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Developing a rapid, efficient and low cost method for rapid DNA extraction from arthropods Ciência Rural
Mega,Nicolás Oliveira; Revers,Luís Fernando.
Here, it is presented a rapid and efficient method to obtain good quality DNA from small samples of arthropod tissues generating low quantities of hazardous wastes. This new method was compared with another homemade protocol using phenol and other two commercial kits. The quality of DNA obtained was checked by spectrophotometer and evaluated by an AFLP assay. Low shearing DNA was obtained from all samples and the best readings were observed to DNA recollected with the new method. The AFLP assay indicated that DNA obtained with all methods were suitable for use in molecular biology techniques sensitive to contaminants. However, homemade protocols were more efficient in recollect DNA than commercial kits, without lose any quality of samples. Also, they were...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Arthropod DNA; High quality DNA; Molecular biology; AFLP.
Ano: 2011 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782011000900012
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Variabilidade genética interespecífica em formigas cortadeiras do gênero Acromyrmex que ocorrem no Estado do Rio Grande do Sul Ciência Rural
Grutzmacher,Douglas Daniel; Loeck,Alci Enimar; Oliveira,Antônio Costa; Zimmer,Paulo Dejalma; Malone,Gaspar.
São poucos os taxonomistas que atuam na identificação de formigas cortadeiras. Os métodos morfométricos utilizados nem sempre permitem uma identificação confiável, em função do acentuado polimorfismo dentro do mesmo formigueiro. O objetivo do trabalho foi testar a possibilidade do uso da ferramenta da biologia molecular para auxiliar na identificação das espécies de formigas cortadeiras do gênero Acromyrmex que ocorrem no Estado do Rio Grande do Sul. O estudo foi realizado com seis espécies de formigas do gênero Acromyrmex coletadas em quatro regiões do RS. Utilizaram-se as técnicas RAPD e AFLP, testando-se inicialmente 50 primers, dos quais apenas 13 foram selecionados por terem amplificado com sucesso fragmentos de todas as espécies estudadas. Embora os...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Quenquéns; RAPD; AFLP; Primers.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782007000400001
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Pareamento de fungos cultivados por diferentes espécies de formigas cortadeiras no Rio Grande do Sul Ciência Rural
Borba,Regina da Silva; Loeck,Alci Enimar; Branco,Juliana Severo Castelo; Bonow,Juliane; Oliveira,Antônio Costa de.
Este trabalho teve por objetivo estudar a possível ocorrência de heterocariose por meio do pareamento de fungos provenientes de diferentes espécies de formigas cortadeiras coletados em diferentes regiões do Estado do Rio Grande do Sul, utilizando a técnica AFLP. Dez grupos de pareamentos foram realizados, sendo que em dois não ocorreu a fusão das colônias. Após ocorrerem os pareamentos, foram coletados discos de micélio da área de intersecção das colônias e das áreas extremas de pareamento, para a realização da extração do DNA e padronização. Para as reações de PCR, utilizaram-se 21 combinações de primers AFLP, dos quais foram selecionados três que apresentaram maior polimorfismo e consistência. Os dados moleculares foram transformados em matriz binária e...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Compatibilidade vegetativa; Marcadores moleculares; Variabilidade; AFLP.
Ano: 2008 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782008000500002
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Polimorfismo do fungo simbionte de formigas cortadeiras submetido à luz ultravioleta Ciência Rural
Borba,Regina da Silva; Loeck,Alci Enimar; Branco,Juliana Severo Castelo; Kopp,Maurício Marini; Oliveira,Antônio Costa de.
O presente trabalho teve por objetivo verificar o efeito de diferentes períodos de luz ultravioleta sobre a similaridade genética do fungo simbionte de formigas cortadeiras pertencentes às espécies Acromyrmex ambiguus, Acromyrmex crassispinus e Acromyrmex lundi, através da técnica AFLP. Os fungos foram inoculados em meio de cultura Pagnocca e mantidos em câmaras climatizadas à temperatura de 25 + 1°C e escotofase de 24h, por um período de 15 dias. Posteriormente, foram expostos à luz ultravioleta por períodos de: 0, 5, 10, 15, 20, 25 e 30 minutos. Aos 45 dias após o tratamento, foi realizada a extração do DNA e padronização, realizando-se as reações de PCR por meio de 24 combinações de primers AFLP, das quais quatro foram selecionadas por apresentarem...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: AFLP; Marcadores moleculares; Simbiose.
Ano: 2007 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782007000500001
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Sexual reproduction in freshwater fairy shrimp, Dendrocephalus brasiliensis (Pesta, 1921) inferred by Amplified Fragment Length Polymorphism markers Ciência Rural
Silva,Suzianny Maria Bezerra Cabral da; Santos,Leilane Bruna Gomes dos; Lopes,José Patrocínio; Gálvez,Alfredo Olivera; Coimbra,Maria Raquel Moura.
Fluctuations in world harvests of Artemia sp cysts have increased prices sharply in the past years. Several organisms have been tested as alternative sources for a total or partial replacement of Artemia sp, among which the microcrustacean (Anostraca) Dendrocephalus brasiliensis stands out. The objective of this study was to investigate the reproductive strategy of D. brasiliensis by means of AFLP markers. The distinction between sexual and parthenogenetic reproduction was conducted using 7 EcoRI and MseI primer combinations in a full-sib family composed of 13 progenies. Forty polymorphic markers were obtained, of these, 35% were from paternal origin and 65% were maternally inherited. Results showed mendelian segregation in all markers through the...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Microcrustacea; AFLP; Paternal inheritance; Sexual reproduction.
Ano: 2013 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0103-84782013000600021
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Variabilidade morfocultural e genética de fungos associados a podridão peduncular do mamão Ciência e Agrotecnologia
Peres,Ângela Pimenta; Silva-Mann,Renata; Vieira,Maria das Graças G. C.; Machado,José da Cruz.
Objetivou-se, com este trabalho, verificar a variabilidade morfocultural e genética de fungos associados à podridão peduncular do mamão (Carica papaya L.). As avaliações morfoculturais foram feitas pelo índice de crescimento micelial e características das colônias, como coloração e tipo de micélio, quando os isolados foram crescidos em diferentes meios de cultura (BDA, MDA e Czapek). A variabilidade genética foi verificada por meio de análises de AFLP. Os isolamentos foram feitos em frutos obtidos de diferentes regiões produtoras do Brasil. Foram estudados oito isolados de cada uma das três espécies mais incidentes (Colletotrichum gloeosporioides, Phoma caricae-papayae e Fusarium solani). Foi verificado que os meios BDA e MDA promoveram um maior e mais...
Tipo: Info:eu-repo/semantics/article Palavras-chave: Colletotrichum gloeosporioides; Phoma caricae-papayae; Fusarium solani; AFLP; Carica papaya.
Ano: 2003 URL: http://www.scielo.br/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S1413-70542003000500012
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