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STING QUINSd: Quantitative and Unique Identification coupled to Navigation through Structure Descriptors of Sting_RDB. Repositório Alice
SOUSA, J. M. de; JARDINE, J. G..
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Proteínas; Computer software; Proteins.
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/981967
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Concentração de óleo e de proteína em soja indicadas para áreas naturalmente férteis e para solos parcialmente corrigidos em função de doses de magnésio e de manganês. Repositório Alice
MOREIRA, A.; MALAVOLTA, E.; HEIRICHS, R..
Objetivou-se, avaliar a influência do magnésio e do manganês sobre a concentração de óleo e de proteína de soja.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Brasil; Amazonas; Manaus; Plant oils.; Fertilidade do Solo; Manganês; Magnésio; Óleo Vegetal; Proteína; Nutriente; Soja; Solo.; Manganese; Magnesium; Nutrients; Proteins; Soybeans.; Soil fertility; Soil.
Ano: 2001 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/671010
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Efeito do fornecimento de colostro caprino na transferência de imunidade passiva e no estresse de cordeiros. Repositório Alice
MELO, F. C. C. de.
Resumo: O presente trabalho teve como objetivo avaliar a influência do manejo de fornecimento de colostro de cabra na aquisição de imunidade passiva de cordeiros até o desmame, mediante a determinação da proteína total, albumina, globulina e gamaglutamiltransferase (GGT) como possíveis indicadores de transferência de imunidade passiva, bem como a dinâmica dos perfis bioquímicos de glicose, creatinina, uréia, cortisol. Foram utilizados 20 cordeiros, machos e fêmeas, com graus de sangue variados, nascidos de mães pluríparas, no qual 10 cordeiros receberam um fornecimento adicional de 10% do peso vivo de colostro caprino termizado, após o parto, dividido em quatro porções e 10 cordeiros permaneceram com a mãe e se alimentaram com colostro ad libitum. Os...
Tipo: Teses Palavras-chave: Kids.; Hydrocortisone; Caprino; Cabra; Cordeiro; Colostro; Imunoglobulina; Soro de leite; Proteína.; Goats; Lambs; Colostrum; Whey; Immunoglobulins; Proteins; Cortisol..
Ano: 2013 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/997242
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DPIN: um dicionário dos nanoambientes internos das proteínas e seu potencial para transformação em ativos para a agricultura. Repositório Alice
MAZONI, I.; NESHICH, G..
Introdução. Nanoambientes proteicos e suas características. Lista dos descritores físico-químicos e estruturais que caracterizam os nanoambientes específicos. Contribuições. Qual é o significado do conhecimento sobre os nanoambientes proteicos. Um dicionário dos descritores dos nanoambientes terá impacto na variedade de pesquisas que visam a inovação em áreas como agricultura, medicina e biologia em geral. Considerações finais.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Dicionário; Dicionário dos Nanoambientes Internos das Proteínas; Nanoambientes proteicos; STING_RDB; Agricultura; Proteína; Aminoácido; Agriculture; Proteins; Amino acids.
Ano: 2020 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1126267
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PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. Repositório Alice
FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G..
Abstract. PDB-Metrics (http://sms.cbi.cnptia.embrapa.br/SMS/pdb_metrics/index.html) is a component of the Diamond STING suite of programs for the analysis of protein sequence, structure and function. It summarizes the characteristics of the collection of protein structure descriptions deposited in the Protein Data Bank (PDB) and provides a Web interface to search and browse the PDB, using a variety of alternative criteria. PDB-Metrics is a powerful tool for bioinformaticians to examine the data span in the PDB from several perspectives. Although other Web sites offer some similar resources to explore the PDB contents, PDB-Metrics is among those with the most complete set of such facilities, integrated into a single Web site. This program has been developed...
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Bioinformática; Banco de dados de proteína; PDB data distribution statistics; Protein Data Bank; Bioinformatics; Proteins.
Ano: 2006 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/8264
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Atividade de lipoxigenase, teor de óleo e proteína em cultivares de soja com tegumento verde, marrom e preto. Repositório Alice
CIABOTTI, S.; JUHÁSZ, A. C.; SILVA, F. J. F.; MANDARINO, J. M. G.; ZITO, R. K.; SANTOS, E. N. F..
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Soja; Óleo Vegetal; Farinha de Soja; Soybeans; Proteins; Vegetable oil; Soybean oil.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093742
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Effect of soybean proteins ont the enzymatic hydrolysis of different pretreated sugarcane bagasse. Repositório Alice
FLORENCIO, C.; BRONDI, M. G.; FARINAS, C. S..
Tipo: Separatas Palavras-chave: Soybean.; Bagasse; Proteins; Sugarcane..
Ano: 2017 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1086159
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Methodological evaluzation of 2-DE to study root proteomics during nematode infection in cotton and coffee plants. Repositório Alice
FRANCO, O. L.; PEREIRA, J. L.; COSTA, P. H. A. "; ROCHA, T. L.; FR, E. V. S. A.; SA, M. F. G. de; CARNEIRO, R. M. D. G.; CARNEIRO, R. G.; REIS, A. M. dos.
Tipo: Separatas Palavras-chave: Differential expression; Meloydogine; Staining methods; Two-dimensional gels; Proteins.
Ano: 2010 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/882810
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Study of specific nanoenvironments containing [alfa]-helices in all-[alfa] and ([alfa]+[beta])+([alfa]/[beta]) proteins. Repositório Alice
MAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G..
Protein secondary structure elements (PSSEs) such as [alfa]-helices, [beta]-strands, and turns are the primary building blocks of the tertiary protein structure. Our primary interest here is to reveal the characteristics of the nanoenvironment formed by both PSSEs and their surrounding amino acid residues (AARs), which might contribute to the general understanding of how proteins fold.
Tipo: Artigo de periódico Palavras-chave: Teste estatístico; Estrutura secundária de proteína; MANOVA; Student's t-test; Kolmogorov-Smirnov test; Blue Star STING; Protein secondary structure elements; Amino acid residues; Proteína; Aminoácido; Proteins; Statistical analysis; Amino acids.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1093429
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Molecular model of TriBP1, a protein involved in nuclear import. Repositório Alice
BAHIA, D.; BACH-ELIAS, M.; KUSER-FALCÃO, P. R..
Further structural analysis will be performed in order to understand the biological properties and roles of TriBP1 and TriBP2.
Tipo: Anais e Proceedings de eventos Palavras-chave: Bioinformática; Modelo molecular; Proteína; Bioinformatics; Models; Proteins.
Ano: 2007 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1887
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Desempenho produtivo de raças caprinas especializadas e seus mestiços para produção de leite em regiões tropicais: revisão de literatura. Repositório Alice
LOBO, A. M. B. O.; LOBO, R. N. B..
A caprinocultura leiteira no Brasil vem se consolidando nos últimos anos, seja pelo aumento na produção no Nordeste alavancada por políticas públicas, seja pelo aumento na oferta de derivados lácteos, com alto valor agregado, observado com maior intensidade nas regiões Sul e Sudeste do País. Esse crescimento, ao exemplo do que ocorreu em outros países tropicais e subtropicais, tem sido sustentado pelo uso de material genético importado, notadamente de países da Europa, de raças como a Saanen, as Alpinas e a Toggenburg, e ainda a Anglo Nubiana. No entanto, a base de dados sobre o potencial de produção e a composição em constituintes lácteos dessas raças puras e de suas cruzas, ainda não está bem caracterizada nos países de clima tropical e subtropical,...
Tipo: Folhetos Palavras-chave: Desempenho; Extrato seco; Duração da lactação; Anglo Nubiana; Alpina; PL305; Dry extract; Lactose proportion; 305-day lactation yield; Lactation lenght; Crossbreeding; Fats; Milk performance.; Caprino; Cabra leiteira; Melhoramento genético animal; Performance; Cruzamento; Leite de cabra; Produção leiteira; Proteína; Gordura; Lactose; Goats; Animal genetics; Genetic improvement; Lactation duration; Goat milk; Milk yield; Proteins; Saanen; Toggenburg..
Ano: 2015 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1035307
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Cephalic secretion of Arapaima gigas: sex steroids, peptides and proteins suggest roles in chemical communication and parental care. Repositório Alice
TORATI, L. S.; ALBALAT, A.; MESQUITA, P. E.; TAYLOR, J.; MIGAUD, H..
Adults of the Amazon fish Arapaima gigas secrete a fluid from the cephalic canals of the lateral line system, whose biological role(s) along the reproductive cycle are unclear. Up-todate, the biochemical composition of this fluid has been poorly investigated in A. gigas as well as other teleosts. Hence, this study aimed to (1) investigate the potential pheromone release through this cephalic fluid, and (2) to characterise its proteome and peptidome by comparing males and females during and outside the parental care phase.
Tipo: Parte de livro Palavras-chave: Peixe; Pirarucu; Arapauma Gigas; Feromônio; Arapaima gigas; Peptides; Proteins; Pheromones; Proteome.
Ano: 2018 URL: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1092864
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Electrophoretic behavior of ewe milk proteins from local breeds Rembi and Ouled-Djellal of the Algerian central steppe Acta Agron. (Palmira)
Zobiri-Illoul,Assia; Yabrir,Benalia; Laoun,Abbas; Mati,Abderrahmane.
Abstract In order to characterize the production of sheep milk in Algeria (North of Africa) and to detect molecular markers related to the constitution of the protein phase of this milk, we proposed to analyze the electrophoretic behaviors of caseins and serum proteins under various migration conditions (native, urea and SDS-PAGE), from milk collected during the first three months of the year, from two breeds Ouled-Djellal and Rembi, living in the central area steppe. The profiles obtained show a great similarity and homogeneity between the different samples of the milk of the two breeds of ewes studied as to the number and intensity of the revealed migration bands. Some of the latter are nevertheless distinguished from cow’s milk by different levels of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Algerian steppe; Electrophoresis; Ewe’s breed; Ewe’s milk; Proteins.
Ano: 2020 URL: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0120-28122020000100014
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Relation between chemical composition of Grateloupia doryphora (Montagne) Howe, Gymnogongrus griffithsiae (Turner) Martius, and abiotic parameters Acta Botanica
Perfeto,Paulo Nelo Medeiros.
In Grateloupia doryphora and Gymnogongrus griffithsiae the seasonal variation of their chemical compounds was studied, establishing a relation with the physical and chemical properties of seawater. High values of proteins in the studied species were detected during the winter, 28.88% in G. doryphora and 26.68% in G. griffithsiae, corresponding to the maximum period of ammonium concentration in the marine environment. The variation in carbohydrates content showed an inverse relation with the proteins, with a maximum of 54.72% in G. doryphora and of 55.36% in G. griffithsiae, both in summer, positively correlated with salinity and temperature of sea water. Lipids content was low in both species. In G. doryphora the values ranged between 0.81 and 1.30% and,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Algae; Proteins; Carbohidrates; Lipids; Ashes; Nitrogen; Phosphorus; Potassium.
Ano: 1998 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33061998000100006
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Taxonomic value of histochemical features of the style in early lineages of Asteraceae Acta Botanica
Hernández,Marcelo Paulo; Katinas,Liliana; Arambarri,Ana María.
In this paper we examine lipophilic substances, tannins, proteins, reducing carbohydrates, starch, and oxalate salts in early lineages of Asteraceae to test if they are a useful complement to classification studies. Styles of mature flowers of 44 species were processed according to plant histochemical techniques and observed by means of a light microscope. Lipophilic compounds were always present in the cuticle and cell walls, and in some species were located inside the cells. Proteins were located in the style cell walls and cell interior of most of the analyzed species. No tannins were found. In general, there is a correlation in the presence of reducing sugars and proteins. Starch granules and oxalate salts were found in the style parenchyma of a few...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Compositae; Crystal salts; Lipophilic substances; Proteins; Starch; Sugars; Taxonomy.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0102-33062015000400575
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Physiological and biochemical changes during the loss of desiccation tolerance in millet (Pennisetum glaucum L.) seeds Agronomy
Fernandes, Joana Souza; Guimarães, Renato Mendes; Faria, Jose Marcio Rocha; Pereira, Diego de Sousa; Coelho, Stefania Vilas Boas; Oliveira, Ariadne Santos.
The aim of this study was to evaluate the physiological and biochemical changes related to the loss of desiccation tolerance in millet seeds. The points studied were determined according to the seed imbibition curve of the hybrid ADRF6010: control (0 h), 3 h, 1 and 3 mm of radicle. The seeds were dried on silica gel for 72 h at 20 °C, followed by pre-humidification at 25 °C for 24 h. The physiological quality was evaluated by the electrical conductivity and germination test, and the seed vigor through the first count and germination speed index. The experiment was performed in a completely randomized design and means were compared by the Scott-knott test at 5% probability. The enzymatic systems evaluated were: superoxide dismutase, catalase, peroxidase,...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Seed Physiology; Desiccation Tolerance desiccation sensitivity; Germination; Proteins; Enzymes. Agronomy Dessecação de sementes; Fisiologia de Sementes Tolerância à dessecação em sementes.
Ano: 2019 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/36522
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Physiological and biochemical changes during desiccation tolerance loss in millet (Pennisetum glaucum L.) seeds Agronomy
Fernandes, Joana Souza; Guimarães, Renato Mendes; Faria, Jose Marcio Rocha; Pereira, Diego de Sousa; Coelho, Stefania Vilas Boas; Oliveira, Ariadne Santos.
The aim of this study was to evaluate the physiological and biochemical changes related to desiccation tolerance loss in millet seeds. The studied points of the germination process were determined according to the seed imbibition curve of the millet hybrid ADRF6010: control (0h), 3h of imbibition, 1 and 3 mm radicle. The seeds were dried on silica gel for 72h at 20°C, followed by pre-humidification at 25°C for 24h. Seed physiological quality was evaluated by electrical conductivity and a germination test, and seed vigor was evaluated with a first germination count and a germination speed index. The experiment was performed in a completely randomized design, and means were compared by the Scott-Knott test at a 5% probability. The enzymatic systems of...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Desiccation sensitivity; Germination; Proteins; Enzymes.; Agronomy; Dessecação de sementes; Fisiologia de Sementes; Tolerância à dessecação em sementes.
Ano: 2019 URL: http://periodicos.uem.br/ojs/index.php/ActaSciAgron/article/view/36522
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Evaluation of protein extraction methods for enhanced proteomic analysis of tomato leaves and roots Anais da ABC (AABC)
VILHENA,MILCA B.; FRANCO,MÔNICA R.; SCHMIDT,DAIANA; CARVALHO,GISELLE; AZEVEDO,RICARDO A..
Proteomics is an outstanding area in science whose increasing application has advanced to distinct purposes. A crucial aspect to achieve a good proteome resolution is the establishment of a methodology that results in the best quality and wide range representation of total proteins. Another important aspect is that in many studies, limited amounts of tissue and total protein in the tissue to be studied are found, making difficult the analysis. In order to test different parameters, combinations using minimum amount of tissue with 4 protocols for protein extraction from tomato (Solanum lycopersicum L.) leaves and roots were evaluated with special attention to their capacity for removing interferents and achieving suitable resolution in bidimensional gel...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Bidimensional electrophoresis; Proteins; Protocol optimization; Tomato.
Ano: 2015 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652015000401853
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Ion-specific thermodynamical properties of aqueous proteins Anais da ABC (AABC)
Lima,Eduardo R.A.; Biscaia Jr.,Evaristo C.; Boström,Mathias; Tavares,Frederico W..
Ion-specific interactions between two colloidal particles are calculated using a modified Poisson-Boltzmann (PB)equationandMonteCarlo(MC)simulations. PBequationspresentgoodresultsofionicconcentration profiles around a macroion, especially for salt solutions containing monovalent ions. These equations include not only electrostatic interactions, but also dispersion potentials originated from polarizabilities of ions and proteins. This enables us to predict ion-specific properties of colloidal systems. We compared results obtained from the modified PB equation with those from MC simulations and integral equations. Phase diagrams and osmotic second virial coefficients are also presented for different salt solutions at different pH and ionic strengths, in...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Colloid stability; Hofmeister series; Potential of mean force; Proteins.
Ano: 2010 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652010000100010
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Growth and biochemical composition of Chlorella vulgaris in different growth media Anais da ABC (AABC)
CHIA,MATHIAS A.; LOMBARDI,ANA T.; MELãO,MARIA DA GRAÇA G..
The need for clean and low-cost algae production demands for investigations on algal physiological response under different growth conditions. In this research, we investigated the growth, biomass production and biochemical composition of Chlorella vulgaris using semi-continuous cultures employing three growth media (LC Oligo, Chu 10 and WC media). The highest cell density was obtained in LC Oligo, while the lowest in Chu medium. Chlorophyll a, carbohydrate and protein concentrations and yield were highest in Chu and LC Oligo media. Lipid class analysis showed that hydrocarbons (HC), sterol esthers (SE), free fatty acids (FFA), aliphatic alcohols (ALC), acetone mobile polar lipids (AMPL) and phospholipids (PL) concentrations and yields were highest in the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Carbohydrates; Lipid class; Microalgae; Proteins.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0001-37652013000401427
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