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Long dsRNAs promote an anti-viral response in Pacific oyster hampering ostreid herpesvirus 1 replication ArchiMer
Pauletto, Marianna; Segarra, Amelie; Montagnani, Caroline; Quillien, Virgile; Faury, Nicole; Le Grand, Jacqueline; Miner, Philippe; Petton, Bruno; Labreuche, Yannick; Fleury, Elodie; Fabioux, Caroline; Bargelloni, Luca; Renault, Tristan; Huvet, Arnaud.
Double-stranded RNA (dsRNA)-mediated genetic interference (RNAi) is a widely used reverse genetic tool for determining the loss-of-function phenotype of a gene. Here, the possible induction of an immune response by long dsRNA was tested in a marine bivalve (Crassostrea gigas), as well as the specific role of the subunit 2 of the nuclear factor kappa B inhibitor (I kappa B2). This gene is a candidate of particular interest for functional investigations in the context of oyster mass mortality events, as Cg-I kappa B2 mRNA levels exhibited significant variation depending on the amount of ostreid herpesvirus 1 (OsHV-1) DNA detected. In the present study, dsRNAs targeting Cg-I kappa B2 and green fluorescent protein genes were injected in vivo into oysters...
Tipo: Text Palavras-chave: Anti-viral response; RNA interference; Inhibitor of NF-kappa B; Marine bivalve; Ostreid herpesvirus 1.
Ano: 2017 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00409/52011/52698.pdf
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Microarray analysis highlights immune response of Pacific oysters as a determinant of resistance to summer mortality ArchiMer
Fleury, Elodie; Huvet, Arnaud.
Summer mortality of Crassostrea gigas is the result of a complex interaction between oysters, their environment, and pathogens. A high heritability was estimated for resistance to summer mortality, which provided an opportunity to develop lines of oysters that were resistant (R) or susceptible (S) to summer mortality. Previous genome-wide expression profiling study of R and S oyster gonads highlighted reproduction and antioxidant defense as constitutive pathways that operate differentially between these two lines. Here, we show that signaling in innate immunity also operates differentially between these lines, and we hypothesize that this is at the main determinant of their difference in survival in the field. A reanalysis of our published microarray data...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusca; Crassostrea gigas; Gene; Immunity; CDNA microarray; Summer mortality.
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00083/19423/17213.pdf
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Observatoire national du cycle de vie de l’huître creuse en France. Rapport annuel ECOSCOPA 2019 ArchiMer
Fleury, Elodie; Petton, Sebastien; Corporeau, Charlotte; Benabdelmouna, Abdellah; Pouvreau, Stephane.
Occupant une place de premier ordre dans les paysages côtiers français, l’ostréiculture est le premier contributeur de la filière aquacole française avec une production estimée à 85000 tonnes ces dernières années. Pourtant, depuis 2008, cette espèce est affectée par des épisodes de mortalités massives et récurrentes déclenchées par la présence d'agents infectieux viraux (de type Herpes virus OsHV-1 μVar) en conjonction avec des facteurs environnementaux (i.e. élévation de la température). Cette infection virale induit une altération des défenses antimicrobiennes ainsi qu'une déstabilisation de son microbiote. Ce processus conduit à une infection secondaire par des bactéries opportunistes potentiellement pathogènes qui se multiplient rapidement entrainant...
Tipo: Text Palavras-chave: Huître creuse; Physiologie; Cytogénétique; Écologie; Réseau National.
Ano: 2020 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00687/79902/82833.pdf
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Rapport d’activité 2018-2019 UNITE RBE/PFOM. Physiologie Fonctionnelle des Organismes Marins ArchiMer
Boudry, Pierre; Fleury, Elodie; Le Roux, Frederique; Zambonino Infante, Jose-luis.
Activités scientifiques 2018-2019
Tipo: Text
Ano: 2021 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00689/80155/83222.pdf
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Transcriptomic response of the Pacific oyster Crassostrea gigas to hypoxia ArchiMer
Sussarellu, Rossana; Fabioux, Caroline; Le Moullac, Gilles; Fleury, Elodie; Moraga, Dario.
Marine intertidal organisms commonly face hypoxic stress during low tide emersion; moreover, eutrophic conditions and sediment nearness could lead to hypoxic phenomena; it is indeed important to understand the molecular processes involved in the response to hypoxia. In this study the molecular response of the Pacific oyster Crassostrea gigas to prolonged hypoxia (2 mg O-2 L-1 for 20 d) was investigated under experimental conditions. A transcriptomic approach was employed using a cDNA microarray of 9058 C. gigas clones to highlight the genetic expression patterns of the Pacific oyster under hypoxic conditions. Lines of oysters resistant (R) and susceptible (S) to summer mortality were used in this study. ANOVA analysis was used to identify the genes...
Tipo: Text Palavras-chave: Mollusca; Hypoxia; CDNA microarray; Gene expression; Oxidative stress; Respiratory chain.
Ano: 2010 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00027/13799/11053.pdf
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RESCO : analyses statitistiques des données de 2009 à 2011 ArchiMer
Fleury, Elodie; Jolivel, Aude.
Tipo: Text
Ano: 2012 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00122/23340/21164.pdf
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REPAMO 2016. Bulletins de la surveillance. Janvier à juin et décembre 2016 ArchiMer
Osta Amigo, Axel; Robert, Stephane; Fleury, Elodie; Lupo, Coralie; Garcia, Celine; Geairon, Philippe.
Ce document compile l’ensemble des bulletins de la surveillance de la santé des mollusques marins émis au cours de l’année 2016 par le réseau REPAMO. Ces bulletins, édités à fréquence mensuelle, relatent les événements de mortalité notifiés au réseau ainsi que les résultats des analyses effectuées lors des prélèvements d’animaux réalisés sur les lieux des mortalités. Les bulletins sont diffusés aux instances professionnelles concernées (CRC, CNC, CDPMEM, CNPMEM, centres techniques), à la DGAL, à la DPMA, aux laboratoires d’analyses, à Ifremer ainsi que sur le site internet du REPAMO. Ils ont pour objectif de tenir les destinataires informés des épisodes de mortalités anormales de mollusques marins rencontrés sur le littoral français métropolitain et corse.
Tipo: Text Palavras-chave: REPAMO; Surveillance zoosanitaire; Mollusques marins; Mortalités.
Ano: 2018 URL: https://archimer.ifremer.fr/doc/00480/59210/61902.pdf
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In situ markers of Crassostrea gigas oyster sensibility to pathogen infection : toward the selection of early indicators of summer mortality ArchiMer
Fleury, Elodie; Normand, Julien; Suquet, Eloïse; Dechamps, Lucie; Quillien, Virgile; Richard, Marion; Cochennec-laureau, Nathalie.
Massive mortalities of Crassostrea gigas spat associated with OsHV-1 virus occurred every year since 2008, all along the French coasts. Previous experimental studies lead to identify physiological functions of the oyster metabolism that responds to infection, denoting infection routes and symptoms or indicating immune response. Among these functions, studies highlighted several genes whose expression was significantly down or upregulated before the mortality event. The expression of these genes should be then used as predictive indicator of oyster response to pathogen infection, including marker-associated selection. In this study, two experiments were designed to identify genes linked to early infection response of Pacific oyster spat during in situ...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00286/39768/38261.pdf
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RESCO - Réseau d'observations Conchylicoles : Rapport annuel Campagne 2014. ArchiMer
Fleury, Elodie.
Après cinq ans de suivi des performances conchylicoles sur 13 sites ateliers repartis sur le littoral français, le réseau RESCO a permis d’approfondir les connaissances concernant la dynamique spatio-temporelle des mortalités d’huîtres. Cependant, il était apparu très difficile d’être suffisamment exhaustif sur le choix des lots sentinelles suivis, et les résultats obtenus ne pouvaient pas représenter toute la diversité des lots d’huîtres creuses cultivées sur les côtes françaises. Par conséquent, le protocole du RESCO a légèrement évolué en 2014 afin de palier à ces biais mais aussi d’améliorer la lisibilité des objectifs du réseau. Pour ce faire, deux actions principales ont été mises en oeuvre : (i) l’introduction dans les suivis d’un nouveau matériel...
Tipo: Text
Ano: 2015 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00287/39794/38271.pdf
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Exploration fonctionnelle de gènes différentiellement exprimés entre les souches d'huîtres creuses Crassostrea gigas résistantes et sensibles à la mortalité estivale ArchiMer
Fleury, Elodie.
This work contributed to the development of specific genomic tools for the Pacific oyster Crassostrea gigas, aiming to identify molecular markers associated with summer survival of this species. To do so, 29745 ESTs obtained from different sequencing programs were grouped in a unique database. 9058 unigenes have been used to produce a cDNA microarray, to compare lines selected to be Resistant (R) or Sensitive (S) to summer mortality. 34 genes were observed as differentially expressed before the mortality event. Most of these genes are associated with reproduction and oxidative stress. This underlines the implication of the cost of reproduction and the importance of oxidative stress defenses in development of an immune weakness before the mortality event....
Tipo: Text Palavras-chave: Reproduction; Transforming Growth Factor b; Micorarray; Database; Summer mortality; Bivalves; Reproduction; Transforming Growth Factor b; Puce à ADN; Base de données; Mortalité estivale; Bivalves.
Ano: 2009 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/2009/these-6462.pdf
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Bilan 2016 du dispositif national de surveillance de la santé des mollusques marins ArchiMer
Lupo, Coralie; Fleury, Elodie; Normand, Julien; Osta Amigo, Axel; Robert, Stephane; Canier, Lydie; Francois, Cyrille; Garcia, Celine.
Depuis 1992, une surveillance de la santé des mollusques marins du littoral français est assurée par le réseau de Pathologie des Mollusques (Repamo). Ses activités s’inscrivent dans le cadre de la Directive Européenne 2006/88/CE. Depuis son évaluation par la plateforme nationale d’épidémiosurveillance en santé animale en 2012, l’objectif de surveillance est la détection précoce des infections dues à des organismes pathogènes exotiques et émergents affectant les mollusques marins sauvages et d’élevage. L’année 2016 est la deuxième année de transition pour laquelle une évolution des modalités de surveillance de la santé des mollusques marins animées par l’Ifremer a été amorcée. Un dispositif hybride de surveillance a été mis en place en 2015, s’appuyant sur...
Tipo: Text Palavras-chave: Réseau; Surveillance; Pathologie; Mollusques; Coquillages; Santé; Mortalité; Maladie.
Ano: 2017 URL: http://archimer.ifremer.fr/doc/00386/49781/50327.pdf
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