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Utilização de microssatélites e RAPD na caracterização molecular de acessos de Paspalum urvillei Steudel R. Bras. Zootec.
Sawasato,Joaquim Taizo; Dall'Agnol,Miguel; Conceição,Daniele Priscila da; Tafernaberri Junior,Vilmar; Klafke,Gabriel Baracy.
Este estudo foi realizado com o objetivo de verificar a diversidade genética na coleção de acessos de P. urvillei do Departamento de Plantas Forrageiras e Agrometeorologia (DPFA) da Faculdade de Agronomia (UFRG) visando sua utilização em futuros trabalhos de seleção. Foram avaliados 64 acessos provenientes do Rio Grande do Sul, 1 de Xanxerê, Santa Catarina, três de Curitiba, Paraná, e 1 da Argentina. A diversidade genética foi analisada por meio de marcadores do tipo RAPD e SSR. Utilizaram-se dez primers para marcadores RAPD, o que possibilitou obter 56 bandas polimórficas e 11 grupos no dendrograma com similaridade média de 0,70. Na técnica de SSR, foram utilizados sete primers e obtidas 28 bandas polimórficas, formando sete grupos no dendrograma com...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diversidade genética; Marcadores moleculares; Melhoramento de plantas; Paspalum urvillei.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1516-35982008000800005
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Desempenho agronômico e divergência genética de genótipos de coentro Rev. Ciênc. Agron.
Bertini,Cândida Hermínia de Magalhães; Pinheiro,Everton Alves Rodrigues; Nóbrega,Gabriel Nuto; Duarte,José Moacir de Lima.
Cinco genótipos de Coriandrum sativum, procedentes de diferentes regiões do Estado do Ceará e duas cultivares comerciais, foram avaliados objetivando-se identificar genótipos com potencial agronômico para serem utilizados em programa de melhoramento genético por meio de análise de desempenho e divergência genética. O trabalho foi conduzido no período de setembro a dezembro de 2007 no município de Fortaleza-CE. O delineamento utilizado foi o aleatorizado em blocos com três repetições, onde os genótipos e cultivares foram considerados tratamentos. Na análise de desempenho verificou-se diferença entre as médias dos genótipos avaliados para as características: altura da planta, diâmetro do colo, surgimento da primeira inflorescência, antese, média de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Coriandrum sativum; Fenologia vegetal; Melhoramento genético; Diversidade genética.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1806-66902010000300013
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Variabilidade genética de etnovariedades de mandioca, avaliada por marcadores de DNA Scientia Agricola
Mühlen,Gilda Santos; Martins,Paulo Sodero; Ando,Akihiko.
O objetivo deste trabalho foi quantificar a variabilidade genética de etnovariedades ("folk varieties") de mandioca e examinar a distribuição desta variabilidade entre grupos de etnovariedades de diferentes locais de origem e tipos. Foram escolhidas 54 etnovariedades de mandioca originárias de quatro regiões brasileiras: 45 etnovariedades da Amazônia (23 do Rio Negro, 6 do Rio Branco e 16 do Rio Solimões) e 9 do litoral sul do Estado de São Paulo. A variedade moderna Mantiqueira<A HREF="#1not">¹</A>, de ampla distribuição mundial, também foi incluída. Destas, 38 variedades eram mandiocas bravas e 17 de mesa (aipins ou macaxeiras). Foram utilizados três tipos de marcador de DNA: RAPD, AFLP e microssatélites. A análise dos resultados consistiu na...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Manihot esculenta; Aipim; Marcador; Diversidade genética.
Ano: 2000 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-90162000000200020
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Brachiaria access germplasm distinction using SDS PAGE Agronomy
Machado Neto, Nelson Barbosa; UNOESTE; Custodio, Ceci Castilho; UNOESTE; Pal Flandorfer Peniche, Anthal Geza; UNOESTE.
Brachiaria is a very important grass used as forage in tropical countries. However, improvement of Brachiaria species is slow and time consuming, being made essentially by introduction of the foreign genetic material. To verify the difference among accesses of different species of Brachiaria, five access of six species, were submitted to SDS-PAGE. The accesses of Brachiaria presented variations in almost all the species. Brachiaria jubata showed little variation, meaning that received samples are very homogeneous genetically. The other species present enough variations to separate wild accesses
Palavras-chave: 5.00.00.00-4 Ciências Agrárias proteínas solúveis; Acessos genéticos; Eletroforese; Diversidade genética; Brachiaria 5.00.00.00-4 Ciências Agrárias.
Ano: 2002 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/2399
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Diversidade genética e identificação de híbridos por marcadores RAPD em feijão-de-vagem - DOI: 10.4025/actasciagron.v27i3.1466 Agronomy
Silva, Marlon Peres da; UNIG; Amaral Júnior, Antonio Teixeira do; UENF; Pereira, Messias Gonzaga; UENF; Rodrigues, Rosana; UENF; Daher, Rogério Figueiredo; UENF; Posse, Sheila Cristina Prucoli; UENF.
Cinco acessos de feijão-de-vagem da Coleção de Germoplasma da UENF foram avaliados quanto à diversidade genética por meio de caracteres morfoagronômicos e marcadores RAPD. Para tanto, foram utilizados os métodos multivariados de Agrupamento de Tocher e “Hierárquico do Vizinho Mais Próximo” e análise por meio de Variáveis Canônicas. Os resultados de cada método apresentaram semelhança, indicando a existência de variabilidade. A formação de grupos entre os genitores variou de acordo com o tipo de vagem. Conclui-se que é possível, em nível molecular ou morfoagronômico, inferir a respeito da diversidade genética dos genitores. Os marcadores RAPD permitiram a inequívoca identificação de híbridos.
Palavras-chave: 5.01.00.00-9 Agronomia feijão-de-vagem; Diversidade genética; Marcadores RAPD 5.01.00.00-9 Agronomia.
Ano: 2005 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/1466
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Diversidade genética e eficiência da predição do comportamento de híbridos de pimentão (Capsicum annuum L.) Agronomy
Oliveira, Valter Rodrigues; UEM; Scapim, Carlos Alberto; UEM; Casali, Vicente Wagner Dias; UFV.
A diversidade genética entre seis linhagens de pimentão, em relação a oito características de crescimento e nutricionais, foi avaliada por meio de técnicas de análise multivariada (distâncias D2ii' de Mahalanobis, agrupamento pelo método de Tocher e análise por variáveis canônicas). Com base nas distâncias D2ii' estimadas, avaliou-se também a relação entre a dissimilaridade genética predita e a média de matéria seca total, a heterose em relação à média dos progenitores e à capacidade específica de combinação dos híbridos F1, por meio dos coeficientes de correlação de Pearson e Spearman. Houve manifestação de ampla variabilidade genética, destacando-se as linhagens P-141-152-F14, P-142-403-F11 e P-141-190-F16 pela dissimilaridade entre si e em relação ao...
Palavras-chave: 5.01.00.00-9 Agronomia capacidade específica de combinação; Diversidade genética; Heterose; Pimentão 5.01.00.00-9 Agronomia.
Ano: 1998 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/4354
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Variabilidade genética em alface (Lactuca sativa L.) e determinação do número ótimo de marcas RAPD para estudos de diversidade molecular - DOI: 10.4025/actasciagron.v25i1.2142 Agronomy
Tardin, Flávio Dessune; UENF; Amaral Júnior, Antonio Teixeira do; UENF; Pereira, Messias Gonzaga; UENF; Vidigal, Maria Celeste Gonçalves; UEM; Daher, Rogério Figueiredo; UENF; Scapim, Carlos Alberto; UEM.
Vinte acessos de alface da Coleção de Germoplasma da UENF foram avaliados quanto à diversidade genética, pelo uso de marcadores RAPD. Foram empregadas técnicas estatísticas multivariadas, como análises de agrupamento, utilizando-se os métodos de Tocher e ‘Hierárquico do Vizinho Mais Próximo’. Pela análise de 55 fragmentos polimórficos obtidos com 25 ‘primers’, os acessos BGH 4060 e Grand Rapids foram os mais dissimilares, enquanto Regina e Repolhuda Todo Ano foram os mais semelhantes. Constatou-se elevada concordância entre a origem ecogeográfica e a similaridade molecular. Verificou-se, ainda, que 50 fragmentos polimórficos foram o número ótimo de marcadores para uma análise segura da diversidade genética nos acessos avaliados.
Palavras-chave: 5.00.00.00-4 Ciências Agrárias Lactuca sativa; Diversidade genética; Marcadores RAPD 5.00.00.00-4 Ciências Agrárias.
Ano: 2003 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/2142
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Diversidade isozímica em variedades RB (República do Brasil) de cana-de-açúcar (Saccharum spp) - DOI: 10.4025/actascibiolsci.v25i1.2094 Biological Sciences
Orasmo, Gleice Ribeiro; UEM; Machado, Maria de Fátima Pires da Silva; Biologia - UEM.
A eletroforese de isoenzimas foi usada como um método para encontrar marcadores bioquímicos para a identificação de genótipos e para determinar a diversidade genética em cinco variedades de cana-de-açúcar, Saccharum spp. (Poaceae) cultivadas na região norte do estado do Paraná, sul do Brasil. As cinco variedades RB (República do Brasil) representam um material genético melhorado, usado para a produção de açúcar e de álcool. O padrão de isoenzimas SOD pode ser usado como um marcador bioquímico para discriminar as variedades RB (72454, 835089, 845257, 855156 e 855536) de cana-de-açúcar. A proporção de loci polimórficos foi de 25% para as variedades RB835089, RB855156, RB855536 e RB72454, e de 18.8% para a variedade RB845257. A diversidade genética mostrou...
Palavras-chave: 2.01.00.00-0 Biologia Geral isoenzimas; Cana-de-açúcar; Diversidade genética; Melhoramento genético 2.01.00.00-0 Biologia Geral.
Ano: 2003 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciBiolSci/article/view/2094
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Fraca relação entre diversidade genética e biológica de populações naturais de Trypanosoma cruzi - DOI: 10.4025/actascibiolsci.v28i2.1044 Biological Sciences
Andó, Mirian Hitomi; Hemocentro Regional de Maringá; Bértoli, Marta; Hemocentro Regional de Maringá; Toledo, Max Jean de Ornelas; UEM; Gomes, Mônica Lúcia; UEM; Guedes, Terezinha Aparecida; UEM; Araújo, Silvana Marques; UEM.
Este trabalho estudou a relação entre diversidade genética e biológica de populações naturais de Trypanosoma cruzi do Estado do Parana, isoladas de humanos (H), classificadas como T. cruzi II, e de reservatórios silvestres (G), e triatomíneos (T) classificadas como T. cruzi I. Foram avaliados 25 parâmetros biológicos relacionados à cinética de crescimento e de metaciclogênese em meios LIT e M16, à infectividade em camundongos BALB/c e à suscetibilidade ao benznidazol. Os achados falam a favor de uma fraca relação entre distância genética e diferenças biológicas utilizando cepas. A comparação estatística entre as médias de cada parâmetro, considerando os diferentes hospedeiros, mostrou que o grupo T. cruzi II (H) foi significativamente diferente do grupo T....
Palavras-chave: 2.13.00.00-3 Parasitologia Trypanosoma cruzi; Diversidade genética; Diversidade biológica 2.13.00.00-3 Parasitologia.
Ano: 2006 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciBiolSci/article/view/1044
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Diversidade genética entre três linhagens de codorna selecionadas para produção de ovos Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Prioli,R.A.; Gasparino,E.; Soares,M.A.M.; Marques,D.S.; Blanck,D.V.; Prioli,S.M.A..
A diversidade genética entre três linhagens de codorna (Coturnix japônica) foi avaliada utilizando-se a técnica de random amplified polymorphic DNA (RAPD). As linhagens selecionadas para produção de ovos foram identificadas como amarela, azul e vermelha por meio de anilhas no pé esquerdo. Seis primers de RAPD amplificaram 55 loci, os quais geraram padrão de bandas intensa e reproduzível em gel de agarose. Os resultados indicaram polimorfismos dentro e entre as linhagens. A similaridade de Jaccard média e o índice de diversidade Shannon revelaram alta diversidade dentro das linhagens de codornas. O teste de Mantel por meio do algoritmo unweighted pair-group method using arithmetic average (UPGMA) e a dispersão de coordenadas principais indicaram...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Codorna; Coturnix japonica; Diversidade genética; RAPD.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352010000300030
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Avaliação genética de populações naturais e de estoques de um programa de repovoamento de pacu (Piaractus mesopotamicus) utilizando marcadores microssatélite Arq. Bras. Med. Vet. Zootec.
Lopera-Barrero,N.M.; Ribeiro,R.P.; Povh,J.A.; Sirol,R.N.; Mangolin,C.A..
Utilizaram-se marcadores microssatélites para estimar a diversidade genética de grupos de pacu (Piaractus mesopotamicus) coletados nas escadas de transposição das hidroelétricas de Canoas I (CI) e Canoas II (CII), no Rio Paranapanema, e de um estoque e uma progênie utilizados em programas de repovoamento nesse rio. Os loci microssatélites produziram 16 alelos e heterozigosidade observada média similar entre os indivíduos do rio nos dois tempos de coleta (CI14 = 0,7356; CI28 = 0,7361; CII14 = 0,7442; e CII28 = 0,7507), do estoque e da progênie (0,7261 e 0,7287, respectivamente). Foram observados desvios no equilíbrio de Hardy-Weinberg, e valores negativos do índice de fixação com excesso de heterozigotos que indicaram ausência de endogamia. As análises de...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Peixe; Pacu; Conservação genética; Diversidade genética; Escadas de transposição.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-09352010000400027
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Elevada diversidade genética interpopulacional em Oryza glumaepatula Steud. (Poaceae) avaliada com microssatélites Biota Neotropica
Silva,Cynthia Maria; Karasawa,Marines Marli Gniech; Vencovsky,Roland; Veasey,Elizabeth Ann.
Marcadores microssatélites foram usados para caracterizar a diversidade genética entre e dentro de sete populações naturais de Oryza glumaepaula. Seis dessas populações são originárias da bacia hidrográfica da Amazônia e uma do rio Paraguai no Pantanal Matogrossense. Utilizando sete locos de microssatélites, observou-se diversidade genética intrapopulacional média de 1,98 alelos por loco, 56,2% de locos polimórficos, Ho = 0,026 e He = 0,241. Elevada diferenciação interpopulacional foi observada pelo índice de fixação de Wright e pelo parâmetro de divergência de Slatkin (F ST = 0,715 e R ST = 0,595, respectivamente), bem como elevado nível de endogamia total (F IT = 0,963), em grande parte influenciada pelo sistema reprodutivo (F IS = 0,858). Verificou-se...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Diversidade genética; Estrutura genética; Oryza glumaepatula; Microssatélites; Sistema reprodutivo; Populações.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1676-06032007000200019
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Caracterização agromorfológica interpopulacional em Oryza glumaepatula Bragantia
Rosa,Mariana Silva; Santos,Patrícia Pimentel dos; Veasey,Elizabeth Ann.
O gênero Oryza apresenta duas espécies cultivadas e 21 espécies silvestres, sendo quatro originárias da América do Sul e Central. Dentre essas, a única espécie diplóide é Oryza glumaepatula Steud., compatível em cruzamentos com a espécie cultivada O. sativa L. O objetivo deste trabalho foi caracterizar, por meio de caracteres agromorfológicos, oito populações de O. glumaepatula, coletadas em diferentes bacias hidrográficas brasileiras. O experimento foi realizado em casa de vegetação utilizando-se o delineamento em blocos ao acaso com oito tratamentos e seis repetições. Cada parcela foi constituída de quatro plantas, obtendo-se o total de 24 plantas por população. Foram avaliadas três características agronômicas e 18 características morfológicas. Os dados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arroz silvestre; Caracterização morfológica; Caracterização agronômica; Diversidade genética; Oryza glumaepatula.
Ano: 2006 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052006000100002
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Diversidade química de cafeeiros na espécie Coffea canephora Bragantia
Aguiar,Adriano Tosoni da Eira; Fazuoli,Luiz Carlos; Salva,Terezinha de Jesus Garcia; Favarin,José Laércio.
Este trabalho teve por objetivo caracterizar seis variedades de C. canephora do Banco de Germoplasma de Café do Instituto Agronômico, em Campinas. Para tanto, considerou-se a caracterização química de quarenta e sete exemplares analisando-se as variáveis sólidos solúveis, lipídios, trigonelina, ácidos clorogênicos e cafeína nas sementes. Observou-se a existência de grande variação entre e dentro dos diferentes materiais analisados, com valores extremos de 24,53% a 30,68% para sólidos solúveis; 6,61% a 12,27% para lipídios; 0,73% a 1,59% para trigonelina; 3,30% a 6,30% para ácidos clorogênicos e 1,94% a 3,29% para cafeína, indicando a possibilidade de seleção de plantas de interesse para o melhoramento dessa espécie.
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Cafeína; Componentes químicos; Café robusta; Diversidade genética; Trigonelina.
Ano: 2005 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0006-87052005000400007
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Divergência genética entre populações de pessegueiro baseada em características da planta e do fruto Ciência Rural
Silva,José Osmar da Costa e; Cremasco,João Paulo Gava; Matias,Rosana Gonçalves Pires; Silva,Danielle Fabíola Pereira da; Salazar,Alejandro Hurtado; Bruckner,Cláudio Horst.
O presente trabalho teve como objetivo avaliar a divergência genética entre populações de pessegueiro e quantificar a contribuição relativa de 13 características na diversidade, utilizando procedimentos multivariados. Foram analisados 179 indivíduos de 15 populações, com número de indivíduos variando de 3 a 64 plantas. As características avaliadas foram: na planta (densidade de nós por metro em ramos mistos, densidade de gemas vegetativas brotadas por metro de ramo, altura da planta e diâmetro do tronco); nos frutos (comprimento, diâmetro médio, firmeza, teor de sólidos solúveis, acidez total titulável, teor de vitamina C, área percentual de recobrimento com pigmento vermelho da epiderme, coordenada 'b' obtida da epiderme e ângulo hue da epiderme). A...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Prunus pérsica; Diversidade genética; Coeficiente de parentesco; Análise multivariada.
Ano: 2014 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782014001001770
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Variabilidade genética entre acessos de açaizeiro utilizando marcadores microssatélites Ciência e Agrotecnologia
Oliveira,Maria do Socorro Padilha de; Santos,João Bosco dos; Amorim,Edson Perito; Ferreira,Daniel Furtado.
Conduziu-se este trabalho, com o objetivo de caracterizar a variabilidade genética entre 116 acessos de açaizeiro da coleção de germoplasma da Embrapa Amazônia Oriental por marcadores microssatélites (SSR). As reações foram efetuadas com base em 116 amostras de DNA, utilizando sete primers SSR. Os níveis de polimorfismo e as estimativas das distâncias genéticas de Roger foram determinados pelas frequências alélicas e agrupado pelo método UPGMA. Os sete locos SSR revelaram 42 alelos com média de 6 alelos por loco. O conteúdo de informação de polimorfismo (PIC) variou de 0,60 a 0,86 com média de 0,75 e as heterozigosidades observada (Ho) e esperada (He) foram de 0,54 e 0,75, respectivamente. A distância genética média entre todos os acessos foi de 0,61,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Euterpe oleracea; Germoplasma; Polimorfismo; Diversidade genética; SSR.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542010000500025
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Caracterização molecular de cultivares de cana-de-açúcar utilizando marcadores ISSR Ciência e Agrotecnologia
Almeida,Clébia Maria Alves de; Lima,Sue Ellen Nascimento de; Lima,Gaus Silvestre de Andrade; Brito,Júlio Zoé de; Donato,Virgínia Maria Tenório Sabino; Silva,Márcia Vanusa da.
A diversidade genética de catorze cultivares de cana-de-açúcar (Saccharum oficinarum) foi acessada por meio de marcadores moleculares ISSR. Objetivou-se caracterizar molecularmente as cultivares estudadas. Foram utilizados trinta e sete primers de ISSR, dos quais, oito foram eficientes na amplificação do DNA das amostras analisadas, sendo sete primers suficientes para distinguir todas as cultivares de cana-de-açúcar envolvidas nas análises. A faixa de amplicons variou de 300 a 2000 pb. As cultivares RB 92579 e RB 863129 apresentaram maiores coeficientes de similaridade (77%) enquanto as cultivares RB 961 e RB 931611 formaram o grupo com menor similaridade (22%). Os resultados indicam que os marcadores ISSR foram úteis na análise da diversidade genética e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Saccharum oficinarum; Marcadores moleculares ISSR; Diversidade genética.
Ano: 2009 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542009000700012
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Similaridade genética entre clones de seringueira (Hevea brasiliensis), por meio de marcadores RAPD Ciência e Agrotecnologia
Bicalho,Karine Cristina; Oliveira,Luiz Edson Mota de; Santos,João Bosco dos; Mesquita,Alessandro Carlos; Mendonça,Evânia Galvão.
A seringueira [Hevea brasiliensis (Willd. ex. Adr. de Juss) Muell.-Arg.] é uma espécie nativa da região amazônica e compreende a maior fonte produtora de borracha natural do mundo. Na busca de condições mais favoráveis ao cultivo, além da busca pela auto-suficiência na produção de borracha natural, o cultivo da seringueira migrou para outras regiões do país. Objetivou-se, com o presente trabalho, estimar a similaridade genética de genótipos de seringueira, provenientes de regiões distintas do país, Lavras-MG (UFLA) e Campinas-SP (IAC), por meio de marcadores moleculares RAPD. A análise foi efetuada em 41 indivíduos, representados por 17 genótipos diferentes, com base em 19 primers, que geraram 121 fragmentos polimórficos. Os dados foram analisados...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Marcador de DNA; Diversidade genética; Germoplasma; Identidade genética.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542008000500023
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