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Barili,Leiri Daiane; Vale,Naine Martins do; Amaral,Rodolfo de Castro; Carneiro,José Eustáquio de Souza; Silva,Fabyano Fonseca e; Carneiro,Pedro Crescêncio Souza. |
RESUMO: O objetivo deste trabalho foi estudar os parâmetros de adaptabilidade e estabilidade fenotípica e avaliar o incremento na produtividade de grãos em genótipos de feijão preto, desenvolvidos pelos programas brasileiros de melhoramento genético entre os anos de 1960 a 2013. Os experimentos foram realizados considerando 38 cultivares e duas linhagens em quatro ambientes (Coimbra e Viçosa nas safras da seca e de inverno de 2013), usando um delineamento em blocos casualizados com três repetições. Os resultados evidenciaram incremento efetivo na produtividade de grãos, proporcionado pela recomendação de novas cultivares pelos programas de melhoramento de feijão do Brasil nas últimas cinco décadas. Além disso, a análise da interação GxA indicou que as... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris L.; Melhoramento genético; Interação GxA; Incremento na produtividade. |
Ano: 2015 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782015001101980 |
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Azevedo,Camila Ferreira; Silva,Fabyano Fonseca e; Rezende,Marcos Deon Vilela de; Peternelli,Luiz Alexandre; Guimarães,Simone Eliza Facione; Lopes,Paulo Sávio. |
A principal contribuição da genética molecular é a utilização direta das informações de DNA no processo de identificação de indivíduos geneticamente superiores. Sob esse enfoque, idealizou-se a seleção genômica ampla (Genome Wide Selection - GWS), a qual consiste na análise de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms) amplamente distribuídos no genoma. Devido a esse grande número de SNPs, geralmente maior que o número de indivíduos genotipados, e à alta colinearidade entre eles, métodos de redução de dimensionalidade são requeridos. Dentre estes, destaca-se o método de regressão via Quadrados Mínimos Parciais (Partial Least Squares - PLS), que além de solucionar tais problemas, permite uma abordagem multivariada, considerando múltiplos fenótipos.... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Seleção genômica; Redução de dimensionalidade; Análise multivariada. |
Ano: 2013 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000900017 |
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Barroso,Laís Mayara Azevedo; Nascimento,Moysés; Barili,Leiri Daiane; Nascimento,Ana Carolina Campana; Vale,Naine Martins do; Silva,Fabyano Fonseca e; Carneiro,José Eustáquio de Souza. |
ABSTRACT: The aim of this study was to use quantile regression (QR) to characterize the effect of the adaptability parameter throughout the distribution of the productivity variable on black bean cultivars launched by different national research institutes (research centers) over the last 50 years. For this purpose, 40 cultivars developed by Brazilian genetic improvement programs between 1959 and 2013 were used. Initially, QR models were adjusted considering three quantiles (τ = 0.2, 0.5 and 0.8). Subsequently, with the confidence intervals, quantile models τ = 0.2 and 0.8 (QR0.2 and QR0.8) showed differences regarding the parameter of adaptability and average productivity. Finally, by grouping the cultivars into one of the two groups defined from QR0.2... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Gene-environment (GxE) interaction; Phaseolus vulgaris L; Genetic improvement; Quantiles; Regression models. |
Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782019000300200 |
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Puiatti,Guilherme Alves; Cecon,Paulo Roberto; Nascimento,Moysés; Nascimento,Ana Carolina Campana; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Silva,Fabyano Fonseca e; Puiatti,Mário; Cruz,Cosme Damião. |
ABSTRACT: The objective of this study was to adjust nonlinear quantile regression models for the study of dry matter accumulation in garlic plants over time, and to compare them to models fitted by the ordinary least squares method. The total dry matter of nine garlic accessions belonging to the Vegetable Germplasm Bank of Universidade Federal de Viçosa (BGH/UFV) was measured in four stages (60, 90, 120 and 150 days after planting), and those values were used for the nonlinear regression models fitting. For each accession, there was an adjustment of one model of quantile regression (τ=0.5) and one based on the least squares method. The nonlinear regression model fitted was the Logistic. The Akaike Information Criterion was used to evaluate the goodness of... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Quantile regression; Nonlinear regression; Allium sativum L.; Growth rate; Cluster analysis.. |
Ano: 2020 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782020000100203 |
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Reis,Ricardo Luis dos; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Sáfadi,Thelma; Aquino,Luiz Henrique de. |
Este trabalho tem como objetivo realizar uma análise bayesiana de modelos, por meio do fator de Bayes, para o desequilíbrio de Hardy-Weinberg. Pretende-se também testar a metodologia por meio da simulação de dados e aplicá-la a um conjunto de dados reais. Na definição dos modelos, utilizaram-se as prioris Dirichlet (modelo 1), Beta - função degrau Uniforme (modelo 2), Uniforme - função degrau Uniforme (modelo 3) e as prioris independentes Uniformes (modelo 4) relacionadas aos parâmetros coeficiente de endogamia e proporção alélica. Foi implementado um algoritmo no software livre R para realizar a amostragem pelo Metropolis-Hastings das distribuições condicionais a posteriori dos parâmetros dos modelos. A convergência das cadeias foram monitoradas por meio... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Fator de Bayes; Desequilíbrio de Hardy-Weinberg; Simulação de dados. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000600018 |
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Mazzini,Ana Rita de Assumpção; Muniz,Joel Augusto; Silva,Fabyano Fonseca e; Aquino,Luiz Henrique de. |
O objetivo do presente trabalho foi ajustar os modelos de crescimento Brody, Gompertz, Logístico e Von Bertalanffy a dados de peso e idade de 152 novilhos Hereford através dos métodos dos quadrados mínimos ordinários (QMO), quadrados mínimos ponderados (QMP), quadrados mínimos ponderados generalizados com erros autorregressivos de primeira (QMPG-AR1) e segunda (QMPG-AR2) ordens. Utilizou-se o procedimento MODEL do software Statistical Analysis System (SAS) através das opções WEIGTH e %AR. Os modelos foram comparados pelos seguintes avaliadores de qualidade do ajuste: percentual de convergência, quadrado médio do resíduo, coeficiente de determinação ajustado e erro de predição médio. Os modelos Gompertz e von Bertalanffy ajustados pelos métodos QMP,... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Curva de crescimento; Gado Hereford; Heterocedasticidade; Autocorrelação residual. |
Ano: 2005 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782005000200028 |
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Silveira,Fernanda Gomes da; Silva,Fabyano Fonseca e; Carneiro,Paulo Luiz Souza; Malhado,Carlos Henrique Mendes; Muniz,Joel Augusto. |
Este estudo teve como objetivo utilizar a análise de agrupamento para classificar modelos de regressão não-lineares usados para descrever a curva de crescimento de ovinos cruzados, tendo em vista os resultados de diferentes avaliadores de qualidade de ajuste. Para tanto, utilizaram-se dados de peso-idade dos seguintes cruzamentos entre raças de ovinos de corte: Dorper x Morada Nova, Dorper x Rabo Largo e Dorper x Santa Inês. Após a indicação do melhor modelo, objetivou-se ainda aplicar a técnica de identidade de modelos a fim de identificar o cruzamento mais produtivo. Foram ajustados doze modelos não-lineares, cuja qualidade de ajuste foi medida pelo coeficiente de determinação ajustado, critérios de informação de Akaike e Bayesiano, erro quadrático médio... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Classificação multivariada; Identidade de modelos; Ovis aries. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000400024 |
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Gonçalves,Renata Pires; Chaves,Lucas Monteiro; Savian,Taciana Villela; Silva,Fabyano Fonseca e; Paixão,Crysttian Arantes. |
Dentro do contexto nutricional, a suplementação de microminerais em rações para aves frequentemente é feita em quantidades superiores às exigidas na tentativa de assegurar o bom desempenho dos animais. Os experimentos do tipo dose resposta são muito comuns na determinação de níveis ótimos dos nutrientes na ração e contemplam a utilização de modelos de regressão para atingir tal objetivo. Porém, na análise de regressão usual, geralmente, não se usa uma informação a priori sobre uma possível relação de ordem na variável resposta. A regressão isotônica é um método de estimação por mínimos quadrados que gera estimativas que satisfazem a mesma ordenação dos dados. Na teoria da regressão isotônica, essa informação é utilizada de forma essencial e espera-se que a... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Isotonização; Modelos segmentados; Modelos não lineares. |
Ano: 2012 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782012000200026 |
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Puiatti,Guilherme Alves; Cecon,Paulo Roberto; Nascimento,Moysés; Nascimento,Ana Carolina Campana; Carneiro,Antônio Policarpo Souza; Silva,Fabyano Fonseca e; Puiatti,Mário; Oliveira,Ana Carolina Ribeiro de. |
ABSTRACT: Plant growth analyses are important because they generate information on the demand and necessary care for each development stage of a plant. Nonlinear regression models are appropriate for the description of curves of growth, since they include parameters with practical biological interpretation. However, these models present information in terms of the conditional mean, and they are subject to problems in the adjustment caused by possible outliers or asymmetry in the distribution of the data. Quantile regression can solve these problems, and it allows the estimation of different quantiles, generating more complete and robust results. The objective of this research was to adjust a nonlinear quantile regression model for the study of dry matter... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Quantile regression; Nonlinear regression; Dry matter; Allium sativum L. |
Ano: 2018 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000100203 |
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Melo,Ana Lúcia Puerro de; Torres,Robledo de Almeida; Ribeiro Júnior,José Ivo; Silva,Fabyano Fonseca e; Rodrigues,Marcelo Teixeira; Silva,Felipe Gomes da; Brito,Luiz Fernando; Brito,Luiz Fernando. |
Objetivou-se com este trabalho apresentar uma metodologia de identificação e modelagem da autocorrelação residual considerando ajustes individuais do modelo de Wood às lactações de cabras leiteiras e também avaliar a influência de tal modelagem na qualidade do ajuste. O modelo de Wood foi ajustado individualmente às lactações, considerando três estruturas residuais. Na primeira, assumiu-se independência dos erros (EI) para todas as lactações, na segunda, assumiu-se a estrutura de erros autoregressivos de primeira ordem (AR1) para todas as lactações e, na terceira, nomeada por EI-AR1, foi utilizada a estrutura de erros AR1 somente para as lactações que apresentaram autocorrelação residual, segundo o teste de Durbin-Watson, e de EI para as demais. As três... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Durbin-Watson; Erros independentes; Resíduos autoregressivos. |
Ano: 2011 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011001000024 |
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Savian,Taciana Villela; Muniz,Joel Augusto; Sáfadi,Thelma; Silva,Fabyano Fonseca e. |
Neste estudo, utilizou-se a metodologia bayesiana para ajustar os modelos de ORSKOV & MCDONALD (1979) e MCDONALD (1981) a conjuntos de dados simulados e a um conjunto de dados de porcentagem de degradação da fibra em detergente neutro da gramínea coastcross (Cynodon dactylon x Cynodon nlemfuensis), ao longo do tempo. As amostras das distribuições marginais a posteriori dos parâmetros foram obtidas por meio dos métodos de Monte Carlo com cadeias de Markov (MCMC), especificamente, os algoritmos Amostrador de Gibbs e Metropolis-Hastings. A metodologia bayesiana mostrou-se eficiente, sendo avaliada e comprovada pelo estudo de simulação, que apresentou estimativas bem próximas ao valor paramétrico. As estimativas obtidas para os parâmetros dos modelos... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Modelo não linear; Degradabilidade in situ; Métodos MCMC; Inferência bayesiana. |
Ano: 2009 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782009000700033 |
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Suela,Matheus Massariol; Lima,Leísa Pires; Azevedo,Camila Ferreira; Resende,Marcos Deon Vilela de; Nascimento,Moysés; Silva,Fabyano Fonseca e. |
ABSTRACT: Rice cultivation has great national and global importance, being one of the most produced and consumed cereals in the world and the primary food for more than half of the world’s population. Because of its importance as food, developing efficient methods to select and predict genetically superior individuals in reference to plant traits is of extreme importance for breeding programs. The objective of this research was to evaluate and compare the efficiency of the Delta-p, G-BLUP (Genomic Best Linear Unbiased Predictor), BayesCpi, BLASSO (Bayesian Least Absolute Shrinkage and Selection Operator), Delta-p/G-BLUP index, Delta-p/BayesCpi index, and Delta-p/BLASSO index in the estimation of genomic values and the effects of single nucleotide... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Genomic prediction; Selection index; Genetic gain. |
Ano: 2019 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782019000600404 |
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Azevedo,Camila Ferreira; Silva,Fabyano Fonseca e; Ribeiro,Natália Barbosa; Silva,Derly Jose Henriques da; Cecon,Paulo Roberto; Barili,Leiri Daiane; Pinheiro,Valeria Rosado. |
O objetivo deste trabalho foi apresentar uma metodologia de análise de experimentos em fitopatologia que considera a comparação de curvas de progressos de doenças na presença de um grande número de tratamentos por meio da análise de cluster. Foram cultivados 42 acessos do Banco de Germoplasma de Hortaliças (BGH) da Universidade Federal de Viçosa (UFV). Ajustou-se o modelo exponencial aos dados de percentagem de severidade de requeima, e as estimativas obtidas quanto à incidência inicial da doença (y o) e taxa de progresso da doença (r) foram submetidas à análise de variância multivariada (Manova), seguindo o delineamento de blocos casualizados. As médias ajustadas foram submetidas à análise de agrupamento hierárquico, o método centroide. Observou-se um... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/report |
Palavras-chave: Análise de cluster; Melhoramento genético. |
Ano: 2012 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782012000300005 |
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Barili,Leiri Daiane; Vale,Naine Martins do; Silva,Fabyano Fonseca e; Carneiro,José Eustáquio de Souza; Oliveira,Hinayah Rojas de; Vianello,Rosana Pereira; Valdisser,Paula Arielle Mendes Ribeiro; Nascimento,Moyses. |
ABSTRACT: We aimed to apply genomic information based on SNP (single nucleotide polymorphism) markers for the genetic evaluation of the traits “stay-green” (SG), plant architecture (PA), grain aspect (GA) and grain yield (GY) in common bean through Bayesian models. These models were compared in terms of prediction accuracy and ability for heritability estimation for each one of the mentioned traits. A total of 80 cultivars were genotyped for 377 SNP markers, whose effects were estimated by five different Bayesian models: Bayes A (BA), B (BB), C (BC), LASSO (BL) e Ridge regression (BRR). Although, prediction accuracies calculated by means of cross-validation have been similar within each trait, the BB model stood out for the trait SG, whereas the BRR was... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: Phaseolus vulgaris; SNP markers; Cross-validation. |
Ano: 2018 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782018000800204 |
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Silveira,Fernanda Gomes da; Duarte,Darlene Ana Souza; Chaves,Lucas Monteiro; Silva,Fabyano Fonseca e; Filho,Ivan Carvalho; Duarte,Marcio de Souza; Lopes,Paulo Sávio; Guimarães,Simone Eliza Facioni. |
ABSTRACT: The main application of genomic selection (GS) is the early identification of genetically superior animals for traits difficult-to-measure or lately evaluated, such as meat pH (measured after slaughter). Because the number of markers in GS is generally larger than the number of genotyped animals and these markers are highly correlated owing to linkage disequilibrium, statistical methods based on dimensionality reduction have been proposed. Among them, the partial least squares (PLS) technique stands out, because of its simplicity and high predictive accuracy. However, choosing the optimal number of components remains a relevant issue for PLS applications. Thus, we applied PLS (and principal component and traditional multiple regression)... |
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article |
Palavras-chave: SNP; Genomic prediction; Meat quality. |
Ano: 2017 |
URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782017000100652 |
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