qui assure 70% des besoins en jeunes huîtres (naissain) : cette activité de collecte s’appelle le captage. Les deux principaux centres de captage en France sont les bassins d’Arcachon et de Marennes-Oléron. Or, depuis une dizaine d'années, sur le bassin d'Arcachon, le captage devient très variable: à des années de captage nul (par exemple les années 2002, 2005, 2007) ou faible (2009, 2010, 2011) succèdent des années excellentes voire pléthoriques (les années 2003, 2006, 2008, 2012, 2013). A Marennes-Oléron, cette variabilité existe, mais... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Huître creuse; Naissain; Recrutement; Captage; Larves; Cycle de reproduction; Changement climatique; Pacific oyster; Spat; Recruitment; Spat collecting; Larvae; Reproductive cycle; Climate change. |
| Ano: 2015 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00279/38990/37561.pdf |
| |
|
|
| Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Guesdon, Stephane; Degremont, Lionel; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Renault, Tristan; Travers, Marie-agnes; Tourbiez, Delphine; Geairon, Philippe; Le Moine, Olivier; Seugnet, Jean-luc; Soletchnik, Patrick. |
| This study aims to improve understanding of causes of mortalities in oyster Crassostrea gigas in pertuis charentais related to environmental parameters and the kinetics of targeted infectious agents, such as bacteria Vibrio splendidus (group ) and V. aestuarianus and Ostreid herpesvirus OsHV-1. Two sampling campaigns were carried out on the site of Agnas in 2009 and 2010, before, during or following mortality events of spat from March to September. The approach is to detect and quantify in short time step infectious agents from tissues of farmed oysters placed on rack and in various samples taken nearby: native oysters and other species (wild mussels and barnacles), seawater and sediment. With physical and chemical automatic probes placed on the site,... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Huître creuse; Crassostrea gigas; Mortalité; Virus herpès; Vibrions; Environnement; Pertuis Charentais; Pacific oyster; Crassostrea gigas; Mortality; Herpes virus; Vibrios; Environment; Pertuis Charentais. |
| Ano: 2011 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00058/16920/14400.pdf |
| |
|
|
| Pepin, Jean-francois; Soletchnik, Patrick; Le Moine, Olivier; Polsenaere, Pierre; Genauzeau, Sylvie; Robert, Stephane; Grizon, James; Seugnet, Jean-luc; Schmitt, Anne; Chabirand, Jean-michel; Tourbiez, Delphine; Travers, Marie-agnes; Guesdon, Stephane. |
| We report in this work data of two independent studies carried out in the Pertuis Charentais for which a link might exist? A 30-years local time series study of hydro-climatic variations in water temperature and salinity, which show a significant warming of the water masses in the Marennes Oleron bay (+ 1.5 °C) associated with a significant drop ( > -15%) of freshwater intakes by nearby rivers. In this changing local climate context several major epizootics have appeared, severely affecting farmers and the production of Pacific oysters and mussels, from the first French shellfish-producing department (catching and growing, Agreste, 2012). Following massive mortality event of blue mussels in 2014, a specific study (MORBLEU) is conducted, trying to... |
| Tipo: Text |
|
| Ano: 2017 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00415/52697/53567.pdf |
| |
|
|
| Francois, Cyrille; Garcia, Celine; Arzul, Isabelle; Joly, Jean-pierre; Miossec, Laurence; Chollet, Bruno; Ferrand, Sylvie; Robert, Maeva; Tourbiez, Delphine; Omnes, Emmanuelle; Cobret, Laetitia; Faury, Nicole; Haffner, Philippe; Saulnier, Denis; Pepin, Jean-francois; Renault, Tristan; Antajan, Elvire; Rauflet, Fabienne; Ropert, Michel; Mouillard, Gilbert; Gerla, Daniel; Annezo, Jean-pierre; Le Gal, Dominique; Langlade, Aime; Bedier, Edouard; Nourry, Max; Chabirand, Jean-michel; Fillon, Alain; Robert, Stephane; Courtois, Olivier. |
| Créé en 1992, le réseau REPAMO (REseau de PAthologie des MOllusques) est un réseau de surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français. Son activité s'inscrit dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Les objectifs du réseau sont de prévenir l'introduction et la propagation d'organismes pathogènes, en particulier ceux à déclaration obligatoire et de surveiller l'évolution de ceux déjà présents sur le territoire national. Ces activités font parties des missions institutionnelles de l'IFREMER. La surveillance assurée par le réseau vise en premier lieu les infections à déclaration obligatoire présentes en France, la bonamiose à Bonamia ostreae chez l'huître plate Ostrea edulis et la marteiliose à Marteilia refringens chez... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Etat de santé. |
| Ano: 2009 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00086/19709/17351.pdf |
| |
|
|
| Breuil, Gilles; Mouchel, Olivier; Fauvel, Christian; Pepin, Jean-francois. |
| Reproduction of nodavirus disease was performed by experimental infection of sea bass eggs during fertilization or at larval stage 4 with 2 genetically distinguishable nodavirus strains (Sb1 and Sb2) isolated from sea bass collected along the Atlantic and Mediterranean French coast. The pathogenicity of the virus strains was assigned after detection of the virus by ELISA and immunohistochemistry (IHC). The Atlantic (Sb1) strain was more pathogenic than the Mediterranean (Sb2) strain during the fertilization step whilst both strains were pathogenic following experimental exposure of 4 d old larvae. Virus lesions developed in the brain 4 to 6 d following experimental exposure. Experimental ELISA proved very sensitive for detecting the nodavirus in Sb1 or Sb2... |
| Tipo: Text |
Palavras-chave: ELISA; Nodavirus; Fish encephalopathy. |
| Ano: 2001 |
URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2001/publication-814.pdf |
| |
| Registros recuperados: 57 | |
|
|
|
